ナゾの宇宙船に乗っていたのは、なんと子供たちだけだった。フリーザに故郷を滅ぼされた彼らは、悟飯たちをなかなか信じてくれない。その時、宇宙船がピンチに！悟飯たちは、子供たちと力を合わせて流星群から船を守る。その結果、誤解もとけて、再びナメック星を目指すことになるが、今度は宇宙潮流に巻き込まれ…。

宇宙潮流に巻き込まれた悟飯たち。潮流を乗り越えた先に、ついにナメック星らしき惑星を発見する。さっそくドラゴンボールを探そうとした悟飯たちは、ガケ崩れに襲われたところを、ナメック星人のライチとザークロに助けられる。親切なライチの手助けもあり、思っていた以上に順調にことは運んでゆく。

早くも３個のドラゴンボールを見つけた悟飯たち。一方、地球では悟空がケガを治して激しい特訓を開始。さらに、ベジータもフリーザの基地にたどりついて治療を受け、復活を果たしていた。悟飯たちのドラゴンボール集めはその間も順調に続き、さらに２個のドラゴンボールの入手に成功していた！

順調に、ナメック星でのドラゴンボール集めを進めてゆく悟飯たち。氷の洞窟内にあった６個目のドラゴンボールも、数々の難関を突破し、なんとか手に入れることに成功する。ついに、最後の１個がある場所を突き止めるが、そこにはライチとザークロが待ち構えていた。彼らの行動に隠された秘密とは…？

ライチとザークロは、悟飯たちの宇宙船をだまし取ろうとして、ナメック星人になりすましていた別の宇宙人だった。すんでのところで宇宙船を奪い返し、今度こそ本当のナメック星に到着した一行。しかし、時を同じくしてベジータもドラゴンボールを求め、ナメック星に到着した。悟飯たちに危機が迫る！

悟飯たちやベジータより一足先に、ナメック星に到着した一団がいた。永遠の命を得るために、ドラゴンボールを狙うフリーザ一味だ。同じ目的を持つベジータは、一味のキュイと闘い、かつては同等だった相手を難なく倒す。また、悟飯たちもフリーザの手下を一蹴するが、命綱の宇宙船を破壊されてしまう。

ドラゴンボールを探して、ナメック星を移動するフリーザ一味。悟飯とクリリンは、近くを通り過ぎるフリーザから身を隠すが、その強大な気に恐怖を覚える。一方、地球では、復活した悟空がベジータとフリーザの存在を聞きつけ、ブリーフ博士の改造した宇宙船でナメック星に急行しようとしていた。

フリーザたちの後を追う悟飯とクリリンは、ナメック星人の村に到着した。村を襲ったフリーザたちはドラゴンボールを渡すよう村人を脅すものの、それが通じないと知るや村人たちを殺し始める！長老は一味がスカウターを頼りに村を探していることを知り、スカウターを破壊するが、その抵抗に怒ったドドリアが…！

フリーザ一味の幹部・ドドリアは怒りにまかせ、ナメック星人の戦士を皆殺しにしてしまった。さらに、子供たちの命だけでも守ろうと、ドラゴンボールを差し出した長老さえも殺してしまう。残った子供たちも命を奪われそうになったその時、とっさに悟飯が飛び出した。子供を救い、逃げる悟飯たちは追跡者を振りきれるのか!?

悟飯とクリリンを見失ったドドリアは、激怒し周囲を爆破!! ２人を抹殺したつもりでフリーザのもとへ戻ろうとするドドリアに、ベジータが不意討ちをかける。以前とはうって変わってベジータに全く歯が立たないドドリアは、フリーザこそが惑星ベジータを滅ぼした張本人であることを告白して命乞いをする。

悟空がナメック星に向かっていることをブルマから聞かされ、悟飯たちは大喜び。ところが、悟空の宇宙船に隕石が衝突し、ナメック星への軌道からずれて灼熱の惑星突入の危機に…！そのナメック星では、気を探る技も身につけたベジータが、フリーザたちを出しぬいて、残るドラゴンボールのある村へやって来ていた。

ベジータはナメック星人たちの村を襲い、力ずくでドラゴンボールを手に入れた。星の危機を知ったデンデは、悪の手から仲間を救ってほしいと悟飯たちに頼み込み、クリリンとともに最長老の家へ出発する。一方、宇宙船内で修行に励む悟空はピッコロたちが界王星に到着したという朗報に勇気づけられる。

界王はナメック星に感じる超特大の気の主を察知し、絶対フリーザには近づくなと悟空に警告する。暴虐の限りを尽くすフリーザの行状を聞いたピッコロたちは、より強くなろうと、界王のもとで修行させてもらうための課題・ダジャレに挑戦。その頃ナメック星では、ベジータが単独行動中のザーボンに闘いをしかけていた。

ベジータの猛攻により追いつめられたザーボンが、ついに真の力をあらわにする。醜悪な姿に変身し、強大なパワーでベジータを圧倒！絶対的な力の差を見せつけベジータを完膚無きまでにたたきのめし、フリーザへ報告に向かう。同じ頃、クリリンとデンデは最後のドラゴンボールを持つ最長老のもとへ到着していた。

最長老に面会したクリリンは、最後のドラゴンボールを受け取り、さらに自分の中に眠っている力を最大限に引きだしてもらう。一方、ドラゴンボールのありかを吐かせるため、ザーボンは息も絶え絶えなベジータをフリーザの宇宙船に連れ帰り、不本意ながらもメディカルマシーンでの治療を開始する。

界王星ではバブルスやグレゴリーを相手に天津飯たちの修行が続けられていたが、修行の成果に疑問を抱くピッコロは１人だけ参加しない。しかし、いざ組み手を始めると、ピッコロは以前より格段に上がったヤムチャの腕に驚く。一方ナメック星では、メディカルマシーンで治療を受けたベジータが復活を果たしていた。

ベジータがフリーザの宇宙船からドラゴンボールを奪って逃亡！一気にすべてを集めてしまおうと、最後の１つを持ってブルマのもとへと急ぐクリリンを追いかけるが、その追跡劇に気付いたザーボンも現れ、一触即発の危機に陥る。そのころ悟飯は、ベジータの隙をつき、池に沈めてあったドラゴンボールを手に入れていた。

クリリンのドラゴンボールを狙うベジータと、ベジータを追いかけてきたザーボンが、再び相まみえる。だが、変身後のザーボンをいともたやすくベジータは倒す。その強さに観念したクリリンは、最後のドラゴンボールを渡してしまう。同じ頃、宇宙船内の悟空は磁気嵐が原因で生じた100倍超重力と闘い続けていた。

惑星フリーザからギニュー特戦隊が発進！その目的地であるナメック星では、ドラゴンボールを持ってブルマのもとへ戻る悟飯が、ベジータに見つかってしまう。しかし、とっさの機転でベジータからドラゴンボールを隠しおおせた悟飯は、休むまもなく、潜在能力を引き出してもらうためにクリリンと最長老の家へ急ぐ。

フリーザが放った超特大のエネルギーが大地を震わせ、ブルマの持つ四星球が海中へ転落する。慌てて潜水艇で海中に潜ったブルマは、ドラゴンボールと無数の卵を守る巨大蟹と対決！なんとか無事にドラゴンボールを取り戻して地上に帰還するが、今度はフリーザの手下・ブールベリとラーズベリに捕まってしまう。

フリーザ配下のブールベリとラーズベリは、ブルマの話を聞き、ドラゴンボールを自分たちのものにしようと企み始める。ブルマは海にまだ残りのドラゴンボールがあると２人を騙して、潜水艇で海中を案内するが、途中で２人についた嘘がバレてしまう！その頃、宇宙船の中の悟空は100倍重力をも克服していた。

無事に修行を終えた悟空は、ナメック星での決戦に備えて宇宙船内で休息に入る。一方、クリリンと悟飯は最長老のもとへようやく到着するが、そこでベジータと遭遇。なんとか悟飯の能力を引きだすことに成功するものの、ベジータの力には及ばない。と、その時５つの大きな気が接近。もしや、この気の正体は…。

ついにナメック星に到着したギニュー特戦隊。倒すためにはドラゴンボールの力でベジータを不死身にするしかない…。ベジータと協力してドラゴンボールを集めるクリリンたちだが、あと一歩というところでギニュー特戦隊が現れてしまう。グルドVSクリリン＆悟飯、リクームVSベジータの闘いが始まった！

