洛根知道玛莎的决定后大为恼怒，但又不能通知保安部门改变路线，因为这会使前功尽弃。诺维克担心玛莎会告诉俄国总统事实真相，让白宫陷入极为被动的局面。他问总统要不要通知送行车队撤回来，总统没有说话。玛莎在车里坐着跟俄国总统及夫人聊天，一分钟一分钟过去，她越来越绝望。内森生交给杰克的芯片上记录有一家公司Omicron，是毒弹的制作商。公司一名高层人员汉德森是杰克当年在CTU的师父，但后来他被陷害被迫离开CTU,杰克对此也负有一定责任。杰克到达Omicron公司，并成功地混入了汉德森的办公室。然而，早有准备的汉德森击倒了杰克，并拿走了他的枪。汉德森解释说，自己的公司是为国防部定制毒弹，对其他事情一概不知情。他听说正是自己公司的产品在这日早先杀死了购物中心11条无辜生命，大为惊骇。奥德莉和柯蒂斯、克洛伊、埃伽秘密商议，要架空林，让布坎南重新回来主持工作。按照规章，当CTU主管无法工作时，CTU二号负责人可以接替他的工作。奥德莉要柯蒂斯立刻采取行动。洛根终于绝望地认识到，他不能牺牲成千上万人的生命来保护俄国总统，同样，他也不能为了玛莎而牺牲其他人。玛莎只能为了她的理想主义付出生命了。正当柯蒂斯还在犹豫不决时，克洛伊和埃伽的电脑突然被强行关闭了。林带着警卫来到他们面前，要逮捕两人，并命令柯蒂斯把奥德莉从CTU办公室里赶出去。柯蒂斯迟疑不决，林命令警卫把他也一起关押。柯蒂斯被迫采取行动，声称林精神状态不再适宜领导CTU工作，要警卫带走林，并命令释放布坎南。CTU通知白宫，有信息表示恐怖分子可能要刺杀俄国总统。车内的保镖皮尔斯听说了消息，及时命令车子调头。虽然恐怖分子还是投放了炸弹，但因为车子本身防弹性能极好，车内人员侥幸逃生。汉德森把杰克骗进小房间，锁死了门，房间内有一颗定时炸弹。

比埃克打来电话，告诉洛根总统，美国人民将为他的决定付出代价。比埃克的一名手下奥斯托夫给詹妮的男友杜恩打去电话，要他带着CTU的密钥卡来交易。詹妮和杜恩梦想能换来一大笔钱，好继续吸毒。杰克前往汉德森的家，去继续寻找线索。汉德森夫人和杰克以前私交极好，在外界都认定杰克去世的那段时间里一直照顾着杰克的女儿金。杰克不想这样，但不得不硬起心肠对汉德森夫人举起枪，要她说出丈夫的秘密。但汉德森夫人根本不相信自己的丈夫会和恐怖袭击有瓜葛。她反而认为杰克对自己的丈夫抱有不公平的仇恨。克洛伊告诉杰克，汉德森电脑里有最近他和别人通话的记录，但文件被密码稳妥地保护着，如要破译需要一天时间，他必须从其他途径得到密码。这时，比埃克的手下已在一家公众医院里又释放了一颗毒弹。托尼从昏迷中苏醒过来，知道米歇尔已死，他崩溃了。林要求和妹妹通话，布坎南拿给他一支手机，电话中，他威胁詹妮，再不还给他密钥卡，他就报警。詹妮害怕起来，要男友归还，但杜恩说密钥卡已被他卖了2万美元。汉德森回家了，杰克把他铐了起来。汉德森声称自己对毒弹一无所知。杰克打开汉德森的手提箱，发现成堆成堆的美元钞票。汉德森夫人大吃一惊，问丈夫是否一直在骗她。汉德森强硬地回答自己一直都在为国家服务，如果杰克不相信自己就尽管开枪好了。杰克对着汉德森夫人开了一枪。疼痛中的汉德森夫人尖声大叫，乞求丈夫告诉杰克一切。汉德森硬着心肠说：“很遗憾，我什么都不知道。”意识到汉德森心里已不再关心其他人，杰克打电话叫来救护车。奥斯托夫杀了詹妮和杜恩，打电话给比埃克说自己已经得到了密钥卡。

