Selon le pacte passé avec Edgars, Garibaldi attire Sheridan dans un piège: il l'informe que son père a été capturé par les hommes de Clark et qu'il doit se rendre immédiatement sur Mars s'il veut le sauver. John, bien que conscient des risques, part aussitôt pour la planète rouge...Franklin et Lyta débarquent sur Mars avec les télépathes cryogénisés et rejoignent la Résistance...Edgars et Garibaldi ont une longue discussion: Michael apprend ainsi que son patron a conçu un virus tuant les personnes porteuses du gène télépathe! Mais ce qu'Edgars ignore, c'est que Garibaldi est depuis plusieurs mois (depuis son enlèvement) sous l'influence d'un membre important du Corps Psi...d'où ses pertes de mémoire et son attitude étrange. Lorsque Susan apprend que Garibaldi a attiré John dans un piège, elle lance l'ordre à la première personne qui le retrouve de le descendre...L'Agamemnon, que Sheridan a commandé autrefois, rejoint la Résistance.

Alors que John est toujours prisonnier sur Mars, Garibaldi, qui a à présent retrouvé toute sa mémoire et sa vraie personnalité, se fait capturer par la Résistance: Numéro Un est prête à le descendre pour ce qu'il a fait à Sheridan. Michael demande alors à Lyta de le scanner afin de prouver qu'il n'était ni responsable, ni conscient de ce qui s'est passé...Franklin, Lyta et Garibaldi vont monter un plan afin de libérer John...La Ligue des Mondes non Alignés, les Centauris, les Narns et les Minbaris décident de soutenir la Résistance contre Clark avec leurs propres vaisseaux. Susan qui dirige la flotte, apprend que l'Alliance Terrienne compte se servir, contre la Résistance, de croiseurs utilisant une nouvelle technologie. Marcus et elle prennent alors les Etoiles Célestes afin de les stopper...

Susan, toujours à bord du vaisseau de Delenn, est mortellement blessée. Marcus, qui ne peut se résoudre à la laisser mourir, décide de repartir avec elle pour Babylon 5, en utilisant une des Etoiles Célestes. Il pense avoir trouvé un moyen de la sauver, et il est prêt à donner sa vie pour cela...La bataille finale pour libérer Mars et la Terre est sur le point de commencer: Sheridan, depuis l'Agamemnon, conduit la flotte. Le plan consistant à utiliser les télépathes cryogénisés est mis en place...L'ensemble des vaisseaux alliés de Sheridan vont s'opposer aux croiseurs de l'Alliance Terrienne, fidèles à Clark: après avoir libéré Mars, la flotte de la Résistance va se diriger vers la Terre. Mais elle va devoir aussi faire face à la grille de défense de la planète. Lorsque Clark réalise qu'il va perdre, il se suicide, tout en ayant pris soin auparavant de retourner la grille de défense vers la Terre elle-même. Ainsi, tout sera détruit avec lui...