クリリンたちを獲物と決めたグルド。特戦隊の中では戦闘力の劣るグルドは、なんと時間を止める超能力を持っていた。それでもスピードをいかしてグルドを追い詰めるクリリンたちだったが、ついにはグルドの最終奥義である金縛りの術で動きを封じられてしまう。身動きの取れないクリリンたちは絶体絶命の危機に陥る！

不意討ちによりグルドを倒したベジータは、リクームとの対決に望む。パワー全開で先制攻撃をしかけるベジータだったが、戦闘力２万の攻撃もリクームには通用しない。パワフルな攻撃の前に瀕死状態となるベジータ。とどめのリクームイレイザーガンの攻撃にさらされたその時、クリリンの機転が彼を救う。

７つのドラゴンボールをすべて集めたフリーザは、願いをかなえる方法を突き止めるために最長老のもとへ向かう。一方、リクームに対して攻撃をしかける悟飯。全力を振り絞って闘うが、リクームは余裕の表情。渾身の力で放った魔閃光弾も片手で受け止められてしまう。そして、悟飯は遊び飽きたリクームによって…。

ついに悟空が到着。すべての状況を理解した悟空は、悟飯とクリリンだけでなくベジータにも仙豆を与えるのだった。３人が元気になったことを確認すると、リクームに対し１人で立ち向かう悟空。あまりにも落ち着いているその姿に不安を覚えるクリリンたちだったが、悟空はたった一撃でリクームを倒してしまう。

ジースとバータはスカウターで見た悟空の5000という戦闘力に油断して、攻撃を開始する。しかし、自慢のスピードを活かした直接攻撃を２人がかりで仕掛けても、一撃も当てることができない。格闘戦に不利を感じた２人は、ついに合体技であるパープルコメットボールを発動。多数の光弾が悟空を襲う！

ジースとバータに手を引かせるため、バータを一撃で気絶させて実力の差を見せつける悟空。その力に恐れをなしたジースは、ギニュー隊長のもとへ飛び去ってしまう。ジースを逃がしたことに憤慨するベジータは、バータとリクームにとどめをさし、悟空の甘さをののしる。一方、ギニューはジースの報告を受けて…。

ギニューの強さを認めた悟空は、クリリンと悟飯を逃がすために、ドラゴンボールの探索に向かわせる。それを見たベジータは隙をついて戦闘を離脱、クリリンたちの後を追いかけていってしまった。ただ１人ギニューたちに立ち向かう悟空。ギニューはその実力を確認するかのように、一騎打ちを仕掛けてきた！

18万にも達した悟空の戦闘力を見て、超サイヤ人の伝説が真実であったと恐れを隠せないギニュー。一方のクリリンと悟飯は、ドラゴンボール探索のためにブルマの隠れている場所に戻ったのだが、ブルマの姿はそこにはなかった…。そうした状況のなか、ついに最長老のもとにフリーザが到着してしまう。

デンデがクリリンたちに神龍を呼び出すための合い言葉を無事に伝えられるよう、ネイルはフリーザに対して時間稼ぎの闘いを挑む。また、悟空はギニューとの無益な闘いを避けるために圧倒的なパワーを見せつける！しかし、ギニューは不利な状況を楽しむかのように、なぜか自らを傷付け始める…。

ギニューと体が入れ替わってしまった悟空は、不慣れなうえに傷ついている体でギニューの後を追う。一方、悟飯とクリリンはフリーザの宇宙船で全てのドラゴンボールを発見するが、合言葉がわからずに神龍を呼び出すことはできない。そこに悟空の姿をしたギニューが到着。クリリンたちは悟空の登場に喜ぶが…。

悟空の体でパワーを全開にするギニューだが、戦闘力は思うように上がらない。悟飯たちの攻撃に、不慣れな体のギニューは大苦戦。しかし、体になれてくると形勢は逆転し、今度は悟飯たちがピンチに。そこにジースを倒したベジータが参戦。再び窮地に追い込まれたギニューは、ベジータとのボディチェンジを狙う。

ベジータとのボディチェンジが行われようとしたまさにその瞬間、２人の間に悟空が飛び込んだ。元の姿へと戻った悟空だが、そのダメージはあまりに大きく、最後の力をふりしぼったかめはめ波もギニューをとらえることはできない。再びベジータとのボディチェンジを狙うギニューに対し、悟空がとっさにとった策は…？

神龍を呼び出すための合言葉を聞くために、クリリンは最長老のもとへと向かう。一方、デンデも合言葉を伝えるべくクリリンたちのもとへと向かっていた。ネイルと闘っていたフリーザは、この闘いがそのための時間稼ぎだったことを知って激怒。猛スピードで悟飯たちへと迫る。はたして神龍を呼び出すのは誰なのか!?

ついに現れたナメック星の神龍。かなえられる願いは3つだが、1人ずつしか生き返らせることができないという。迷う悟飯たちにピッコロは、自分を生き返らせ、さらにナメック星にワープさせて欲しいと呼びかける。残る願いはあと1つ。その時、悟飯たちに出し抜かれたベジータが、怒りの形相で神龍の前に現れた!!

願いがかなわず怒り狂うフリーザ。その気は悟飯たちを怯えさせるには、十分すぎる程に強大なものだった。だがベジータは3人で闘えば勝てると豪語する。ベジータもまた大幅にパワーアップしていたのだ。一方、悟飯たちのもとへと急ぐピッコロは瀕死のネイルを発見。ネイルは自分と同化しろとピッコロに提案する。

変身を開始したフリーザは、ベジータの父・ベジータ王を殺し惑星ベジータを破壊した時でさえ、一度も変身することはなかったと語る。そしてフリーザの変身は完了。巨大化した体から発する気は、今までとは比べものにならない。フリーザが軽く片手を振り上げるだけで、周囲はすべて吹き飛んでしまうのだった…!!

フリーザの角で腹を突き刺されたクリリンが、無残な姿で湖へと落ちていく…。その光景に怒りを爆発させた悟飯が、フリーザに猛攻撃をしかける。その力に驚くベジータ。超サイヤ人に一番近いのは悟飯なのだろうか!?だがその攻撃もフリーザには効かなかった。フリーザはさらに戦闘力を上げ、悟飯に襲いかかる。

悟飯への攻撃を目の当たりにしたベジータは、あまりの力の差に手を出すこともできない。フリーザが悟飯にとどめを刺そうとしたその瞬間、クリリンの気円斬がフリーザの尻尾を切った。不思議がるフリーザを挑発し、逃げ回るクリリン。そのスキをついてデンデが悟飯のもとへかけよる。デンデが持つ能力とは…。

ついに到着したピッコロが自信たっぷりにフリーザと対峙する。クリリンはそんなピッコロの態度に不安を隠せない。だがピッコロの自信は本物だった。クリリンと悟飯の手を借りずに、１人でフリーザと闘うピッコロ。あの凄まじいパワーのフリーザと互角の勝負をするピッコロの姿に、３人は希望を見出すのだった。

本気の力はまだまだこんなものじゃないというフリーザだが、ピッコロもまた重い服を着て闘っていた。服を脱ぎ本気になったピッコロの力は、フリーザに勝るとも劣らない程凄まじいものだった。それにも関わらず、余裕の態度を崩さないフリーザ。困惑するピッコロに対し、フリーザが語り始めた驚愕の事実とは…!?

２度目の変身を遂げたフリーザが執拗にピッコロを痛めつける。たまらず飛び出した悟飯は、フルパワーの気功波をフリーザに放つが、あとひと息というところで弾き返されてしまう。サイヤ人の強さを改めて認識したフリーザは最後の変身を開始。一方ベジータは、デンデの能力を利用して超サイヤ人になろうと目論む。

ついに真の姿を現したフリーザは、悟飯たちが見ることもできない超スピードの攻撃でデンデを殺してしまう。悟飯たちは３人がかりで攻撃するが、フリーザに触れることすらできない。ただ１人フリーザの攻撃が見えていたベジータは自信たっぷりにフリーザに挑む。ベジータは本当に超サイヤ人になったのだろうか!?

