塞姆利亞大陸規模最大的獵兵團「北方獵兵」負責護送貨物運往諾森比亞自治州首府哈利亞斯克。 途中，停靠在被魔獸襲擊的村莊時，部隊突然遭到魔獸的襲擊。 在這之中，一位身材嬌小、沉默寡言的獵兵拉薇，她不顧阻止獨自面對。

得知克洛斯貝爾自治州被埃雷波尼亞帝國吞併的消息後，高官們對羅根提出抗議，羅根警告諾森比亞將是下一個。 因獨自驅趕魔物而被視為違紀的拉薇奉命擔任戰鬥訓練教官，卻發生了訓練中軍用車輛失控的事件。拉薇、塔利昂、伊賽莉亞將要面對他們的長官馬蒂。

為了取得「帝國的英雄」的情報，奉命對埃雷波尼亞帝國進行秘密調查的拉薇等人四人，來到了帝國西部的拉瑪爾州海都歐爾迪斯。 最一開始的命令是要潛入慶典派對，但拉薇卻早早離開，為了追她的塔利昂，看到了帝國的繁榮。 就在這時，也看到一群可疑的人聚集在港口倉庫裡。

拉薇一行人在帝國秘密調查的途中停留來到了溫泉鄉悠米爾，遇到了村裡的溫泉變冷的奇怪現象。 拉薇和伊賽莉亞得知深山的深處源頭可能是原因並前往調查，但在那等待她們的是一隻與七耀石合體的魔獸，伊賽莉亞被困在水晶的結晶化所困住。 拉薇試圖用她限有的武器要營救伊賽莉亞。

拉薇等一行人見證了灰之騎神「瓦利瑪」和操控它的「帝國的英雄」黎恩．舒華澤的壓倒性力量後，在等待轉乘火車的凱爾迪克站，等待他們四人的是帝國軍情報局的雷克多。接近四人的雷克多已經掌握了拉薇是「北方獵兵」的英雄兀拉德的孫女，並指示亞爾緹娜和米莉亞姆要扣留拉薇。

因馬蒂被帝國扣留，拉薇一行人便返回諾森比亞，並被告知調查任務已經結束。再次被指派擔任教官職務的拉薇，在王宮內得知了導致祖父兀拉德名譽落地的巴雷斯坦上校被謀殺的真相。帝國來訊要求諾森比亞對「凱爾迪克縱火案」進行賠償，古拉格請求拉薇跟隨祖父的腳步，一起為國家而戰。

帝國要求賠償的謠言四起，諾森比亞自治州內部的緊張局勢一觸即發。緊急召集的古拉格亮出了反抗軍的王牌「人形兵器」，並承諾與「英雄的孫女」拉薇一起保護諾森比亞。然而，在演講結束後，古拉格向高層幹部們透露了一個意想不到的政策。但羅根正面否決，兩邊的衝突越來越加深。

是誰暗殺了古拉格。 羅根趁亂接管議會，宣布他將代替古拉格領導諾森比亞。激進派部隊和「人形兵器」包圍了哈利亞斯克，並囚禁了古拉格派的重要成員。 戒嚴令實施後，拉薇得知羅根並不是暗殺古拉格的主謀，並著手查明羅根在王宮裡的目的為何。

拉薇被塔利昂開槍打傷，但僥倖逃過一劫，在家鄉米修斯克村由母親照顧。拉薇得知本該是村裡叛徒的兀拉德，卻受到了村民的敬仰，還想起了爺爺的話，英雄該要有什麼樣子。然而，追捕拉薇的極光分隊來到村莊，並放火燒麥田引誘她出現。

帝國越過邊境逼近州首府哈利亞斯克。諾森比亞採取徹底抵抗的立場。拉薇和伊賽莉亞離開村莊前往哈利亞斯克，拉薇開始確信暗殺古拉格的幕後策劃者的存在。目標前往王宮，但擋住帝國攻勢的人形兵器卻突然暴走。並襲擊平民百姓，使哈利亞斯克陷入混亂。為了打破這種局面，拉薇遇到了羅根，並獨自前往真正的主謀者那裡要阻止混亂。

瓦利瑪的出現讓疏散中的哈利亞斯克居民陷入混亂。拉薇與黎恩的重逢，請求他協助守護諾森比亞。莎拉率領的遊擊士協會也趕到開始營救市民。在歸來的馬蒂和亞爾緹娜的幫助下，拉薇終於踏入了混亂根源巴爾穆特森林的人形兵器工廠。