La ciurma del Bebop è sulle tracce di un pericoloso dinamitardo di nome Decker. Non conoscendo il suo aspetto, per trovarlo, Spike e Faye piantonano diversi bar; in uno di questi Spike rimane coinvolto in una rissa e stringe amicizia con VT, irruenta trasportatrice spaziale.

MPU, l'intelligenza artificiale di un vecchio satellite terrestre, sviluppa una sorta di coscienza e, stanco della solitudine, inizia a connettersi ad altri satelliti bombardando con dei laser la Terra e disegnando profili di animali.

Vicious viene incaricato dai Van, capi del Red Dragon Crime Syndicate, di gestire un'operazione per l'acquisto di una partita di droga Red Eye su Callisto e gli viene assegnato come guardia del corpo un ragazzo di nome Lin.

Faye, in un momento di malinconia, inizia a raccontare ad Ein quanto ricorda del proprio passato.

Dopo l'ennesimo danno riportato durante una missione, Spike va sulla Terra per far riparare il suo hovercraft, lo Swordfish II, dal suo proprietario originale e progettista, Doohan. Contemporaneamente Jet e Faye danno la caccia ad un gruppo di pirati spaziali che, tramite alcuni virus informatici riescono a prendere il controllo delle navicelle altrui.

La ciurma del Bebop è all'inseguimento di "Teddy Bomber", un dinamitardo che fa saltare in aria, per protesta al capitalismo, gli edifici sfarzosi riempiendo di esplosivo degli orsetti di peluche.

Abbattuti, pur senza volerlo ammettere, per le amiche perdute, Jet e Spike si recano a un bar ad affogare i dispiaceri nell'alcol, ignari che nel frattempo i capi del Red Dragon Crime Syndicate, abbiano dato ordine di uccidere tutti gli ex-membri dell'organizzazione a seguito di un tentato colpo di stato.