Αφού παλεύει με το πρώτο τέρας, το κόκκινο ρομπότ Σάινι εκτοξεύεται στο διάστημα, αλλά όταν επιστρέφει και συναντά τον Κεραυνό, καταλαβαίνει ότι τα πράγματα άλλαξαν.

Η μάχη με τα Καϊτζού είναι για γενναίους. Ο Κεραυνός επαναφέρει τον Σάινι στη βάση, όπου η νεαρή εφευρέτης Άλεξ και ο Συνταγματάρχης Κριντ δοκιμάζουν τις ικανότητές του.

Ο Σάινι θέλει να αποδείξει ότι είναι σε θέση να παλέψει με τον Κεραυνό. Αφού ο Σάινι δείχνει τις κινήσεις του, η Άλεξ τού δίνει μια ευκαιρία με μια σόλο αποστολή.

Έχοντας κουραστεί να είναι στη σκιά του Κεραυνού, ο Σάινι ζητά τη βοήθεια του Σαρτζ για να βελτιώσει τις ικανότητές του στη μάχη ενάντια στα τρομακτικά Καϊτζού.

Όταν τα μαμούνια Καϊτζού επιτίθενται στον Σάινι και τον Κεραυνό, η Άλεξ κι ο Κριντ καλούν μια ομάδα εξολοθρευτών, ενώ ένας εξωγήινος κατάσκοπος εισβάλλει στα κεντρικά.

Ο Σάινι κι ο Κεραυνός πάνε στην άλλη άκρη του πλανήτη για να πολεμήσουν το δικέφαλο Καϊτζού. Ο κατάσκοπος προσπαθεί να σαμποτάρει την αποστολή και να καταλάβει τη βάση.

Η Άλεξ ερωτεύεται έναν ιδιοφυή εξωγήινο έφηβο που προσγειώνεται στη Γη μετά τη μάχη με τα Καϊτζού. Όμως ο Σάινι, ο Κεραυνός και ο Κριντ αμφισβητούν τις προθέσεις του.

Η κατάσκοπος Βανέσα στέλνει ένα σήμα που καλεί τα αρχαία Καϊτζού να ξεπηδήσουν από την υπόγεια χειμερία νάρκη τους και να σπείρουν το χάος σε πολλές πόλεις.

Ο Σάινι αποκαλύπτει ένα στοιχείο που βοηθά την Άλεξ να εντοπίσει τους γονείς της. Η Βανέσα κι ο εξωγήινος αρχηγός αποφασίζουν να επιταχύνουν τα καταστροφικά σχέδιά τους.

Για να σώσουν την Άλεξ και τον κόσμο, ο Σάινι κι ο Κεραυνός συνεργάζονται με τον δρα Στάρφεϊς και τον Κριντ και δείχνουν τη δύναμη του αδελφικού τους δεσμού.