En poste d’observation durant la nuit, Neji tombe à cours de chakra et Kiba lui conseille d’aller à la tente médicale. Là-bas, malgré les contrôles à l’entrée, des jōnin médicaux sont assassinés ; après avoir été soigné par Sakura, Neji propose d’utiliser son Byakugan pour retrouver l’espion qui a été infiltré dans l’Alliance ninja, mais faisant semblant de rechercher le coupable, il assassine deux autres jōnin médicaux après leur avoir demandé où se trouvait Sakura. Pendant ce temps, cette dernière reçoit un ninja qu’elle a soigné qui lui donne une lettre d’amour ; lui expliquant qu’elle est déjà amoureuse de quelqu’un, elle le congédie et repense à Sasuke. Alors qu’il s’avère que le vrai Neji n’est pas allé à la tente médicale, le faux s’introduit dans la tente de Sakura ; il cherche à savoir où se trouve Shizune, la capitaine de l’unité médicale, mais quand Sakura lui dit qu’elle soigne Ton-Ton d’une entorse, le faux Neji fait une erreur en parlant de mains, pensant que c’est un ninja, ce qui permet à Sakura de le démasquer. Au moment où il s’apprête à la poignarder, elle l’écrase d’un coup de poing et s’aperçoit qu’il s’agit d’une transformation de Zetsu ; ce dernier lui explique que sa technique de transformation est très puissante et lui permet de prendre la forme et le chakra d’une personne, laissant comprendre qu’il y a sans doute maintenant beaucoup d’espions ayant pris la forme de ninjas de l’alliance dans leur camp. Sakura repense au rapport à propos de la fausse mort de Kisame face à Killer Bee et au Raikage et comprend de quelle manière fonctionne la technique de Zetsu.

Au quartier général, Shikaku reçoit de nombreux rapports d’assassinats, puis apprend par Sakura que plusieurs Zetsu blancs ont infiltré leurs troupes ; Ao et Mabui estiment que la situation est catastrophique. Shikaku se concentre et examine toutes les données de la guerre en sa possession pour chercher rapidement une solution avant le combat du lendemain, pour éviter que les ninjas de l’Alliance ne s’entretuent.

Alors qu’il se dirige avec Bee vers le champ de bataille, Naruto ressent le doute qui s’instille au sein des troupes de l’Alliance Ninja. Soudain, A et Tsunade surgissent devant eux. Voyant qu’il ne peut convaincre le Raikage de le laisser passer, Naruto décide de passer en force, mais A le devance et l’envoie à terre. Naruto essaie alors de convaincre Tsunade, mais cette dernière lui dit qu’elle ne peut prendre de décisions individuellement au sein de l’Alliance. Naruto réessaie de s’enfuir, mais est sans cesse devancé par le Raikage, bien que sa vitesse impressionne Tsunade ; A lui annonce qu’il est le ninja le plus rapide depuis la mort du 4e Hokage. Alors que Naruto l’interroge sur son père, il déclare l’avoir affronté en de maintes occasions, et pensé que personne ne pourrait jamais le vaincre ; mais bien qu’il eut été considéré comme l’« enfant de la prophétie », il a selon lui échoué face à Kyûbi, et Naruto, son fils, devrait en prendre de la graine. Se souvenant de sa conversation avec sa mère, Naruto décrète que son père n’a pas échoué, lui ayant transmis son héritage. Devant l’entêtement de Naruto, le Raikage décide de le tuer pour retarder la renaissance de Kyûbi et le plan de l’ennemi, mais Bee s’interpose, bloquant le bras de son frère avec le sien. Bee dit à son frère qu’il fait confiance à Naruto, et que si quelqu’un doit mourir, il préfère que ce soit lui. Alors que A lui dit que les jinchūriki ne sont que des outils pour leur village, Bee lui répond qu’ils ont également des sentiments, et qu’avec leurs poings en contact, il devrait être capable de lire dans son cœur.

