This episode was originally supposed to air on 4/18/07, but was postponed a year due to the tragic events at Virgina Tech. As a result scenes were changed to fit in season 3 and are restored in this version.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

With optional commentary by executive producers Hart Hanson and Stephen Nathan.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

Interview on the red carpet with Angela Montenegro and Dr. Jack Hodgins

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

We don't have an overview translated in English. Help us expand our database by adding one.

Dr Temperance Brennan (nazywana też Bones), antropolog sądowa, musi rozwiązać zagadkę i zidentyfikować kości, które wyłowiono z dna jeziora. Jednakże gdy odkrywa, kim była ofiara, morderstwo okazuje się wiązać ze śmierdzącą polityczną sprawą. Bones szuka pomocy u agenta FBI, Seeleya Bootha, który przekonuje swojego szefa, by ten pozwolił Bones zostać jego partnerką w sprawach, w których przydatne są jej umiejętności.

Mężczyzna ginie, prowadząc pojazd zarejestrowany na pochodzącego z Bliskiego Wschodu człowieka. Wkrótce ekipa Bones orientuje się, że znajduje się na tropie terrorysty.

W kampusie ekskluzywnej prywatnej szkoły zostają znalezione wiszące na drzewie gnijące zwłoki syna wenezuelskiej ambasador. Złudnie prosta sprawa, która łączy pracowników szkoły i uczniów, szybko zmienia się w mieszankę kłamstw, seksu i skandalu.

Brennan i Booth jadą do stanu Waszyngton w sprawie śledztwa dotyczącego ludzkiej ręki, którą znaleziono w brzuchu niedźwiedzia.

Booth prosi Brennan o pomoc w odszukaniu i zidentyfikowaniu szczątków sześcioletniego chłopca, Charliego, który zniknął z lokalnego parku.

Kiedy Brennan i Angela wszczęły bójkę w nocnym klubie, Brennan rzuca kogoś na ścianę, która pęka, odkrywając zmumifikowane szczątki.

Prawnik skazanego na śmierć prosi Bootha, by ten pomógł w udowodnieniu niewinności jego klienta, nim wyrok zostanie wykonany. Agent zgadza się i prosi Bones oraz jej ekipę o pomoc.

Brennan wychodzi na kolację wraz ze swoim byłym profesorem, a zarazem byłym kochankiem, kiedy Booth prosi ją i jej ekipę o zidentyfikowanie szczątków młodej kobiety znalezionej w lodówce.

Brennan i jej ekipa zajmują się identyfikacją ciała znalezionego w schronie. W trakcie cięcia kości Zack przypadkowo uwalnia trujący pył, który staje się powodem kwarantanny, jakiej na czas świąt musi się poddać ekipa.

Brennan i Booth prowadzą śledztwo w sprawie części ciała kobiety, które znaleziono w pobliżu L.A. International Airport. Ich praca jest utrudniona ze względu na liczne operacje plastyczne, które przeszła ofiara.

Kiedy spalone ciało kobiety zostaje znalezione w samochodzie, w którym są ślady porwania dziecka, Brennan i Booth podejrzewają ojca chłopca, Carla Deckera. Sprawa bardziej się komplikuje, gdy Decker okazuje się człowiekiem chronionym przez program ochrony świadków.

Brennan i Booth prowadzą śledztwo w sprawie pochodzenia rozkładającego się ciała, które znaleziono ubrane w niecodzienny kostium w jednej z uliczek. Bones i Booth odkrywają, że nastolatek, którego szczątki znaleźli, prowadził drugie życie.

Booth i Brennan zostają wezwani, gdy w bagażniku samochodu członka gangu zostaje znalezione ciało. W czasie przesłuchania mężczyzny nadjeżdża samochód. Wybucha strzelanina, która ułatwia ucieczkę podejrzanemu. Booth i Brennan podążają za wskazówkami, które doprowadzają ich zarówno do kolejnego pustego grobu, jak i do domu senatora, gdzie pracował członek gangu.

Brennan i Zack przeszukują miejsce rozbicia samolotu z chińskimi dyplomatami i kobietą. Na miejscu zdarzenia Brennan znajduje fragmenty kości, które nie mogą należeć do żadnego z pasażerów, ale mogą należeć do człowieka, który zaginął pięć lat wcześniej. Dr Goodman nakazuje ekipie skupić się wyłącznie na sprawie dyplomatów, ale Bones decyduje się, za jego plecami prowadzić śledztwo w sprawie fragmentów kości.

Brennan właśnie umawia się na randkę przez Internet, kiedy dostaje bardzo pilne zadanie – w zatoce Chesapeake znaleziono podziurawione kulami zwłoki, a FBI chce wiedzieć, czy jest to James Cugini, mafioso, który zaginął sześć lat temu. Booth, który prowadzi śledztwo, jest jednocześnie pochłonięty inną sprawą – w opuszczonym magazynie znaleziono przywiązany do łóżka szkielet, wszystko wskazuje na to, że ciało było bardzo poważnie okaleczone. Wieczorem, kiedy Brennan idzie na randkę, ktoś strzela do niej. Brennan roztrzęsiona wraca do Instytutu – jest przekonana, że ktoś próbuje ją powstrzymać od rozwiązania zagadki jednego z morderstw, którymi obecnie się zajmuje. Dlatego tym bardziej jest zdeterminowana, by jak najszybciej wyjaśnić obie sprawy.

Brennan i Booth schodzą do innego świata, który bezdomni stworzyli sobie w tunelach. Bones i Booth znajdują w szybie wentylacyjnym szczątki kobiety-filmowca.

Podczas wakacji Angela znajduje czaszkę. Prosi Bones o pomoc w zidentyfikowaniu ofiary, ponieważ obawia się, że może to być czaszka jej chłopaka, który zaginął z miejscową przewodniczką. Śledztwo wiedzie ekipę od agresywnego chłopaka strażniczki przez lokalnego szeryfa aż do grupy fałszerzy.

Booth i Brennan prowadzą dochodzenie w sprawie 300-letniej kości palca i miejsca, gdzie mógł zostać ukryty skarb piratów. Hodgins jest podekscytowany, kiedy może opuścić laboratorium i pomóc w sprawie, jednak jego życie jest zagrożone i Booth oraz Bones będą musieli go uratować.

Brennan bierze urlop i jedzie do Nowego Orleanu, by pomóc w identyfikacji ofiar huraganu Katrina. Któregoś dnia budzi się w hotelu pobita i cała we krwi, nie pamięta, co się stało. Booth przyjeżdża, by pomóc jej dowiedzieć się, co się wydarzyło. Gdy miejscowa policja odnajduje martwego eksperta medycznego, Brennan zostaje główną podejrzaną. Śledztwo kieruje bohaterów w świat voodoo.

Ekipa pomaga córce szefa Bootha, Sama Cullena – Amy. Wykryto u niej raka po przeszczepie fragmentu kości. Booth i Brennan odkrywają, że Amy nie jest jedyną ofiarą, która zaraziła się rakiem po przeszczepie.

Brennan i Booth prowadzą śledztwo w sprawie samobójstwa na cmentarzu Arlington, wkrótce dowiadują się, że było to morderstwo, a ofiara była żołnierzem, który służył w Iraku. Podczas śledztwa mnożą się pytania bez odpowiedzi o stosunek ofiary do wojska. Wskazówki pomagają znaleźć odpowiedzi. W międzyczasie Booth wspomina swoją ciemną przeszłość jako snajpera w wojsku oraz horror wojny.

Brennan identyfikuje pewne kości i kamienieje, gdy orientuje się, że znalazła szczątki swojej matki. To ciężki cios dla Bones, która nie wiedziała, co stało się z jej rodzicami, którzy zaginęli 15 lat wcześniej. Śledztwo w tej sprawie otwiera Booth. Brennan jest zszokowana dowodami, które znajdują. Okazuje się, że jej rodzice mogli być kimś innym niż sądziła. Bones musi sobie poradzić z przeszłością rodziców i własną.

Brennan jest w trakcie pracy przy wypadku kolejowym, gdy okazuje się, że ma nowego szefa – dr Camille Saroyan. Pociąg wiózł popularnego senatora i wykoleił się z powodu samochodu, który zatrzymał się na torach. Brennan szuka odpowiedzi na pytanie, dlaczego ciało martwego biznesmena zostało umieszczone w tym samochodzie. W tym odcinku Bones stara się odnaleźć swego ojca.

Booth i Brennan sprawdzają szczątki matki i jej płodu znalezione w zatoce Delaware. Ciało należy do młodej mężatki, która zaginęła w tajemniczych okolicznościach rok wcześniej. Jej mąż jest głównym podejrzanym w sprawie, ale zniknął zanim Booth i Bones zdążyli go przepytać. Booth jest smutny, bo jego była dziewczyna pozwala ich synowi spędzać czas ze swoim chłopakiem.

W śmieciarce znaleziono zwłoki młodego człowieka, który zaginął 3 tygodnie wcześniej. Śledztwo pokazuje, że młoda dziewczyna przygarnięta przez przybraną rodzinę jest główną podejrzaną. Narasta konflikt między Cam i Bones.

Po wykopaniu szczątków młodej dziewczyny dla Bootha i Bones staje się jasne, że nie mają do czynienia z normalną sprawą. Potwierdza się to w laboratorium, kiedy odkrywają, że przyczyna śmierci jest podobna do tej, która jest wynikiem działań seryjnego zabójcy. Po rozmowie z mordercą Booth do niczego nie dochodzi, do czasu aż z Brennan znajdują ciało należące do kolejnej ofiary, która spoczywa na miejscu dopiero od tygodnia. Złapani w śmiertelną grę, Bones i jej ekipa muszą rozwiązać zagadki, by znaleźć współpracownika mordercy. Sprawa staje się coraz gorsza, gdy ekipa dowiaduje się, że kolejna ofiara jeszcze żyje. Muszą ją odnaleźć, nim umrze.

W sprawie szczątków mężczyzny znalezionego w wannie z chemikaliami, którą prowadzą Bones i Booth, jest dwoje podejrzanych. B&B wkrótce odkrywają, że ofiara miała dwie żony i dziewczynę.

Brennan i Booth prowadzą śledztwo w sprawie wybuchu w hotelu.

Ekipa bada sprawę śmierci dziewięcioletniej księżniczki piękności. Rodzice jej rywalek wkrótce stają się podejrzanymi. Brennan popełnia wielki błąd, kiedy ona i Booth odwiedzają zajęcia taneczne, na których chcą znaleźć możliwego zabójcę. Hodgins i Angela idą na randkę, która mija przyjemniej niż przewidzieli.

Szczątki prokuratora federalnego, który zaginął pięć lat wcześniej, zostają odnalezione na pustyni nieopodal Las Vegas. Wkrótce znalezione zostaje również ciało kobiety, leżące zaledwie parę jardów dalej. Ekipa podejrzewa, że obie ofiary zabiła ta sama osoba. Obrażenia kobiety pozwalają Brennan wierzyć, że była ona ofiarą długoletniej przemocy domowej. Kiedy jej mąż zaprzecza biciu żony, B&B zaczynają poszukiwania w światku bokserskim. By poznać prawdę o zbrodni, Booth zaryzykuje życie.

