Heller viene rapito e Jack cerca di convincere Driscoll a riassumerlo al CTU; Driscoll accetta ma Jack si ritrova nel ruolo di semplice subordinato. Insieme a una squadra operativa va a prelevare Andrew. Behrooz riceve il suo primo in carico e si trova in conflitto tra la lealtà dovuta alla sua famiglia e i sentimenti che prova per la sua ragazza. I rapitori di Heller annunciano le loro richieste attraverso internet e Heller cerca di rassicurare sua figlia.

Jack rintraccia Kalil grazie all'aiuto di Chloe, ma è costretto ad assistere impotente mentre Andrew viene torturato per ottenere informazioni. I genitori di Behrooz gli ordinano di portare Debbie a casa loro per interrogarla. Curtis decide di usare le maniere forti per interrogare il figlio di Heller mentre Driscoll continua a cercare Jack.

Jack prende drastiche misure per assicuare a Chloe il tempo necessario per ottenere la sorveglianza satellitare. Nel frattempo Driscoll comincia a sospettare di Chloe la quale chiede aiuto a Edgar. Behrooz scopre fino a che punto sua madre è pronta a spingersi per assicurare il successo della loro missione segreta. Heller e Audrey cercano di scappare dalla mani di Omar. Driscoll usa la sua influenza per affrontare una crisi personale.

In seguito a un errore commesso dalla polizia con Kalik, Jack e Driscoll raggiungono un accordo per lavorare insieme. Heller e sua figlia prendono una decisione drastica per evitare di affrontare la situazione in cui si trovano. Driscoll fa un accordo con Chloe per liberarsene mentre la famiglia Araz deve affrontare un altro problema che riguarda la loro copertura.

Jack è impegnato in una sparatoria rovente contro i terroristi per salvare Heller e Audrey prima dell'intervento dei militari. Il marito di Dina svela i suoi piani per Behrooz e Dina comincia a dubitare della sua fede alla causa. Driscoll e Curtis scoprono ulteriori prove che guidano a un massiccio attacco terroristico. Audrey incontra suo marito con un certo imbarazzo, mentre Heller si scontra ancora una volta con suo figlio.