幼少期に訪れたヒスイ地方に、再び足を踏み入れたアキオ。その矢先、ヒスイ地方に異変が起こる。傷ついたポケモンを目の当たりにし、助けたいと思うアキオだが……。「人とポケモンは、共には生きられない」これは、未来へと続く物語。