Ciała dwóch nastoletnich bliźniaków, porwanych pięć lat wcześniej, zostają nareszcie odnalezione. Booth i Brennan podążają tropem seryjnego mordercy, znanego jako Grave Diggera (Kopacz Grobów). Jego sposób działania to porywanie, zakopywanie i żądanie okupu. Jeśli jego żądania nie są spełniane, ofiara ginie. Brennan i Hodigns wkrótce stają się kolejnymi ofiarami Grave Diggera. Oboje walczą o przetrwanie zakopani w samochodzie.

Trwa śledztwo w sprawie śmierci studenta szkoły filmowej, który robił dokumentalny film na temat legendy o bezgłowej czarownicy, mieszkającej w nawiedzonym lesie 300 lat temu. Brennan odczuwa silną więź z bratem ofiary.

Booth i Brennan zostają wezwani na miejsce zbrodni. Znaleziono spalone zwłoki mężczyzny na dachu siedziby FBI. Dokumenty znalezione przy ciele dotyczą sprawy sprzed 30 lat i łączą się z ojcem Bones. Jej brat, Russ, mówi jej, że jest w kontakcie z ich ojcem, który ostrzega swoje dzieci przed niebezpieczeństwem. Okazuje się, że ciało z dachu to były agent FBI, który chciał zabić Russa. Im głębiej śledczy wchodzą w sprawę, tym więcej szokujących faktów wychodzi na jaw. Wszystko to może zniszczyć karierę Bootha. Zack broni pracy doktorskiej i prosi o pomoc kolegów.

Booth i Brennan zostają wezwani do zidentyfikowania szczątków, które znajdują się w celi seryjnego zabójcy Howarda Eppsa. Oboje są zdziwieni, gdy okazuje się, że szczątki nie należą do Eppsa. Orientują się, że morderca uciekł. Epps chce się zemścić i włącza do tego nawet małego syna Bootha, Parkera. Z powodu niebezpieczeństwa Bones dostaje ochronę FBI. Cam wdycha śmiertelne toksyny podczas autopsji, co zagraża jej życiu.

Brennan musi pracować z nowym agentem, Sullivanem, podczas gdy Booth spotyka się z terapeutą. Śledztwo, które prowadzi Bones, dotyczy szczątków znalezionych w brzuchu aligatora. Sully zaprasza Bones na randkę.

Booth i Brennan prowadzą śledztwo w sprawie śmierci Terence'a Bancrofta, jednego z ludzi dotujących Instytut Jeffersona, którego znaleziono martwego we własnym domu. Hodgins naraża reputację instytutu, usuwając jeden z dowodów, który łączył go z ofiarą i jego żoną. Brennan musi podjąć poważną decyzję dotyczącą zespołu. Booth, pomimo zgody dra Wyatta, by nosił broń, musi nadal chodzić na terapię.

Brennan i Booth prowadzą dochodzenie w sprawie śmierci, które do złudzenia przypominają te, jakie opisała w swojej książce Bones.

Ekipa prowadzi dochodzenie w sprawie śmierci młodej Azjatki, z której ciała usunięto wszystkie kości. Sully składa Brennan kuszącą propozycję, której ona nie może jednak przyjąć.

Woda podmywa stary cmentarz i powoduje wypłynięcie wielu trumien. Brennan zgadza się pomóc w identyfikacji szczątków, by można je było znowu pochować. Bones znajduje szczątki, które leżały w ziemi zaledwie pięć lat, a na cmentarzu nie chowano nikogo od pięćdziesięciu. Booth zabiera Brennan do terapeuty, by naprawić ich wzajemne stosunki. Związek między Hodginsem i Angelą rozwija się, ale Hodgins robi zły ruch.

Booth i Brennan prowadzą dochodzenie w sprawie szkieletu znalezionego w betonie. Booth uważa, że morderstwo ma związek z mafijną rodziną i Hugh Kennedym, jednakże okazuje się, że Hugh spłonął w samochodzie. Sprawa komplikuje się. Booth dowiaduje się, że Hugh żyje, jednak wkrótce zostaje przez niego związany, a potem porwany przez jego wrogów. Brennan musi teraz znaleźć Bootha, zanim stanie się mu krzywda. Jednak jest to trudniejsze niż myśli i dlatego musi zgodzić się na to, by ktoś udzielił jej pomocy.

Tajemniczy mężczyzna zostaje znaleziony w kraterze. Jego szczątki są zmiażdżone z powodu upadku z dużej wysokości. Brenan i Booth starają się dowiedzieć, kim był mężczyzna. Hodgins wysuwa wiele rozmaitych teorii o kosmitach. Booth i Bones dowiadują się, że ofiarą jest astronauta.

Brennan i Booth prowadzą dochodzenie w sprawie śmierci młodej szefowej kuchni. Wszystkich zaskakują kości ofiary, które świecą.

Rozkładający się szkielet młodej kobiety zostaje znaleziony w wózku sklepowym. Jednak po rekonstrukcji twarzy okazuje się, że dziewczyna wyglądała na osiemdziesięciolatkę. Booth i Bones nie mogą znaleźć nikogo, kto chciałby zabić dziewczynę. W międzyczasie Max Kennan, ojciec Bones, pojawia się z informacją z jej przeszłości. Angela i Hodgins chcą się pobrać, ale gdy stają przed ołtarzem, nic nie idzie zgodnie z planem.

W premierowym odcinku sezonu trzeciego czaszka wbija się w przednią szybę samochodu nastolatków. Podczas oględzin czaszki Brennan i Cam znajdują ślady ludzkich zębów, które wskazują na kanibalizm. Dane ofiary pomagają Bones i Boothowi iść dalej i znaleźć dziwną kanibalistyczną społeczność. W międzyczasie Angela i Hodgins zatrudniają prywatnego detektywa, by znalazł męża dziewczyny. Zack wraca do instytutu z Iraku, pomaga znaleźć dowody mogące ułatwić rozwiązanie sprawy.

Brennan i Booth prowadzą dochodzenie w sprawie śmierci mamy młodej piłkarki. Kobieta zginęła w wybuchu, zapalając samochód. Dziwne jest to, że ktoś chciał zabić spokojną kurę domową. Wkrótce odkrywają, kim była zamordowana – June była członkiem radykalnej organizacji z lat 70., o nazwie Narodowa Armia Wolności. Była też poszukiwana przez FBI, by zeznawała w sprawie morderstwa, co dało motyw mordercy. W międzyczasie Brennan odwiedza ojca w więzieniu.

Ekipa bada sprawę rozkładających się zwłok, które znaleziono w lesie. Są pozbawione rąk i stóp.

Booth i Brennan oglądają rozkładające się zwłoki, znalezione przez parę nastolatków. Okazuje się, że ofiarą jest Franklin Curtis, który zajmował się organiczną żywnością. Brennan odkrywa, że ciało mężczyzny zostało wcześniej ugotowane. Booth i Brennan przepytują ludzi na farmie Curtisa. Wkrótce zostaje znalezione kolejne ciało. W międzyczasie Booth i Brennan zaczynają chodzić na terapię partnerską.

W trakcie zabawy halloweenowej zostają znalezione zmumifikowane zwłoki dziewczyny. Booth i Brennan prowadzą śledztwo i są zszokowani tym, że ofiara była martwa już od roku. Wszystko to czyni sprawę jeszcze okropniejszą. Drugie ciało zostaje znalezione w halloweenowym parku rozrywki. Tym razem ofiara nie żyje już dwa lata. Booth i Brennan muszą znaleźć kolejną dziewczynę, zanim morderca zabije i ją.

W piecu instytutu zostają znalezione szczątki. Podejrzenie spada na pracowników Jeffersonian. Pierwszym motywem wydaje się praca ofiary z artefaktami Gormogona. Jednak sprawa jest bardziej skomplikowana, gdy wychodzi na jaw uczuciowy związek między pracownikami instytutu. Booth musi udawać chłopaka Cam na obiedzie u jej rodziny.

Kapsuła czasu, zakopana w 1987 roku, zostaje wykopana po 20 latach. Wszyscy są zszokowani, gdy wewnątrz odnajdują zwłoki. Booth i Brennan dowiadują się, że ofiara była outsiderem i uczniem szkoły. Muszą cofnąć się do przeszłości absolwentów, by znaleźć mordercę.

Zostaje znalezione ciało arcybiskupa. Jego rzepki kolanowe zostały chirurgicznie usunięte. Wszystko wskazuje na powrót Gormogona.

Booth i Brennan badają sprawę św. Mikołaja, nazwiskiem Kris Kringle, który został znaleziony martwy przez dwa elfy. W ciągu śledztwa Mikołaj wydaje się coraz bardziej prawdziwy. W międzyczasie Bones stara się załatwić ojcu i bratu rodzinne święta w więzieniu. Prokurator Caroline zgadza się pod warunkiem, że Booth i Brennan pocałują się pod jemiołą, w usta.

Ciało zostaje odkryte w Homestead Natural Hot Springs w błotnistym źródle. Booth i Brennan badają sprawę i dowiadują się, że ofiarą był Tripp Goddard, przystojny kierowca motocyklowy, który został zamordowany około dwóch tygodni wcześniej, po wyścigu. Pojawia się dziewczyna Sweetsa.

Cała ekipa pracuje nad identyfikacją szczątków młodego sportowca. Po identyfikacji Booth i Bones rozmawiają z siostrą ofiary. Angela i Hodgins przeprowadzają poważną rozmowę. Zack poświęca całą swoją uwagę rekonstrukcji połamanego szkieletu.

Samochód młodej kobiety zjeżdża z drogi. Dziewczyna ginie, ale jej dziecko cudem przeżywa. Booth i Brennan jadą do rodzinnego miasta dziewczyny, by dowiedzieć się, kto jest winny jej śmierci. Bones, z pomocą Bootha, zajmuje się dzieckiem aż do wyjaśnienia sprawy.

Ojciec Brennan, Max Keenan, jest sądzony za morderstwo dyrektora FBI, Kirby'ego. Cały zespół, oprócz dr Brennan, jest wzywany na świadków oskarżenia. Brennan wspiera obronę i musi wykorzystać wszystkie sposoby, by pomóc ojcu.

Tommy Sour, marzący o karierze piosenkarza, zostaje znaleziony martwy. Śledztwo doprowadza Bootha i Brennan do Checker Box Restaurant, gdzie Tommy śpiewał. Pojawia się kilku podejrzanych. Bones prezentuje swoje umiejętności wokalne przed całą ekipą, jednak występ przerywa dramatyczne wydarzenie. Szalona kobieta, zakochana w Boothie, strzela do Brennan. Booth ratuje życie Bones, kula trafia go w klatkę piersiową.

Gormogon, seryjny zabójca, powraca. Z instytutu znika srebrny szkielet. Wszyscy pracownicy są podejrzani. Ktoś z nich współpracuje z Gormogonem.