奥斯托夫改动了CTU密钥卡的内置程序，更换了持有者照片。杰克的女儿金和另一名男子来到了CTU，此时的她还不知道父亲还在世。奥德莉问杰克要不要由她来先告诉金这个消息，被押在后座上的汉德森插话说，金的前男友切斯离开她后，她整个人都崩溃了。是他和他妻子一直在关心金，但杰克却对自己的亲生女儿不管不问。金看着CTU的环境，百感交集，因为她的父母都死在了这里。奥德莉告诉她，杰克还在世，至于为什么一直把她蒙在鼓里，是因为这样才能更好地保护她。金被这个消息震得目瞪口呆。副总统加德纳来到白宫，建议基于目前的紧急事态，宣布洛杉矶地区立刻进入戒严，而不经过国会批准这是违反宪法的。诺维克非常反对，但洛根认为这样能让全国人民看到白宫还在掌控事态发展，同意了副总统的建议。汉德森被押进了CTU，此时，奥斯托夫也用修改过的密钥卡混入了CTU。杰克和金终于见面了，但并不愉快。金抽泣着说，她以为父亲死了，自己陷入了心理崩溃，不得不去看心理医生。而父亲现在好端端活着，让自己所受的一切折磨都失去了意义。诺维克劝说玛莎去说服洛根总统不要听取副总统的建议，但玛莎经历了这么多事，已经对丈夫有了新的认知，回答说洛根总统并没有他们认为的那么易受操纵。奥斯托夫在CTU的空调系统作了手脚。工程师加丽立刻发现了问题，向埃伽报告。忙碌的埃伽要她自己去查一下出了什么问题。加丽进入控制室，立刻看到了毒弹，正当她掏出手机呼救的时候，奥斯托夫杀死了她。布坎南告诉林他妹妹及男友遇害的消息，并说凶手很可能是职业杀手。林终于说出了自己密钥卡被盗的事情。毒气释放了，克洛伊封闭了部分房间的门，以使毒气扩散更慢。没有来得及撤退到房间里的人们三三两两地倒在地上死了，其中也包括埃伽。

托尼和汉德森被关在了一起，托尼夺过刑讯人员的枪，指着汉德森的头，称他要为米歇尔报仇。杰克从监视器里看到了这一切，大声呼唤托尼，请求他停下来，因为他们还需要汉德森来拯救成千上万条生命。托尼最后放下了枪，悲伤不已。然而，尽管刑讯人员用尽方法，汉德森仍然咬紧牙关，坚持不肯说出自己电脑的密码。由于CTU受到严重损失，国防部的一位高级官员凯伦·海尔斯建议由国防部接管CTU在恐怖分子一案上的工作，总统批准了。　　副总统坚持要总统批准紧急戒备，总统犹豫不决。这时，比埃克命令手下，把其余毒弹准备好，用于下一个目标。CTU的空气密闭室响起了警报，毒气中含有腐蚀性气体，蚀坏了密封封条。克洛伊判断还有二十分钟毒气就会把封条完全腐蚀，进入密封区。　　克洛伊找到了停止空调系统的办法，然而她需要关掉办公楼里另一台计算机上的程序。那台计算机无法通过远程操纵，只能进入房间手动关闭，而唯一进入房间的途径就是通过林所在的房间。杰克在电话里向林解释了目前的处境。然而，一旦林离开所处的房间，毒气就会立刻弥漫，这意味着林和所在房间的警卫都只有死路一条。林取得了警卫的同意，告诉杰克自己会去做该做的事。警卫在电话里和孩子道别，林走出了房间，关掉了计算机，慢慢倒下了。克洛伊仍在努力破译汉德森计算机的密码，另一间房间里，汉德森仍在受审，托尼在旁边观看，越来越不耐烦。

