Члени Акацукі Дейдара і Сасорі починають атаку на Селище Піску з метою викрасти Кадзекаґе Ґаару. Дейдара атакує з повітря, використовуючи створених ним глиняних тварин, які вибухають.

Сакура та бабуся Чіо ведуть запеклу боротьбу з Сасорі, який вміє перетворювати себе на людську маріонетку. Їм вдається вкластися у відведений час, але Сасорі відроджується.

Створивши дерев'яну копію Хіруко, Ямато маскується під Сасорі і вирушає на зустріч зі шпигуном. Шпигун виявляється правою рукою Орочімару, Кабуто Якуші, який розкриває Ямато місцезнаходження схованки Орочімару. Орочімару перериває зустріч, начебто нападаючи на Кабуто, і хоча спочатку здається, що Орочімару прийшов за Кабуто, Кабуто нападає на Ямато і показує, що він насправді відданий Орочімару. Орочімару кличе Наруто, Сакуру і Сая, які ховаються і спостерігають за зустріччю і готується до бою з командою.

У повній темряві поселення Коноха намагається захиститися від чотирьох нападників, які забарикадували все село за бар'єром. Усе село перебуває у стані надзвичайної ситуації. Асума, якому Цунаде наказала слідувати за Сорою та Наруто, нарешті наздоганяє їх. Асума розуміє, що четверо загарбників планують знищити все село, використовуючи блискавичну силу вкрадених ними трупів. Одкровення шокує Сору. Коли Асума йде, щоб допомогти стримати нападників, він доручає Наруто продовжувати переслідувати Сору.

Боротьба між Наруто та Сорою триває. Асума і Казума б'ються. З'являється Сай, який втік з лікарні і зв'язує Казуму чорнильною змією. Казума виривається з-під дзюцу Сая і нападає на Асуму, але гине. Зрештою Наруто добирається до Сори, якому вдається вивільнити чакру Дев'ятихвостого. Після цього Сора залишає село, щоб подорожувати світом. Асума та Шикамару грають у сьоґі та обговорюють, хто є королем Конохи. В іншому місці з'являються двоє членів Акацукі, Хідан і Какудзу, які переслідують Двохвостого Джинчурікі.

Асума оплакує смерть Чіріку і розуміє, що Хідан і Какудзу намагаються отримати винагороду за його голову. Хідан і Какудзу забирають Чіріку, щоб отримати винагороду. Тим часом Какаші показує Наруто справжню мету його тренувань.

Поки Акацукі обговорюють справжні цілі їхньої організації, Наруто продовжує тренування. Тим часом Цунаде отримує трагічну звістку.

Шикамару продовжує боротьбу з Хіданом. Хідану вдається поранити Шикамару і проклинає його так само, як і Асуму, але коли Шикамару виживає після нападу Хідана, Хідан розуміє, що щось не зовсім так.

Какаші відправляє Кібу, Хінату та Шино на місію, щоб проникнути до лігва Орочімару. Які жахи та пастки чекають на них?

Юкімару викликає Трихвостого і знерухомлює його, а Ґурен намагається його схопити. Йому вдається вирватися і напасти. Какаші наказує Наруто дослідити озеро, поки вони шукають Рінджі та інших. Рінджі та його люди готують засідку, але Хіната, Сакура та Сай прибувають, щоб запобігти цьому. Наруто викликає Ґамакічі та Ґаматацу і вони йдуть до Трихвостого, де бачать Юкімару і дізнаються про його вірність Ґурену. Намагаючись врятувати Ґурен, Юкімару знову намагається придушити Трихвостого, перш ніж йому вдається втекти з нею.

Ґурен намагається напасти на Наруто всередині Трихвостого, але в ослабленому стані не може цього зробити і втрачає свідомість. Тим часом Какаші просить Сакуру та Іно вилікувати Юкімару, поки він, Шізуне, Кіба, Сай та Хіната шукатимуть Наруто. Незабаром Наруто і Ґурен стикаються з ордою міні-трихвостів, які намагаються напасти на них, але вони ухиляються від них і починають сперечатися про Юкімару. Поки Юкімару прокидається, Наруто скликає групу Тіньових клонів, щоб знайти вихід зі шлунку звіра. В іншому місці Кабуто роздає прокляті знаки людям Рінджі.

