Chad, un amigo de Ichigo, acaba de conseguir un periquito maldito que dentro tiene el alma de un niño pequeño. El periquito produce a todos los que lo tienen en su poder muchas desgracias, las desgracias las causa un hollow que persigue el alma del niño. Chad empieza a pelear con él aunque no lo vea, Rukia llega después para ayudarle.

Rukia y Chad luchan con el hollow aunque este parece sobrepasarlos en fuerza, luego de un tiempo llega Ichigo quien consigue finalmente derrotar el Hollow. Una vez derrotado se abren las puertas del infierno a donde es llevada el alma del Hollow por haber cometido pecados mortales en vida. Explican que el Hollow es el alma del asesino de la madre del niño cuya alma estaba en el periquito y que además le había hecho una falsa promesa de traer su madre de vuelta a la vida si permanecía dentro del animal por tres meses.

Comienza el duelo entre Ichigo y Ishida, el Quincy. Para provocar el ataque de Hollows, Ishida rompe una píldora anti-hollow que los atrae a la ciudad. La apuesta consiste en quién derrote más hollows. Pese a la negativa de Ichigo a hacer la apuesta, la ciudad empieza a ser invadida por Hollows... y tan sólo tienen 24 horas para demostrar quién es el mejor de los 2. Después de eso, Chad tratando de proteger a la hermana de Ichigo, Karin, de un hollow, obtiene un poder en su brazo derecho.

Las 72 horas están a punto de cumplirse e Ichigo lucha agónicamente para salir del pozo. Cuando su transformación en hollow casi se ha completado, Ichigo tiene un encuentro con su espíritu interior, Zangetsu, quien ayuda a Ichigo a obtener su propio poder de shinigami. Al final Ichigo logra salir del pozo con el uniforme de shinigami pero también con una máscara hollow. Rompiendo la máscara, Ichigo inicia la última fase del entrenamiento lo cual consiste pelear contra Kisuke

Durante el viaje, Ganju revela que la razón por la cual odia a shinigamis es porque su hermano, quien era shinigami, fue asesinado por otro shinigami. Antes de tocar suelo, la bola de energía en que viajaba Ichigo y los demás se hace inestable y a la vez se rompe, separando el grupo. Mientras tanto, la enemistad entre Sosuke Aizen, capitán del quinto escuadrón, e Ichimaru Gin es cada vez más notoria. Guía ilustrada de shinigamis: Shunsui Kyoraku.

Renji, totalmente vencido por Ichigo, empieza a recordar como conoció a Rukia. Renji vivía en un pueblo extremadamente pobre y para vivir tenía que robar junto con unos amigos. Rukia los ayudó mucho en sus aventuras pero luego Renji y Rukia deciden convertirse en Shinigamis ya que sus amigos habían muerto. Al final del flashback, Renji le ruega a Ichigo que salve a Rukia. Guía ilustrada de shinigamis: Jirobo Ikkanzata.

Después que Sado fuera derrotado, Shunsui, en vez de matarlo, ordena encarcelarlo. Ichigo está impactado al ver que los golpes que da a Kenpachi con la espada no consigue abrirle ninguna herida. Zaraki le cuenta a Ichigo que su zanpakuto no tiene liberación shikai ni bankai y que solo usa su propio poder para vencer a sus enemigos. Ichigo se debilita y Kenpachi consigue romper la espada de Ichigo con facilidad y logra herir a Ichigo gravemente. Guía ilustrada de shinigamis: Iemurai Yasochika.

Yoruichi usa un objeto llamado tenshintai creado por Kisuke Urahara. El tenshintai es capaz de traer a Zangetsu al mundo real y hacer Ichigo pelee con él. El efecto del Tenshintai es de tres días, así que Ichigo tendrá que derrotar a Zangetsu en tres días si es que quiere obtener el bankai. Mientras tanto, Renji se escapa de la prisión, Hanataro es castigado por su capitana, Retsu Unohana e Ichimaru Gin ayuda a Izururu Kira a escaparse de la prisión. Por último, Zaraki acepta ayudar a Orihime. Guía ilustrada de shinigamis: Kotetsu Kiyone.

