鹦鹉螺号终于达到南极洲地下的广阔空洞的秘密基地。修理作业期间，尼莫带着让和娜蒂娅前往某个地方。在那途中，有一个将遥远的太古时期濒临灭绝的各种各样的生物冰封起来的冰之博物馆。看到未知的生命，让和娜蒂娅对大自然的不可思议惊讶万分。然后来到目的地，那里有一条被尼莫视为至友，活了两万年之久的白色鲸鱼伊利雍。

　　感觉只靠自己一个人无法生活下去，感谢让的娜蒂娅变得异常地温柔体贴，看到这样子的小狮王，仿佛内心受伤般。小狮王看到关系变好的让和娜蒂娅相互缠绵的样子，然后……终于离家出走了。出去寻找小狮王的让，途中不小心掉进山谷，在那里发现了矿脉。

　　把小狮王捉住的那个男人，正是格兰蒂斯的初恋对象，骗走她所有财产的人渣冈萨雷斯（ゴンザレス。CV：江原正士）。而且，独自展开拯救行动失败的格兰蒂斯和娜蒂娅也被他捉住了。让等人商定了周密的作战计划，然后跟哈马哈马及村名们一起开始了拯救作战，然后途中出现了意外……