明日那ことポッピーピポパポ（松田るか）に認められ、仮面ライダーエグゼイドとして戦う権利を得た小児科研修医・永夢（飯島寛騎）だが、戸惑いを隠せない。そこへ現れた天才外科医・飛彩（瀬戸利樹）は「お前の存在はノーサンキューだ」とゲーマドライバーを永夢に見せつける。

バグスターウイルスに冒された患者・蓮介（山岸門人）が現れた。永夢は明日那とともに現場に急行。が、同時に飛彩も現れ、仮面ライダーブレイブに変身。エグゼイドがもたつく間に、蓮介からアランブラバグスターの分離に成功するが、突如現れた謎の黒いライダーに邪魔をされてしまう。

グラファイト（町井祥真）によってばらまかれたウイルスによってゲーム病がまん延。ゲーム病に冒された永夢（飯島寛騎）の恩人・恭太郎（野村宏伸）を救うためにもダークグラファイトバグスターを一刻も早く倒さなければ…。一人焦る永夢に恭太郎は「大切なのはチーム医療だ」と叱りつける。

レベル5にアップするドラゴナイトハンターZガシャットは4人でプレイするゲーム。永夢は飛彩（瀬戸利樹）、大我（松本享恭）、貴利矢（小野塚勇人）に「チームになってオペを」と頭を下げるが、全員に無視され自らの力のなさに失望してしまう。

2体のエグゼイドXXはゲンムを倒すか、アランブラを倒すかで大げんか。その間にゲンムらに逃げられてしまい、変身を解除。永夢（飯島寛騎）へと戻るが、突然頭痛を訴え倒れてしまう。

永夢はゲーム病患者の白河（岡田浩暉）のすい臓がんの手術を飛彩（瀬戸利樹）に執刀して欲しいと依頼。オペの是非は患者次第と断る飛彩だったが、飛彩がアランブラに狙われたのは白河が飛彩の手術を願っている証拠、と永夢に指摘されて翻意する。飛彩は困難な白河のがんの手術を、永夢はアランブラを倒しゲーム病の治療をすることを誓う。