언제나 돈에 쪼들리지만, 전 애인인 아야노와 헌신적으로 자신을 돌봐주는 키사라의 지원 덕분에 어떻게든 살아가고 있는 슈. PMC로서 일을 하는 것도 상황은 비슷해서, 오늘도 아야노의 협력 덕분에 카지노에서 일어난 D 재해 대책 사업 입찰 경쟁을 덤핑 된 가격으로 따냈다. 악마 퇴치 현장에서는 키사라의 악마의 힘에 기댈 생각이었지만, 돈 때문에 기분을 상하게 만든 탓에 그녀의 모습은 보이지 않았다. 어쩔 수 없이 아야노가 소속된 대형 PMC와 협력해 악마와 대치했지만, 점점 싸움의 형세가 이상해져 가고 있었는데.

슈가 살고 있는 집의 여벌 열쇠를 손에 넣어 키사라는 매우 기분이 좋았다. 이에 반해 슈의 마음은, 회사의 재무 상황까지 멋대로 파악하며 점점 생활 반경을 침식해가는 그녀로 인해 마냥 편하지는 않았다. 하지만 그 이상으로 문제인 것이 바로 생활비가 없다는 것. 기다리고 있었던 입금이 계산 착오로 한참 뒤에야 들어온다는 걸 알게 된 슈는 아케노에게 부탁해 2차 하청 일을 하게 되었다. 이리하여 슈와 키사라는 베이론 시티 수뇌부 설립 25주년 기념 파티를 경호하고 예고된 테러로부터 시장을 지키는 일을 맡게 되었는데.

베이론 시티 상점가 중심에서 발생한 대규모 정전. 그것은 거대한 애벌래 형태의 악마 빙의자에 의해 발생한 D 재해였다. 어디선가 그 악마 빙의자에 대한 자세한 정보를 얻는 슈는, 이를 '해야 할 일'이라고 판단해 아야노를 통해 뒤에서 손을 썼다. 이리하여 언제나처럼 덤핑 된 가격으로 슈네 회사가 입찰에 성공하는 듯했으나, 그 순간 악마 빙의자에 관련된 중요한 정보가 새롭게 판명되었다. 사태가 심상치 않다고 판단한 사람들에 의해 입찰은 중지되었고 슈는 재해 대책 업무에서 배제되게 되었는데.

대규모 정전의 원인이었던 악마 빙의자를 퇴치했지만 사건을 완전히 수습하는 데는 실패했고, 베이론 시티에는 전력 부족이 계속되고 있었다. 그런 가운데, 아야노가 수수께끼의 남자와 만나고 있는 모습을 목격한 키사라는 슈의 마음을 확인하기 위해 이를 촬영해 SNS에 올렸다. 한편, 퇴마국 형사인 미카미 앞으로 급히 달려온 슈는, 생각지도 못한 흐름으로 아야노가 자신에게는 숨기고 뒤에서 무언가를 획책하고 있다는 걸 깨닫고 말았다. 둘 사이에 이제까지는 없었던 긴장감이 흐르기 시작했는데.

악마 빙의자의 타깃이 되어버리고만 아야노. 키사라의 도움으로 간신히 첫 번째 습격으로부터 도망치는 데는 성공했으나, 그녀는 악마 빙의자의 눈을 피하기 위해 격리 생활을 시작했다. 그 무렵 슈는 자신의 과거에 대해 잘 아는 미카미로부터 협력할 것을 제안받았다. 이야기에 응한 슈로부터 정보를 얻은 미카미와 퇴마국은, 악마의 대리인으로서 계속해서 악마 빙의자를 만들어내고 있는 남자의 신원을 파악하고 그 소굴에 발을 디뎠는데.

슈와 아야노가 창고에서 보낸 시간에 대한 기억을 본 이후 키사라는 슈의 방에서 멀어지게 되었다. 반대로 아야노는 키사라가 없는 틈을 타 슈를 돌보게 되면서 연인이 된 기분을 만끽했다. 그 모습을 SNS를 통해서 확인한 키사라는 점점 더 괴로워하며 지내게 되었다. 그런 삼각관계가 이루어지는 가운데 베이론 시티에 폭력의 폭풍이 거칠게 불어닥쳤다. 수녀복 차림으로 어느샌가 나타나 악마 재해 현장에 난입해, 불합리한 만행을 거듭하는 금발 미소녀의 정체와 목적은 과연.

성천 교회. 겉으로는 박애주의를 내세운 세계 최대의 엑소시스트 집단. 돌연 베이론 시티에 나타난 수수께끼의 수녀의 정체는, 그 성천 교회 안에서도 한층 더 위험한 존재인 12명의 엑소시스트들 중 하나이자 '순결한 샤론'이라고도 불리는 샤론 홀리그레일이었다. D 재해를 둘러싼 권력의 구조를 흔드는 새로운 힘의 등장에 퇴마국 관계자는 위기감을 강하게 느끼고 있었다. 그런 가운데, 키사라는 부상당하고 잠든 슈 앞에서 아야노에게 자신과 슈, 샤론 사이에 인연이 생겼던 설산에서의 일에 대해 말하기 시작했는데.

