KANAEシステムは、かつてコウキとアスミの母・香苗が設計したAIがベースとなっていた。過去、そのAIを搭載した車がゼロスと黒葛川を巻き込んで事故を起こしてしまう。そして、AIの判断でゼロスが被害に遭い、その後遺症で失読症となってしまった。問題を解決するために頭を悩ませる香苗であったが、システムには原理的に解決できない問題があるかもしれないと諭される。加えて、ゼロスがグラフィティに目覚めたことを聞き、開発を諦めることに。時は流れ、順調に発展してゆくかに見えた24区だが、香苗の死をきっかけに大きく運命が動き出す。

アスミに会いに行く、そう決めたRGBの下に、アスミから着信が。アスミは改めて自身を取り巻くトロッコ問題を提示する。システム内部にあるアスミの存在を明らかにし、KANAEシステムを解体させるか、アスミの中にあるバグを修正してKANAEシステムによる統制を受けるか、どちらを選んでもアスミを消すことになる選択だった。3人はそれを認めず、意地でもアスミに会いに行く決意を固めるのであった。果たしてRGBの3人はどんな未来を選ぶのか――。