Booth i Brennan wyjeżdżają do Londynu. Oboje są przybici zamknięciem Zacka w szpitalu psychiatrycznym. Agent i pani doktor mają w Wielkiej Brytanii wykłady i angażują się w pewne śledztwo dotyczące śmierci młodej Amerykanki. W międzyczasie mąż Angeli, Grayson Barasa, pojawia się w instytucie. Odmawia podpisania papierów rozwodowych. Chce, by Angela do niego wróciła.

W londyńskim mieszkaniu zostają znalezione zwłoki antropologa sądowego, Iana Wexlera, przyjaciela Bones. Podejmuje się ona pomóc w śledztwie, w czym wspiera ją Booth. Angela i Hodgins postanawiają się rozstać.

Ciało popularnego prowadzącego reality show zostaje znalezione w stanie częściowego rozkładu w wychodku. Booth i Brennan muszą się dowiedzieć, kto go zabił. W międzyczasie Booth tłumaczy Brennan, że bycie w dwóch związkach naraz jest błędem.

Parker, syn Bootha, znajduje ludzki palec w ptasim gnieździe. Ekipa zaczyna poszukiwać reszty ciała.

Części rozczłonkowanego ciała zostają znalezione w basenie pełnym fioletowej wody. Nie ma tam jednak głowy. Ekipa dowiaduje się, że ciało należy do Jareda Addisona, pisarza science fiction, który miał problemy psychologiczne. Z pomocą Sweetsa kolejni podejrzani zostają wyeliminowani. Ekipa ma problemy ze znalezieniem wystarczającej ilości dowodów w sprawie. Nadal nie ma też głowy ofiary. Jednak tylko do czasu, kiedy z pomocą wkracza Zack.

Szczątki menedżerki pewnego biura zostają odnalezione w szybie windy. Booth i Brennan muszą się dowiedzieć, który ze współpracowników zabił kobietę. Podczas śledztwa dowiadują się ciekawych rzeczy o pracownikach firmy. Angela i Hodgins próbują unormować sytuację w pracy po swoim zerwaniu.

Booth i Brennan rozpoczynają śledztwo w sprawie ciała znalezionego w zatoce Chesapeake. Po przyjeździe znajdują tylko górną część tułowia, co pozwala ekipie na trochę pracy, w której pomagają jedynie implanty piersi ofiary. Brennan i Booth docierają do małego kościoła w Marylandzie, gdzie okazuje się, że ofiara była pastorem. Gdy ekipa znajduje dolną część ciała, okazuje się, że wstępne wnioski mogły być błędne.

Dwóch mężczyzn znajduje na złomowisku wrak auta, w którym jest ludzka czaszka. Obiekt zostaje przetransportowany do Instytutu Jeffersona. Booth i Brennan szybko docierają do galerii, gdzie zmiażdżone samochody uważane są za dzieła sztuki. Właścicielką tego miejsca jest kobieta wyraźnie zafascynowana sztuką kabuki, natomiast jej asystentka, Roxie, jest dawną znajomą Angeli. Wszystko wskazuje na to, że szkielet w aucie należał do artysty, który popełniając samobójstwo, chciał ukoronować swoją twórczość. W laboratorium ponownie pomaga Daisy Wick.

Podczas szkolenia wojskowego demonstracyjnie zostaje wysadzone laboratorium amfetaminy. Okazuje się, że w środku znajdowały się ludzkie szczątki, które podczas eksplozji poszybowały nad okolicą. Wydaje się, że znalezione kości należą do ojca marnotrawnego młodego inżyniera, ale wkrótce wychodzi na jaw, że to nieprawda – szczątki należą do jego dawnego wspólnika, który się pod niego podszywał. Sprawa trochę się komplikuje. W laboratorium ponownie pomaga Clark. Pojawia się także brat Bootha.

Brennan i Booth spokojnie lecą do Chin, gdzie Brennan ma zidentyfikować prehistoryczne szczątki. W trakcie lotu w wielkiej lotniczej mikrofalówce zostają odnalezione ugotowane ludzkie szczątki. Booth i Bones, używając supernowoczesnego sprzętu antropologicznego, wysyłają dowody do Instytutu. Odkrywają, że ofiara była dziennikarką, która pisywała kontrowersyjne artykuły o liniach lotniczych. Booth i Bones muszą znaleźć mordercę, nim samolot wyląduje w Chinach, a FBI straci jurysdykcję.

Ojciec Brennan, Max, rozpoczyna pracę na stanowisku nauczyciela w Instytucie. Kiedy kończy pomagać w rozwiązywaniu sprawy morderstwa, Bones zaczyna irytować jego nagła i częsta obecność w jej naukowym życiu.

Bones otrzymuje do identyfikacji szkielet bliźniąt syjamskich. Wkrótce okazuje się, że pracowały one w cyrku. Bones i Booth muszą udać się tam pod przykrywką, udając małżeństwo cyrkowców.

W jeziorze zostają odnalezione szczątki strażaka. Booth jest jednym z podejrzanych, bo razem z ofiarą grywał w hokeja. Śledztwo prowadzi agentka Payton Perotta. Między Boothem a nią iskrzy. Bones uczy się jeździć na łyżwach. W odcinku wystąpił gościnnie były zawodowy hokeista, Kanadyjczyk Luc Robitaille.

Hodgins nadal nie wyzwolił się z traumy po porwaniu przez Grave'a Diggera. Częściowo obwinia się za porwanie Bootha. Wychodzi na jaw, że Booth został otumaniony i zamknięty w czymś wyglądającym jak żółta łódź podwodna. Booth staje twarzą w twarz z kimś ze swojej wojskowej przeszłości. Ekipa pracuje nad zlokalizowaniem Bootha i poznaniem, kto stoi za porwaniem. Dowiadujemy się, dlaczego syn Bootha ma na imię Parker. Brennan, Hodgins i Thomas Vega, Judge Dix Williams i AUSA Kim Kurland (ostatnia trójka znana z epizodu 02x09) są podejrzani po tym, jak część dowodów w sprawie znika. Hodgins ma obsesję na punkcie Grave'a Diggera. Vega pisze na ten temat książkę. W sprawie pomaga Jared, brat Bootha.

Bones i agentka Payton Perrota prowadzą dochodzenie w sprawie morderstwa kobiety. Booth i reszta robią za wsparcie. Ich śledztwo prowadzi je na spotkanie fanów fantasy, Magic-Con (parodię Comic-Conu), gdzie dowiadują się, że zamordowaną kobietę można połączyć z starym rekwizytem – Excaliburem, znanym ze sławnego francuskiego filmu Śmierć Artura (fr. Le Morte d' Arthur).

Booth i Bones prowadzą dochodzenie w sprawie sprzedawcy samochodów, którego szczątki odkryła skacząca na bungee para młoda.

Booth i Bones prowadzą dochodzenie w sprawie śmierci dziewczyny z drużyny siatkarskiej. Jak się okazuje, była ona w ciąży, podobnie jak siedem innych dziewcząt z drużyny (4 z nich z tym samym chłopakiem). Roxie zrywa z Angelą, która szukając pocieszenia, spędza noc z Hodginsem.

Booth i Bones wraz z Cam prowadzą sprawę śmierci byłego narzeczonego patolog, który został rozszarpany przez tygrysa. W międzyczasie Angela postanawia żyć w celibacie. Okazuje się też, że Clark jest z kimś związany.

Gdy zespół zauważa na uchu ofiary odłamek meteorytu, doprowadza ich to do Instytutu Informatyki Collar – znanego Centrum Badań w Dziedzinie Fizyki. Po przesłuchaniu naukowców B&B identyfikują ofiarę jako dr Diane Sidman – wybitnego naukowca oraz redaktora naczelnego „Dziennika Urzędowego z Instytutu Collar” i jego założycielkę. Dr Sidman pracowała właśnie nad kontrowersyjnym projektem. Poszukiwania zabójcy doprowadzają Bootha i Brennan do bardzo niebezpiecznej sytuacji (zostają uwięzieni w komorze rezonansu, co może kosztować ich życie). Tymczasem do miasta przyjeżdża ojciec Angeli (w tej roli Billy F. Gibbons z zespołu ZZ Top) , aby zemścić się na Hodginsie za skrzywdzenie jego córki. Mediatorem w tej sprawie zostaje Sweets. Stażystą tygodnia jest Vincent Nigel-Murray.

Booth i Bones badają sprawę zmiażdżonych szczątek kobiety, znalezionych w kartonach przeznaczonych do recyklingu. Lista podejrzanych rośnie coraz bardziej do czasu, gdy ekipa odkrywa, że maniaczka małżeństwa oprócz narzeczonego spotykała się jeszcze z chłopakami poznanymi przez serwis randkowy. Booth i Bones muszą przekazać Sweetsowi nowinę o tym, że widzieli jego dziewczynę – Daisy – przymierzającą suknię ślubną w towarzystwie innego mężczyzny.

Kiedy szkielet zostaje odkryty jako rekwizyt używany w trakcie występów grupy blackmetalowej z Norwegii, policjanci wzywają na pomoc FBI, które odkrywa tożsamość ofiary. Śledztwo jest prowadzone wśród zespołów metalowych, a ekipa dzięki temu dowiaduje się o zadziwiających preferencjach muzycznych Sweetsa. W międzyczasie powraca dr Wyatt i pomaga Sweetsowi w pracy nad jego książką, ukazując inną perspektywę spojrzenia na związek partnerów.

Kiedy kolega z egiptologii umiera, Brennan orientuje się, że ta śmierć nie była wynikiem wypadku. Bones namawia Bootha do kradzieży zwłok, by ona i Cam mogły zbadać ciało. Cam musi poradzić sobie z papierosowym problemem swojej adoptowanej córki.

W Waszyngtonie zostaje odnaleziona głowa Sachi Nakamury, siostry przyjaciela Bootha. Ken, detektyw z Tokio, przylatuje do Stanów, by pomóc w śledztwie. Wkrótce okazuje się, że współlokatorka Sachi także zniknęła.

Jimmy „Bóbr” Bouvier zostaje znaleziony martwy w kostiumie swojego kolegi maskotki. Booth i Bones prowadzą śledztwo, by odkryć czas śmierci chłopaka. Prawdopodobny motyw zabójstwa zostaje odkryty dzięki bractwu „Bobra”. W międzyczasie Booth oferuje bratu pomoc w znalezieniu nowej pracy po usunięciu z Armii.

Po podjęciu decyzji o posiadaniu dziecka Brennan zadziwia Bootha prośbą o to, by był jego ojcem. Booth nie może przestać o tym myśleć. Stres i wcześniej niezdiagnozowane problemy zdrowotne prowadzą do halucynacji – Booth zaczyna widywać Steviego z serialu Family Guy, który daje mu pewne rady. Okazuje się że Seeley ma guza mózgu wymagającego natychmiastowej interwencji chirurgicznej. Prosi Bones, aby była z nim podczas operacji. Przed wejściem na salę mówi Temperance, że jeśli się coś nie uda, ona ma użyć jego nasienia i urodzić dziecko.