奥德莉可能是内奸的消息传回CTU，布坎南虽然也震惊不已，但立刻下令克洛伊查清楚奥德莉过去几年的行踪，以及她是否有机会和汉德森或是柯宁斯有什么来往。奥德莉被拘留了，她一口否认自己是叛徒，而另一边，刑具已经运到了拘留室。布坎南对杰克说，他绝不相信奥德莉是叛徒，但是也许她无意中知道了一些可以帮助破案的线索。克洛伊发现奥德莉和柯宁斯曾经在马里兰州的一家旅馆过夜，证人是旅馆的经理。杰克非常吃惊。杰克怒斥奥德莉撒谎，奥德莉痛苦万分，说自己是清白的，只是和柯宁斯有私人关系而已，但绝无叛国行径。布坎南和凯伦在摄像机的另一端观察着一切。布坎南认为奥德莉是无辜的，但凯伦却认为她在欺骗杰克。取代埃伽的新工程师莎瑞和麦尔斯有些不愉快，她对克洛伊说，几年前自己曾经和麦尔斯同事，而她举报过麦尔斯对她性骚扰。特工皮尔斯一直想办法打韦恩的手机，但总和他联系不上。另一名保安告诉皮尔斯，半小时前韦恩就已经通过了设限的路口。皮尔斯决定自己去找韦恩，叮嘱手下不要露出一丝口风。　　这时，比埃克带着手下进入天然气公司，枪杀了保安，让经理带他们进入中央控制室，准备把毒气混入天然气气舱内。杰克向柯莱特逼供，柯莱特终于说出，是比埃克交代她，一旦被捕就交出奥德莉的名字来混淆视听，并且供出了比埃克的下一个攻击目标是一家天然气生产公司，但不知道是哪一家。莎瑞读过化学，立刻说如果要混入毒气，天然气的气压必须降低。克洛伊查到了目标工厂的名字。布坎南轻轻拍了拍莎瑞的肩膀以示鼓励，莎瑞立刻对克洛伊说，她觉得布坎南在骚扰她。克洛伊瞠目结舌。

杰克抓到了比埃克，但意识到事情远远没有结束，汉德森是从一个比他地位高很多的人那里接指示做事。“我认为事情远远超出了我们的想象。”杰克向布坎南汇报说。　　副总统要求凯伦立刻接管CTU，尽管她争辩说CTU仍在运转良好，而且工作卓有成效。麦尔斯建议用误抓奥德莉一案来指控布坎南管理不善。另一方面，布坎南对奥德莉说，国防部正在吃掉CTU，但他想不明白为什么副总统这么急于接管CTU。皮尔斯和韦恩见面了，韦恩告诉他，第一夫人玛莎的助理艾维琳是前总统戴维在白宫的情报源。他认为正是艾维琳提供给戴维的情报导致他被刺身亡。现在，有人又在阻止韦恩去白宫和艾维琳见面。在皮尔斯的帮助下，他们见到了艾维琳。艾维琳承认自己的确知道一些事情，但不敢说，因为有人绑架了她的女儿。韦恩答应帮她救回女儿，并向杰克求救。麦尔斯起草了一份声明，要求奥德莉签署，声明上写道这日发生的所有事情都是由于布坎南指挥不力，并且威胁她说，如果她不签署，她所代表的部门也将分担部分责任。奥德莉轻蔑地拒绝了。杰克给奥德莉打来电话，称他怀疑副总统也卷入了这日的阴谋，因为他太急于接管CTU，而显然这伙恐怖分子是在听从某位政府高官的命令。他要求奥德莉帮助他，而不能显露出来。为了取得必要的资源，奥德莉找到麦尔斯，在声明上签了字。布坎南被赶出了办公室，不理解地望着奥德莉。奥德莉也望着他，希望他能从自己的目光中理解，自己并不是一个弄权的小人。杰克救出了艾维琳的女儿，但艾维琳腿上中了一枪。杰克抓住艾维琳追问：“阴谋的主使人是不是副总统？”艾维琳大喊：“副总统和这一切没有任何关系！”汉德森给一个人打电话：“我并没有预料到杰克会出现，但，我将立刻干掉杰克和韦恩，不会让您失望。”电话另一端，总统洛根慢慢放下电话，显示出复杂的表情。

