우주 산업계 대기업 베네리트 그룹이 경영하는 아스티카시아 고등 전문 학원. 수성에서 온 편입생 슬레타 머큐리는 학원에서 시작될 새로운 생활에 마음이 설렌다. 그런데 도착 직전, 슬레타는 우주를 떠다니는 형체 하나를 발견한다.

급히 시작된 주식회사 건담 프로젝트. 사장이 된 미오리네는 지구 기숙사 멤버들을 사원으로 끌어들인다. 하지만 급조된 회사인 탓에 사업 내용이 정해지지 않았는데. 미오리네는 건담의 저주를 풀 계기를 위해 프로스페라를 찾는다.

플랜트 쿠에타를 습격한 2기의 건담. 슬레타와 떨어져 버린 미오리네는 합류를 위해 시설 속을 달린다. 한편, 슬레타는 미오리네를 구하기 위해 앞으로 나아간다.