Os irmãos Elric participam numa caça ao homem em perseguição do perigoso Isaac, um antigo alquimista do estado, apostado em derrubar o King Bradley.

Numa disputa com Greed, King Bradley prova ser um adversário brutal. Mas o homem que destrói o Ultimate Shield é mais poderoso até do que o Bradley.

Mustang, Alphonse, Havoc e Hawkeye dividem-se para investigar um laboratório militar. Se Lust levar a dela avante, nenhum deles sobrevirá.

Há muito tempo, o sangue de um simples escravo foi usado numa experiência que criou um estranho ser disforme.

Um rumor acerca de um alegado golpe de estado ajuda os rebeldes, enquanto May alicia Envy para uma armadilha que leva a um confronto com Mustang.

Edward desvenda o plano de Envy para semear a discórdia dentro do grupo. O rumo da batalha entre os Armstrong e Sloth começa finalmente a mudar.

A situação fica cada vez pior quando Edward, Alphonse, Hohenheim, Izumi e Mustang aguardam o seu destino final no covil do Pai.

O Pai executa o seu plano, absorvendo todas as almas em Amestris, permitindo-lhe assim abrir os portões do céu e o Olho de Deus.

Os irmãos Elric regressam a Resembool para enfrentar um novo futuro. Edward e Winry finalmente exprimem o que realmente sentem um pelo outro.