La musique est devenue un sujet tabou depuis le cessez-le-feu avec les D2, il y a quatre ans de cela. Mais un jour, un jeune garçon qui a grandi sans connaître la musique entend une mélodie provenant d'un piano, jouée par un jeune homme aux cheveux noirs appelé Takt.

Dix ans auparavant, un grand chef d'orchestre est attaqué en pleine représentation à Boston et perd la vie. Dès lors, son fils tente de surmonter son chagrin en se consacrant entièrement au piano.

Après l'attaque des D2, Takt se réveille dans son lit, chez lui. Il fait alors la connaissance d'un homme qui lui explique pourquoi Cosette se comporte différemment.

Takt, Destiny et Anna continuent leur voyage à destination de New York. Malheureusement pour eux, un D2 se dirige vers eux au moment où ils changent une roue de leur voiture.

Anna et Destiny décident d'aller faire quelques courses dans une ville et rencontrent plusieurs habitants sur leur chemin. Takt, quant à lui, suit un homme dans un bar bien particulier…

Au cours de leur voyage, le trio rejoint une ville sujette à des attaques de D2. Alors que le danger rôde, Takt semble être complètement absorbé par autre chose…

Takt et Destiny apprennent la vérité sur l'origine de l'attaque qui a mis fin aux jours de Cosette. Furieux, Takt perd le contrôle et tente d'éliminer son ennemi, tandis que Destiny essaie de le ramener à la raison.

Takt, Destiny et Anna finissent enfin par atteindre New York, la seule ville qui est encore intacte depuis l'invasion des D2. À peine arrivés, ils rejoignent Charlotte pour se faire examiner au plus vite dans son laboratoire.

Takt et Destiny vont à la rencontre de Lenny pour découvrir la vérité au sujet de Symphonica et de la tragédie de Boston.

À son réveil, Takt apprend que le QG de Symphonica est la cible d'une attaque. Au même moment, Destiny l'informe qu'Anna et Charlotte s'y trouvent toujours…

Takt et Destiny affrontent Orpheus afin de mettre un terme à la folie de Sagan.