Zaraki con sus subordinados, junto con Orihime, Ishida, Ganju, Sado se dirigen hacia el campo de ejecución pero en el camino se encuentran con Kaname Tosen, capitán del noveno escuadrón, y Sajin Komamura, capitán del séptimo escuadrón. Ikkaku Madarame e Yumichika Ayasegawa se enfretan con Tetsuzaemon Iba y Shuhei Hisagi, estos dos últimos son tenientes de los dos capitanes respectivamente. Komamura y Tosen atacan a Zaraki pero este sale ileso de los ataques, con leves heridas para él, pero básicamente ileso. Mientras tanto, Renji ha obtenido la liberación bankai. Ichigo todavía no puede vencer al espíritu de Zangetsu para obtener así su propio bankai. Guía ilustrada de shinigamis: Kon.

Yumickika derrota a Hisagi. Shinsui y Ukitake usa sus respectivos shikai, lo cual sus zanpakuto se trasforma en dos espadas. Soi Fon, capitana del segundo escuadrón, empieza a pelear contra Yoruichi. Soi Fon libera su shikai y después usa una técnica que recién ha dominado, llamado shunko. Sin embargo, Yoruichi también sabía usar esa técnica desde mucho antes y lo domina mejor que Soi Fon.

Hitsugaya y Matsumoto entran al central 46 y encuentran a todos los integrantes muertos. Izuru Kira aparece, Hitsugaya y Matsumoto van detrás de él pero Hitsugaya se vuelve al enterarse que Hinamori iba a morir también en el central 46. Ichimaru lleva a Hinamori hasta donde esta Aizen, quien había fingido su muerte con una técnica de ilusión. Aizen atraviesa a Hinamori con su espada. Hitsugaya alcanza a llegar un poco después y al ver a Hinamori gravemente herida, libera su bankai para atacar a Aizen. Sin embargo, es derrotado fácilmente por Aizen. En este momento llega Retsu Unohana con su teniente Isane Kotetsu. Aizen le cuenta lo que ha sucedido y cómo fue que engañó a todos los capitanes. Por último, Aizen revela que Kaname Tosen también fue su cómplice junto con Ichimaru.

Kisuke le cuenta a Ichigo y los demás sobre un tipo de humanos llamados bount. Kisuke también da un alma modificada a Ichigo, Orihime, Sado. Quedando Kurodo con Inoue, Nova con Chad, y Lirin con Ichigo. Ichigo se enfrenta contra un mujer bount, quien libera su mascota, Geite.

Ishida está en el hospital gracias a la ayuda de Yoshino. Al cabo de un rato, llegan sus amigos. En la noche, llegan dos bount llamados Ho y Ban, quienes usan técnicas relaciondas con el control del agua. Después de varios intentos de escapar del hospital, Ichigo y Renji se encuentran que afuera está lloviendo.

Renji e Ichigo pasan toda la noche peleando en la base. Yoshino se escapa de la tienda Urahara y va enfretarse contra Kariya. Kariya logra matar a Yoshino, pudiendo crear un tipo de insectos llamados los bitto.

A la clase de Ichigo ha llegado un estudiante nuevo llamado Shinji Hirako. Durante una pelea entre un hollow e Ichigo, aparece sorpresivamente Shinji Hirako atacando a Ichigo y además usa una máscara con aspecto de un hollow. Shinji le pide a Ichigo que se una a su grupo denominado los Vizard. Al mismo tiempo, Kon (en el cuerpo de Ichigo) es atacado por un hollow llamado Grand Fisher. Uryu Ishida es atacado también por otro hollow. Ishida, quien había perdido sus poderes, no puede contra el hollow y es rescatado sorpresivamente por su padre.

