Felix daagt de tieners van Tree Hill uit tot het uithalen van allerlei stunts. Ook de volwassenen zijn overmoedig. Karen daat uit met haar docent bedrijfswetenschap en een knappe klant flirt met Keith.

Tree Hill begint op de Ark van Noach te lijken. Lucas en Anna, Brooke en Felix, Haley en Nathan, Jules en Keith, Karen en Andy, Deb en Dan - allemaal met z'n tweetjes.

Iedereen die meetelt is bij de opening van Karen's club Tric. Peyton regelt de optredens. Brooke wordt dronken. Lucas en Felix gaan op de vuist. Het publiek is dolenthousiast bij Haley's eerste optreden.

Op een pyjamafeestje wisselen de meisjes geheimen uit. Onderweg naar een basketbalwedstrijd tobben Nathan en Lucas over hun vaders hartafwijking, die erfelijk is. Nathan laat zich testen, Lucas wil dat niet.

Lucas gaat met Anna naar het semi-formal, maar het einde van de avond brengt hij door met Brooke. Haley is te laat op het formal, Nathan wordt boos als hij te weten komt dat ze aan het samenwerken was met Chris. Ondertussen ligt Payton in de knoop door de druk die ze voelt om drugs te nemen.

Nathan maakt zich zorgen over de gezondheid van Lucas. Hij vertelt Karen dat Lucas de harttest niet genomen heeft. Dan biedt Keith een job aan als vicepresident. Op school wordt Payton geconfronteerd met de roddels dat ze lesbisch zou zijn. Hierdoor komt haar vriendschap met Anna onder spanning te staan. Nathan en Haley beginnen uit elkaar te groeien.

Haley is verrast als haar oudere zus Taylor naar huis komt, maar niet zo erg als Nathan. Hij en Taylor hebben een verleden. Brooke en Felix beslissen om een koppel te worden. Jake gaat bij Payton op bezoek en ze nemen samen een beslissing. Anna vertelt Lucas een geheim.

Nathan vertelt Haley over zijn verleden met haar zus Taylor, maar Haley blijft mailen met Chris zonder dit aan Nathan te vertellen. Taylor ziet de mails. Karen is er niet akkoord mee dat Lucas zijn HCM-test niet wil nemen. Keith vraagt Jules of ze met hem wil trouwen. Boooke vecht voor betere werkgelegenheden op haar nieuwe werk. Lucas beslist om samen met Keith de HCM-test te nemen.

Als Michelle Branch en Jessica Harp (the wrechers) optreden in TRIC, beseft Haley haar droom om een muziekcarrière uit te beginnen. Ondertussen beslist Lucas om bij Dan te gaan wonen, hierdoor komen zowel zijn relatie met karen als Nathan onder spanning te staan. Pauton en Jake hun vriendschap wordt sterken. Lucas krijgt zijn HCM resultaten.

Het is tijd voor een time capsule project op Tree Hill High, en iedereen deelt z'n meeste intieme geheimen voor een anonieme video camera. Nathan wordt steeds bozer vanwege Haley's vertrek, en beland zelfs in de gevangenis - samen met Lucas. Peyton en Jake beginnen steeds meer voor elkaar te voelen, terwijl Felix een feestje organiseert om Brooke's nieuwe positie als president van de leerlingenraad te vieren.

Keith wordt gewelddadig als hij erachter dat Jules door Dan was ingehuurd. Anna komt erachter dat Felix degene was die 'Dyke' had geschilderd op het kluisje van Peyton's en licht de school in. Ondertussen reist Nathan af naar Atlanta om Haley naar huis te halen.

Na zijn bezoek aan Haley gaat Nathan nog even langs bij Taylor voor wat plezier. Anna bezoek van haar ex-vriendinnetje en besluit uit de kast te komen voor haar ouders. Lucas en Andy werken samen tegen Dan. Karen is streng voor Brooke en Peyton en Jake blijven Jenny verstoppen voor Nicki.