W finale czwartej serii ukazana została historia Brennan i Bootha jako małżeństwa. Posiadają oni klub 'The LAB'. Właśnie tam zostaje znalezione ciało ofiary. Temperance nie jest antropologiem, Seeley nie jest agentem FBI. Wszyscy dotychczasowi bohaterowie otrzymali inne role w ich życiu. Po zakończeniu dochodzenia w sprawie morderstwa okazuje się że Brennan jest w ciąży. Wtedy Booth budzi się w szpitalu. Okazuje się, że po operacji zapadł w śpiączkę, a historia powstała w jego głowie, kiedy Bones czytała mu swoją nową książkę. Seeley cierpi na chwilową amnezję.

Sześć tygodni po finale czwartej serii Bones dzięki medium Brennan i Booth odnajdują ludzkie szczątki pod fontanną. Szczątki wszystkich ofiar zawierają truciznę, jednak jedna z nich nie zginęła w wyniku otrucia, bo trucizna nie zdążyła zadziałać. Okazuje się, że ofiara ta została zastrzelona z kuszy. Śledztwo Bootha i Bones doprowadza ich do grupy religijnej „Harbingers of a New Day”, której członkowie chcą żyć w podwodnej utopii. W dochodzenie zaangażowani są też Angela, Caroline i Sweets. Booth wyznaje Bones, że ją kocha… jak partnerkę z pracy. W odcinku gościnnie pojawi się Cindy Laupert jako Avalon Harmonia (medium), która z kart wyczyta uczucia Brennan i Bootha, w co Bones nie uwierzy.

Brennan i Booth badają sprawę ciała mężczyzny zamordowanego z powodu nieujawnionej zawartości jego nesesera (teczki). Początkowo dowody prowadzą zespół do podejrzanych w służbach specjalnych, a ich teorię potwierdza fakt znalezienia ciekłych zwłok agenta CIA w bagażniku samochodu. Kiedy Booth i Brennan przesłuchują zastępcę dyrektora CIA, zostaje podważona ich lojalność wobec USA. W tym samym czasie najlepiej sprzedająca się książka Brennan odnosi finansowy sukces i jest przyczyną sporu z Boothem… Stażysta Wendell Bray traci swoje stypendium, a zespół stara się znaleźć inny sposób, by zatrzymać go w Instytucie.

Sprawa dotyczy śmierci nastoletniego amisza, który zginął podczas Rumspringi*. Brennan postrzega amiszów jako wierzących w zabobony głupców, ale ich tradycja ją fascynuje. Wychodzi na jaw, że chłopiec był utalentowanym pianistą i tuż przed śmiercią miał mieć przesłuchanie do National Conservatory**. B&B przesłuchują jego rodzinę i przyjaciół, których poznał po opuszczeniu społeczności. Powraca przybrana córka Cam – Michelle. Michelle i Cam kłócą się. Rozmawiają o seksie i Michelle mówi, iż Cam nie jest jej matką, a jedynie sprawuje nad nią opiekę po śmierci jej ojca, więc niech nie próbuje być kimś więcej. To rani Cam, ale później obie kobiety dochodzą do porozumienia.

Trwa hawajski piknik na przedmieściach. W piecu przygotowywana jest świnia. Nagle zaczyna dziać się coś dziwnego i sąsiedzi odkrywają ukryte pod zwierzęciem ludzkie szczątki. Zespół z Instytutu Jeffersona stwierdza z całą stanowczością, że mężczyzna nie żył już przed upieczeniem. Brakuje tylko jednego mieszkańca osiedla, więc ofiara zostaje od razu zidentyfikowana. Mężczyzna i jego żona nie byli zbyt lubiani wśród sąsiadów z powodu korzystania z wiatraka, który, choć przyjazny dla środowiska, był brzydki, hałaśliwy i nie pasował do zadbanej okolicy. Wkrótce jednak wychodzą na jaw sprawy o wiele poważniejsze, z powodu których ktoś faktycznie mógł zabić Kurta – otrucie przez niego psa, romans z żoną i córką jednego z sąsiadów, wyłudzanie pieniędzy…

Na ogrodzeniu zostaje znaleziona współczesna mumia. Booth robi listę podejrzanych i wypytuje personel czy nikogo nie brakuje. Booth ma nowego szefa, Andrew Hackera, który pyta go, czy wie, że umówił się z dr Brennan. Chce się upewnić, czy to nie zakłóci współpracy między nim, a dr Brennan. Booth zaprzecza.

Harcerki znajdują nad rzeką ludzkie szczątki. Zabezpieczają dowody i przewożą wszystko do Instytutu Jeffersona. Brennan nie jest zachwycona faktem, że dzieci naruszyły miejsce znalezienia ciała. Rekonstrukcja wykonana przez Angelę sugeruje, że mężczyzna był człowiekiem-kurczakiem… W dodatku Hodgins znajduje w ciele pasożyty, które zwykle występują u kur. Niedługo później okazuje się, że ofiara była właścicielem znienawidzonej przez mieszkańców miasteczka i ekologów kurzej fermy.

Kiedy zawaliła się jedna z waszyngtońskich ulic, na dnie dziury odkryto ludzkie szczątki, które nie dość, że zielone, są mniejszych rozmiarów niż zazwyczaj. Dr Brennan od razu stwierdza, że należały do karła. Wygląd kości sugeruje, że miał on świetną kondycję fizyczną i prawdopodobnie uprawiał zapasy. Odnajdują ofiarę w Internecie, ale okazuje się „Żelazny Skrzat” nadal walczy. Wniosek może być tylko jeden – inny karzeł podaje się za „Żelaznego”. Okazuje się, że takie działania w świecie zapasów są na porządku dziennym. Trop prowadzi do szefa ofiary – kobiety, z którą zapaśnik miał romans.

W domu wystawionym na sprzedaż agentka nieruchomości znajduje spopielone ludzkie szczątki. W dobrym stanie pozostaje tylko stopa i fragment ręki. Badając stopę, zespół z Instytutu Jeffersona stwierdza, że ofiara była kobietą, która ważyła niewiele ponad 50 kg, czyli o wiele za mało, jak na tyle popiołu. Zatem w łóżku musiały znajdować się dwie osoby. Booth i Brennan zaczynają więc poszukiwać partnera kobiety. W tym celu trafiają, między innymi, do klubu, w którym przede wszystkim cenione są puszyste panie – takie, jaką jeszcze do niedawna była ofiara.

Podczas porządkowania odpadów z restauracji, pracownicy znajdują w pojemniku ludzkie szczątki. Zostaje wezwana ekipa z Instytutu Jeffersona, Booth zawiadamia Bones, która stwierdza, że nie jest potrzebna – nie ma tam kości. Jednak w czasie przenoszenia zwłok, z nieboszczyka ześlizguje się skóra… Szybko udaje się ustalić, że ofiara była listonoszem. Wkrótce zostaje ustalona jego tożsamość. Żona mężczyzny opowiada Boothowi i Brennan, że mąż ostatnio został mistrzem w grze „Punky Pong”, co mogło rozzłościć wiele osób. Zwycięska gra na automacie została przesłana sędziemu nagrana. Angela i Brennan dochodzą do wniosku, że listonosz oszukiwał i tak naprawdę ktoś inny przeprowadził zwycięską grę. Asystentem tygodnia jest Fisher, któremu udaje się zdobyć bilety na najnowszy kinowy przebój Jamesa Camerona Avatar. Na pokaz zaprasza Hodginsa i Sweetsa.

Do banku przychodzi Święty Mikołaj i pokazuje, że pod ubraniem ma bombę, każe zapakować sobie pieniądze. Radiowozy w okolicy dostają wezwanie o napadzie. Na miejscu zdarzenia najszybciej zjawia się Booth. Mikołaj wychodzi z banku, próbuje coś powiedzieć Boothowi i… wybucha. Ranne są przy tym dwie osoby, trochę cząstek zostaje też na Boothie (staje się zatem dowodem). Okazuje się, że wybuch spowodowały fale radiowe pochodzące z zaparkowanej nieopodal taksówki. Booth podejrzewa, że sprawcą wybuchu może być autor niezależnej audycji radiowej rozpoczynającej się w chwili, gdy Mikołaj wyszedł z banku. Razem z Brennan wyruszają na poszukiwania. Stażystką jest Daisy. Wszyscy w Instytucie planują święta. Bones zamierzała spędzić je w Salwadorze, ale ostatecznie postanawia zostać z ojcem i kuzynką (w tej roli Zooey Deschanel), zaprasza też Bootha. Daisy nie chce świętować ze Sweetsem, bo przyjmuje, że Jezus urodził się w marcu. Natomiast Michelle postanawia wyjechać z koleżanką i zostawić Cam samą.

Jedna ze spraw prowadzi Brennan i Bootha do Nowego Meksyku, gdzie mają oni zbadać ludzkie szczątki wykazujące cechy pozaziemskie. Ofiara zostaje zidentyfikowana jako miejscowy fanatyk UFO, znany wszystkim w miasteczku jako niestrudzony poszukiwacz obcych form życia. Znalezione przez niego „dowody” zmuszają nawet Bootha i Brennan do przemyśleń nad możliwością istnienia innych form życia. Tymczasem miejscowy szeryf odmawia wydania szczątek i wysłania ich do Jeffersonian, dlatego zespół jest zmuszony do pracy za pośrednictwem satelity. Angela i Wendell mówią wszystkim o swoim związku…

Mr White i jego zespół rządowych agentów zamykają Laboratorium Jeffersonian i nalegają, aby Brennan i jej zespół naukowców określił przyczynę śmierci niezidentyfikowanych, ale wysoko sklasyfikowanych kompletnych ludzkich szczątków. Zespół rozpoczyna pracę, a wkrótce zaczyna podejrzewać, że bada jedno z najsławniejszych prezydenckich morderstw w historii. Tymczasem szef Bootha Andrew Hacker pomaga mu włamać się do laboratorium i określić motywy tajemniczego śledztwa. Sfrustrowana Cam martwi się o Michelle; sądzi, że ta coś przed nią ukrywa.

Gdy ludzki szkielet odkryto w okopach pola bitewnego wojny secesyjnej, Brennan i Booth zostają wezwani do sprawy. Mimo że jest to miejsce historyczne, Brennan szybko identyfikuje szczątki, należące do Dan Pinard, lokalnego dentysty. Kiedy Booth przesłuchuje podejrzanych, w tym byłego chłopaka ofiary, Hodgins w laboratorium wraz z Vincentem Nigel-Murrayem pracują wytrwale nad czyszczeniem kości z pozostałości gliny, która uniemożliwia zespołowi określenie przyczyny zgonu. Tymczasem Jared, brat Bootha, wraca z podróży z zaskakującą wiadomością.

Brennan i Booth prowadzą śledztwo w sprawie wyjątkowo zniekształconych szczątek alegoryzujących biblijny tekst. Kiedy dowiadują się więcej na temat ofiary, pacjenta dr. Adama Copelanda z Sanatorium Havenhurst, spotykają podejrzanych, których trudno scharakteryzować jako dobrych lub złych. Tymczasem w Jeffersonian stażysta Arastoo Vaziri ujawnia tajemnicę o swojej przeszłości.

