O Japão foi arrasado pela Grande Catástrofe. Kiruko aceita levar um rapaz de nome Maru a um lugar chamado Paraíso. Entretanto, há crianças a viver por detrás dos muros de um orfanato entre paisagens verdejantes. Após receber uma mensagem misteriosa, Tokio começa a duvidar do mundo que o rodeia.

Há cinco anos, em Asakusa, Robin, Haruki e a sua irmã e piloto Kiriko, viviam felizes num orfanato. Quando uma multidão entusiasmada se junta para assistir a uma corrida de karts elétricos, algo terrível tenta perturbar o evento e Haruki enfrenta uma situação devastadora.

Tokio é levado a ver alguns bebés de aspeto bizarro e percebe o quão pouco sabe acerca do que o rodeia. Num navio sem escapatória, Maru e Kiruko são vítimas de um terrível ataque. Com tudo a falhar, cabe a Kiruko pensar numa nova estratégia.

Maru e Kiruko descobrem que o Dr. Usami tinha um botão com um padrão idêntico ao do logótipo que viram na Kiru-Laser. Eles decidem seguir o seu rasto e encontram um informador misterioso pelo caminho. Entretanto, é convocada uma reunião de emergência no orfanato.