Een verbannen prins die een andere identiteit heeft aangenomen wordt gevangengezet, maar ontsnapt met hulp van een meisje dat hem bijzondere krachten geeft.

Lelouch gebruikt Geass om een reusachtige robot te bemachtigen die Lancelot belichaamt en hem helpt te vechten tegen het leger van onderkoning Clovis la Brittania.

Lelouch onderzoekt de dood van zijn moeder. Op school ontdekt hij dat een klasgenoot bijzondere krachten heeft. Suzaku wordt gearresteerd voor moord.

Suzaku wordt valselijk beschuldigd van moord, als excuus voor het leger om eervolle Britannianen te verbannen. Lelouch helpt hem ontsnappen en wil hem inhuren als rebel.

Het groenharige meisje komt bij Lelouch in huis wonen. Suzaku is vrijgesproken en laat prinses Euphemia de stad Shinjuku zien, waar ze een moordaanslag tegenhouden.

Suzaku en Lelouch krijgen te maken met de vooroordelen van studenten. Een kat veroorzaakt paniek. De vader van Lelouch geeft een speech bij de begrafenis van de prins.

Lelouch denkt terug aan zijn laatste ontmoeting met zijn vader voor zijn verbanning. Wanneer Cornelia een val zet voor Zero, vormt Lelouch zijn eigen leger.

Wanneer een hotel wordt bezet door een Japanse terroristische groep, zet Lelouch een reddingsactie op touw en verkondigt de formatie van de Black Knights.

De Black Knights zitten een kartel op de hielen dat een populaire en gevaarlijke drug maakt, een strijd die vooral voor Kallen zeer persoonlijk is.

Lelouch en zijn Knights volgen Cornelia en haar leger naar het hoofdkwartier van het Front, waar Kallen een aardverschuiving teweegbrengt.

Wanneer de Black Knights Narita innemen, draagt Euphemia Suzaku op om Cornelia te redden, waardoor Lelouch terechtkomt in een strijd tussen drie partijen.

Zero en zijn vertrouwelingen ontmoeten een sleutelfiguur uit de Japanse underground. In Tokyo vertelt Shirley Fenette Zero over een slachtoffer van de oorlog.

Villetta spoort Shirley aan om Lelouch in de gaten te houden. Lelouch blaast een vrachtschip op en komt vervolgens in een lastig parket te zitten.

Lelouch volgt Shirley naar Narita, waar een gewonde Villetta wordt aangetroffen en wordt onthuld wat er achter Shirleys aanval op Lelouch zat.

Villetta ontwaakt en heeft geheugenverlies. Als C.C. ten prooi valt aan Mao's psychologische spelletjes, zweert Lelouch zich niet door zijn krachten te laten beheersen.

Milly ontmoet haar toekomstige echtgenoot. Als Mao Nunnally ontvoert, pogen Lelouch en Suzaku haar samen te redden, terwijl C.C. de confrontatie aangaat met Mao.

Er wordt een kunstmuseum geopend ter herinnering aan Clovis. Lelouch werft een nieuwe Black Knight, net op tijd voor een gevecht met Lancelot dat een schok veroorzaakt.

Suzaku wordt Euphemia's ridder. Lelouch wil Suzaku en de Lancelot gevangennemen, maar de commandant van een oorlogsschip van Britannia heeft andere plannen.

Op het eiland Kamine worden geheime identiteiten ontmaskerd en verbergen oude ruïnes een val. De Chinese Federatie helpt verbannen Japanners een aanval op touw te zetten.

De indringers stuiten op weerstand van het leger van Britannia. Nina helpt Euphemia onbedoeld. C. C. en Zero werpen zich in de strijd om Suzaku te helpen.

Ohgi, Villeta, Euphemia en Kallen verbergen hun ware identiteit bij een festival op school, maar als Euphemia's identiteit onthuld wordt, verkondigt ze iets noodlottigs.

Een discussie over de toekomst van Japan gaat mis wanneer Lelouch de controle over zijn krachten verliest en Euphemia af doet koersen op een ondenkbare slachtpartij.

Euphemia probeert te vechten tegen de Geass, maar worstelt om te overleven. Zero kondigt zijn plan aan voor de oprichting van een nieuwe natie, en een revolutie begint.

Ashford Academy wordt het hoofdkwartier van de Black Knights, als Suzaku hen trotseert. Villeta's geheugen komt terug en Lelouch gaat de confrontatie aan met Cornelia.