슈와 키사라의 분투로 퇴마국은 샤론의 신병을 구속하는 데에 성공하고 베이론 시티에는 다시 평온이 찾아왔다. 슈는 다시 한번 협력자인 미카미와 마일즈와 함께, 누군가의 의지가 개입되어 전부터 연속해서 발생하고 있는 D 재해의 진상을 쫓았다. 살해당한 악마 대리인인 하나무라 준야의 배후에 있을 것으로 추측되는 진짜 대리인의 정체를 밝히기 위해 추리에 추리를 거듭한 끝에, 미카미는 어떤 결론을 이끌어내고 급하게 슈에게 연락하려 했는데.

모인 모든 증거가 가리키는 참 악마 대리인. 그 사람은 슈가 누구보다도 신뢰하는 인물이었다. 경찰청과 AAA의 일인자 사이에 거래가 오가는 가운데 슈는 홀로 진범과 대치했다. 왜. 어째서. 그러한 질문들이 흘러나왔지만, 대답 대신 그의 눈앞에서 진범은 흉악한 악마의 모습으로 변모했다. 그 힘은 너무 압도적인 나머지 AAA의 전력을 집결해도 대미지를 줄 수 없었다. 이대로라면 소중한 사람들까지 다치게 되는 상황. 슈는 격렬한 분노와 깊은 슬픔을 가슴에 품은 채 악마를 쓰러뜨리기 위해 키사라에게 소중한 기억을 넘겨주기로 결심했는데.

키사라가 악마로부터 기억을 빼앗은 것으로 인해, 12년 전 슈와 그의 가족들에게 닥친 사건의 전말이 명확해졌다. 모습을 바꾸고 시간을 초월해서 백 년 이상 전부터 세계 각지를 활보하며, 악마 빙의자를 만들어내 인간에게 해를 입힌 악마 '아스모데우스'. 성천 교회가 원수로서 쫓고 있는, 재액 그 자체인 그 존재가 슈의 아버지를 죽이고 동생을 앗아간 진짜 적이었다. 거기에다 그 악마는 베이론 시티의 번영의 근간인 오르고늄의 근원과도 관련이 있었다. 사태는 어느새 시티를 넘어서 인류와 악마의 명운을 건 싸움으로 발전했는데.

인공 섬을 무대 삼아 모든 것의 원흉인 악마와의 싸움이 한창인 가운데, 슈 앞에서 키사라가 창에 찔렸다. 아야노와 샤론의 도움을 받아 어쩔 도리 없이 그 자리에서 대피하는 슈가 본 것은, 그가 그토록 찾았던 여동생 칸나였다. 그 후 베이론 시티의 총전력을 결집한 인류의 필사적인 저항이 있었음에도 불구하고, S급 악마로 인정된 칸나에 의한 대규모 재해는 점점 그 범위를 확대했다. 심하게 당한 탓에 의식은커녕 생명 반응도 완전히 없어진 키사라를 그저 바라볼 수밖에 없는 슈. 그런 그의 마음에 답하듯이 키사라가 눈을 떴는데.

완전 처음인 것처럼 돌아온 슈와 키사라의 관계. 키사라의 마음을 파악한 슈는 이번에는 자신이 그녀를 지키겠다고 결의했다. 그러는 가운데 베이론 시티에 S급 악마 칸나의 대공세가 닥쳐왔고, 공항이 불타버리는 등 막대한 피해를 더 이상 숨길 길이 없어 외국의 여러 나라들에도 베이론 시티의 위기가 알려지기 시작했다. 이대로라면 독립 자치를 유지할 수 있을지조차 불투명한 상황. 그런 가운데 어째서인지 칸나는 중요 인물도 아닌 아야노를 집요하게 노렸고, 아야노는 이에 전력으로 저항했으나 S급 악마의 맹공 앞에 결국 한계에 다다랐다. 하지만 그 순간에 이변이 발생했는데.

인간과 악마가 뒤섞여, 갖가지 의도가 교차하고 폭염에 휩싸인 전장에서 12년간의 공백을 메우려는 듯 격하게 부딪히는 슈와 칸나. 이렇게 세계의 명운을 건 남매 싸움에 어떻게든 끼어들어 보려 하는 아야노, 샤론 그리고 키사라. 최강의 악마를 저지할 수 있는 건 악마의 힘뿐. 그렇게 다시 한번 슈와 키사라가 손을 잡았고, 둘의 겹쳐진 마음은 격하게 분노한 칸나에게 닿을 수 있을 것인가. 그리고 싸움 끝에 인간과 악마의 미래는 어디로 향할 것인가.