Il team del Jeffersonian indagherà sulla morte di Jack Spindler, impiegato modello di giorno e spogliarellista di notte e quando i resti dell’uomo vengono trovati in un sito di demolizione ed emerge quanto il secondo lavoro della vittima influenzasse la sua vita privata, gli agenti iniziano a torchiare l’amico dello spogliarellista, Storm. Nel frattempo, dopo ventiquattro anni di assenza, la madre di Booth ricompare con una speciale richiesta per lui.

Il team del Jeffersonian deve evitare la diffusione di un virus letale, mentre investiga sull’omicidio della giornalista Mia Garrett, il cui corpo è stato ritrovato in un impianto di rischio biologico. Quando il virus che ha ucciso Mia contagia anche lo stagista Arastoo Vaziri, la sua unica speranza di sopravvivenza è che il team riesca a trovare l’assassino, dando il via ad una gara contro il tempo per poter trovare una cura e salvare la sua vita e quella di milioni di persone.