Gaara wird von den Dorfbewohnern von Suna-Gakure inzwischen anerkannt. Ja, man sieht ihn dort mittlerweile sogar als große Stütze, nicht mehr als Sonderling. Seine Auseinandersetzungen mit Deidara verlaufen allerdings nicht immer gleich erfolgreich, auch wenn er mit seinem speziellen Sand, seiner „Absoluten Verteidigung," gewisse Vorteile zu haben scheint.

Das Dorf Suna-Gakure ist in Aufregung, weil Kazekage Gaara offensichtlich entführt wurde. Damit hatte keiner gerechnet. Kankuro möchte auf eigene Faust versuchen, Gaara zu befreien, aber Baki schickt ihm Verstärkung hinterher. An einem Ort, an dem Deidara gelandet war, findet man mehrere leblose Körper. Was mag wohl dahinter stecken?

In Suna-Gakure wird nach weiteren Fallen der Feinde gesucht. Man macht sich ernsthafte Gedanken um die Sicherheit im Dorf, und ob man nicht einen neuen Kazekage ernennen muss. Das stößt auf Widerstand von Baki und Kankuro, der sich nach der Giftattacke einigermaßen erholt hat. Das Team Kakashi ist noch unterwegs zum Unruheherd und trifft auf Temari.

Guys Team, das Kakashi zu Hilfe kommen sollte, wird von Kisame aufgehalten. Er hat von der Akatsuki Organisation den Auftrag, Guy zu bekämpfen, was er gern tut, denn mit ihm hat er noch eine alte Rechnung zu begleichen. Guy hat einen schweren Stand, denn Kisame kann mit seinem Chakra unglaubliche Mengen an Wasser entstehen lassen und bewegen …

Bei dem Kampf gegen Sasori ist es Sakura und Chiyo gelungen, ihn zu zwingen aus seiner Marionette herauszukommen. Für Chiyo ein Schock. Sie hat ihn seit 20 Jahren nicht mehr gesehen, aber er ist um keinen Tag gealtert. Vor ihnen steht ein junger Mann, der ihnen im Kampf allerdings die Hölle heiß macht und alle Register zieht.

Oma Chiyo und Sakura wissen, dass das Gegengift nur noch drei Minuten wirkt, also müssen sie schnell eine Entscheidung fällen, wie sie gegen Sasori vorgehen. Der wiederum ist sich seiner Sache sehr sicher, zumal er ein spezielles Jutsu anwenden kann, mit dem seine Gegnerinnen wohl nicht rechnen. Aber auch Oma Chiyo hat mit ihrem „Zehn-Finger" - Jutsu noch einen Trumpf in der Hand …

Yamato und sein Team haben Sai aus Orochimarus Versteck geholt und ihn gefangen genommen, da kommt ihnen Kabuto in die Quere. Der jedoch hat allein gegen die Drei keine Chance und so befreit er Sai von dessen Fesseln, in der Hoffnung, dass er sich auf seine Seite schlägt, doch Sai reagiert anders: Er stellt sich auf die Seite des Teams und so gelingt es ihnen, Kabuto festzusetzen.

Deidara und Tobi, zwei von Akatsuki, sind unterwegs, um den Bijuu-Geist Sanbi, den Dreischwänzigen zu finden. Tobi scheint einen ziemlichen Knall zu haben, womit er Deidara auf die Nerven geht. Dem Bijuu-Geist sind Guren und Gozu schon um Längen näher, denn mit Hilfe der außergewöhnlichen Fähigkeiten von Yukimaru wollen sie ihn hervorrufen.

Lee ist enttäuscht, dass er nicht dem Team zugeteilt wurde, das gegen Guren, die Frau mit dem Kristallversteck, antreten soll, aber Kiba bestätigt ihm, dass ihre Untergebenen auch extrem starke Gegner seien. Während Shizune und die Mädchen die Versiegelungsbarriere aufbauen, geraten Lee, Kiba, TenTen und Yamato in den Hinterhalt von Gurens Schergen.