Команда запечатувальників продовжує свої зусилля по запечатуванню Санбі, в той час як Какаші та інші протистоять монстру, якого створили Кігірі, Нурарі та Кіхоу. Кабуто розкриває плани Орочімару щодо Санбі і вони з Наруто починають боротьбу. Захищаючи Юкімару, Ґурен бореться проти справжнього Рінджі, якого воскресив Кабуто. Коли Ґурен жертвує своїм життям, щоб врятувати Юкімару, сили Юкімару вступають у повну силу. Тепер, щоб захистити Юкімару, Наруто готується виступити проти несамовитого Санбі.

Обіто ігнорує наказ Какаші продовжувати місію і вирушає рятувати Рін, яку викрали Скелясті ніндзя. Але вороги виявляють прибуття Обіто і перемагають його. Какаші прибуває в останню хвилину і рятує Обіто...

Ставши ґенинами, Джірайя, Цунаде та Орочімару потрапляють до майбутнього взводу Третього Хокаґе. Спостерігаючи за просторово-часовим ніндзюцу Сарутобі, Джирайя з головою поринає у його вивчення. Одного разу Джірайя збивається зі шляху і натрапляє на гору Міубоку. Там він зустрічає Великого Жаб'ячого Мудреця, який передбачив його прихід. Дізнайтеся про походження Жаб'ячого Мудреця Джірайї!

Не зумівши повернути Саске, ніндзя Листя повертаються до Поселення Прихованого Листя. Однак Цунаде посилає Кацую повідомити їм, що бар'єр гори Кацунагі клану Цучіґумо, яка володіє потужним забороненим дзюцу, зламано. Поки Какаші та Команда 8 повертаються до Поселення Листя, Команда 7 на чолі з Ямато має з'ясувати, що там відбувається.

Наруто вдається знайти місцезнаходження Ширані, але він виявляє, що Ширані, якого він знайшов, насправді був замаскованим під нього ніндзя-бандитом. Хотару знаходить справжню Ширанами і та переконує Хотару не вилучати заборонене дзюцу і відвозить її назад до села Цучіґумо. Після того, як Наруто врятував Утакату від бандитів-ніндзя, вони повертаються до села Цучіґумо, де виявляють, що Ширанамі тримає під своїм контролем усіх мешканців села.

In a flashback of Naruto and Sakura's, Team 7 is on a mission to take an ostrich called Mr. Ostrich to his home. They arrive at a village where they see a swordsman named Tsukado who has a vendetta to carry on a man named Katazu who killed his distant relative Shikazo. Tsukado fails to defeat him so Naruto decides to teach him unusual revenge lessons. Katazu has then took his brother's identity and attracted Shikazo's pursuers while Kageki and his family went into hiding. Tsukado decides not to kill him and ends their years of fighting though Kanabun wants them to keep fighting. The swordsmen, Team 7 and Mr. Ostrich chase the Kanabun Gang out of town.

During the two-and-a-half-year time period in which Naruto was training under Jiraiya, the latter decided that it was time for Naruto to learn how to repel genjutsu. During this training session, the two traveled to a village which Jiraiya had previously been associated with, but they discovered that something dark was amidst.

Naruto and Sakura learn that Danzo has been made Hokage and that his first order is to eliminate Sasuke. The two go to Sai and inquire about Danzo, but Sai reveals that a curse mark given to all members of the Foundation prevent him from revealing anything about the new Hokage. Soon afterward, Karui and Darui attack them, demanding information about Sasuke.

Naruto returns to the Leaf Village, and his teammates demand to know why he didn't finish Sasuke off when the latter was in such a weak state. Naruto tells them that when the time is right, he will deal with Sasuke personally. Meanwhile, a supposedly deceased member of Akastuki has infiltrated the Hidden Cloud Village.

Kiba trains hard to catch up to Naruto, who is now hailed as the hero of the Leaf Village, but with little success. Feeling desperate, Kiba asks Kakashi if he could train him.

Zetsu reports on new intel from Kisame and Madara learns about Naruto hideout. Tsunade, Gaara, Lord Raikage, and others must figure out how to get Naruto out of the secret island of Land of Lighting and all without telling him about the war. New mission is introduced.

Darui manages to seal away Ginkaku. Fueled by the rage of losing his brother, Kinkaku transforms into a monster that resembles a jinchuriki’s Tailed Beast State.