Pękła magistrala wodna. Ogromne ilości wody uderzyły w pociąg metra, który wypadł z szyn. Jedyną ofiarą jest chłopak, który chwilę przed wypadkiem poinformował Sweetsa przez telefon, że wygrał walkę z rakiem. Katastrofa w metrze odsłoniła ludzki szkielet ukryty w betonowej ścianie. Niebieska barwa kości przyciąga uwagę wszystkich w instytucie. Naukowcy odkrywają, że ofiarą jest niewidomy mężczyzna, który pisał listy w imieniu innych osób – na zlecenie sporządzał pisma urzędowe oraz wyznawał uczucia.

Booth i Brennan powracają pamięcią do pierwszej wspólnej sprawy sprzed sześciu lat. Na wysypisku znaleziono zwłoki dziewczyny. Booth ukrył przed Brennan prawdziwą tożsamość ofiary i okoliczności jej śmierci oraz nazwisko domniemanego sprawcy, który jest tak wpływową osobą w Waszyngtonie, że nawet agent federalny potrzebuje niepodważalnych dowodów, by go o coś oskarżyć. Agent nie docenił jednak inteligencji Brennan i pasji w poszukiwaniu prawdy.

Podczas randki para (homoseksualna) znajduje czaszkę. Według legendy w lesie mieszka duch, który opętuje ludzi i zmusza ich do zabijania. Brennan wychowała się w tych stronach. Za jej szkolnych czasów w ten sam sposób zamordowano jej koleżankę. Sprawcy nigdy nie znaleziono. Okrzyknięto go rzeźnikiem z Burtonsville. Głównym podejrzanym był woźny, Ray Buxley. Mieszkał na odludziu, był małomówny i tylko Brennan darzyła go sympatią. Obecnie ona nadal wierzy w jego niewinność, chociaż ważne dowody świadczą przeciw niemu.

We wnętrzu martwego rekina odkryto ludzką kończynę. Ślady na kościach dowodzą, że człowiek został zaatakowany przez kilka drapieżników ze strefy tropikalnej. Miejscem zbrodni jest oceanarium. Brennan i Booth znajdują w ogromnym akwarium czaszkę i kręgosłup. W trakcie śledztwa wychodzi na jaw, że do zabójstwa musiało dojść w czasie, gdy w oceanarium była szkolna wycieczka. Badacze ustalają tożsamość ofiary. Jest nią kontrowersyjny naukowiec, który zdobył sławę, głosząc, iż po poważnej kontuzji doznał ozdrowienia w morzu.

W bębnie hotelowej pralki znaleziono zwłoki. Szkielet uległ poważnemu uszkodzeniu, więc określenie przyczyny śmierci będzie trudne. Brennan i Arastoo odkrywają na kościach uszkodzenia, których ofiara musiała doznać w wyniku ryzykownych zachowań. Okazuje się, że zaginął biznesmen Richard Cole, który w wywiadzie wspomniał, że planuje udział w „Obozie fantazji”. Wśród szczątków wydobytych z pralki Hodgins znajduje fragment kła mamuta.

W lesie strażacy gaszą pożar domu. W szafie odkrywają szkielet kobiety w sukni ślubnej. Stalowe ściany kapsuły uchroniły szczątki przed ogniem, w przeciwieństwie do innych zwłok odkrytych na pogorzelisku. Okazuje się, że ofiary zmarły, zanim płomienie ogarnęły chatę. Analiza szkieletu kobiety w sukni ślubnej dowodzi, że jej kości wydobyto z grobu i ponownie połączono. Wykryte na nich obrażenia przypominają ślady tortur, którym poddawano niewiasty podejrzewane o czary w XVII wieku.

Rozpoczyna się proces Grabarza – seryjnej zabójczyni, która porywała i mordowała ludzi, zakopując ich żywcem. Ponieważ oskarżona była prokuratorem federalnym, sama broni się w sądzie przed zarzutami, m.in. zamordowania kilkuletniego chłopca. Ciała nigdy nie odnaleziono. Z powodu błędów proceduralnych, które Brennan świadomie popełniła przed rokiem, by ratować Bootha i Hodginsa, oskarżona może wyjść na wolność. Przyjaciele z instytutu Jeffersona muszą ponownie przeanalizować ślady w sprawie porwania dziesięciolatka.

Pewien chłopak ma wrażenie, że śnieg zaczyna padać w jego sypialni. Niespodziewanie sufit spada mu na głowę. Wraz ze stosem śmieci zsuwa się ludzki szkielet. Ofiara to mężczyzna, który z powodu choroby psychicznej zamienił mieszkanie w magazyn śmieci. Ślady na czaszce świadczą o tym, że został zaatakowany. Angela i Hodgins są bardzo szczęśliwi. Ojciec Angeli zjawia się nagle w mieście. Zleca Hodginsowi, by wykradł jego wóz z parkingu należącego do gangu szalonych motocyklistów.

Siedem miesięcy minęło od rozpadu ekipy i Caroline Julian wzywa zespół z powrotem do Instytutu Jeffersona w Waszyngtonie, aby uratować karierę Cam i pomóc rozwiązać kontrowersje dotyczące sprawy małego chłopca.

Zespół z instytutu próbuje odkryć tożsamość pary, której ciała zostały znalezione w jaskini. Dziewczyna Bootha – Hannah Burley, wraca do Waszyngtonu i Brennan ponownie ocenia swój związek z Boothem zdając sobie sprawę, że jemu naprawdę zależy na Hannah.

Booth i Brennan badają szczątki Richiego „V” Genaro, który był ostatnio widziany w Jersey Shore, klubie nocnym. Brennan zna się na tej pop-kulturze, gdyż wierzy, że oglądała o tym film dokumentalny, a tak naprawdę było to show telewizyjne. Tymczasem Hannah zaprzyjaźnia się z zespołem z instytutu Jeffersonian, a Angela stara się utrzymać ciążę w tajemnicy.

Zespół jedzie na poszukiwanie zaginionych części ciała po wcześniejszym znalezieniu czaszki i rozkładających się rąk w śmietniku. Ofiara została zidentyfikowana jako łowca nagród, który szuka mordercy o imieniu Charles Braverman. Zespół odkrywa, że inny łowca nagród szuka Bevermana, co jest dobrym motywem zabójstwa. W międzyczasie Brennan sprawia, że gwiazda show dla dzieci prof. Bunsen Jude „The Science Dude” (gościnnie David Alan Grier) jest jej nowym stażystą.

Zostaje zamordowany uliczny tancerz. Booth i Brennan podejrzewają kogoś z konkurencyjnej trupy. W międzyczasie, dziewczyna Bootha zostaje postrzelona, a Booth bardzo martwi się o jej zdrowie.

Behind the scenes of Bones

Zespół, podczas identyfikacji szczątków niewolników z wraku 150-letniego statku, odkrywa szkielet młodego mężczyzny, który jest znacznie młodszy niż pozostałe. Dochodzenie doprowadza Bootha i Brennan na rejs, który przeznaczony jest dla starszych kobiet szukających adoracji młodych mężczyzn. Tymczasem, Sweets ma kłopoty z utrzymaniem platonicznego związku z Daisy, a Cam dowiaduje się, że jej prababka znajdowała się na statku niewolników badanym przez zespół.

Kiedy znaleziono ludzkie szczątki w największej na świecie tabliczce czekolady, ekscentryczny potentat Candy (Wayne Knight) jest jednym z podejrzanych. Zespół zbadał zaskakujący sposób, w jaki szczątki dostały się do wnętrza czekolady. Tymczasem Cam martwi się o uczelnię, na którą uczęszczać ma Michelle, a Hodgins planuje powiedzieć przyjaciołom o ciąży Angeli, mimo że wszyscy już wiedzą.

Zespół bada interesujące przypadek skręconych kości znalezionej podczas eksplozji ciężarówki. Tymczasem Booth próbuje ułożyć dobrze stosunki między Hannah a Parkerem, a Daisy przygotowuje się do egzaminu FBI.

Brennan ma paranoję, bo porównuje ofiarę do siebie. Cała sprawa przybiera dosyć nieoczekiwany obrót.

Zespół bada śmierć kobiety pod prysznicem. Sprawa staje się coraz ciekawsza, gdy okazuje się, że wszystko ma związek z fałszerstwami na szeroką skalę markowych toreb. W badaniach asystuje Clark, który przeszedł swoistą odmianę.

Powraca Heather Taffet, lepiej znana jako „Grabarz”. Przed budynkiem sądu, w którym miała się odbyć apelacja, ktoś odstrzela jej głowę. Naukowcy z Jeffersonian razem z FBI mimo wielkiej ulgi starają się znaleźć sprawcę.

Zespół bada tajemniczą śmierć farmera, który żył w poligamicznym związku.

Odnalezione na dachu budynku zapleśniałe szczątki, doprowadzają zespół do szaleńców, dla których więcej warta jest sława niż własne życie. Tymczasem Booth planuje oświadczyć się Hannah.

Zwłoki organizatorki ślubów zostają odnalezione w łóżku do opalania. Ironicznie, całe wydarzenie ma miejscu w Dniu Świętego Walentego, gdy jedna z klientek ofiary miała wziąć ślub. Z uwagi na wieczorne plany prawie każdego członka zespołu śledczych, dr Saroyan nakłania do jak najszybszego rozwiązania sprawy i wyznacza ośmiogodzinny limit.

Powraca Jacob Broadski – snajper, z którym Booth służył w wojsku. Tymczasem ojciec Angeli chce mieć swój wkład w nadaniu imienia jej i Hodginsa dziecku.

W Waszyngtonie szaleje burza śnieżna. Brennan i Booth utykają w windzie, a w całym mieście wyłączają prąd, podczas gdy do instytutu trafia szkielet kobiety, na którym znajdują się ślady wirusa gorączki krwotocznej.

Na granicy kanadyjsko-amerykańskiej zostają odnalezione szczątki kilku par stóp. Ze strony amerykańskiej do śledztwa zostają przydzieleni dr Brennan i Booth. Po stronie kanadyjskiej wsparciem dla lokalnych służb jest dr Filmore – obsmarowany w artykule przez dr Brennan ekspert od ludzkich stóp. Pomimo animozji i wzajemnej niechęci wspólnie rozwiązują zagadkę.

Znalezione w lesie, pozbawione krwi oraz serca szczątki, noszące dziwne znamiona ugryzień wskazują, że sprawcą tej okrutnej zbrodni może być mityczny potwór chupacabra. Jak zwykle niektórzy sceptycznie, a inni entuzjastycznie, wszyscy w naukowy sposób próbują ustalić prawdę.

Na bagnach zostaje znaleziony szkielet, który doprowadza dr Brennan i Bootha do skradzionego z muzeum kawałka mapy. Booth wierzy, że w odnalezieniu zabójcy, jak i skarbu, do którego prowadzi mapa może pomóc Walter Sherman – lepiej znany jako „wyszukiwacz”. Posiada on niezwykłą zdolność odnajdywania rzeczy potencjalnie niemożliwych do odnalezienia. Odcinek jest tzw. spin-offem serialu Bones zaliczonym jako odcinek pilotujący dla nowego serialu pt. „The Finder”.

W donicy obok placu zabaw zostają odnalezione szczątki człowieka. Zespół natrafia na jego przynależność do grupy osób, dla których szczerość jest filozofią życia. Brennan i Booth, Angela i Hodgins oraz Wendell i Cam przekonują się, że bycie szczerym nie do końca jest właściwą życiową polisą.

