在重建木叶忍者村时，鸣人与小樱遇到了昔日熟悉的人物，他们就是波之国的木工——达兹纳与伊那利，他们祖孙俩是过来协助木叶忍者村的重建工作。欢喜相会的鸣人等人，因此回想起在波之国执行完任务后的某一起事件……

杀人蜂顺理成章地成了鸣人的师父，鸣人与杀人蜂、大和一起来到位于真实瀑布里面的遗迹，并在据说整个空间可以与尾兽对话的系统的领域内，与封印在自己体内的九尾对峙。鸣人开启了自来也所托付的封印之钥，为了能够控制九尾的力量，就必须全力奋战。鸣人与被解放的九尾之战，就此展开……。

由勘九郎担任队长率领祭与重等人的奇袭部队，从上空侵入了敌军的领地内。晓利用他们操控着联军的忍者，还利用秽土转生并刻意安排起起回生的死人与生身有关的人交手。随着双方奇袭的部队展开冲突，战争的导火线也随之引爆……。

经过一番缠斗，懒终于成功地封印了银角，没想到被激怒的金角，竟变身成简直就是已九尾化的祭品之力！雷影提出利用对方的宝具，将金角封印的作战策略，四角此时灵光乍现，想到了一个策略，并将指令传送给能合作猪鹿蝶阵型的那三个人……。

黑土前来与成为俘虏的地达罗进行交涉，意外得知昔日交手过的佐助还活着的事实。受到打击的地达罗，在假扮成武士的白绝的协助下，从傀儡中脱困而出。地达罗为了完成超极致的艺术只能全力脱逃，就在此时，有个意外的人物出现在地达罗的面前……。

卡卡西小组接受指派执行某起任务。就是前往位于邻近火之国边境的神圣之地——托尼卡村，处理村子里发生的灭村事件。目的就是找出真凶，给与应有的制裁。

鸣人被九尾复制体打败后，便与德克被关在祭坛内。兜一行人的目的就是古代遗产“旋律”，与作为钥匙之用的“音”。当所有的“音”都凑齐时，传承自“霍尔”的强大“力量”就会出现。

我爱罗与大轩攻破了第二代水影的海市蜃楼。但是，本来站在协助立场的第二代水影，竟开始乐在战斗了，甚至还发动了更强的忍术攻击，无限爆破忍术·蒸危暴威！可以重覆引发大范围的水蒸气爆炸，此一绝招让我爱罗他们陷入了苦战！