惑星爆発のタイムリミットもあと３ケ月となり、パルタ軍はついに総攻撃を仕掛けてきた！　何と宇宙ロケットを使って本星から直接攻撃を展開してきたのだ！　そこでレインボー戦隊はパルタ星に潜入して、惑星間ロケットミサイルの破壊作戦を開始する。だが到着したのもつかの間、レインボー戦隊は将軍に囚われてしまう。

ミッチェル博士に新発明品の視察を依頼されたロビンと教授は、彼の邸宅で何の説明も受けず謎の機械に座らされた。しかしその機械を「神が乗り移って作らせたもの」と表現し、自分を神の子だと語る偏屈な博士は、ロビンたちを騙して実験のモルモットにしようと考えていたのだった。

休暇を楽しむレインボー戦隊の目の前で突然爆発した豪華ヨット。それは３日後に戴冠式を控えたキレイーネ王女の乗るヨットだった。王女が敵対国からの殺し屋に狙われていることを聞いたリリは、男子禁制の王宮に護衛役として乗り込むことを思いつく。

ロンドンの公園で発見された変死体。それは女優ベティ・クロフォードのものだった。スコットランド・ヤードのパーク警部は、その血液が抜き取られた変死事件の重要参考人として、行方をくらましてるクロフォードの運転手、ルゴシを手配。だが捜査を開始したロビンたちは、そのルゴシの死体を発見してしまう。

レインボー戦隊に中央情報局の長官から出動要請があった。世界連邦を脱退した独裁者・ペトロフ総統の国「南アドニア」が隣国ベネリアの侵略を企んでいるらしい。どうやらサムソンと呼ばれるミサイルを設置し、犯罪者をサイボーグ化させた部隊「コンドル」を結成したようだ。

人気急上昇中の歌手フランソワーズと間違えられて、リリとベルが誘拐されそうになった。自分が人違いされていることに気付いたリリは、フランソワーズになりきって誘拐犯たちについて行く。そこでボスがいることを知ったリリは、真犯人を捕らえるべく意気込んだ。

連邦軍を狙う謎の組織が、軍基地に侵入し世界平和を揺るがす書類を盗んだ。無人衛星で長官からその調査を依頼されたロビンは、もう一方の秘密書類が保管されているF19空軍基地の警護にあたる。しかしそこにも黒マスクの集団が襲撃してきた。

世界的富豪リッチモンドが宿泊先のホテルに預けた「ゴライアスの眼」。それが盗まれてしまった！　「ゴライアスの眼」とは、インク帝国発掘の際に出土した世界最大のダイヤ。その事件を担当していたカルロス警部は、ヤジウマに来ていた教授とベルを逮捕。しかも迎えに行ったリリまで掴まえてしまう。

大陸全体を撮影用のセットに作り替えた惑星で、映画俳優のムウゲイが撮影中に殺された。その人物が世界連邦の諜報部員だったため、事件の調査のためにレインボー戦隊が派遣される。彼らは混乱を避けるために一般俳優として西部劇の衣装に着替えると、さっそく調査に取り掛かった。