己を超サイヤ人だと信じて疑わないベジータは、フルパワーのエネルギー弾をフリーザへ放つが、蹴りだけで簡単にはじかれてしまう。その圧倒的な力の差に絶望。大粒の涙を流して、生まれて初めての挫折を知る…。完全に戦意を失ってしまったベジータに刻一刻と死が迫っていたその時、悟空の傷がついに完治した。

フリーザのもとへ到着した悟空。パワーアップを果たした悟空を見たベジータは、フリーザに「これが超サイヤ人」と告げる。しかしその瞬間、フリーザのビームがベジータの心臓を貫く!! 実力を見込んだ悟空にサイヤ人の誇りを託し、絶命したベジータ…。その遺体を埋葬した悟空は、フリーザへの怒りを爆発させる。

宇宙最大の闘いが、ついに始まった。闘いの最中、悟空に対し「ここまでやるサイヤ人は初めてだ」と、感心するフリーザ。そして悟空の実力を試すかのように、超能力で操った津波のようなマグマを浴びせかけるのだった。遠くで闘いを見守る仲間たちは、常識を超えるハイレベルな闘いに、ただ驚くことしかできない…。

悟飯を救うため、地球ではチチがナメック星へ飛び立つ準備を進めていた。同じ頃、悟空は気が読めないというフリーザの弱点を見ぬいて、２発のかめはめ波を使った不意打ちを成功させる。だが、カスリ傷１つ負わないフリーザは、超能力で悟空を攻撃。立て続けに金縛りを繰り出し、勝負にケリをつけようとする。

ウォーミングアップは終わりだと口を揃え、２人は戦いの場を地上へと移す。依然として余裕の笑みを浮かべるフリーザは、自らにハンデを課すと宣言。人を食ったようなその態度に、悟空は先制攻撃を仕掛けるのだった。一方ブルマはその頭脳が仇となり、カエルの姿をしたギニューにボディチェンジを食らう羽目に…。

悟空に隠された力を計算しても、マックスパワーの半分も出せば勝てると豪語するフリーザ。悟空はその立ち込める気から、虚勢ではないと感じとる。そして次の瞬間、フリーザのひじ打ちが悟空の顔面をとらえた。一方、地球では宇宙船の打ち上げが失敗。悟飯たちの前には、ブルマの身体を得たギニューが現れる。

悟飯たちと一緒にいたギニューは、ブルマからピッコロへ体を変えようとするが、悟飯に見破られて再びカエルに戻ってしまう。ブルマは元の体に戻れて大喜び。一方、悟空はフリーザの前に大苦戦。一気に追い込まれるも、仲間たちのことを思い出して再び反撃に転じる。そして20倍界王拳のかめはめ波で勝負に出るが…。

悟空が放った渾身の20倍界王拳かめはめ波も、フリーザには通用しなかった。手に傷をつけられたフリーザは激怒。再び一方的な猛攻で悟空を襲う。体力が限界の悟空は、最終奥義・元気玉にすべてを賭けることを決意する。その頃界王星には、隊長を除くギニュー特戦隊がごきげんなポーズで乗り込んでくる。

確実にフリーザを倒すために、時間を費やし巨大な元気玉を造ろうとする悟空。しかし、訝しがりつつも無防備な悟空を攻めていたフリーザは、水面に映る元気玉を見て悟空の作戦に気付いてしまう。万策尽きたと思われた瞬間、ピッコロが奇襲に出るが…。同じ頃、ギニュー特戦隊は界王星を乗っ取ろうと動き始める。

界王星を襲い始めたギニュー特戦隊に対し、修行を積んだヤムチャたちが互角の闘いを展開する。一方の悟空は、ピッコロの助けによって命拾いするも、元気玉の完成にはまだ時間が必要。懸命に時間を稼ぐピッコロに、悟飯とクリリンも加勢する。相次ぐ邪魔に激怒したフリーザは、星をまるごと消そうともくろむ！

界王星での一戦はギニュー特戦隊の敗退で決着し、ナメック星でも元気玉の超絶パワーの前にフリーザは散ったと思われた。しかし、歓喜に浸る悟空たちの前に再び姿を現すフリーザ！仲間たちはなす術もなく、次々と倒されてしまう。その時、限界を突破した怒りに震える悟空の体に、突如異変が起こり始める…!!

ついに超サイヤ人となった悟空。悟飯にピッコロを連れて地球へ帰るよう命ずると、驚愕パワーで怒涛の猛攻をフリーザにしかける。超サイヤ人相手でも勝てると踏んでいたフリーザだったが、指から発射した必殺の光線を次々とかわされてしまう。未だかつて経験したことのない脅威に、絶対的な自信も揺らぎ始め…。

悟空の猛攻に自尊心を傷つけられたフリーザは、ナメック星の破壊を決意。強大なエネルギー波を星の中枢へ撃ちこむ。しかし自爆を恐れパワーを抑制したため、星の爆発まで５分の余地を残してしまう。一方、宇宙船に辿り着いた悟飯は、地球へ戻るためブルマを探しに出発。そして悟空とフリーザの最後の闘いが始まった。

フリーザは30秒で悟空を倒すと豪語し、気を集中し始める。界王様はその隙をついて攻撃するよう悟空に勧めるが、フルパワーのフリーザを倒してクリリンの敵を討つのだと、その言葉を無視。悟空とフリーザの激闘が最高潮を迎え、ナメック星消滅の時は刻一刻と迫ってくる。ブルマは無事に救出できるのか…？

大地が割れ、消滅が迫るナメック星。その頃、地球ではミスター･ポポがドラゴンボールを集めていた。界王様の狙いはフリーザに殺されたナメック星人の復活、と同時にポルンガも復活させること。一方、悟飯たちの脱出まで時間稼ぎの闘いをする悟空だったが、悟飯とブルマが到着した宇宙船に思わぬトラブルが発生してしまう。

ナメック星の消滅まで３分を切った時、地球の神龍によって、フリーザに殺された者が蘇った。ナメック星の最長老も復活し、ポルンガが出現。皆の心に希望の光がさすものの、悟空がフリーザに痛恨の一撃を受けてしまう。父の気が消えたことを感知した悟飯は、引き止めようとするブルマに背を向けて宇宙船を飛び出す！

気をためなおして戻って来た悟空は、フリーザ以外の者のワープをポルンガに頼もうとする界王様に、自分も闘いに決着をつけるためナメック星に残ると宣言する。界王様は悩みぬいた末に了承、その願いはデンデによってポルンガに届けられた。そして消滅寸前のナメック星には悟空とフリーザのみが残された…。

ナメック星から地球にワープした者は、みな喜びに浸っていた。しかし悟空の状況を知り、不安を募らせる。ナメック星が消滅したら、悟空は生き延びることができないからだ。逆にベジータは自分が宇宙一になれると高笑い。悟空とフリーザの死闘は両者一歩も譲らぬまま、ついにタイムリミットまで１分を切り…！

力と力、誇りと誇りが激しくぶつかり合い、相譲らぬ戦いを続ける悟空とフリーザ。その頃地球では、ブルマが悟空の運命に不吉なものを感じていた…。そんなブルマの心配をよそに、悟空は次第にフリーザを圧倒!この世で誰も超えるはずのない自分を超える孫悟空の出現に、フリーザのとった恐るべき行動とは…!?

フリーザはフルパワーの反動によって気が減少、「たかがサイヤ人ごとき」に苦汁を嘗めさせられる。フリーザの渾身の一撃も、もはや悟空には通用しない。悟空の余裕の態度にフリーザは激昂、円盤状の気を放ち悟空を追いつめたかに思えたが、逆に自分の体を切断してしまう。命乞いをして、その命を繋ぎ止めたが…。

ナメック星のドラゴンボールなら、人間を何度も蘇らせることが可能だと知り、悟飯たちは歓喜の声を上げる。これで、クリリンと餃子を再び生き返らせることができるのだ。そしてナメック星では、悟空の圧勝でその死闘に終止符が打たれようとしていた。しかし立ち去る悟空の背後から、フリーザが最後の一撃を…。

フリーザに完全勝利した悟空に、猶予はなかった！ナメック星爆発のタイムリミットが刻一刻と迫っていたからだ。悟空はフリーザの宇宙船で脱出を試

ドラゴンボールを使えば、悟空とクリリンを死んだ場所に蘇らせることは可能だ。しかし、ナメック星が存在しない今、２人が生き返る場所は宇宙空間。２人を蘇らせるという希望は、一瞬にして絶望にかわった。その時、ベジータは２人の魂を地球に呼びよせてから生き返らせればいいと提案。果たして、その結末は…!?、リクームに対し１人で立ち向かう悟空。あまりにも落ち着いているその姿に不安を覚えるクリリンたちだったが、悟空はたった一撃でリクームを倒してしまう。