Do Instytutu Jeffersonian trafia nietypowo żywy człowiek – głuchoniema dziewczynka, którą mogła być sprawcą lub świadkiem morderstwa. Zespół próbuje zmierzyć się z tą wyjątkowo trudną sprawą.

Booth trafia na trop Jacoba Broadskiego, który tym razem dopuszcza się wyjątkowo okrutnego czynu. Cały zespół staje na głowie, aby doprowadzić przestępcę przed wymiar sprawiedliwości.

W kręgielni zostają odnalezione zmasakrowane szczątki jednego z zawodników turnieju kręglarskiego. Booth i dr Brennan, z niewielką pomocą Maxa – ojca pani antropolog – próbują wtopić się w świat kręglarzy, aby rozwikłać zagadkę. W tym czasie Angela znajduje się w szpitalu i rodzi dziecko. Temperance wyznaje Boothowi, że jest z nim w ciąży.

Kiedy ekipa z Jeffersonian identyfikuje zwłoki kobiety znalezionej na polu do paintballa, w jej aktach odkrywa dwa reporty o zaginionych osobach. Booth oraz Sweets przesłuchują męża ofiary (gościnnie Brad Greenquist) i dowiadują się, że kobieta cierpiała na amnezję. Kiedy zezulec Wendell Bray (gościnnie Michael Grant Terry) odkrywa, że ofiara przeżyła również ranę postrzałową, niespójności w jej karcie medycznej odkrywają zaskakujące połączenie z jej śmiercią.

Ekipa z Jeffersonian identyfikuje zwłoki mistrza w zawodach w jedzeniu na dzień przed Gluttony Games (Zawody w Obżarstwie/Jedzeniu), premierowymi zawodami, na których stawką jest 10 tysięcy dolarów. Niezwykła praca wyjątkowo błyskotliwego nowego zezulca i byłego młodocianego przestępcy Finna (gościnnie Luke Kleintank) w celu rozwiązania zbrodni, łączy niejasne dowody znalezione w brzuchu węża z prawami fizyki. Mimo niezaprzeczalnego mistrzostwa w laboratorium, Finn spotyka się z wrogością i sceptycyzmem, co sprawia, że Cam (Tamara Taylor) zaczyna się zastanawiać, czy dobrze zrobiła dając mu szansę na nowy start. Tymczasem, Booth jest zaskoczony ogłoszeniem Brennan w sprawie ich dziecka. Aby rozładować napięcie między nimi, para zgadza się na eksperyment wiążący się z zamianą miejsc.

Po znalezieniu szczątków kierowniczki firmy zabawek, zawiniętych w folię wraz z lalką Czarującego Księcia, prezes spółki (gościnnie Morgan Fairchild) daje Boothowi i Sweetsowi dostęp do ściśle tajnego laboratorium prototypów w siedzibie firmy, gdzie zaczynają pojawiać się dane dotyczące życia prywatnego ofiary. Tymczasem, Sweets z pomocą swojej dziewczyny Daisy (gościnnie Carla Galo), przygotowuje się do testu na pozwolenie na broń, mimo sprzeciwu Bootha odnośnie posiadania przez niego broni. Przyszła mama, Bones zastanawia się, czy będzie dobrą matką i wykorzystuje sprawę, by zrozumieć ważność zabawek i zabaw z dzieckiem.

Na poczcie zostają odnalezione zwłoki jej pracownika, zapakowane w pudła. Ekipa z Jeffersonian stara się znaleźć zabójcę. Booth dowiaduje się, od swojego dziadka, że jego ojciec nie żyje. Brennan stara się pomóc Boothowi, mimo jego pozornej niechęci.

Na obozie zostają odnalezione zwłoki ofiary tornada. Ekipa z Jeffersonian stara się rozwikłać nietypową sprawę.

Na pomniku narodowym odkryto zagadkową wiadomość napisaną ludzką krwią. Kiedy zespół z Jeffersonian rozpoczyna polowanie, by rozwiązać sprawę, zdaje sobie sprawę, że ich zaznajomiony z techniką podejrzany (gościnnie Andrew Leeds) wciąż pozostaje krok przed nimi.

Szczątki zbiegłego skazańca zostają znalezione w kanałach ściekowych, ale ich badanie wskazuje, że morderstwa dokonano wewnątrz murów więziennych. Brennan naciska na rozwiązanie zagadki – choć Booth wolałby, żeby bardziej się oszczędzała – i tak nasza spodziewająca się dziecka para doświadczy nietuzinkowych narodzin córki.

Z pomocą agentki specjalnej Genny Shaw ekipa Jeffersonian identyfikuje szczątki klienta dyskontów, pasjonata kuponów rabatowych, którego ciało było ciągnięte wzdłuż drogi przez 18–kołową ciężarówkę.

Gdy zwłoki ufarbowane w niebieskiej substancji zostają znalezione przy składowaniu odpadów stażysta Arastoo Vaziri znajduje metodę, która pomaga eliminować pośmiertne uszkodzenia ciała. To prowadzi zespół do salonu fryzjerskiego gdzie pracowała ofiara.

Ciało pracownika przedsiębiorstwa transportowego zostaje znalezione w lesie. Po przesłuchaniu syna ofiary, Booth i Brennan w poszukiwaniu motywu odwiedzają szkołę karate, do której uczęszczał. Tymczasem w laboratorium Hodgins przekracza granice w zakupie sprzętu laboratoryjnego. Z Anglii wraca do domu syn Bootha, Parker, a Brennan martwi się o jego reakcję na nową siostrę…

Kiedy w środku lasu znalezione zostaje ciało, zespół łączy ofiarę z dwoma, skłóconymi od prawie wieku, rodzinami. Podczas przesłuchania członka rodziny Booth i Brennan zyskują szokujące zeznania, które prowadzą ich do odkrycia motywu morderstwa. W międzyczasie, Brennan przechodzi ciężki okres w związku z zaakceptowaniem jej ojca jako opiekuna ich córeczki, a to dlatego, że w jej dzieciństwie był nieodpowiedzialny.

Brennan i Booth jadą do Los Angeles do Hollywood aby móc obserwować jak powstaje film pt. „Kość niezgody”, którego scenariusz został oparty na książce Brennan. Na planie spotykają dr Filmora, specjalistę od stóp, który pracuje tam jako konsultant. Podczas kręcenia sceny w laboratorium, Temperance odkrywa, że rekwizyt mający udawać zwłoki jest prawdziwymi szczątkami. Przy pomocy aktora-odpowiednika Hodgins i dr Filmora Brennan i Booth zaczynają śledztwo.

Brennan jest podejrzana w sprawie morderstwa, którego nie popełniła. Razem z córką zostawia Bootha i ucieka z pomocą ojca.

Mija 3 miesiące od czasu, jak Bones uciekła przed aresztowaniem. W tym czasie jedynie Angela nieustannie bada dowody, które miałyby oczyścić przyjaciółkę. Podczas swej ucieczki w miejscowości, w której uczył się Christopher Pelant, Bones odkrywa zwłoki zamordowanej przed laty kobiety. Razem z ojcem anonimowo informują o znalezisku FBI. Szczątki ofiary wskazują na dzieło Pelanta, a Angie odkrywa kod, dzięki któremu udowadnia, że nagrania z kamery obwiniające Bones zostało spreparowane. Bones zostaje oczyszczona z zarzutów. Pelant zostaje zwolniony, okazuje się, że najprawdopodobniej spreparował całą swoją przeszłość i oficjalnie jest… Egipcjaninem.

Z pozoru zwykła kryminalna sprawa jest tłem do narastającego napięcia pomiędzy Bones, a Boothem. Zostaje zamordowany adwokat specjalizujący się w sprawach rozwodowych. Początkowo trop wiedzie do asystentki adwokata, która miała romans z żoną ofiary. Ostatecznie winnym okazało się małżeństwo, któremu zamordowany miał przeprowadzić rozwód. Bones zmienia się po 3-miesięcznej banicji, chce przejąć pod kontrolę większość spraw, które wcześniej wykonywała wraz z Boothem. Daje mu także do zrozumienia, że sama lepiej wie, jak wychować córkę. Prowadzi to do zgrzytów i kłótni. Na koniec odcinka wszystko sobie wyjaśniają i powraca między nimi zgoda.

W hotelowym garażu wybucha bomba-pułapka zabijając mężczyznę. Jednak Boot zostaje odsunięty od śledztwa przez prokurator Julian, która poleca mu przygotowanie prezentacji budżetowej. Jeśli Boothowi się powiedzie, ma obiecany awans i podwyżkę. W tej sytuacji śledztwo musi poprowadzić dr Sweets wraz z Olivią Sparling, początkującą agentką FBI. Sparling początkowo odnosi się do Sweetsa lekceważąco, dopiero z czasem nabiera przekonania do jego umiejętności. Ofiara wybuchu okazuje się przypadkowa – mężczyzna miał brata bliźniaka, o którym nie wiedział. Sprawczynią jest żona, która odkrywając, że mąż chce przeznaczyć wszystkie pieniądze na sektę, postanawia wynająć zamachowca. Booth w ostatniej chwili zrzuca przeprowadzenie prezentacji na dr. Saroyan, co kosztuje go utratę awansu. Sam udaje się ze Sweetsem i Sparling, by złapać mordercę. W trakcie strzelaniny Sparling postrzeli Sweetsa, a między tymi dwojga zaczyna powstawać chemia.

Skłócona para której samochód ugrzązł w błocie w makabryczny sposób odkrywa płytko zakopane ciało. Okazuje się, że życie ofiary wywróciło się do góry nogami po utracie rodzinnego interesu, przez co musiał podejmować się prostych prac poniżej swoich kwalifikacji. Podczas, gdy Bones rozważa plusy i minusy pomysłu o swojej kandydaturze na prezydenta USA, Sweets i Daisy mają zamieszkać razem. Sweets zdaje sobie sprawę z tego, że wspólne mieszkanie to ważny krok dla Daisy. Sam nie jest pewny tej decyzji i dlatego podejmuje decyzję o rozstaniu.

Operowy kierowca śmieciarki i jego kolega odkrywają zwłoki ukryte w jednym kubłów. Okazuje się że ofiara prowadziła wraz ze wspólniczką małą przetwórnię owoców w klasycznej rzemieślniczej dzielnicy. Zmasakrowane zwłoki prowadzą ekipę z Jeffersonian do odkrycia drugiego życia ofiary. Podejrzanym jest lekarz, u którego leczyła się kobieta i jej tajemniczy wielki ochroniarz. Sweets cierpi po rozstaniu z Daisy, wprowadza się do Bones i Bootha i jednocześnie szuka nowego mieszkania.

Dr Brennan zaprasza stażystów do udziału w nowym zadaniu, którym jest zidentyfikowanie jak największej liczby nieznanych zwłok. Młodzi antropolodzy sądowi rozpoczynają pracę w laboratorium. Okazuje się, że jedno z ciał to prawdopodobnie człowiek, który został ranny podczas ataku terrorystycznego na Pentagon 11 września 2001 roku. Booth jest wstrząśnięty, bo uświadamia sobie, że mógł znać ofiarę. Być może walczyli razem podczas Pustynnej Burzy. Agent specjalny FBI dociera też do akt policyjnych, które pomagają w identyfikacji ciała.

