Quand l'équipe de natation d'une université commence à pulvériser tous les records, Myka et Claudia sont chargées d'enquêter. Pendant ce temps, Pete essaye de soigner l'appendicite de Artie.

L’équipe est envoyée en Egypte car l’Entrepôt n°2 est mystérieusement découvert et son autodestruction est enclenchée.

Le docteur Vanessa Calder arrive à Salt Lake City pour déterminer les raisons d'une vague de décès mystérieux. Une maladie semble transformer les personnes en statues. Artie, qui souhaite pouvoir travailler avec son ex petite amie, emmène Claudia avec lui pour enquêter. Mais l'enquête est complexe et l'équipe va devoir faire appel à un ancien agent...

Tandis que Steve cherche une solution pour se passer du métronome, et ainsi éviter de faire du mal à Claudia, Pete et Myka découvrent que le miroir de Lewis Caroll a été remis en circulation puis brisé - mais pas avant d'avoir causé la folie d'une jeune femme, possédée par la personnalité criminelle d'Alice. Les deux agents la retrouvent, mais se rendent compte qu'Alice a conservé un éclat du miroir, et pourrait s'être tranférée dans n'importe qui. Le même soir; Artie a un rendez-vous amoureux avec Vanessa, mais la soirée tourne court quand il est informé de la situation, et qu'il reconnait Alice dans la serveuse. Après de multiples changements d'identité, Alice est enfin maîtrisée. Suite à ces événements, Artie décide de rompre avec Vanessa pour la protéger, mais elle lui répond qu'elle l'attendra. Steve finit par avouer à Claudia le lien qui les unit. De retour à l'entrepôt, Artie se met en colère contre la confrérie, sans s'apercevoir que Leena a tout entendu.

Alors qu'une maladie touche des centaines et bientôt des milliers de personnes dans le monde et qu'Artie est inconscient après avoir été attaqué par Claudia, Madame Frederic, Pete et Myka sont à la recherche d'un artefact qui pourrait ramener à la vie l'orchidée chinoise et arrêter l'épidémie mondiale...

Paracelsus prend contrôle de l’entrepôt 13 dans le but de recréer le monde à son image. Pete et Myka doivent le suivre en 1541 et l’empêcher de tuer les régents et devenir le maître des entrepôts.