フリーザ戦から数ヶ月…。地球ではクリリンにガールフレンドができるなど、平穏な日々が続いていた。そんなある日、平和を脅かす不吉な影が天界に迫る。かつて、悟空たちがデッドゾーンに封じたガーリックJr.が復活したのだ。そして神様を小瓶に封じ、人間を魔族に変えるアクアミストを地球に流し始める。

アクアミストを吸うと魔族化し、ガーリックJr.のしもべとなってしまう。天界から地上へと流されたミストは、汚染範囲を広げてカメハウスを包み込み、ブルマやヤムチャたちまでもが魔族化してしまう。運良く吸わずにすんだ悟飯とクリリンは、ミストの効果を消す超神水を探しに天界へ向かうが…。

アクアミストを吸ってから24時間が経過すると、超神水でも元に戻すことはできない。悟飯の窮地に駆けつけたピッコロは、四天王と魔族化したヤムチャたちを１人でくい止め、そのスキに悟飯とクリリンを天界へ向かわせる。しかし、二人を天界で待ち構えていたのは、ヤムチャに噛みつかれて魔族化したピッコロだった。

悟飯によりデッドゾーンに封じられた過去をもつガーリックJr.は、恨みを晴らすため、四天王に悟飯を集中攻撃させ、徹底的にいたぶりつくす。かろうじて攻撃をかわし、致命傷を避ける悟飯だったが、四天王の１人ゾルドが一瞬の隙をつく。その時、自分を犠牲にして悟飯を守ったのはクリリンだった…。

完全にガーリックJr.のしもべとなってしまったのか、情け容赦のないピッコロの猛攻が悟飯を襲う！悟飯は尊敬するピッコロを攻撃することができず、防戦一方。さらに悟飯をかばい、クリリンまでもがピッコロに噛まれて魔族化してしまう。ひとり孤独な闘いを強いられることになった悟飯に、果たして勝機はあるのか？

夜が明ける前に全世界に超神水を流さなければ、アクアミストの効果を消すことはできない。残された時間で超神水を行き渡らせるためには、世界中の気流が集まる天界の底の穴から流すしか方法はない。しかし天界の底に行くためには、先代の神々が眠る墓がある、神仙界という危険な場所を通らなければならない…。

ミスター･ポポの案内で神仙界を訪れた神様は、先代の神々の攻撃を受けながらも、天界の底をめざす。一方、悟飯たちは、魔凶星の影響で何十倍もの力を得たガーリックJr.に苦戦。互角に渡り合っていたピッコロも、突如力が抜け体が半透明になってしまう。一心同体である神様が死ねばピッコロも…神様の身に危険が!?

悟飯はガーリックJr.に攻撃を仕掛けるが、永遠の命を得ている者を倒すことはできない。だが、先代の神々から攻撃を受けていた神様は、ミスター･ポポに超神水を託して天界の底から流させる。人々を魔族にし、世界を支配する計画を潰されたガーリックJr.は激怒。デッドゾーンを再び発生させる…。

デッドゾーンに対し、シールドを張ってピッコロとクリリンを守ろうとする悟飯。先代の神々から解放された神様とミスター･ポポを吸い込もうと、ガーリックJr.はデッドゾーンのパワーを上げる。だがその時、ピッコロとクリリンがシールドを飛び出した。その瞬間にできた一瞬の隙をつき、悟飯は全力で魔凶星を狙う！

平和に戻った世界。マロンの買い物につき合わされていたクリリンは、ウェディングドレスに憧れるマロンの姿を見て、プロポーズを決意する。1000歳の誕生日を迎えたウミガメから、伝説の真珠“マーメイドの涙”の話を聞いた彼は、悟飯と共に海底に向かう。しかし、マーメイドの涙は魚たちの大切な宝物だった…。みるも、宇宙船は故障。フリーザを倒し宇宙最強の戦士となった悟空は為すすべもなく、銀河に一筋の閃光を放ったナメック星とともに消滅してしまうのだった…。

チチは悟飯に周災悪という家庭教師をつける。周は悟飯に体罰を与え、反抗的な態度を帰ってこない悟空のせいだと罵る。一方、宇宙から帰還したベジータは、ブルマに悟空が地球に戻る日まで一緒に暮らすよう提案され、渋々承諾…。そんなある日、悟飯は突然強大な力を感じて家を飛び出した。その気の正体とは…!?

悟飯をはじめ、巨大な気のもとに集結した戦士たちは、その気の正体がフリーザと知って絶望する…。着陸した宇宙船から現れたフリーザとコルド大王。サイボーグ化して生き長らえたフリーザは悟空への恨みを晴らすため、地球人を皆殺しにせよと部下に命令する。だが、彼らの前に突如謎の少年が立ち塞がった!

謎の少年は、フリーザの部下を次々と倒していく。余裕を見せるフリーザ親子に対し「超サイヤ人は孫悟空さんだけじゃない」と宣言するや、みずから超サイヤ人に変身した。その姿に悟空の姿を思い浮かべたフリーザは、怒りにまかせて、ナメック星を滅ぼした時の10倍ものエネルギーで攻撃を仕掛けるのだが…?

フリーザを一刀両断した謎の少年。その絶対的な強さに驚愕する悟飯たち。命乞いをするコルド大王にも冷静にとどめを刺した少年は、悟飯たちに悟空を迎えに行こうと誘う。戦闘時とはうって変わった穏やかな態度から少年を信用する一同。そして数時間後、少年の言葉どおり、悟空の乗ったカプセルが到着した…。

地球に到着した悟空に、少年は自分の正体を打ち明ける。トランクスと名のるその少年はベジータの息子で、3年後に現れる人造人間のことを警告するため約20年後の未来からやって来たというのだ。さらにトランクスは、自分の乗って来たタイムマシンは母親が作ったものだとも語る。悟空も驚くその母親の正体は…?

ナメック星爆発の瞬間、ギニュー特戦隊の乗って来たカプセルで脱出した悟空。不時着したヤードラット星の人々に救出され、新たな技を習得した彼は、それを披露する。未来を変えるため、3年後に現地での集合を誓い合う戦士たち。そんな中ブルマは、人造人間が作られる前にドクター･ゲロを倒すことを提案する。

戦士たちの修行は順調に続いていた。超サイヤ人となった悟空との力の差に憤るベジータは、ブリーフ博士に300Ｇの重力室を作らせ、修行を開始。激しい特訓の末に重力室を破壊し、大ケガを負って寝込んでしまった彼は、父と過ごした子供の頃の夢を見て、王子のプライドを再認識。悟空を超えるため、闘志を燃やす。

買い物帰りの山道で猪に襲われたチチは、楽しそうにエアカーを飛ばす夫婦の姿にフラストレーションを爆発させる!悟空とピッコロに免許を取れと命令するが、教習所でも意地を張り合う2人は、デッドヒートを繰り広げる始末…。そんなある日、雨の路上教習中に、幼稚園のバスが崖崩れに巻き込まれるのを目撃…。

修行を終え、約束の地点に集結した戦士。だが、トランクスの予告した10時間を過ぎても敵の気配は感じられない。その時、仙豆を届けて去っていったヤジロべーのスカイカーが突然爆発!ついに出現した人造人間たちは街に降りる。戦士たちは気配のない敵を探すのに戸惑うが、ついにヤムチャが人造人間を発見する…。

人造人間と対峙した悟空は、ヤムチャを傷つけ、無慈悲に街を破壊しつくす彼らの行為に激昂!闘いの場を他所に移し決着をつけようとする。そんな悟空に対し人造人間は「ドクター･ゲロは、悟空のこれまでの闘いを偵察したうえで自分たちを製造したため、自分らの実力は悟空を上回っている」と告げるが…。

超サイヤ人に変身した悟空の力は、人造人間たちの予想を遥かに上回っていた!あまりの強さに、驚きを隠せない人造人間たち。しかしピッコロは、超サイヤ人となった悟空のパワーが、以前ほどではないことに疑問と不安を抱く。そしてピッコロが懸念したとおり、闘いの趨勢は徐々に人造人間へと傾いていくのだった。

劣勢に立たされた悟空は仙豆を食べるが、一向に回復する気配がない。それもそのはず、悟空は心臓病に冒されていたのだ。それを知ったピッコロは悟空を助けに入るが、20号に妨害されてしまう。絶体絶命かと思われたその時、ベジータが現れ悟空を救出。だがピッコロは、ベジータでは19号を倒せないと危惧する…。

超サイヤ人として覚醒したベジータは19号を圧倒、たちまち破壊してみせる!その実力を目のあたりにした20号は、ベジータには勝てないと悟り逃走を始めた。しかし、追ってくるピッコロたちを目にした時、彼はある計画を画策する。ピッコロたちのエネルギーを吸収して自分の力にし、ベジータを倒そうというのだ。

気配がないという利点を活かし、ピッコロを襲撃してエネルギーを吸収する20号。しかし、悟飯のおかげで窮地を脱したピッコロは、逆に20号を圧倒していった。そこへ、以前に約束したとおりトランクスも未来から助力にかけつける。だが、19号や20号を見たトランクスは、驚愕の事実をベジータたちに告げたのだ…!!