Ulquiorra usa una técnica para revelar lo que vio de Ichigo a Aizen y a los demás arrancar. Un arrancar llamado Grimmjow Jeagerjaques recrimina a Ulquiorra por no matar a Ichigo. Ulquiorra se defenderá argumentando que no era nacesario matarlo ya que Ichigo no es una amenaza para ellos. El grupo de Hitsugaya se aloja en diferentes lugares. Grimmjow y sus cinco subordinados llegan al mundo humano para eliminar todas las personas que tuvieran poder espiritual.

En este capítulo muestran las peleas de los restantes miembros del equipo de Hitsugaya. Renji está peleando con su bankai contra Yylfordt Granz en el que Ururu lo lastima gravemente, lo cual obliga la liberación de la zanpakuto de Yylfordt Granz. Ichigo también llega a usar su bankai para pelear contra Grimmjow. Mientras tanto, Hitsugaya usa su bankai para pelear contra Shawlong Koufang después de ver que su shikai no hacía ningún daño en Shawlong. A pesar que Hitsugaya haya usado el bankai, sigue sin poder vencer a Shawlong. Al final del episodio, Rangiku consigue permiso de la sociedad de almas para que ella, Hitsugaya y Abarai puedan quitarse el sello de poder, pudiendo pasar de utilizar no más del 20% a usar el 100% de su poder.

Kisuke Urahara abre un agujero hacia el hueco mundo y le dice a Ichigo, Chad e Ishida que tendrán que usar su reiatsu para construir un camino para así llegar al hueco mundo. Antes de irse, Ichigo le pide a Urahara que avise a su familia de su ausencia. Una vez dentro de la Garganta, Ishida explica que Ichigo no es como los demás Shinigami y eso le permitíó no romper la promesa hecha con su padre. Mientras tanto, Inoue ya llegó al castillo Las Noches y Aizen le pide como demostración de su poder, curar el brazo de Grimmjow. Luppi se ríe de Inoue diciendo que era imposible para Inoue curar a Grimmjow ya que el brazo ya fue cortado mucho antes y además Kaname Tosen lo quemó. Pero Inoue igualmente le regenera el brazo a Grimmjow. Aizen dice que la habilidad de Inoue no es la curación sino "el rechazo de los eventos (ya ocurridos)". Entonces Grimmjow ataca de sorpresa a Luppi y le lanza un cero. Finalmente, Luppi muere y Grimmjow vuelve a ser el sexto Espada.

Después que Ichigo y los demás salieron del bosque de los menos, se van directamente a Palacio Las Noches, rompiendo los muros del palacio y entrando sin difilcultad. Ichigo se despide de Nell ya que entraban a una zona peligrosa. Sin embargo, Nell no le obedece y sigue a Ichigo hasta que se topan con cinco puertas. Cada uno elige una puerta. Ichigo le advierte a Nell que no siga ya que adentro de la puerta hay presencias espirituales muy fuertes. No obstante, Nell hace caso omiso y vuelve a seguir a Ichigo.

Después de liberar su zanpakuto, Aaoniero le cuenta a Rukia que en su forma liberada puede usar a la vez todas las técnicas de los hollows que fueron absorbidos por él. Usando la zanpakuto de Kaien, parte en dos la espada de Rukia y le ocasiona una gran herida en el pecho. Entonces, Rukia empieza a recordar su pasado, cuando entrenaba con Kaien. Kaien le dijo que cuando una persona muere, deja su corazón a sus amigos. Rukia reconstruye su zanpakuto usando la tercera danza, shirafune, con la cual corta en dos la cabeza del Espada. Rukia queda profundamente lastimada.

