Pete y Myka son enviados a investigar un pueblo en el que las mentes de sus habitantes están siendo alteradas de manera que éstos actúan sin pensar.

El robo de una escultura lleva a Myka y Pete a una cueva India sagrada que alberga un antiguo secreto de la creación... y la destrucción, y que está en relación con la tribu Lenape.

La señora Frederic descubre que Artie y MacPherson discutieron sobre si utilizar uno de los artefactos para salvar la vida de Carol. Artie no ha confiado en nadie desde entonces. Por otro lado, Claudia encuentra el bolígrafo de Edgar Allan Poe a la venta en Internet, pero cuando Artie pincha en el enlace, un virus se introduce en su ordenador. Mientras tanto, MacPherson trata de vender los artefactos que robó del almacén en una subasta privada. El equipo tratará de encontrar el lugar donde se está celebrando para dar así con su antiguo compañero.

MacPherson libera a H. G. Wells y escapa del Almacén con la ayuda de Leena (controlada mentalmente). Los agentes les siguen la pista para traerles de vuelta al Almacén.

El ataque de Wells en Egipto puso en marcha el plan que había urdido secretamente durante los últimos cien años. Cuando se hace evidente que tiene en sus manos el arma original de destrucción masiva, Artie, Claudia y la Sra. Frederic corren contra el reloj para detener su mortal juego final.

Con la llegada de un nuevo agente con un sexto sentido al almacén, una obra mortal de William Shakespeare y el hacer volver a Myka, Pete tendrá que soportar lo que le espera. Myka tiene la oportunidad de dialogar con H.G. Wells gracias a la proyección holográfica de conciencia facilitada por la Señora Irene.

El equipo del Almacen lucha con la horrible realidad de la destrucción del almacén y la trágica pérdida de Steve Jinks, la señora Frederic y HG Wells; a parte la explosión ha destruido la Caja de Pandora desatando el caos en todo el mundo. En una hora tan desesperada, Pete, Maika, Artie, Leena y Claudia debe decidir si van a utilizar a sabiendas un artefacto peligroso para su propio beneficio personal - con el riesgo de tener consecuencias funestas.

Cuando Paracelso toma el control del Almacén 13, se demuestra que sólo es el primer paso en su plan para crear el mundo a su imagen. Para detenerle, Pete y Myka deben seguirlo a través del tiempo a 1541 e impedirle matar a los regentes y convertirse en el cuidador permanente de los Almacenes.