ピッコロに追いつめられた20号だが、様子を見にやって来たブルマたちを襲撃し、その隙に研究所へと逃げ出す。残されたベジータたちは、トランクスとブルマから、20号がドクター･ゲロであることや、彼ら以外にも人造人間がいることを告げられる。それを知ったベジータは、嬉々としてドクター･ゲロの後を追うが…。

あくまでも人造人間17号＆18号との闘いを望むベジータに対し、その復活を阻止するよう説得をするトランクス。一方、ピッコロとクリリン、天津飯の3人は、手分けしてドクター･ゲロの研究所の捜索にあたる。だが、ドクター･ゲロの方がひと足早く研究所に戻り、ついに17号と18号を目覚めさせてしまうのだった!

17号と18号は、ドクター･ゲロを破壊し、残っていた人造人間16号をも目覚めさせてしまう。恐れていた事態の到来に、恐怖するトランクス。しかし3体の人造人間は、トランクスたちには目もくれず悟空の家を目指すのだった。そのことに自尊心を傷つけられたベジータは、トランクスの制止も聞かず、彼らの後を追う!

トランクスやピッコロの助力を頑なに拒むベジータは、単身18号に勝負を挑み、ほぼ互角の攻防をくり広げる。想像をはるかに越えるベジータの実力に、トランクスはもちろんのこと、さすがの17号たちも驚きを隠せない。しかし、無尽蔵のスタミナを有する18号に対し、ベジータの動きは下降線を辿る一方。そして…!

窮地のベジータを救出するため、18号に飛びかかるトランクス!だが、トランクスの攻撃は、軽く18号にかわされてしまう。ピッコロたちも、ベジータたちの救出に飛び出すが、今度は17号が18号のサポートにかけつけ、ピッコロたちを一蹴。そしてついに、ベジータも18号に完膚なきまでに叩きのめされてしまい…。

仙豆によって体力を回復したピッコロたちだが、人造人間のあまりの強さに愕然とする。プライドをズタズタにされたベジータは、復讐の誓いを胸にその場を立ち去ってしまった。一方ピッコロは、悟空を安全な場所に移すようクリリンに伝えると、自身はとある決意を固め、クリリンたちと別行動をとるのだった。

人造人間たちはトラックを強奪し、一路悟空の家を目指す。人造人間たちよりも早く悟空の家に到着したクリリンとトランクスは、意識のない悟空を飛行艇に乗せてカメハウスへと急行する。一方、人造人間に敗れたピッコロはさらなるパワーアップのため、神様と融合すべく天界におもむく。だが神様の反応は…?

トランクスは「パラレルワールド」の仕組みに隠された事実に気付く。たとえ悟空たちが人造人間を倒したとしても、トランクスのいた悲惨な未来は変わらないのだ。未来のブルマは、もうひとつの平和な未来があってもいいと考え、タイムマシンを作ったのだ。しかし、もう一台のタイムマシンの存在が明らかとなり…。

謎のタイムマシンの存在を知ったトランクスたちは、とある場所でその発見に成功する。トランクスより1年も早く現代に到着していた、古びたタイムマシンの中には不気味な卵の殻が。さらにその近くには、奇妙な生物の抜け殻が発見された。言い知れぬ恐怖に震えるトランクスたち。このタイムマシンの持ち主は…!?

ジンジャータウンという町の人々が、忽然と姿を消してしまう。町はタイムマシンの発見現場からほど近い場所にあった。天界からこの様子を見ていた神様は町を襲った怪物の姿を目の当たりにし、ピッコロとの融合を決意する。融合の末ついに誕生した新ピッコロは、ジンジャータウンに急行し、怪物を発見する。

悟空やフリーザとそっくりな気を持つ怪物･セルが、ピッコロの前に現れた。未知の敵と対峙するピッコロ。セルはそれをあざ笑うかのように、ピッコロの必殺技である魔貫光殺砲を繰り出した。動揺を隠せないピッコロにとどめを刺すべく、つづいてセルは、かめはめ波のポーズをとる。恐るべき怪物の正体は一体…?

悟空の必殺技であるかめはめ波を、いともたやすく放つセル。ピッコロは間一髪で避けたものの、セルにつかまり左腕の生体エキスを吸収されてしまう。冥土のみやげにと自らの生い立ちを語るセルだったが、それは正体を聞き出すためのピッコロの罠であった。すぐさま左腕を再生したピッコロは、再びセルに挑む!

セルを倒すべくパワーを全開にするピッコロのもとに、クリリン、トランクスが合流。未熟な体で3人に勝つことは難しいと悟ったセルは、ひとまずその場から逃亡する。やがてベジータもピッコロたちの前に現れるが、セルを逃がしたピッコロへの怒りを露にする。気を消し移動するセルを見つけることはできるのか!?

自分たちの状況が変わらないことを知りながらも、生まれたばかりのセルを消し去るため、未来の世界へと向かったクリリンとトランクス。2人はドクター･ゲロの研究所で幼体のセルを発見し、建物もろとも破壊する。その際、研究所で手に入れた17号の設計図を元に、ブルマは人造人間たちの弱点を調べ始める。

生体エキスを求め、人々を襲い続けるセルがバジルタウンに現れた。偶然通りかかったクリリンがセルに挑むも、返り討ちにあってしまう。絶体絶命かと思われたその時、ピッコロと天津飯がクリリンを救出!そしてカメハウスではついに悟空が眠りからさめ、超サイヤ人をさらに超えるという一大決心をしていた。

悟空、悟飯、ベジータ、トランクスの4人は、1日で1年分の時が過ぎる、精神と時の部屋での修行を決める。圧倒的な“無”の空間を初めて体感し、不安を覚えるトランクス。一方、人造人間たちは悟空を追い、悟空の家からカメハウスへと移動する。そこで出迎えたピッコロたちと、再び一戦交えることになるが…。

悟空を探し、カメハウスへと現れた人造人間16号、17号、18号の三体。しかし、神の神殿で修行中の悟空はもちろんいない。神と合体しパワーアップしたピッコロは人造人間を誘い出し、無人島で17号と闘い始めるのだった。17号と戦うピッコロの強大なパワーが、人造人間を探すセルに感知されてしまう…!!

地球を救う一筋の希望、人造人間の緊急停止コントローラーをブルマは完成させていた。カメハウスへと急ぐブルマ。いまだ続いているピッコロと17号の想像を絶する闘いは、徐々に17号有利へと傾いていた。パワーを使う度にどんどんスタミナを消費してゆくピッコロに対し、人造人間は全く疲れを知らないのだ!!

ついに、闘いを続ける17号とピッコロの前にセルが姿を現した。セルの圧倒的なパワーを前に、立ちすくむピッコロ…。17号、18号を急襲して完全体になるため、セルは彼らに襲いかかる!!完全体になられてしまうと、手の打ちようがない！ピッコロは決死の覚悟でセルに挑むが、ダメージすら与えることができない…。

ピッコロを難なく倒したセルは、17号を吸収せんと容赦ない攻撃を始める。セルの超パワーの前には、17号のパワーも全く歯が立たない。大きく口を開けた不気味な尾に吸収されるかと思われた瞬間、これまでは、闘うそぶりを見せなかった16号が動いた。「闘う時がきたのだ…」と、セルを阻止すべく立ち上がった！

16号の必殺技ヘルズフラッシュがセルに炸裂。セルと互角のそのパワーに、誰もが希望を抱き始める。だが隙をつき、セルは17号の吸収に成功！ついに変態し始めるセル。18号を連れ、その場を逃げ出そうとする16号。だがパワーアップを果たしたセルが16号たちに迫る！とうとう18号も吸収されてしまうのか!?

