암부로 자리를 옮긴 카카시는 냉혈의 위명을 떨치며 더울 철저히 임무에 몰두한다. 그 모습을 보고 걱정이 든 미나토는 카카시에게 임신한 쿠시나 경호를 맡기는데… 그렇게 아무 일 없이 열 달이 차가던 어느 날, 갑자기 나뭇잎 마을에 변고가 터지고 만다.

카카시는 담당 상급 닌자가 되어 하급 닌자들을 교육하게 된다. 하지만 담당하게 된 하급 닌자들마다 낙제점을 주어 아카데미로 쫓아보내는데... 카키시의 마음을 뒤덮은 어둠이 걷히려면 아직 더 시간이 필요해 보였다.

하시라마는 닌자들을 이끌고 신수를 파괴하려 하지만 상황은 결코 쉽지 않았다. 하지만 5카게들이 전장에 당도하면서 닌자연합군은 한층 힘을 받게 되는데... 오비토는 나루토를 향해서 왜 이토록 필사적으로 싸우는냐고 재차 캐묻는다.

마다라는 결국 미수들을 모조리 빼앗는데 성공한다. 그렇게 쿠라마를 빼앗긴 나루토는 죽음에 직면하고… 빈틈을 노리던 토비라마와 사스케마저 마다라에게 완패하고 만다.