Lelouch ontdekt wat Cornelia weet over de moord op zijn moeder. Lelouch gaat naar het eiland Kamine om Nunnally te redden en heeft een krachtmeting met Suzaku.

Lelouch Lamperouge pakt zijn oude leven als luie student en gokker weer op, terwijl zijn geheugen is gewist en vol valse herinneringen zit.

Lelouch krijgt zijn geheugen terug en leidt de Orde van de Black Nights. Nadat de ridders de toren van Babel hebben bestormd, worden ze aangevallen door een nieuwe Frame.

Zero roept de Verenigde Staten van Japan uit, maar Guilford dreigt alle gevangengenomen Zwarte Knights te executeren als hij de uitdaging weigert.

Lelouch heeft twee grote problemen: hij moet ontsnappen aan Rolo, die hem wil vermoorden, en hij moet een manier vinden om de Black Knights te redden.

Zero wint het vertrouwen van de Knights terug. De belangstelling is groot wanneer Suzaku terugkomt op school, dus de studentenraad organiseert een feest voor hem.

Wanneer de Black Knights een verrassingsaanval uitvoeren op de Stille Oceaan, keren ze Zero de rug toe. Deze probeert bij Nunnally te komen om haar te ontvoeren.

Lelouch zit in een crisis. Nunnally is verkozen tot gouverneur-generaal van Area 11, maar er is nog meer schokkend nieuws over haar.

De Black Knights maken zich zorgen over Zero's beslissing om aan de Japanse Speciale Regio te werken. Lelouch gedraagt zich vreemd.

De Orde van de Black Knights is nu in China. De Chinese Federatie wordt officieel geregeerd door de eerbiedwaardige vorst Lihua.

Nadat Zero Lihua heeft ontvoerd tijdens haar huwelijk met prins Odysseus, voeren de Zwarte Knights en Xing ke een gevecht op leven en dood.

Door de belegering in het mausoleum wordt de situatie steeds nijpender voor Lelouch. De legers van China en Britannia zijn overweldigend.

Lelouch en Shirley komen tegenover elkaar te staan. De jongen ondervindt ook de gevolgen van de misverstanden die zijn ontstaan door de betrokkenheid van Sayoko.

Shirley heeft haar geheugen weer terug. Ze herinnert zich nu weer alles over Lelouch. Ze zoekt contact met Suzaku omdat ze Zero wil ontmaskeren.

Na een tragisch verlies besluit Lelouch de Cult of Geass uit te roeien, de organisatie te gronde te richten en Rolo uit te schakelen.

De confrontatie tussen Lelouch en zijn keizerlijke vader vindt plaats in een parallelle wereld. Het einddoel is nabij, maar hij is geschokt door een onthulling.

Door de opkomende Federatie van de Verenigde Staten beschikt Lelouch over de middelen en mankracht om tegen Britannia te strijden.

Lelouch speelt zijn laatste troef uit terwijl hij Nunnally probeert te redden: wanhopig en nederig smeekt hij Suzaku om hem te helpen.

Lelouch en de Black Knights worden geholpen door Jeremia en Guilford, maar verzetten zich nauwelijks tegen Suzaku en de Other Knights of Rounds.

Schneizel profiteert van de afwezigheid van Lelouch en ontmoet de leiders van de Black Knights onder verschrikkelijke lichamelijke en geestelijke omstandigheden.

De ware vorm van Marianne wordt geopenbaard aan C.C.en Zero wordt doodverklaard.

Lelouch heeft zijn vader gevangen en staat nu op het punt de waarheid te ontdekken over de dood van zijn moeder, die plotseling voor hem verschijnt.

Lelouch, die nu is uitgeroepen tot keizer, vernietigt met toestemming van Suzaku alles waar Britannia tot dan toe voor stond.

Schneizel neemt Damocles mee naar een grote hoogte om de hele wereld te bedreigen met FLEIJA-kernkoppen. Om de vrede te garanderen, is hij zelfs bereid tot moord.

Terwijl de Black Knights erin slagen om Avalon binnen te dringen en de gijzelaars te redden, stormt Lelouch Damocles binnen.

Lelouch gebruikt de Geass en Nunnally en ontvangt de sleutel van Damocles. Met deze sleutel en de FLEIJA is hij onoverwinnelijk.