Na zaśmieconej plaży zostaje znaleziony plastikowy kokon wypełniony ludzkimi szczątkami. Antropolodzy ustalają tożsamość ofiary. To Charles „Lucky” Milner – profesjonalny czyściciel miejsc zbrodni. Jego kochanka, Renee Mitchell, sugeruje śledczym, że mordercą Charlesa może być jego czwarta żona, Lisa. Śledczy przesłuchują także Melvina Carville'a, rywala zmarłego w interesach. Jednak żaden z tropów nie okazuje się być tym właściwym. Śledztwo utyka w martwym punkcie.

Uliczny artysta, który potajemnie zakleja billboardy swoimi dziełami, spada z dużej wysokości na kubeł kleju i ludzkie szczątki. Strzała w głowie denata sugeruje, że doszło do morderstwa. Ślady po operacji szyi pomagają ustalić, że ofiara to Morgan Donnelly, zaginiony przed trzema dniami pracownik firmy telekomunikacyjnej. Booth odwiedza jego byłą dziewczynę. Ta reaguje głośnym śmiechem na wieść o tragedii. Dr Brennan ustala, że Morgan został dotkliwie pobity. Okazuje się, że ofiara była komikiem, Booth musi wziąć udział w wieczorze talentów kabaretowych. Angela odkrywa, że przyklejony do szczątków dziwak, to ukrywający swoją tożsamość pod pseudonimem Zed, utalentowany artysta. Robi on na Montenegro wielkie wrażenie.

W opuszczonej szklarni znaleziono czaszkę. Brennan ze smutkiem stwierdza, że to część ciała dziecka płci męskiej. Do instytutu przychodzi medium. Kobieta uważa, że wezwała ją dusza ofiary. W trakcie badań wychodzi na jaw, że chłopiec miał około 14 lat i został zamordowany. Dopasowanie w bazie zaginionych wskazuje, że ofiara to zaginiony przed dwoma laty Colin Gibson. Brennan i Hodgins analizują dziwne przebarwienia na jego kościach. Gdy okoliczności śmierci chłopca zostają wyjaśnione, medium twierdzi, że Colin pragnie coś przekazać.

W trakcie programu reality show łowca duchów w poszukiwaniu zjawisk paranormalnych zapuszcza się do groty, w której znajduje kościotrupa świecącego w ciemnościach. Badanie kości sugeruje, że ofiarą jest biała kobieta. Uwagę dr Brennan przykuwają uszkodzenia obu stóp. Inne cechy anatomiczne dowodzą, że zmarła była gimnastyczką lub tancerką. Okazuje się, że niedawno zaginęła dziewczyna, która profesjonalnie ćwiczyła taniec towarzyski. Wszystko wskazuje na to, że zamordowano ją trzy dni przed przesłuchaniem do popularnego telewizyjnego show. Booth i dr Brennan decydują się wystąpić w konkursie tańca, by ustalić, kto zamordował dziewczynę. Angela przechodzi kryzys związany z pracą w instytucie, brakuje jej piękna sztuki. Pod wpływem Hodginsa Cam zmniejsza wymiar etatu Angeli, by ta mogła zając się malarstwem.

Spadochroniarz zawisł na dużej wysokości. Na czubku drzewa zauważa szkielet w białym kokonie. Ofiara to James Sutton – osławiony podróżnik i archeolog, znany jako autor popularnych powieści przygodowych. Wdowa po nim, Marina, przychodzi do biura FBI. Wręcza Boothowi klucz do magazynu, gdzie jej mąż schował przywiezione z Rosji kości. Jedne należą do neandertalczyka, a drugie pochodzą od Homo sapiens. Temperance znajduje trzeci szkielet, który może świadczyć o tym, że Sutton dokonał epokowego odkrycia.

Gdy Jack i Angela budzą się z głębokiego snu, zauważają nad łóżkiem wiszące krwawiące ludzkie zwłoki. Uświadamiają sobie, że wrócił Pelant – psychopata, który wcześniej prześladował Brennan i Bootha. Przy łóżeczku dziecka Hodginsów szaleniec zostawił kwiaty, które oni znajdowali na miejscach jego poprzednich zbrodni. Na rozkaz Bootha w laboratorium zostaje zainstalowane dodatkowe zabezpieczenie. Pracownicy instytutu wiedzą, że Pelant sprofanował szczątki ofiary tak, by były dla nich komunikatem. Pelant włamuje się do tajnych systemów FBI i kontroluje działania ekipy z instytutu. Hodgins używa do porozumiewania się z Boothem Enigmy, by nie korzystać z elektroniki. Okazuje się, że Pelant uzbroił wojskowego drona i skierował go na szkołę dla dziewcząt w Afganistanie. Podczas przekierowywania lotu drona, z kont Hodginsa zaczynają znikać pieniądze, Jack musi dokonać wyboru: pieniądze albo życie dzieci. Podczas akcji w siedzibie agentów namiestników – Serpentus, ciężko ranny zostaje Hayes Flynn, agent FBI, który pomaga Boothowi. Pelant postrzelony przez Bootha w twarz, znów ucieka.

Kobieta jadąca na segwayu przez nieuwagę upada wprost na fragment czaszki wystający z ziemi. Bones przeprowadzając oględziny odkrywa że w ziemi znajdują się dwie ofiary. Dzięki identyfikacji okazuje się że jedną z nich była śmiertelnie chora kobieta chcąca być pochowana w naturalny sposób. Temperance i Booth podczas prowadzenia śledztwa rozmawiają o swoich testamentach. Sweets i Daisy spotykają się po raz pierwszy po rozstaniu. Oboje wciąż coś do siebie czują, ale nie zmieniają wcześniej podjętej decyzji.

Jeden z policjantów wezwanych do zgłoszenia w starej rzeźni wpada na ciało. Po przybyciu na miejsce specjaliści z Jeffersonian odkrywają, że ofiara została zamordowana zaledwie kilka godzin wcześniej, a zwłoki musiały zostać w czymś rozpuszczone. Trop prowadzi do grupy niezwykle brutalnych wrotkarek biorących udział w wyścigach roller derby. Ofiara miała dość bogate życie erotyczne. Podejrzanym jest zazdrosny mąż. Booth w tajemnicy odwiedza szpital. Cam i Angela martwią się o jego zdrowie. Okazuje się, że Seeley charytatywnie pomaga dzieciom chorym na neurofibromatozę.

W parku narodowym New River Gorge, na skałach pod mostem znaleziono ciało mężczyzny. Charakterystyczne złamania kości sugerują, że sam odebrał sobie życie. Samobójstwo szybko zostaje wykluczone. Ciało zostało zrzucone po tym, gdy doszło u ofiary do ataku serca. Po kłótni z Boothem Brennan wraca do laboratorium. W ciemności ktoś do niej strzela. Booth znajduje ją ranną kilka minut później. Gdy Brennan trafia do szpitala, jest już nieprzytomna. A wkrótce potem jej stan się pogarsza. Na terenie instytutu zostają znalezione zwłoki strażnika. W ciele Brennan nie ma pocisku, Hodgins przypuszcza, że mógł być zrobiony z lodu. W stanie śmierci klinicznej Bones spotyka się ze swoją matką, która przekazuje wiadomość dla Maxa.

Bezdomny wyłowił z rzeki walizkę. Gdy chce ją sprzedać w lombardzie, okazuje się że w środku znajdują się zwłoki piętnastoletniego chłopca. Ofiara to zaginiony przed dwoma tygodniami Manny. Po raz ostatni nastolatek był widziany, gdy wybierał się na imprezę, na której była jego przyjaciółka Kat. Badania toksykologiczne wskazują, że chłopiec przed śmiercią zażył narkotyk. Okazuje się, że dorabiał, naprawiając telefony i komputery. Booth i Sweets odwiedzają kolegów Manny'ego. Ci zapewniają, że unikał on używek. Okazuje się, że chłopak był zakochany i próbował ratować swoją koleżankę przed gwałtem. Finn Abernathy w tajemnicy przed Cam spotyka się z Michelle, która przyjechała z uczelni tylko do niego. Nie wytrzymuje napięcia i wyjawia wszystko szefowej.

Na polu rolnik znalazł zwłoki bez głowy. Szczątki spoczywały w płytkim grobie. Obecność chrząszczy świadczy, że do morderstwa doszło przed pięcioma dniami. Ofiara to Benji Garcia. Chciał on być naukowcem i miał zostać pierwszą osobą w rodzinie, która ukończy college. Jego brat, Alex Garcia, właściciel warsztatu samochodowego, przekonuje Bootha i Sweetsa, że ktoś mógł zabić Benjiego dla zabytkowego auta, które ten naprawił. Angela przegląda komputer Benjiego. Odkrywa, że mężczyzna interesował się fizyką i miał obsesję na punkcie czasu.

Do laboratorium zostaje przywieziona beczka ze szczątkami zatopionymi w mydle. Akcja odcinka toczy się wokół środowiska afrykańskich imigrantów, a za śmiercią ofiary wydaje się stać jeden z uchodźców. Okazuje się, że chłopak w czasie wojny domowej w Sierra Leone był dziecięcym żołnierzem. Na wystawie zdjęć z tego okresu, zauważył coś, co doprowadziło do jego śmierci. Relacje Arastoo i Cam zaczynają być widoczne w trakcie ich pracy. Pod wpływem wspomnień wojennych Arastoo, decydują się ujawnić swój związek.

Kobieta zostaje znaleziona w spalonej szopie. Okazuje się, że zginęła od wybuchu. Z jej śmiercią powiązana jest grupa osób przygotowującą się do przetrwania nadejścia końca cywilizacji. Wybudowali schron, w którym chcieli przetrwać koniec świata. Daisy odkrywa, że ofiara była chora na kiłę. Sweets postanawia się w końcu wyprowadzić od Bootha i Bones.

Znaleziono wyschnięte zwłoki na opuszczonym placu. W żołądku były diamenty. Okazało się, że to policjant pracujący jako tajniak w salonie jubilerskim. Jego przełożony broni honoru zmarłego policjanta i nie wierzy w kradzież klejnotów. Podejrzani stają się złodzieje, których rozpracowywał. W trakcie śledztwa kręcony jest film o Instytucie. Każdy chce zaistnieć w dokumencie. Twórca filmu, a jednocześnie kamerzysta zakochuje się w pani prokurator od pierwszego wejrzenia z wzajemnością.

Szukając wskazówek zostawionych przez znajomych para odnajduje czaszkę zasypaną ziemią w opuszczonym budynku. Ofiarą jest asystentka sędziny z telewizyjnego show. Hodgins zjada ostatnią butelkę sosu zrobionego przez zmarłą babcię Abernathy'ego. Finn jest zrozpaczony. Hodgins postanawia naprawić ten błąd, tworzy sos od podstaw. Christine ugryzła w żłobku koleżankę. Brennan nie wierzy w jej winę.