艾维琳匿藏有洛根总统和汉德森的电话录音，能够清楚地显示总统才是这日恐怖活动背后的操纵人，她把保险箱的钥匙给了杰克。杰克打电话给奥德莉，请她寻求她父亲的帮助，因为现在没有什么人值得信任。凯伦私下里对麦尔斯说，她觉得真的没必要接管CTU，因为CTU工作仍然井井有条而且高效。洛根打电话给CTU，要求他们立刻把杰克作为刺杀前总统的嫌犯逮捕，因为“我们手里有了新的证据。”凯伦对此非常不满，因为她觉得目前的首要任务还应该是抓住汉德森。奥德莉驱车离开，一面打电话给自己正在飞机上的父亲，请求他回洛杉矶来，因为事关重大。海勒部长相信女儿的判断，叫飞行员立刻掉头。正在负责CTU事务的副总统问总统，到底发现了什么新证据表明杰克才是凶手。洛根总统拒绝谈这件事，皮尔斯在一边听到了。在旅馆里休息的艾维琳想过去帮助哭泣的女儿，不小心摔了一跤，昏倒在地上。女儿本能地拨了911电话，告诉了接线员母亲的名字。皮尔斯打电话给杰克，告诉他总统签发了关于他的逮捕令。杰克告诉他事实真相，并说他们将寻求海勒部长的帮助。

洛根非常恼怒，因为汉德森还是没有干掉杰克，反而让他拿到了对自己不利的证据。汉德森建议用CTU来追捕杰克。另一方面，杰克也在向布坎南寻求帮助，他请布坎南带韦恩去安全的地方，自己去见海勒部长。当着海勒部长和奥德莉的面，杰克播放了录音，里面洛根总统的声音清清楚楚，他在给恐怖分子下命令，是他把神经毒弹交给了恐怖分子，虽然他的原计划是毒弹到达莫斯科之前就引爆它们。这样，他就足够的理由来和俄国总统签署关于武器合作方面的条约了。而且，这也为美国干涉中东石油问题提供了很好的借口。杰克认为戴维·帕默总统正是因为发现了这一点而遭到暗杀。海勒部长非常了解洛根总统，相信他能做出这种事情来。但是，海勒部长不同意杰克的做法，他认为公开录音只会在这个时候动摇美国人民对政府的信心，从而危害这个国家。他准备用这盘录音逼迫洛根总统引咎辞职。他命令手下把奥德莉和杰克捆起来。杰克大叫：“相信那个人你会很危险！”凯伦找到了奥德莉的踪迹，一边派出CTU特工去逮捕他们，一边汇报给总统，而洛根却让她立刻撤回CTU的人马，他会另派军队过去。凯伦对此感到很疑惑，打电话给诺维克。诺维克也不知道总统此举何意。诺维克问了副总统，副总统仍在恼怒总统没有采取他的建议，说总统这么做一定有他的理由。诺维克又给洛杉矶的驻军司令打去电话，驻军司令很肯定地说他们并没有接到命令去机场捉拿犯人。海勒单独会见了洛根总统，要求他引咎辞职，并且保证奥德莉和杰克的人身安全，作为交换条件，他可以把录音还给总统。正当海勒逼迫总统把副总统叫来做为辞职的见证人时，洛根正不得不在辞职信上签下自己的名字，他接到一个电话，汉德森说已经拿到了录音。洛根的脸色马上变了，告诉副总统他不得不请求海勒辞职，因为他无根据地指控自己才是恐怖活动的幕后指使人。