Con la ayuda de Renji, Uryu es capaz de llevar a cabo su técnica de Spenger, con lo cual hace una gran explosión que deja a Szayel gravemente herido. Sin embargo, Szayel se recupera totalmente de sus heridas al devorar a uno de los arrancar de su fracción. Szayel se retira de la batalla argumentando que tiene que cambiar su ropa que quedó destrozada. Mientras tanto, Grimmjow lleva a Orihime a donde está Ichigo para curar sus heridas, pero antes que Ichigo esté recuperado, llega Ulquiorra.

La princesa Rurichiyo conoce las diversiones del mundo real de mano de Rukia, pero al final del día la princesa discute con sus guardaespaldas y sale corriendo quedándose sola. Mientras Ichigo y los guardaespaldas de la princesa la buscan, está se encuentra con Orihime quien se verá obligada a proteger a la princesa de otro asesino esperando que Ichigo y los demás lleguen.

Kumoi parece tomar el control del clan Kasumioji. Mientras tanto, Ichigo y su grupo se enfrentan a un equipo recién armado de asesinos que poseen Bakoto.

La princesa Rurichiyo, al ver que Ishida y Chad fueron lastimados cuando la protegían y sabiendo que Kumoi trata de asesinarla, se siente culpable y decide volver a la Sociedad de Almas para casarse con Kannogi Shuu, su prometido. Ichigo, Rukia, Kenryuu y Enryuu vuelven a la Sociedad de Almas para rescatarla. El día de la boda, cuando esta ya se había efectuado, llegan Ichigo y los demás pero son interceptados por la capitana de la segunda división Soi Fong.

Ichigo y Rukia Junto con Kannogi Shuu van por los subterráneos para ganar tiempo pero son encontrados y se ven forzados a salir, en la salida se encuentra esperándolos nada menos que el capitán de la tercera división Amagai Shusuke e Ichigo se ve obligado a luchar contra él, el capitán no tiene problemas para luchar contra Ichigo hasta que este le lanza un Getsuga Tensho y el Capitán se ve forzado a liberar su shikai, ambos son detenidos por Kannogi Shuu que le explica lo sucedido al Capitán y este los apoya y se dirige con ellos en busca de la princesa Rurichiyo.

El Capitán Comandante Yamamoto Genryuusai da la orden para entrar en la casa de Kasumioji y todos los escuadrones irrumpen en ella. Mientras tanto Ichigo está buscando a Kumoi, que intenta escapar cuando se entera que los shinigamis han entrado en la mansión. Sus siervos intentan impedir la entrada de los shinigamis luchando con sus Bakkoto pero son fácilmente vencidos. Kumoi toma a Rurichio como rehén y entonces es encontrado por Ichigo. En ese instante aparece el Capitán Amagai que mata a Kumoi y se lleva a Rurichio frente al Comandante Yamamoto.

Ishida, Renji, Dondochaka y Pesche siguen luchando contra los clones que creó Szayel Aporro y se dan cuenta que cuando vencen a uno sus partes se convierten en más clones. Gracias a una estrategia de Renji, la habitación en donde se encontraban es destruida, lo cual enfurece a Szayel. Entonces el Espada decide eliminar a los clones y mostrarles a Renji e Ishida el verdadero poder de Fornicaras.

Zommari Rureaux se salva del bankai de Byakuya gracias a una coraza pero el capitán le da muerte cortando su pecho. Mientras tanto, Szayel Aporro Granz disfruta destrozando los órganos internos de Mayuri. Posteriormente Mayuri le dice que había intercambiado todos sus órganos por unos falsos antes de la pelea y por eso no muere. Luego de esto el capitán usa su Bankai.

Luego de que Nnoitra es derrotado, aparece Starrk y se lleva a Inoue sin que Ichigo y Zaraki puedan reaccionar. Aizen finalmente le revela a todos los shinigami que su objetivo era llevarlos a Hueco Mundo para encerrarlos y así poder destruir Karakura. Sin embargo, la Sociedad de Almas sospechaba algo así y estaban preparados para pelear, puesto que Kisuke Urahara reemplazó la ciudad por un falsa para que pudieran pelear sin inconvenientes. Así, la batalla entre los Shinigami y los Espada, está a punto de comenzar.

