时间过得真的好快，木叶丸他们终于成为了可以执行任务的小组了，虽然冒冒失失，莽莽撞撞，但是总算把任务完成了，不过木叶丸和当年的鸣人真的好像啊，一上场就要求执行更复杂的任务。不过，这么长时间了，鸣人和自来也的修行终于结束了，两人回到了村子里，鸣人一阵感慨，村子还是一点都没变呢，只是多了一个纲手的影岩。多年没见，鸣人变得更高更强壮了，只是个别神经还是......

五封结界被解除了，但敌人所设下的陷阱也在此时启动，阿凯小组得先打败自己的分身强敌，才有办法脱身。卡卡西他们也只能先靠自己对付眼前的敌人了……

空跟降土有了第一次的接触，降土看上空的强大力量，便鼓吹他加入他们的行列。另一方面，被“有为转变”的陷阱困住的小樱一行人也终于会合了……

自来也利用蛤蟆成功潜入雨忍者村后，随即开始搜集村里内战的情报，对于村人避谈昔日首领山椒鱼半藏的话题和景仰新首领培因的态度来看，自来也认为事有蹊跷，便决定抓两名雨忍者村的下忍来打探有关培因的情报……

佐助一行人在雷之国的云雷峡找到了八尾杀人蜂的踪迹，而八尾虽然老是唱着古怪的饶舌歌曲，但却让佐助他们陷入苦战，佐助甚至还一度受到濒临死亡的重伤，而想尽早解决敌人的八尾，也终于显露出尾兽的原貌……

为了村子的重建工作，天天与宁次前往研究所筹措必要的忍具，并回想起第一次造访研究所时发生的意外事件。当时鸣人取代小李，与天天和宁次组成三人小组。然而，出现在他们面前的，却是风格独特的忍具研究家硫黄与他的助理硝石……

杀人蜂背着紧黏着他的鲛肌回到云忍者村，但它的行动背后，竟隐藏着晓的企图。另一方面，刚醒来的祭发现舌头上的咒印已消失，这是因为段藏已死，所以术也跟着解开了。当然木叶的暗部也察觉到此事，因而引起了骚动。

因鬼鲛将情报外泄，使得大和一行人害怕自己的所在之地遭到敌人锁定。虽然想安排鸣人与杀人蜂移动，却又得隐瞒战争的事实，只好对鸣人宣称纲手指派他执行机密任务，也就是“动物们的生态调查”工作，超S级的极机密任务。

兜出现在托尼卡村。鸣人为了抓住兜，不惜使出浑身解数，但最后还是让他逃走了。德克带着孩子们，逃到了邻近的小村庄里。幼小的米娜，不知何故常哼出一段神秘的旋律。

兜的过去终于被揭露了。年幼时因身受重伤而失去记忆的兜，被在木叶忍者村经营孤儿院的名为“野乃宇”的女性捡回去，并得到了“兜”这个名字。孤儿院由于资金问题而难以继续运营，兜因此运用自野乃宇那里习得的医疗忍术，从事为忍者们治疗的工作，也是在那时初次与大蛇丸见面。此后，身为第三代火影·日斩的幼时好友、组织了暗部养成部队“根”的男人“团藏”，以援助金方面的交涉为由，与大蛇丸一同在孤儿院现身了……

为了守护村子，柱间打倒了身为朋友的斑，两人之间的战斗迎来了终结。之后，希望知道何为村子、何为忍者而发问的佐助，被柱间告知忍者即为“忍耐之人”。佐助得知了如此作答的柱间的意志，于是一边说着“鼬也是继承了这样的意志。继承了这意志的是宇智波一族的人，还真是讽刺啊”，一边露出了冷笑。聆听了所有火影的发言，并了解了忍者以及村子的成立的佐助，他从其中推导出的答案究竟是！？

鸣人醒来时，发现自己身在精神世界。正当他对于自己是否已死感到不安时，他与传说中的忍者六道仙人相遇了。在那里，鸣人得知了自己是六道仙人的儿子·阿修罗的转生者，而佐助则是阿修罗的哥哥·因陀罗的转生者。阿修罗和因陀罗从过去开始就不断争斗。这两人的命运给鸣人和佐助带来的究竟是什么？另一方面，在战场赌上性命与斑交战的阿凯，生命之灯即将消逝。

同鸣人汇合，下忍们解除了傀儡来袭的危机。看到了这些下忍的行动，感觉年轻忍者们还有未来可言而心满意足的面具男，准备按照约定释放上忍们。和面具男一起见证了一部分实验的宁次也被解放出现在了鸣人他们面前。随后这次事件的主谋面具男开始诉说这次的目的以及他的真实身份，最终面具男究竟会是谁呢！？而且这次事件看上去算是解决了，但其背面隐藏着…？

鸣人和佐助的最终对决。鸣人想将佐助带回去，但佐助却是杀气外露。为何佐助会敌视鸣人呢？木叶同宇智波一族。火影与富岳。火影的儿子鸣人，宇智波族长的儿子佐助。再加之优秀忍者哥哥·鼬的存在。佐助面对鸣人思绪万千，一边不断地猛烈攻击对方一边回想当初。最终战斗如何！？另外自来也忍法帐，就此完结！！

第七班合力终于成功将辉夜封印了。辉夜之前所吸收的尾兽都被释放了出来，这下战争终结世界得救了。正当大家这么想时...黑绝逃离了封印，准备再次为母亲复活而逃亡。不过鸣人没有放跑黑绝。黑绝说「你们这些人，不过是我所创造的历史的一部分」，鸣人义愤填膺的回道「忍者的历史是由无数忍者的生死组成的！」。

「超越火影！让村里的所有人都认可我！」说出这句话并持续贯彻自我忍道的鸣人如今已经成长为了一个人人称道的忍者，并且成为了拯救世界的英雄。这样的鸣人将踏上的道路是...？忍者世界的未来又将如何发展！？在人们的心中，有如疾风般奔驰向前的漩涡鸣人物语。

鸣人和雏田就要结婚了。可这迫在眼前的婚礼让卡卡西为了某个问题很是烦恼。现在虽然是和平了，但鸣人的朋友们都是忍村活跃在一线的忍者。一直都在连日连夜处理任务的他们，必定会有人无法出席当日的结婚典礼。作为火影的卡卡西为了避免这种情况发生，向大家颁布了“准备二人的结婚贺礼”这个绝密任务！

鸣人曾经得不到任何人认同而孤独的生活。但是，由于伊鲁卡认可鸣人的事情，鸣人的故事开始了。伊鲁卡的话语和存在，支撑鸣人走到了今天。伊鲁卡眼看鸣人现在已经快要结婚了，变得不知道现在的自己对鸣人来说是怎样的存在，而一直无法决定结婚贺词。到底伊鲁卡为鸣人准备了怎样的贺词呢...？经历漫长旅途的火影忍者疾风传，在此完结！！