杰克正在给奥德莉止血，海勒打来电话，说总统拒绝引咎辞职，他们失败了。杰克向正在布坎南家的克洛伊打电话求助，克洛伊冒着被CTU发现的危险利用CTU的卫星资源帮助杰克搜寻汉德森。杰克抓住了汉德森，但汉德森威胁说，他的手下已经跟上了海勒部长。一旦他出事，海勒马上就会死。杰克打电话给海勒确认，海勒经提醒发现自己车子上空的确盘旋着一部直升飞机，并且从飞机上射下的镭射光线也紧紧咬住了他的车子。汉德森要求杰克释放自己，作为交换海勒性命的条件。但性情刚硬的海勒从电话里听到了汉德森的话，说自己宁可死，也不愿意受恐怖分子威胁。他把方向盘一歪，车子翻下山崖，坠入湖中。洛根给另一个叫格汉姆的人打电话，通知他针对汉德森的行动取消。格汉姆提醒洛根，玛莎已经对他的行动有所怀疑，正在到处问东问西。与此同时，玛莎还在追踪皮尔斯的下落。一名保镖把玛莎骗进小黑屋锁了起来。经克洛伊帮助，杰克找到了录音带的下落，此时正被人携上一架即将起飞的飞机。杰克混上了飞机。充满疑窦的凯伦叫来莎瑞，详细追问她关于克洛伊逃脱时的话，听说总统可能是陷害杰克和刺杀帕默总统的幕后真凶，凯伦陷入了沉思。洛根对妻子承认，虽然自己从来没有下令刺杀帕默，但他的手下却的确杀害了帕默总统。玛莎惊呆了。麦尔斯终于找到了克洛伊的下落，他如获重宝，立刻派人去搜捕克洛伊。凯伦却偷偷给布坎南家里打去电话，叫他立刻让克洛伊离开。

和最高检察官、国会长官的电话会议准备好了，克洛伊再次试放录音，然而除了噪音以外什么都没有。克洛伊想起来麦尔斯曾经进过办公室。怒气冲冲的杰克勒住麦尔斯的脖子，麦尔斯得意洋洋地称自己现在直接受总统管辖。凯伦扇了他一个耳光。他趾高气扬地离开了办公室。玛莎仍在思念皮尔斯，她把皮尔斯的手机递给一名保镖，请他转交给皮尔斯。她以为皮尔斯被转派去外地工作，没想到他被关押了起来。洛根去看皮尔斯，威胁他和自己合作，但皮尔斯根本不买帐，称他是叛国者。比埃克在转移的途中被劫走，幸存的一名保镖说，恐怖分子提到还有一颗毒弹完好无损。CTU立刻把所有资源转移到找到这颗毒弹上面。汉德森知道唯一能够保住自己性命的录音带已经不存在了，作为交换，他告诉了杰克一张人名单，要杰克放自己和妻子秘密离开这个国家远走高飞。在走廊里吸烟的玛莎看到一部车离开车库，感到有些好奇，便跟过去看个究竟，没想到无意中救下了被总统命令秘密处决的皮尔斯。皮尔斯请求玛莎回去，装作什么事情都没有发生，但要把真相告诉诺维克。玛莎称自己本来打算沉默，但洛根为了保护自己不惜牺牲无辜者的做法震惊了她，她无法再置之不理。

比埃克和手下用毒弹劫持了一部潜艇。杰克带着汉德森到潜艇上。汉德森向杰克索要一把枪保护自己，杰克递给他。然而，解决了比埃克之后，汉德森立刻把枪口对准了杰克：“你从来没想过让我平安离开，对不对？”他一面说，一面扣动了扳机。然而枪里面没有子弹。杰克把枪对准汉德森：“你杀了我的朋友戴维，托尼，还有米歇尔，现在是你偿债的时候了。”他扣动了扳机。解决了一切，杰克溜走了，要求克洛伊协助他捉拿总统归案。克洛伊不假思索地答应了。知道恐怖分子终于不再是威胁的洛根得意万分，打算立刻召开记者招待会，命令诺维克为他起草文件。玛莎叫走诺维克，让他和皮尔斯见了面，对他说了事情真相。一直就存有疑虑的诺维克相信了。杰克打来电话，说自己准备混上总统座机，逼迫总统承认一切，但需要总统的飞机延迟起飞二十分钟。诺维克暗示玛莎只有她可以做到。玛莎和总统虚与委蛇，洛根本以为已经和妻子的感情彻底破裂，发现还有机会挽回，非常珍惜。这时，CTU迎来了一位新工程师——莫里斯·奥布赖恩，克洛伊的前夫。