後ろに迫るセルを足止めし、18号を逃がすため、命の危険も顧みず天津飯は新気功砲を連発する。なんとか18号と16号を逃がすことには成功するが、天津飯の命はもはや風前の灯火。そして、倒れた天津飯をセルが光弾で消し去ろうとした、まさにその時、神の神殿から瞬間移動で現れた悟空がセルの前に立ちはだかる！

ついに精神と時の部屋での修行を終えた、ベジータとトランクス親子。彼らはすぐさま、セルを倒すために神の神殿から飛び立った!一方、セルの猛攻から身を隠す16号と18号のもとへ、セルの魔の手が近づいていく…。そして神の神殿では、悟空と悟飯が、精神と時の部屋での修行をスタートさせようとしていた。

18号を吸収して完全体となるため、無人島に隠れている16号と18号に迫るセル。ついにセルは完全体になってしまうのか、と思われてその時、パワーアップを果たしたベジータが到着！金色に輝く超サイヤ人へと変身したベジータは、セルに対し容赦ない攻撃を見舞うのだった。ベジータの超パワーが、セルを圧倒!!

精神と時の部屋での修行により、ベジータは第2形態となったセルをも上回るほどのパワーを手にしていた。パワー全開で戦うセルも、パワーアップした「超ベジータ」の前では子ども扱い。そして、ブルマが作った人造人間緊急停止コントローラーを持つクリリンが、セルとベジータが対決する島へと到着するのだった。

セルが全力を込めた光弾も、超ベジータにはかすり傷ひとつ負わすことはできない。トランクス、クリリン、16号、18号が見守るなか、セルを追いつめていくベジータ。歴然たる力の差にセルを殺す価値もない存在とベジータが感じ始めたその時、挑発するようにセルが放つ危険な誘惑。「完全体になりさえすれば!!」

完全体になることができれば負けないというセルの言葉に、ベジータのプライドが反応する。より強いものと闘いたいというサイヤ人の本能によりベジータは完全体セルとの闘いを選んだのだ。そしてトランクスの制止も聞かず、セルを逃がしてしまう。ベジータの猛攻から逃れたセルの視界に、探し求めていた18号が！

セルは完全体へと進化するために、18号に襲いかかる。それを阻止しようとするトランクスだったが、その前に立ちはだかったのはなんとベジータだった！完全体へのパワーアップをくい止めるため、トランクスは父ベジータへと攻撃を加える。その隙をついたセルは太陽拳を目くらましに、ついに18号を吸収する!! セルは完全体へと進化するために、18号に襲いかかる。それを阻止しようとするトランクスだったが、その前に立ちはだかったのはなんとベジータだった！完全体へのパワーアップをくい止めるため、トランクスは父ベジータへと攻撃を加える。その隙をついたセルは太陽拳を目くらましに、ついに18号を吸収する!!

トランクスたちの隙をつき18号を吸収したセルは、巨大な光のたまに包まれていく。カメハウスや神の神殿、全世界にその衝撃が伝わる。爆煙の中から現れた完全体セルに対し、クリリンとトランクスは攻撃を仕掛けるが…!?その頃、精神と時の部屋で修行を続けていた悟飯が、苦労の末に超サイヤ人への変身に成功する！

完全体セルの一撃で、クリリンはいとも簡単に倒されてしまった。そしてついに超ベジータがセルに挑みかかる。セルに対して、強烈な攻撃を連発するベジータ！だがセルは、全く本気を出していなかったのだ…。ベジータは全力を込めたキックをセルに見舞うが、セルにダメージを与えることはできないのだった。

セルの本気の一撃によって、大ダメージを受けるベジータ！セルの実力に驚愕するベジータだったが、全身全霊を込めたファイナルフラッシュにより、セルの上半身を吹き飛ばす！だが、たやすく再生したセルの攻撃により、ベジータは失神。父に代わり、ついにパワーを解放したトランクスがセルに挑みかかる!!

髪の毛が逆立ち、全身もひとまわり大きくなった超トランクスが、セルとの闘いをスタートさせた。だが、トランクスはセルの攻撃を受け続けているばかり…。それは、セルを自分にひきつけクリリンがベジータを救出する作戦だったのだ。クリリンが無事逃げたことを確認すると、トランクスはさらに気を高めていく！

機を上昇させ、全身の筋肉を増大させていくトランクスは、セルと対峙しながら地獄のような未来のことを思い出していた。人間を無差別に襲う17号と18号。悟飯らZ戦士は次々殺され、残った戦士はトランクスだけとなってしまった。そんな未来がくるのを防ぐためにも、トランクスはセルを倒さなければならない！

超トランクスはセルを上回る期で、攻撃を始める。だが余裕の表情で、それを交わしていくセル。パワーばかりをアップさせたトランクスは、セルのスピードについていけなくなっていたのだ。セルにそのことを指摘され、敗北を認めてしまうトランクス…。だが究極の闘いを楽しむため、セルは武道会の開催を提案する。

10日後に、セルと武道家たちが闘う新天下一武道科意を開催することを宣言し、セルはトランクスの元から飛び去った。それを聞いていた人造人間16号は、セルゲームへの参加を希望。カプセルコーポレーションで身体の修理をすることになる。そしてセルは、誰もいない荒野に武道会用の武舞台を作りあげるのだった。

テレビ局を襲撃したセルは、全世界へ向けてセルゲームの開催を宣言する放送を始めた。挑戦者たちとセルが闘い、誰もセルを倒すことができなかったら人間すべてを殺すというのだ!ベジータとトランクスはセルゲームに勝つため、悟空たちの後に、再び精神と時の部屋に入り修行をすることを決意するのだった。

全世界はセルの放送によりパニックに陥る。そんななか、セルゲームに向け戦士たちの準備が始まった。16号の修理をするブルマ。神の神殿で、悟空親子を待つベジータ親子。そしてついに、悟空と悟飯が精神と時の部屋での修行を終える！だがセルゲーム開催を知った悟空は、残りの時間を下界で過ごすと言うのだった。

まだ1日入ることができるのに、精神と時の部屋での修行をしないと言う悟空を、不思議な顔で見送るベジータとトランクス。悟空は悟飯と共に、チチと牛魔王の待つ我が家に帰るのだった。残りの時間を修行せずに過ごすという悟空を不思議がるクリリンをしり目に、悟空と悟飯はのんびり釣りなどの遊びに明け暮れる。

買い物の途中で、チャズケ村の老人ラオと少女ライムに出会った悟飯、チャズケ村では顔役のバーボンが村人を強制労働させて、セルからの避難ドームを作らせていた。バーボンに逆らうラオの前に殺し屋桃白白が現れる。しかし、悟飯が悟空の息子だと知り桃白白は逃走。バーボンの野望は、悟飯の前に潰えるのだった。

セルゲームまであと8日。精神と時の部屋で11歳になっていた悟飯の誕生会を開こうとする父は、アルバムを発見し悟飯と名づけた日を思い出していた。悟空もまた、生まれたばかりの悟飯が自らの危機をすさまじい気で回避していたことを思い出す。そして夜になり、牛魔王やクリリンも参加して悟飯の誕生会が開かれた。

修行を終えたピッコロと入れ替わりに、精神と時の部屋へ入ってゆくベジータ。セルゲームに臨む戦士たちの準備は着々と進んでいた。その一方で、王立防衛軍はセルに総攻撃をかけるが、逆に全滅してしまう。それを見た悟空はセルに殺された人を生き返らせるため、新しい神様によるドラゴンボール復活を思いつく。

界王の協力で、ナメック星人の気を捉えることができた悟空は、新しいナメック星へ瞬間移動。最長老の推薦で、デンデを地球の神様として連れ帰った。優秀な龍族、デンデの力によりドラゴンボールを復活させることに成功!その頃地上では、格闘技世界チャンピオンのサタンが、セルゲームへの参加を宣言していた。

ベジータが修行を終え、サタンがＴＶでセルを倒すことを宣言する中、復活したドラゴンボールをドラゴンレーダーで探し始める悟空。なんと2つのドラゴンボールを、悟空より先に手にしていたのは桃白白だった。だが桃白白は悟空の出現に驚き、またもすぐ降参。ドラゴンボールは7つすべてが悟空の手に集まった。

ついにセルゲーム開催の日がやってきた。会場に真っ先に到着したのは、サタンとTVの中継スタッフ。サタンがセルを挑発するなか、悟空、悟飯を始めとするＺ戦士が続々集結!まず悟空が闘おうとするが、未だにセルの実力に気付いていないサタンに止められてしまう。最初に、サタンが闘うというのだが…!?