Se ordena a la novena división a cargo de Kensei investigar las extrañas desapariciones de almas en el Rukongai. Kensei descubre las ropas del anterior grupo que investigó el incidente y es atacado por un Hollow. Luego de la batalla, el equipo de Kensei es atacado por un enemigo misterioso.

Ichigo logra llegar con Ulquiorra, el cuál se dispone a eliminar a Ichigo para proteger las Noches. Mientras tanto, en Karakura, Barragan toma el lugar de Aizen convoca a 4 enormes Hollow y los manda a destruir los 4 pilares que resguardan a la ciudad de Karakura en la Sociedad de Almas. Entonces aparecen Hisagi, Izuru, Yumichika e Ikkaku para defender cada uno un pilar. Barragan se ve obligado a enviar a 4 de sus 6 Fracciones para eliminar a los guardianes.

Hisagi Shuuhei continúa peleando contra la fracción de Barragan, Findor Carias. Éste demuestra su resurrección Pinza Aguda, tomandolé ventaja. Shuuhei libera su zanpakuto Kazeshini, una espada doble, demostrando su superioridad contra el arrancar. Findor no puede contra la katana del Teniente, quien con un certero golpe acaba con el arrancar. Sin embargo, el pilar que resguardaba Ikkaku ha sido destruido por Poww, que también ha vencido al shinigami.

La trama principal va mucho antes donde empieza la historia, donde Ichigo y Sado van al Instituto de Karakura, y todos los estudiantes empiezan su historia en el primer día de clase. En la Sociedad de Almas Abarai Renji es ascendido a teniente del 6º escuadrón y Rukia Kuchiki es encomendada a ir a la ciudad de Karakura.

Kuchiki Rukia se enfrenta a Sode no Shirayuki, la ventaja de la zanpakuto es muy alta, atacando con los principales ataques de la katana, Tsukishiro y Hakuren, esta última antes de atacar a Rukia es salvada por Kurosaki Ichigo, quien se dispone a pelear contra Sode no Shirayuki una pelea donde el Shinigami Sustituto no pelea con todo su poder porque no quiere provocar daño a la zanpakuto de su compañera. Rukia dispone de libertad a su zanpakuto, usando el Bakudou 66, se juntan, recordando el tiempo y los sentimientos atados, dispone inmolarse con un kidou. Muramasa llega revelándose como una zanpakuto.

Ichigo corre a buscar a Byakuya en el camino se encuentra con Tobiume y Haineko, estas dos pelean contra Ichigo, siendo intervenidas por sus dueñas, Hinamori Momo y Matsumoto Rangiku. Muramasa camina malherido hacia un bosque donde se encuentra con unos hollow y algunos Gillian, que lo atacan. Ichigo en su recorrido también encuentra a un solitario Hyorinmaru que también ataca al Shinigami Sustituto, llegando su portador el capitán del Décimo Escuadrón, Hitsugaya Toushirou. Muramasa ha vencido a todos los Menos caminando sin rumbo.

Muramasa sigue en el bosque de los hollow, de repente lo ataca un Adjuchas y se encuentra con un Vasto Lorde. Hinamori y Matsumoto logran vencer a sus zanpakuto, mediante un bakudou y el trabajo de las dos shinigami, Hitsugaya ha encontrado a Hyorinmaru quien el capitán dice que es su dueño, pero la zanpakuto ha perdido la memoria y no cree que alguien tan joven sea su portador, iniciándose la pelea entre ellos, los kido del shinigami son inútiles ante su zanpakuto. Hitsugaya recuerda su pasado en el Rukongai y porqué era único ante todos, aquellos recuerdos le devuelven el poder por lo que encontró a Hyorinmaru, también la zanpakuto recuerda como conoció a Hitsugaya, su portador. Muramasa ha robado el reiatsu del Vasto Lorde.

