Numa disputa com Greed, King Bradley prova ser um adversário brutal. Mas o homem que destrói o Ultimate Shield é mais poderoso até do que o Bradley.

Verdades alarmantes são reveladas quando Al encontra aquele a quem chamam de Pai, e Ed quebra novamente a regra mais importante da alquimia.

Os irmãos Elric enfrentam o Pai. Ed e Al assistem, impotentes, enquanto o Pai cria um novo homúnculo com a alquimia, algo que deveria ser impossível de fazer.

O rapto de Winry por Scar é revelado, mas ainda não há um plano de resgate. Uma tempestade brutal aproxima-se e apenas Alphonse Elric conseguirá sobreviver a ela.

Há muito tempo, o sangue de um simples escravo foi usado numa experiência que criou um estranho ser disforme.

Os esforços de May e Marcoh para descodificar a investigação do irmão de Scar dão resultados, mas pode ser tarde demais para impedir a catástrofe.

O plano dos conspiradores para assumir o controlo de uma nação é revelado. O caos instala-se após um assassino pôr termo à vida de um importante líder.

Após investigar as distorcidas raízes da árvore genealógica da família Bradley, Mustang reúne as suas tropas mais leais.

Edward desvenda o plano de Envy para semear a discórdia dentro do grupo. O rumo da batalha entre os Armstrong e Sloth começa finalmente a mudar.

Quando uma batalha termina, outra começa. Assim que alcançam a vitória, Hohenheim e o Pai lutam pela posse da Pedra Filosofal.

O Pai elabora um plano de fuga enquanto Bradley enfrenta poderosos adversários no seu ataque ao Quartel General do Comando Central.

Ling chama para si todo o poder de Greed para destruir o inimigo que se aproxima. O grupo de Edward encontra Hohenheim e é apanhado numa armadilha.

A situação fica cada vez pior quando Edward, Alphonse, Hohenheim, Izumi e Mustang aguardam o seu destino final no covil do Pai.

O Pai executa o seu plano, absorvendo todas as almas em Amestris, permitindo-lhe assim abrir os portões do céu e o Olho de Deus.

Um eclipse traz esperança às almas de Amestris, enquanto Hohenheim revela o seu grande plano. Edward enfrenta Pride pela última vez.

Edward, Armstrong e Izumi encontram uma forma de sabotar os demolidores ataques do Pai. Alphonse faz um sacrifício para ajudar Edward.

Após um confronto final com o Pai, Edward retribui o sacrifício de Alphonse com outro. Hohenheim está finalmente em paz.