A se souvient alors de la manière dont il a rencontré Bee, seul enfant du village à pouvoir rivaliser avec sa force pour exécuter un double-lariat équilibré ; depuis ce jour, Bee est devenu son frère adoptif et coéquipier, pour former la plus puissante équipe de Kumo. En travaillant avec A et en grandissant, Bee a développé ses talents de ninja, en même temps que sa force physique, et leur réputation est allée grandissante ; Bee espérait rattraper son frère pour exécuter un double-lariat sans que A restreigne sa force, et pouvoir le regarder de haut à son tour. A se souvient ensuite de sa conversation avec le précédent jinchūriki de Hachibi, cousin de Bee, avant qu’il ne se fasse submerger par le démon : ce dernier lui avait dit que Bee deviendrait sans doute le prochain, et qu’il faudrait alors lui « remplir le cœur » pour l’empêcher de sombrer. Avant qu’il ne soit fait jinchūriki, A parle à Bee, en lui disant de lui dire tout ce qu’il a sur le cœur et qu’il compte beaucoup pour lui en tant que frère et équipier ; Bee lui avait alors dit de ne pas s’inquiéter. A se rappelle ensuite leur première rencontre avec le 4e Hokage ; utilisant un tentacule, Bee avait permis à A d’éviter de se faire poignarder lorsque Minato est apparu dans son dos. A avait ensuite tenté de prendre Minato de vitesse, mais ce dernier est apparu derrière Bee, sur qui il avait apposé son sceau de téléportation. Menacé également par un des sabres de Bee, Minato les avait félicités pour leur travail d’équipe, et avait conseillé à A de trouver ce qui était vraiment important pour Bee afin que celui-ci ne sombre pas dans la folie.

Face aux questions de A, qui souhaite savoir quand Tsunade a accordé sa confiance à Naruto, cette dernière se remémore sa première rencontre avec le jeune ninja et le pari qu’elle avait fait avec lui.

Le Raikage lui rappelle alors la première fois qu’ils se sont rencontrés, avant qu’elle ne devienne Hokage : en mission pour récupérer la technique secrète du Village du Cèdre et ayant été attaqués par des mercenaires du clan Norizaru, A et ses hommes s’étaient retrouvés dans le village ou Tsunade, accompagnée de Shizune, s’était arrêtée. Toujours tourmentée par les morts de Nawaki et Dan, la jeune femme s’endettait et dépensait tout en paris et saké, trompant les collecteurs de dettes pour pouvoir emprunter encore plus. Ayant perdu un de ses hommes, et un autre étant infecté par la technique du clan Norizaru, des insectes explosifs se nourrissant de chakra, le Raikage avait décidé de demander à Tsunade de le soigner. Cette dernière, ne souhaitant pas aider Kumo qui avait voulu voler le Byakugan de Konoha, l’avait défié au bras de fer, et alors qu’elle gagnait en force brute, A avait retournée la situation en reculant son bras et en utilisant sa vitesse pour la repousser.

L’escouade d’Omoï est attaquée par l’épéiste Ameyuri Ringo, utilisant les « Crocs de la Foudre » et a besoin de renfort. Les quelques survivants se rassemblent tandis que Kakashi, Gaï, Saï et quelques autres se dirigent vers les lieux. Celui qui prend le commandement, Nurui, décide de battre en retraite, mais Omoï pense à venger ses compagnons morts au combat. Alors qu’ils s’enfuient, poursuivis par Ameyuri, réputée pour n’avoir jamais laissé sa proie s’enfuir, Omoï décide d’engager le combat. Pendant que Gaï, Kakashi et leurs compagnons se hâtent sur les traces d’Ameyuri, Omoï engage un combat de sabre contre elle ; dominé, il décide d’utiliser une technique d’épéiste que Killer Bee lui a apprise, mais il est finalement mis à terre par son adversaire, qui le félicite pour sa pugnacité. Ameyuri le laisse en vie le temps de se débarrasser de ses deux compagnons, puis le prend à nouveau en chasse ; suivant le plan que Nurui lui a révélé, Omoï fait faisant semblant de fuir, et attire l’épéiste sur un terrain de sables mouvants recouvert d’une couche de terre ; lorsqu’elle utilise sa technique « Thunder Gate », la terre cède et elle est prise au piège. Kakashi, Gaï, et Saï arrivent à temps pour sortir Omoï des sables mouvants ; avant de disparaître, Ameyuri lui offre ses sabres pour le remercier du combat. Inoichi annonce à Kakashi et Gaï que Naruto et Killer Bee se dirigent vers le front et que le cours de la guerre va changer.

Gaara explique à son père qu’Akatsuki a extrait de lui le Shukaku, mais que Chiyo et ses amis l’ont sauvés. Il lui dit qu’il lui pardonne d’avoir tenté de le tuer, car devenu Kazekage, il comprend l’importance de protéger le village de Suna en toute circonstance. Le 4e Kazekage est très surpris d’apprendre que son fils a pu se faire des amis et devenir le chef du village ; il se souvient de la naissance de Gaara et de la mort de Karura, puis du test qu’il avait fait passer à Gaara enfant, en envoyant Yashamaru lui mentir en lui disant que sa mère ne l’avait jamais aimé, pour voir si soumis à une telle émotion, il pourrait résister à son démon, test qui avait échoué et abouti à la mort de Yashamaru. Le père de Gaara en avait alors conclu que son fils n’était que le produit d’une expérience raté et avait tenté de s’en débarrasser à plusieurs reprises.