Yamamoto ha sido encerrado, la misión es de rescatar al Capitán-Comandante.Van a rescatarlo Kenpachi, Ichigo y Yuroichi; en el camino donde Yuroichi e Ichigo van, son atacados por Haineko y Tobiume quien interceptan a los dos intrusos, pero Yuroichi logra reteneralas, Ichigo sigue el camino para el rescate. Kyoraku y Ukitake van también al rescate de su maestro, quien en el camino les esperan son sus zanpakuto, aparece primero Sogyo no Kotowari, quien ataca a su maestro, además Kyoraku tiene que lidiar contra su zanpakuto Katen Kyoukotsu.A Ichigo se le interpone en el camino un restablecido Kazeshini, el Shinigami en el combate libera su Bankai y vence a la zanpakuto de Hisagi Shühei. Subiéndo por la cueva Ichigo puede apreciar a Yamamoto, e inicia un nuevo ataque para poder liberarlo.

Seguimos con la historia de Koga; escapa de la cárcel y mata a los shinigami que conspiraron para encerrarlo. Se encuentra con Ginrei Kuchiki, quien le reprende por sus actos pero Koga se revela y asesina a cualquier shinigami que se cruza en su camino. El Capitán Comandante y el capitán del 6º Escuadrón, van en su busca y se enfrentan a él. Koga invoca a Muramasa pero éste no le responde, por lo que pierde el combate y es sellado y encerrado. Se regresa a la trama actual donde Koga está a punto de inicar una pelea contra Byakuya.

Ichigo es llevado dentro de la esfera oscura, donde pelea contra Muramasa en su mundo interno, teniendo dificultades al luchar contra él. Muramasa ataca usando ilusiones por lo cual se le hace difícil a Ichigo pelear con él, Zangetsu confía en Ichigo y este en él, por lo cual, el shinigami logra ganar la pelea por la confianza mutua entre shinigami y zanpakuto. Muramasa cae en lo profundo de las aguas, donde Ichigo tiende a rescatarlo. Muramasa arrepentido por sus actos, muere y desaparece.Al final llega una lluvia y las zanpakuto materializadas regresan a sus dueños.

Un Nakae anónimo va al mundo de los humanos a buscar a su maestro. Ichigo pelea contra el, pero se escapa. El Capitán Hitsugaya y su teniente le siguen allí acompañados por sus respectivos Zanpakuto, Haineko y Hyorinmaru. Hitsugaya explica a Ichigo y Urahara sobre la situación actual en la Sociedad de Almas.El Nakae sigue buscando a su maestro pero es absorbido por un hollow y los dos se fusionan, formando una Zanpakuto / Hollow híbrido. Ichigo batalla contra la criatura, pero es devuelto por un poderoso Cero antes de que Ichigo pueda utilizar el Getsuga Tensho. Hitsugaya llega y derrota al Nakae.

Una nueva estudiante ingresa en el Instituto donde está Orihime, Urahara alerta a Ichigo y Rukia que hay humanos que son atacados por zanpakuto, provocando la idea de que son demonios espada.Haida Kyoko-el nombre de la nueva estudiante- sufre un golpe, jugando al baloncesto y es llevada por Orihime a la enfermería, en el camino una de las alumnas de los pisos superiores hace caer una maceta donde Orihime utiliza su Santen Kesshun, con lo cual su compañera se da cuenta de su habilidad, Haida desea ser su amiga pero recuerda su pasado, en el cual su mejor amiga la dejó.Una bestia espada estaba controlándola, Kyoko intentó matar a su antigua amiga, llegando Orihime para evitarlo y también más tarde Rukia e Ichigo, y en el combate Ichigo derrota a la bestia espada.

Un resumen de la llegada de Aizen a Karakura, pasando por algunas batallas y el comienzo de algunas de estas en Karakura, hasta también el comienzo de la pelea entre Ichigo y Ulquiorra.