Po wyburzeniu budynku operator koparki wydobywa z gruzów ciało maklera-striptzera. Okazuje się, że ofiara bez skrupułów narażała swoich klientów na straty finansowe. Jako striptizer, mężczyzna był również ryzykantem, przespał się z panną młodą na wieczorze panieńskim. Bootha niespodziewanie odwiedza matka, która zostawiła go w dzieciństwie. Seeley na początku bardzo się cieszy ze spotkania. Jednak dowiaduje się, że matka jest w związku i chce wyjść za mąż. Musi zdecydować, czy jej wybaczy.

Z zakładu utylizacji przywieziono szczątki kobiety zarażone nieznanym wirusem. Okazuje się, że ofiarą jest blogerka, która rozpracowywała nielegalne mutacje wirusów w jednym z instytutów farmaceutycznych. Została zakażona wyjątkowo zjadliwą mutacją wirusa z Afryki. Arastoo podczas przenoszenia szczątków, zakłuwa się igłą i zostaje zarażony. Jego organizm szybko słabnie, po dwóch godzinach jest już w stanie krytycznym. Tylko szybkie odnalezienie winnego pozwoli na uratowanie jego życia. Hodgins i Brennan na podstawie afrykańskiej medycyny ludowej tworzą lek roślinno-zwierzęcy, który podają Arastoo. Stan stażysty poprawia się na jakiś czas, jednak wirus jest silniejszy. Cam robi, co może, by uratować ukochanego. Podejrzaną staje się kobieta, która pracowała kiedyś z wirusami. Niespodziewanie okazuje się, że mutacje stworzyło laboratorium Simatech ecolab. Jego szef nie chce oddać antidotum. Brennan chwyta strzykawkę z wirusem i wbija ją w szyję dyrektora laboratorium.

Na szlaku odkryto ciało z dwunastoma postrzałami. Szybko okazuje się, że za morderstwem stoi znany już widzom seryjny zabójca – Christopher Pelant. Ofiarą jest agent FBI, z którym kiedyś pracował Booth. Kolejną ofiarą jest kolejny agent. Okazuje się, że ma to związek z masakrą w Crystal Creek. Pelant wykorzystuje córkę jednego z zabitych tam agentów, wysyłając do niej video maile od ojca. Dziewczyna ma zabić Sweetsa. Mimo niesprzyjających okoliczności Bones oświadcza się Boothowi. Seeley jest bardzo szczęśliwy. Przerywa to Pelant szantażując Bootha. Jeśli się ożeni z Bones, to on zabije pięć niewinnych osób. Booth nie może powiedzieć Brennan prawdy. Temperance bardzo cierpi.

Sfrustrowany Seeley marzy wyłącznie o tym, by dopaść i zabić psychopatę. W dodatku ciężko mu zachować w tajemnicy umowę, jaką z nim zawarł. W końcu agent odwiedza byłego kapelana i starego przyjaciela Aldo Clemensa. Postanawia wyznać mu, dlaczego okłamał ukochaną kobietę. Tymczasem pracownicy laboratorium oraz Federalnego Biura Śledczego starają się określić tożsamość człowieka, którego szczątki znaleziono w klimatyzatorze hotelowym. Wszystko wskazuje na to, że ofiarę wyrzucono z okna sąsiedniego budynku. Wstępne badania przeprowadzone przez Temperance potwierdzają tę hipotezę. Po szeregu badań okazuje się, że zmarły to Jason Siedel, pracownik Departamentu Stanu. Booth i Sweets odwiedzają biuro i dom denata. Mieszkanie ofiary wygląda na starannie wyczyszczone, jednak przebywa w nim intruz, który na widok niespodziewanych gości rzuca się do ucieczki. Seeley rusza za nim w pościg. Gdy go zatrzymuje, stwierdza, że to jego dawny kumpel z armii, obecnie pracownik CIA, Danny Beck. Należy sądzić, że Siedel nie był osobą, za którą się podawał.

Hycle łapią przy śmietnikach rysia żerującego na ludzkich szczątkach. Okazuje się, że to koreański biznesmen, który spędzał czas z kochanką w ośrodku dla par małżeńskich. Bones i Seeley pracują nad sprawą pod przykryciem jako Tony i Roxie Scalion. Podejrzanym w sprawie jest oszust – właściciel ośrodka oraz żona ofiary. Angela nie rozumie jak Brennan mogła wybaczyć Boothowi odmowę. Ktoś dokonuje oszustw finansowych korzystając z tożsamości Cam. Policja i prokuratura zamrażają Cam konta i karty kredytowe. Dr Saroyann nie chce korzystać z pomocy przyjaciół, w końcu kontaktuje się z adwokatem, którego polecił jej Hodgins oraz przyjmuje pomoc w księgowaniu od Angeli. Booth i Brennan są ze sobą bardzo szczęśliwi.

W spalonym samochodzie znaleziono ciało latynoskiego gangstera. Użyta do zabójstwa broń jest wypożyczana przez jeden z gangów swoim członkom. Booth prosi o pomoc Sweetsa, który jest na urlopie i nadal czuje się winny w sprawi Pelanta. Booth i Sweets podejrzewają o morderstwo konkurencyjny gang. Sweets pracuje w Centrum Kultury, gdzie przychodzi syn latynoski z gangu Estrellas. Okazuje się, że to on brał udział w morderstwie. Matka odrzuca go, Sweets znajduje mu rodzinę zastępczą i wraca na urlop.

Wykorzystując narcystyczną słabość Pelanta zespół zamienia ciało oddane przez denata do celów naukowych Instytutu w makabryczne dzieło seryjnego mordercy, by media zainteresowały się nim, co powinno wywołać zazdrość Christophera i doprowadzić do błędu w jego „grze”, jednak gdy otrzymują wezwanie do morderstwa odkrywają, że mimo podobieństw nie jest to ciało, które spreparowali. Okazuje się, że to ciało agenta Flynna, który pomagał im w tej tajnej akcji. Z powodu braku dowodów, zespół dopuszcza możliwość zdrady Flynna. Booth wierzy w uczciwość przyjaciela. Obok ofiary biegli odnajdują też kwiat tojadu zostawiony przez Pelanta, który ma oznaczać „wróg jest blisko”. Pelant pojawia się w Instytucie i rozmawia z Brennan opowiadając jej o tajemniczej morderczyni. Kości rzekomych ofiar nałożone na mapę nieba wskazują miejsce pobytu Pelanta. Sweets podejrzewa, że Christopher pragnie zdobyć Brennan. Bones jedzie do niego, w ślad za nią podąża Booth. Pelant próbuje przekonać Bootha, że Brennan bardziej zależy na nim niż na narzeczonym. Booth strzela do mordercy. Pelant umiera. Booth oświadcza się Brennan i wyjawia jej tajemnicę poprzedniej odmowy.

Znaleziono zwłoki wiszące na linie na ścianie skalnej. Ofiarą okazuje się być mężczyzna chory na raka w stadium terminalnym, ciężko więc powiedzieć kto mógł chcieć przyspieszyć jego śmierć. Okazuje się, że mężczyzna realizował zadania z listy „co warto zrobić przed śmiercią”. Poza tym w internecie zamieszczał filmiki o życiowych prawdach. Podejrzaną staje się żona ofiary, która skorzysta po jego śmierci z tantiemów. FBI kupiło program VAL, który miał zastąpić Sweetsa w profilowaniu przestępców. Sweets czuje się niedoceniany. VAL źle typuje mordercę. Booth i Brennan planują ślub.

Odbywa się próba ślubu Brennan i Seleeya, kiedy nagle zaczynają wszystkim dzwonić telefony. Pomimo ich wyłączenia ksiądz odbiera swoją komórkę i przekazuje ją Boothowi, gdyż odnaleziono szczątki sprzed ponad 30 lat i było to o wiele pilniejsze niż prywatne życie głównych bohaterów. Hoggins zbiera zakłady względem tego kiedy para odwoła swój ślub z powodu pracy nad morderstwem. Booth zapala świeczkę w kościele za matkę Temperance. Wieczorem dowiadują się, że kościół spłonął. Wszyscy są zaangażowani w pracę nad śledztwem, by odciążyć Brennan. Angela razem z Hodginsem organizują ślub awaryjny w ogrodzie, którego udziela były wojskowy kapłan – kolega Bootha. Temperence i Selley stają się małżeństwem.

Booth i Brennan są w podróży poślubnej. Booth chce się wylegiwać w słońcu i pić piwo, ale Bones zaprasza go na wycieczkę do prosektorium. Odkrywa przy tej okazji, że jedne z kości wykopanych z mogiły zbiorowej pełnej ofiar dawnego reżimu są świeże. Po zbadaniu szczątków okazuje się, że zawierają Cyklon B, gaz używany do zabijania ludzi w obozach koncentracyjnych. Ofiara to bogaty były nazista, któremu udało się uciec przed sądem. Podejrzaną staje się młoda żona. Okazuje się, że miejscowa antropolog sądowa jest jego wnuczką. Booth jako agent Andy – postać z książek Brennan jest niemal noszony na rękach przez „tubylców”.

Para nastolatków znajduje ciało wmontowane w tamę bobrów. Okazuje się, że to model, który dorabiał sobie sprzedażą spermy. Skłamał jednak na temat swojego wykształcenia, co przysporzyło mu wrogów. Hodgins wykluwa w swojej szyi jajo muchówki oczekując na „poród”. Angela jest na niego zła. Większość pracowników instytutu uważa to za odrażające, jedynie dr Brennan podziwia go za poświęcenie. Larwa rośnie, a guz na szyi Hodginsa się powiększa i zaczyna sprawiać ból. Ostatecznie owad się wykluwa i otrzymuje imię Jefferson.

Brennan jest ławnikiem w głośnej w mediach sprawie o morderstwo. Oskarżonym jest znany sportowiec, a ofiarą jego żona. Piłkarz jest pewny siebie i ma dobrego adwokata. Podczas posiedzenia ławników, za sprawą dr Brennan, zapada decyzja o uniewinnieniu. Okazuje się, że szczątki na stole w Jeffersonian to niedoszły świadek oskarżenia. Bones czuje się winna wypuszczenia sportowca. Cała ekipa stara się udowodnić winę piłkarza. Cam nadal nie może się uporać z problemem z kradzieżą jej tożsamości. Angela stara się pomóc. W koncu odnajduje złodziejkę tożsamości Cam. Okazuje się nią być dawna współlokatorka Cam, która we wszystkim ją naśladuje.

W szkolnej stołówce dzieci znajdują w gulaszu wołowym kawałki człowieka. Trop prowadzi do firmy produkującej ten puszkowany gulasz. Okazało się, że ofiarą był pracownik firmy, chemik, biolog, fizyk, który zajmował się żywnością. W ostatnim okresie przekonał się do zdrowej żywności i odkrył, że w fabryce używa się niedozwolonych składników. Brennan uważa, że jej życie nie zmieniło się po ślubie. Angela organizuje jej wieczór panieński. Temperance, Angela, Cam, Daisy i Caroline przebrane za kowbojki jadą na imprezę. Bawią się świetnie, ale zabawa kończy się bójką w barze. Na drugi dzień wszystkie kiepsko się czują. Booth w końcu godzi się z Angelą.