The Allied Shinobi Forces are on the verge of winning the war when Madara Uchiha appears. Madara summons the giant Gedo Statue and unleashes its devastating power.

As the Allied Shinobi Forces' headquarters scramble to deal with White Zetsu Army clones infiltration issue, word reaches the Fifth Division of the development and Mifune instructs his division accordingly.

The reborn Team Kakashi continues to investigate the recent attack by Kabuto and the reincarnated shinobi when Naruto gets swallowed by a giant snake, but manages to escape using shadow clones, and accidentally ingests snakes that were present in the pond which Kabuto uses to summon Hidan.

The legendary Ama no Hoko imbues the Nine Tails’ clone with enough power to destroy the world. Naruto is overcome by its immense power and lies unconscious.

Shikamaru, Choji, Neji, and Kiba find themselves up against some familiar faces from the past. The Sound Ninja Four have been brought back by Kabuto’s Reanimation Jutsu, and they are ready to seek vengeance.

Madara is prepping his new jutsu Limited Tsukuyomi, choosing Naruto as his test subject. Meanwhile, Naruto is spending his day off alone in his room. Thinking that Naruto is lonely, Lee suggests they all go to the bathhouse for some relaxation.

Kabuto’s past is finally revealed. As child, a woman named Nonou raised Kabuto at an orphanage in the Leaf Village. One day, Danzo and Orochimaru visit the orphanage to provide financial aid under the condition that Nonou work as their spy.

Having absorbed the chakras of all nine Tailed Beasts, the Gedo Statue begins its transformation into Ten Tails. Naruto, Killer Bee, Kakashi, and Guy try to destroy the Gedo Statue but are stopped by the masked man.

After being saved by the target he was ordered to kill, Tenzo realizes that the man known as “Kakashi the Friend Killer” is someone who values the lives of his comrades more than anyone.

The Allied Shinobi Forces begin their onslaught against Obito and Madara. But Ten Tails suddenly transforms and hurls powerful Tailed Beast Bombs toward distant towns.

Naruto's past, thoughts, and feelings flow into the consciousness of every shinobi, unifying their hearts.

Naruto and the Allied Shinobi Forces successfully extract the Tailed Beasts from Obito. Only Madara remains, and Naruto heads out to tackle this foe.

The genin are unable to figure out the answer and start to panic.

Naruto wakes up and encounters the legendary shinobi, the Sage of Six Paths. He reveals to Naruto that he is the reincarnation of his son, Ashura, and that Sasuke is the reincarnation of Indra, Ashura's older brother.

It’s been three years since Naruto set out to train with Jiraiya, and he's just returned to the Hidden Leaf Village. Konohamaru immediately begs Naruto to teach him a new jutsu and he starts to go over the basics...but his explanations are very vague. Soon after, Naruto sets out on a mission, leaving Konohamaru to figure it out alone!

Naruto wants to bring Sasuke back to the village, but Sasuke burns with a desire to bring Naruto down. Why is Sasuke so confrontational, and how did his feelings toward Naruto develop? The truth rises to the surface during Sasuke’s relentless attack. Where will this battle lead? Find out in the conclusion of the “Jiraiya Ninja Scrolls.”

Recalling the time when he shared Naruto’s desire to become Hokage, Obito opens up to Naruto about his dreams.

"I'll be a better shinobi than Lord Hokage! Then all the villagers will have to acknowledge my existence at last!" True to his word, Naruto has walked his own path until there are none who do not recognize that he's become a great shinobi and a hero who has saved the world. But what path will Naruto take now? How will the world of the shinobi change? This is the story of the boy who blew through the hearts of all like a "shippu," an irresistible gale. This is the story of Naruto Uzumaki.

Naruto and Hinata’s wedding day has been set. As the date approaches, Kakashi encounters a problem: Naruto’s friends are all top shinobi—the first line of defense in the village. They work 24/7, and there are always a few who cannot attend celebrations. As Kakashi tries to find the most reasonable solution, he announces a super-secret mission to find the couple a wedding gift.

Naruto had once lived a lonely existence, ostracized by everyone. But Iruka's words and his very presence have supported Naruto to this day. As Naruto's wedding nears, Iruka begins to lose sight of what he was to Naruto, and is unsure of what to say for his message.