「蘭道夫藍道魯夫」席捲全世界。研究開發新資源的公司「南極戰線」開始募集新的開拓員，想成為英雄的時雨應徵入隊。立刻被錄取，但卻在入隊之後因隊伍成員拉利和小鳩的惡作劇而暈倒，醒來之後就見到了副隊長雷斯理。雷斯理告訴他，這個工作並不是開拓夢想，而是關乎性命的危險工作。對這個工作來說，最重要的特質是抵抗力，而時雨擁有這個特質。故事就在南極的巨大洞窟·阿塞拉姆開始了。

為了發掘新資源，在阿塞拉姆中前進的時雨，在任務途中因屢次表現出了自己的無知，被隊友菫嘲笑。為了和大家搞好關係，他努力向其他隊友搭話，卻只得到奇怪的回答，亦或是反應平淡，這讓他備受打擊。就在他煩惱之時，無意間得知菫曾是一名偶像。想成為英雄的時雨和想成為偶像的菫，兩人討論起自己的夢想，就這樣解開了對彼此的誤解，逐漸成為夥伴。

時雨突然接到特殊任務。得知完成這個任務就能成為英雄，但這工作卻和想像中的開拓員的工作完全不同，讓他十分困惑。休息時間，時雨和隊友們在購物中心購物。輕鬆打倒了找碴的混混，時雨第一次知道了自己的實力。暴露了開拓員身份，被商人拜託採集只有阿塞拉姆之中才能找到的藥材。接受了委託的拉利和時雨為了不讓小隊知道，從別的路線進入阿塞拉姆，在那裡遇到了阿塞拉姆居民，少女艾爾希。

時雨終於決定接受特殊任務，卻沒想到這個任務的目標居然是艾爾希。休息時間，被副隊長的精湛劍術吸引的時雨、拉利、小鳩一行人，討論起了關於雷斯理的傳聞，一起調查了雷斯理的過去。在和雷斯理吃飯的時候，時雨接到電話，離席來到了外面的小路，在那遇見了神秘少女納迪亞。好奇心驅使令他追上了納迪亞，但沒想到納迪亞突然帶來了「異端者」，時雨遭受攻擊。救出時雨的雷斯理告訴他，異教徒是「放逐者」中最瘋狂的一族。…

看見小鳩卸下義肢的模樣，時雨的反應令小鳩感到不快。雷斯理也發現了兩人之間始終有距離感，於是要求時雨和小鳩進行配合強化訓練。拉利和堇他們，擔心配合度不好的小鳩和時雨不能好好相處，於是開始策劃歡迎會。在購物時，發現了兩人共同的愛好，兩人也終於有了話題。但是納迪亞突然又出現在時雨面前，發起了攻擊，為了救出被襲擊的時雨，小鳩伸出了手。與此同時，艾登也接到了抓捕艾爾希的指令。

探險隊隊長薇拉堅信少女艾爾希擁有毀滅世界的力量，對艾爾希這個目標十分執著。她所提出的計畫，終於得到了組織的認可。時雨、拉利一行人進入阿塞拉姆。他們的新任務是偽裝成流亡者潛入搜查。拜訪戒備的村莊的一行人，分頭開始行動。目標是潛入艾爾希的生日會。然而，他們的作戰走漏風聲，雷斯理也再度遭遇艾登。

雷斯理遭遇連續攻擊犧牲，小隊中充滿了悲傷的氛圍。向薇拉詢問作戰意義的時雨，開始猶豫要不要繼續進行計畫。薇拉也給了他3天時 間，重新進行考慮。薇拉代替雷斯理帶領小隊，再次潛入了村莊。發現了他們的艾登和納迪亞放棄了人質準備逃走。時雨追蹤艾登等人，要阻止他們的行動，但還是在巨大的實力差距下失敗，被趕來的薇拉救下。艾登對薇拉放話稱，看誰能先抓到艾爾希，就這樣消失了。為了不讓雷斯理的犧牲白費，時雨終…

艾登和納迪亞策劃著抓住艾爾希的行動。另一邊，時雨在調查雷斯理的遺物中的手賬中所寫內容。拉利等人也為了紀念雷斯理，提出用雷斯理過去的照片製作相簿。在收集照片時，副隊長的過去中隱藏的資訊也逐漸明朗。被敵人的戰鬥機突襲的小隊一行人分散進行防衛，不敵對手的成員們向隊長薇拉提出支援請求，然而薇拉自己也陷入了困境。

敵人艾斯曼知道薇拉擁有能讓時間重來的能力。作戰計畫失敗兩次，薇拉遭到公司的斥責，薇拉擔心成員們也會被辭退。然而，小隊的成員們為了鼓舞士氣，正在策劃和薇拉一起開燒烤派對。在屋頂上，薇拉為了探討失敗原因，回顧了和艾斯曼的戰鬥。途中小隊成員看到空中的煙花，想起和雷斯理的回憶而悲傷起來。看到這場面，時雨對薇拉說，不管失敗多少次，也想一起繼續進行作戰。然而，看到充滿人情，關係融洽的小隊成員們，薇拉感…

Vera drives Shigure away from the platoon, but he's not ready to leave the Asylum... yet.

Now trapped in a time loop, Shigure struggles to unravel the mystery behind EL-Cee and Iceman's plans.

Shigure travels through time once more to save Vera and stop Iceman from destroying the world.