セルの攻撃をトリックだと信じているサタンは闘う気満々。だがそのとき、上空にヘリコプターが飛来し、サタンの弟子、ピロシキとカロニーが飛び降りてきた！ 師匠であるサタンの前に、自分たちが闘おうというのだ･･･。セルに簡単にあしらわれる2人。ついにサタンも闘いを挑むが、あっさり払い飛ばされてしまう…。

いよいよZ戦士が登場し、セルゲーム本番開始。なんと悟空は、最初の挑戦者を志願。セルとの闘いが始まった。瞬時に移動し壮絶な闘いを繰り広げる2人の姿を、サタンはトリックだと言い放つ…!! だが、まだまだ悟空もセルも本気で闘ってはいなかったのだ。そして、ついに悟空が100％の力でセルに挑みかかる！

セルの要求により、フルパワーで挑む悟空。セルも、100％の力で応戦。巨大な力と力が真っ向から激突する。天津飯の四身の拳やピッコロの魔貫光殺砲などで攻撃するセル。さらに、超パワーのかめはめ波で悟空を地球もろとも吹き飛ばそうとする。危険を察知した悟空は上空に瞬間移動。自分を標的にさせて地球を救う。

互角の戦いを続ける悟空とセル。場外負けなど無意味だというセルは、武舞台を吹き飛ばしてしまう。倒すか倒されるかの本気の闘いの幕が切っておとされた。セルに向かい、上空から超特大かめはめ波を撃つと見せかけた悟空は、発射直前にセルの前へと瞬間移動!特大かめはめ波が、至近距離からセルを直撃する!!

悟空、渾身のかめはめ波が、セルの上半身を吹き飛ばした!だが上半身が消滅したにも関わらず、細胞を再生させ復活するセル!死闘を再開する悟空だったが、まだまだ気も十分で余裕のあるセルに対し、全力で闘い続けた悟空には徐々に疲れが見え始めていた。そして悟空は、突如セルに対して降参を宣言する!!

降参してしまった悟空に、驚くZ戦士たち。だが悟空は、セルより強い戦士として、次の挑戦者に悟飯を指名する。セルとの闘いをためらう悟飯。信じられないことに悟空はセルに仙豆を与え、そのパワーを回復させる。ついに、パワーを完全回復したセルと、悟空が最強と認めた悟飯との地球を賭けた決戦が始まる！

セルの攻撃の前に、手を出さずに耐え続ける悟飯。悟飯は闘いの最中、セルに対し降参を勧める。自分の秘めたパワーによってお前を殺したくない、そうセルを説得する悟飯に対し、セルは容赦ない攻撃を加え続ける。そしてついに、悟飯はセルに対して一撃を放つ。その攻撃の威力に、セルは不気味な笑いを浮かべた…。

セルがいくら攻め続けても、悟飯は本気で闘おうとはしない。セルの虚をついた16号が、セルをはがい締めにし自爆しようとした。だが自爆装置はブルマに取り除かれていた…。16号を破壊したセルは、戦意のない悟飯が闘わざるを得なくするため、セルジュニアを生み出し闘いを見守るZ戦士たちを襲わせるのだった！

セルジュニアの猛攻に苦しめられるZ戦士たち。ただ立ちつくすのみの悟飯。頭だけで転がっていた16号の頼みで、サタンは16号を悟飯の前に投げた。「悟飯、俺の好きだった自然や動物たちを守ってやってくれ。」そう語りかける16号は無惨にもセルに踏みつぶされてしまう。その瞬間、悟飯の怒りは限界を超えた！

セルの思惑通り、悟飯のパワーが臨界点に!そして悟飯はセルから仙豆を奪い、Z戦士たちのもとに向かうと、悟空ですら苦戦したセルジュニアを一撃で葬り去ってしまう。次々とセルジュニアを倒し、全滅させた悟飯を満足そうに見守る悟空。対照的にセルは怒りの表情で悟飯を見ていた。いよいよ最終決戦が始まる！

悟飯とセルが、フルパワーで激突する最後の闘いが始まった！ 悟飯のスピードについてゆけず、攻撃をすべて避けられてしまうセル。焦ったセルはフルパワーのパンチを悟飯に見舞う。だが悟飯はセルのパンチに耐えてみせ、逆にパンチを叩き込んだ…。たった2発のパンチで、セルは地面にひざまずくのだった！

セルを圧倒し始める悟飯。セルの多彩な技も、悟飯には全く通じない。ついにセルは、地球をも破壊するほどの超かめはめ波を上空から悟飯に撃つ!だが、悟飯の超かめはめ波に押し返されてしまう！ 手足を失い再生したセルだったが、絶え間ない悟飯の猛攻に耐えきれず、ついに口から18号を吐き出してしまう…。

18号を吐き出し、セルは第2形態へと戻ってしまった。悟飯には敵わないと悟ったセルは、身体を膨らませ、地球と全人類を道連れにしようととする!全員が死を覚悟した瞬間、悟空が動いた！「バイバイ、みんな。」悟空は自爆するセルと共に界王星へと瞬間移動。悟空の犠牲により、地球は救われたかに見えた。

The nightmare continues! Cell explodes, but a particle of his nucleus survives the blast, providing all the android needs to regenerate himself! Restored to his ultimate form, Cell returns to the Earth more powerful than ever!

完全体を遥かに上回るパワーに、セル自身も驚き、喜んでいた。セルはすべてに終止符を打つために、太陽系ごと吹き飛ばせるほどの気をため、超巨大かめはめ波を撃とうとする。すさまじい気に圧倒される悟飯の頭に、界王の助けを借りた悟空の声が響く。その声に励まされた悟飯は、超かめはめ波で対抗するのだった。

セルと悟飯が同時に放った超巨大かめはめ波が激しくぶつかり合う!パワーがほぼ互角のため、2人の間でせめぎあうエネルギー。悟空の励ましに加え、ベジータやピッコロ、天津飯らZ戦士の加勢を受け、悟飯はすべての力を絞り出し、ついにセルを消滅させる!その隣には、まるで悟空がいるかのようだった。

闘いはついに終焉を迎えた。力を出し尽くし立つこともできない悟飯だったが、その笑顔には満足そうな笑みが浮かぶ。そしてZ戦士たちは、セルに殺された人々を復活させるため神の神殿へ向かう。神龍の力で人々は復活。だが、悟空は、あの世で修行するために、復活させないで欲しいというメッセージを送ってきた。

悟空は閻魔大王のはからいにより、肉体を持ったままあの世に行き、修行をするというのだった。神龍の2つの目の願いで、クリリンの望みを叶え、17号と18号の体内にある爆弾を消し去った。その翌日、未来へ帰るトランクスを見送るため、カプセルコーポレーションに悟飯、クリリン、ヤムチャらZ戦士が集まった。

人造人間に蹂躙される未来に戻ったトランクスは、母ブルマと再会、そして17号と18号を難なく撃破する。かつては適わなかった相手であったが、過去における修行で、とてつもなくパワーアップしていたトランクスの敵ではなかったのだ。数ヵ月後、トランクスはタイムマシンを狙うセルをも簡単に消滅させるのだった。

あの世で一番強いという大界王に修行してもらうため、界王と共に大界王星へとやってきた悟空は、大界王の城の前で、西の銀河の達人･パイクーハンと出会う。あの世の武道家のレベルの高さを見た悟空は、やる気十分。大界王の依頼で、地獄で暴れているセルを退治に行くパイクーハンと共に、悟空は地獄へと向かう。

東西南北の銀河の強者たちが集まる、あの世一武道会が開催されることとなった。優勝者は、大界王の修行が受けられると聞いた語空もなんとか出場

1回戦を勝ち抜いた悟空の次の相手は、東の銀河代表のアークア。弱そうに見えたアークアだが、どこでも水中にしてしまう超能力を持っていた!武舞台の上を覆ったに水の中で闘うことになり、魚のような動きのアークアに苦戦する悟空。一方、パイクーハンは、北の銀河代表のオリブーを倒し、順調に勝ち進んでいた。

悟空は西の銀河代表のマーライコーを倒し、決勝へと駒を進める。決勝戦の対戦相手は、やはりパイクーハン。北の界王と西の界王の声援を受け、悟空とパイクーハンの決勝戦が始まった!お互いの実力を探りつつ闘う2人。ついに悟空は超サイヤ人となり、パイクーハンも道着を脱ぎ捨て、本気の決勝戦がスタートする!!