Les ninjas de l’Alliance et les anciens kage s’apprêtent à reprendre le combat ; tant qu’ils peuvent penser par eux-mêmes, ces derniers donnent des conseils à leurs adversaires. Le sable de Gaara s’oppose à nouveau à la poussière d’or de son père, et Gaara parvient à piéger les kage tout en se protégeant, le sable prenant la forme de sa mère. Le quatrième Kazekage comprend que Karura est toujours vivante dans le sable de Gaara, et annonce au jeune homme que sa mère l’aimait et le protège depuis sa naissance. Faisant son mea culpa à propos de tout ce qu’il a fait subir à son fils, il lui confie le village de Suna avant de se faire sceller, lui disant qu’il l’a surpassé depuis longtemps.

L’unité fūton de Temari ne parvient pas à faire le moindre mal au 3e Raikage. Dodaï leur explique de quelle manière il est mort et l’étendue de ses capacités. Naruto arrive et parvient à frapper le Raikage de plein fouet avec un « Orbe Shuriken », mais ce dernier n’est pas blessé et attaque à son tour les ninjas de l’alliance, brisant les défenses avec sa « Lame de l’enfer ». Battant en retraite avec Naruto, Dodaï lui explique que le Raikage possède l’armure ultime et l’attaque ultime et pouvait affronter un démon à queues seul à main nues. Naruto remarque une cicatrice sur le torse du Raikage et demande comment il a été blessé, mais de son vivant, l’ancien chef de Kumo n’a jamais révélé à personne de quelle manière cet accident, survenu au cours d’un combat contre Hachibi, a eu lieu. Naruto tente alors de créer une « Orbe du démon », mais échoue ; Dodaï envoie le Raikage attaquer un leurre, et utilise ses compétences de ninja transmetteur pour mettre Naruto en contact avec Killer Bee. Hachibi explique à Naruto que le Raikage a été blessé quand ils sont tombés tous deux avec leurs techniques activées ; Naruto comprend alors que le Raikage s’est blessé avec sa propre attaque, seule capable de surpasser son armure. Lorsque ce dernier revient à l’attaque, Naruto utilise le Senjutsu pour esquiver son attaque et envoyer un « Orbe tourbillonnant » sur son bras, le rabattant sur la poitrine de son adversaire qui se transperce et peut être scellé. Dodaï en conclut qu’il est contradictoire d’avoir à la fois l’armure ultime et l’attaque ultime, et que l’armure du Raikage était plus faible que son attaque ; Pour Naruto, l’armure ultime est celle de Gaara.

Naruto et Killer Bee sont face à 6 anciens hôtes qui ont été équipés avec une pupille Rinnegan chacun. Fort de son expérience après avoir combattu Pain, Naruto trouve un plan pour stopper les Jinchuriki.

Petit à petit les forces Alliées Shinobi gagnent du terrain, cepedant de nombreux ninjas doute encore de la défaite de Madara Uchiha. Shikaku et Inoichi cherchent à instaurer et maintenir la cohésion de leur grande armée !

Retour sur la création de Konoha, né de l’alliance entre les clans Senju et Uchiwa.

Le retour de Sasuke semble avoir galvanisé les shinobis de Konoha. Les anciens Aspirants rivalisent de talent pour repousser les créatures engendrées par Jûbi !

Obito est devenu le Réceptacle de Jûbi et déploie une puissance inouïe. Mais sa conscience semble sur le point de sombrer..

Les candidats sont enfin parvenus à Suna. La veille de l’épreuve, la tension est extrême dans la salle où doivent manger les équipes. Quelles horreurs se tapissent donc dans le Désert du Mal ?

À la recherche d’un rouleau du Ciel, Kiba, Hinata et Shino vont tomber dans le piège d’un trio de shinobis aussi méprisables que redoutables. Une course poursuite s’engage alors entre ces candidats aux styles totalement opposés. L’esprit de corps de Konoha triomphera-t-il ?

Munis des rouleaux et presque qualifiés pour la 3e épreuve, Sakura, Ino et Chôji sont attaqués par une sinistre Marionnettiste et ses sbires... Son maléfice est des plus déroutants.

Pour tirer Gaara des griffes des conjurés, Neji décide de se ruer à sa rescousse sur-le-champ, quitte à mettre en péril la qualification de son équipe à l'examen...

Madara semble invincible. L'espoir s'éteint dans les rangs de la coalition quand Gaï se décide à jouer son va-tout en levant tous les Verrous Psychiques...

Naruto revient au village après une longue absence et Konoha-Maru, qui s'est décrété depuis toujours son rival, le supplie de lui enseigner une nouvelle technique. Mais le héros de Konoha n'étant pas le meilleur des pédagogues, le jeune Sarutobi va s'attacher à faire sien l'Orbe tourbillonnant avec de bien curieuses méthodes...