Guy, Kurenai y Asuma se dirigen al cuartel con el fin de entregarle un pergamino especial a Gaara pero no les es permitido dárselo personalmente, en ese momento la tormenta de arena los alcanza lo que obliga a los ninjas de Konoha a refugiarse, Kanguro y Temari siguen en su labor de ayudar a los participantes en peligro. Gaara quien también está ayudando se topa con Hōichi el causante de la tormenta, al notar que Gaara es un Jinchūriki este realiza una técnica de sellado donde una cadena que sale del pecho de Hōichi atrapa a Gaara y empieza a extraer al Shukaku, pero el Bijū al verse en problemas lanza una señal de ayuda a Fū quien rápidamente se percata y sale en su ayuda, tras llegar a donde se encuentra Gaara, Fū también es atrapada por la técnica de sellado.

Obito le pide a Sakura destruir el Rinnegan izquierdo de Madara antes de que este lo recupere, puesto que si obtiene ambos ojos el poder de Madara se incrementara y nadie podrá detenerlo, Sakura la cual esta nerviosa apunta su kunai frente al Rinnegan y cuando está a punto de destruirlo Madara aparece e impide que lo destruya lanzando la estaca pero Obito logra regresarla a tiempo a donde están Naruto y los demás, cuando Sakura regresa rápidamente atiende a Kakashi tras perder su Sharingan, pero Naruto logra darle un ojo nuevo con sus poderes. Kakashi al ver a su equipo reunido nuevamente recuerda las metas de cada uno. En la otra dimensión Madara que tiene inmovilizado a Obito le revela que él fue quien manipulo a los shinobis de Kirigakure, y posteriormente la muerte de Rin, todo fue planeado con el fin de llevar a Obito a la oscuridad, y continuar con el legado de Madara quien además alega que Obito hizo exactamente lo que el quería y que ahora solo le falta recuperar el ojo izquierdo. Poco después Madara vuelve de la otra dimensión junto con Obito y Zetsu, Madara ahora cuenta con ambos Rinnegan y lo que es peor cuatro sombras que lo rodean, Sakura que decide ponerse a la cabeza ataca a Madara sin éxito rápidamente es salvada por Naruto y Sasuke, en ese momento Madara decide no perder más tiempo y ejecutar de una vez por todas el Mugen Tsukuyomi, para ello se eleva lo más alto posible y ejecuta el Chibaku Tensei como distracción para Naruto y Sasuke, rápidamente Sasuke usa el Susanō para destruir la mayor cantidad de meteoritos posibles al igual que Naruto, sin embargo parece ser tarde pues Madara abre un tercer ojo en su frente que se refleja en la luna anunciando que el Mugen Tsukuyomi ha comenzado.

Itachi acompaña a Shisui como compañero de ejercicio, por lo que van por un pergamino con las instrucciones de esta, el primer ejercicio es ubicar a cierto objetivo rastreando sus pasos. A pesar de que Itachi tiende a encontrar pistas, Shisui termina dándole lecciones en cada detalle. Al llegar a un río y luego de pasarse la puesta de sol, Shisui da inicio al segundo ejercicio el cual es acampar. Mientras comen, Itachi le revela a Shisui que ha despertado el Sharingan, pero son interrumpidos por los choques de unos Kunais, por lo que Shisui da inicio al tercer ejercicio. Shisui observa que un ANBU es atacado por desconocidos, al intentar socorrerlo nota que los tres atacantes son de Raíz, quienes acusan al ANBU de traicionar a la aldea. Shisui les pide pruebas de dicha traición, pero se niegan y deciden matarlos a todos. Itachi logra derrotar a una de Raíz con su Sharingan de dos aspas, mientras que Shisui derrota a los otros dos. Al verse derrotados, huyen del lugar sin antes amenazarlos. Al lugar llegan más ANBUs quienes se hacen cargo del ANBU herido, mientras que Shisui carga en su espalda a Itachi al lesionarse en batalla. Años después, Itachi se úne a ANBU.