超サイヤ人悟空と、重い道着を脱ぎ捨て身軽になったパイクーハンは、互角に闘いを続けていた。闘いの場は宇宙にまで広がり、両者まったく譲らず宇宙の果てまで必殺技の応酬が続いた。ついに悟空のかめはめ波がパイクーハンを捕らえ、闘いに決着をつけた!しかし、大界王の判定により、2人とも場外で失格に…。残された核から再生し、パワーアップして復活したセルは、地球に戻り、トランクスをたった一撃で倒す。最愛の息子の死に我を忘れ、セルに襲いかかるベジータだったが、難なくあしらわれる。死を覚悟したベジータを悟飯が救出するが、左腕を負傷…。それを見たセルは、チャンスとばかりに容赦なく襲いかかる！

セルとの死闘から7年が過ぎ、悟飯も高校に入学。サタンシティの学校に通うことに。だが、正義感あふれる悟飯は、登校途中に超サイヤ人の姿で銀行強盗を退治してしまい「金色の戦士」は街の噂になってしまう。さらに、普通の高校生として学生生活を送りたいとの思いもむなしく、うっかり体育の授業で大活躍…。

なんとかして自分の正体を隠したまま正義のヒーローを続けたい悟飯は、ブルマに相談。トランクスと遊んでいる間に作ってもらった変身アイテムで、ヒーローに変身できるようになった悟飯は大喜び!さっそくバスジャック事件を解決し、とっさに「グレートサイヤマン」と名乗った悟飯の、ヒーロー･ライフが始まる。

グレートサイヤマンの正体を、エンジェラという少女に見られてしまった!?秘密をバラすと言われ、仕方なく彼女とデートをする悟飯。だが、初デートに悪戦苦闘。さらに、デート中も事件が発生する!エンジェラの目を盗み、グレートサイヤマンに変身、見事に事件を解決した悟飯。実はエンジェラが見たのは…。

悪党グループ･レッドシャーク団が起こした騒ぎに駆けつけたビーデルは、ボスと闘うことになってしまう。苦戦するビーデルを助けに行きたい悟飯だが、なかなか授業を抜け出せずにイライラ…。なんと悟飯の貧乏ゆすりで地震が起き、その隙に悟飯はビーデルのもとへ駆けつける。しかし、その時すでにビーデルは…。

怪獣トトの子供チビが、サーカス団に捕まり見せ物にされてしまった。悟飯はグレートサイヤマンに変身しチビを助け出すが、泥棒として追われてしまう。チビを奪い返そうとビーデルが登場、グレートサイヤマンこと悟飯は大ピンチに!誤解も解け、一件落着かと思われたその瞬間、グレートサイヤマンの正体が…!

グレートサイヤマンの正体を知ったビーデルは、一緒に天下一武道会へ参加することを約束させる。それを聞いたベジータも、武道会参加を表明。さらに悟空も、あの世から1日だけ戻ってきて、参加するという!悟空との再会を喜ぶ悟飯はクリリンやピッコロにも参加を勧め、大会へ向け久しぶりの修行を開始する。

あの世では悟空、地球ではベジータたちZ戦士が修行に励み、悟飯は弟の悟天と一緒に修行していた。まだまだ幼い悟天だが、悟飯の知らない間に、なんと超サイヤ人に変身できるようになっていた…。そこにビーデルが突然押しかけてきて、約束通り空を飛ぶ方法を教えることに…。自分の修行ができず焦る悟飯…。

ビーデル、そして超サイヤ人にはなれるが空は飛べない悟天に、舞空術を教えなければならず、悟飯の修行は全く進まない。その頃、カプセルコーポレーションで特訓中のベジータ目の前で、トランクスが超サイヤ人に変身!その潜在能力に高さに驚くベジータ。天下一武道会は、もうすぐそこまで近づいていた。

ビーデルは、ようやく舞空術をマスター。そして、天下一武道会開催の日がやってきた。にぎやかな会場に、悟飯、ピッコロ、ベジータらZ戦士たちが、続々と集まってくる。懐かしい仲間との再会を喜ぶみんなのもとへ、頭の上に「わっか」をつけたまま、占いパパに連れられた悟空が1日だけあの世から帰ってきた!

High school jock, Sharpner, discovers his crush, Videl, has her heart set on the mysterious Great Saiyaman! Refusing to be replaced, Sharpner vows to ruin the caped fighter by unmasking his true identity and capturing it on film!

大人の部に先がけて、トランクスと悟天も参加している天下一武道会少年の部がいよいよスタート。だがその前に、とっておきのイベントが用意されていた。それは、サタンがセルを倒したシーンを再現した映画だった。大興奮する観客たち。あまりのお粗末さに、あきれるＺ戦士…。そしてトランクスの試合が始まった。

トランクスに続いて、今度は悟天が登場。ちょっぴり緊張する悟天だが、トランクスと同じようにあっさりと勝利。当然のことだが、2人とも順調に勝ち進み、決勝戦は、トランクスと悟天の対決となった。ついにスタートした決勝戦で、子供とは思えないすさまじい闘いを繰り広げる2人に、観客たちは驚愕する…!

少年の部優勝を賭けた、トランクスと悟天の闘いは続く。気で攻撃するトランクスに、悟天もかめはめ波ならぬ「かめかめ波」で対抗!闘いに熱中した悟天とトランクスは、ついに超サイヤ人に変身!セルとの闘いで見た金色の戦士に似た姿に、サタンは驚く。激しいバトルは、ほんのわずかの差が勝敗を分けた…。

少年の部優勝者のトランクスは、エキシビョンマッチとしてサタンと闘うことに!だが、決勝戦での闘いぶりを見たサタンは、トランクスにビビり、軽く殴らせてうまく負けようとするが、トランクスの「軽い」一撃がもろに顔面にヒット!その頃、予選を勝ち抜いた悟空たちは、謎の選手シンとキビトに出会う。

子供の部は終了したが、本当は大人の部で闘いたかったトランクスと悟天は、マイティマスクを襲撃。肩車して奪ったマスクをかぶり、こっそり大人の部に出場する。トーナメントのくじ引きで互いに顔を合わせる選手たち。シンにスポポビッチ…、いわくありげな出場者が集まった天下一武道会大人の部、ついに開催!

大人の部、第1試合はクリリン対プンター。観客たちは、巨体を誇るプンターの勝利を確信したが、クリリンは余裕の一撃で勝負を決める。続く第2試合、ピッコロの対戦相手は、謎の男シン。神と融合したものだけにわかる直感で正体を察したピッコロは、闘いが始まらないうちに自ら棄権してしまう。シンの正体は!?

シンが界王神であると知り、驚愕するピッコロ。そして第3試合は、ビーデル対スポポビッチ。彼は、前回の大会でサタンに敗れた時とは、性格だけでなく、強さまで別人のように変わっていた。ビーデルの猛攻撃も効果がなく、何度でも立ち上がってくる…。焦ったビーデルは、スポポビッチの首を折ってしまった!

首が折れても闘い続けるスポポビッチに、さらに攻撃を続けるビーデルだが、倒れる素振りもない。疲れが出始めたビーデルを、スポポビッチの容赦ない攻撃が襲う!全く抵抗できない相手に容赦なく攻撃を続ける非道な闘いを、超サイヤ人となった悟飯が止めようとしたその瞬間! スポポビッチの仲間ヤムーが…。

大怪我をした娘を心配するサタンのもとに悟飯が現れ、ビーデルに仙豆を与えて回復させる。そして第4回戦を闘うために急いで武舞台に向かった悟飯だが、グレートサイヤマンの正体がバレてしまう。クラスメートの声援のなかで、悟飯とキビトの闘いがスタート。激しい闘いのなかで、キビトが悟飯の耳元で囁く…。

キビトに言われた通りに超サイヤ人となった悟飯を、ヤムーとスポポビッチが襲う!界王神に金縛りをかけられて動けなくなった悟飯に、2人は謎の器具を突き刺し、悟飯のエネルギーを吸収して逃亡。力の抜けた様子で武舞台に横たわる悟飯。なぜ界王神は、悟飯を襲わせたのか?そして、2人の行動の目的は…!?