Während des dritten Shinobi Weltkrieges wurde die junge Shinobi Rin entführt. Ihre Teamkollegen Kakashi und Obito versuchten daraufhin sie, zu befreien. Im Versteck der Iwa-Nins konnte Kakashi Obito retten, verlor dabei jedoch sein linkes Auge. Die zwei Shinobi mussten sich einem Kampf gegen dem Iwa-Nin Kakkou stellen.

Sasuke ist immer noch in eine Auseinandersetzung mit Deidara und Tobi verwickelt. Deidara setzt zunächst C1-Bomben ein. Diese kann Sasuke mit Hilfe von Chidori Senbon ohne Probleme abwehren. Daraufhin machen ihm explodierende, sich neu regenerierende Lehmpuppen zu schaffen. Doch auch diese kann Sasuke mit einem Trick abschütteln.

Im geheimen Uchiha-Clan Versteck kommt es zu dem entscheidenden Showdown zwischen den Uchiha-Brüdern Sasuke und Itachi. Während des Kampfes erinnern sich beide an ihre gemeinsame Jugend zurück. Als der Kampf etwas zu erliegen kommt, kann Sasuke endlich die entscheidende Frage stellen. Er möchte von seinem Bruder wissen, wer ihm damals bei dem Überfall auf ihr Dorf geholfen hat.

Sasuke stellt sich einem Kampf gegen den Rapper Killer B. Killer B greift Sasuke zunächst mit seinen sechs Schwertern an. Diesen Angriff kann Sasuke mit seinem Chidori schnell beenden. Daraufhin aktiviert Killer B sein Chakra des Hachibi in sich. Kurze Zeit kann Sasuke Killer B gefangen halten, jedoch kann der Rapper sich aus der Illusion befreien.

Nachdem Konoha von Pain völlig zerstört wurde, versuchen die Bewohner das Dorf wieder aufzubauen. Dabei wendet Yamato sein Holz-Jutsu an, um somit einige Häuser wieder zu errichten. Zu Narutos Überraschung tauchen Inari und Tazuna auf. Die Tischler kommen aus dem Land der Wellen, um sich für Narutos geleistete Hilfe zu revanchieren.

Kakashi und seine Schützlinge wurden vor einigen Jahren beauftragt, den von Dieben gestohlenen Schatz der Schwester des Feudalherren zurückzuholen. Schon kurz nach Beginn der Mission, ging so Einiges schief. Den Dieben gelang es zunächst Sakura gefangen zu nehmen und zwischen Sasuke und Naruto buchstäblich eine unzertrennliche Verbindung zu erschaffen.

Yamato erzählt auf der Reise nach Kumogakure seinen Mitreisenden Gruselgeschichten eines Geisterschiffes. Kurze Zeit darauf taucht ein echtes Geisterschiff auf. Dieses Schiff gleicht genau dem Schiff aus Yamatos Erzählung. Yamato, Aoba und Naruto machen sich sofort auf, das Schiff zu erkunden. Auf dem Schiff treffen sie auf den Schiffsjungen Hishaku.

Auch Konohamaru möchte sein Dorf und dessen Bewohner im bevorstehenden Kampf mit den Akatsuki beschützen. Jedoch empfinden die Erwachsenen des Dorfes seine Anwesenheit als störend. Sie beauftragen den jungen Ninja mit nervigen Hilfsaufgaben. Konohamaru will mehr machen und fasst den Entschluss, auf eigene Faust aktiv zu werden. Schon kurz darauf, kann er einen vermeintlichen Spitzel enttarnen.

Eine Rückblende zeigt Obito Uchihas Tod – von seinem angeblichen Ableben während des dritten Ninja-Weltkriegs bis zum Zusammentreffen mit Madara Uchiha.

Obito und Madara haben die Kontrolle über das Juubi. Kyubi und Hachibi versuchen das Erwachen aufzuhalten, doch Naruto und seine Freunde haben nicht genügend Chakra.

Ein Android, der genau wie Naruto aussieht, taucht plötzlich in Konoha auf, um ihm sein Chakra abzunehmen. Naruto ist machtlos und muss fliehen.

(* Filler-Folge gemäß animefillerlist.com)