האחים אלריק מתקוטטים עם לינג יאו ועם בני לווייתו לאן פאן ופוּ, שבאו משינג כדי לחפש את אבן החכמים.

שיתוף פעולה בין הכוחות המורדים של מוסטאנג לחבורתו של לינג יאו מוביל ללכידת הומונקולוס, אבל גם מושך את תשומת ליבו של מרגל הומונקולוס.

אד ולינג מוצאים את עצמם בבטן של גלאטוני, ונתקלים באויב מרושע. בסנטרל, מוסטאנג נאלץ להתבונן מהצד כשבראדלי מפלג את הצבא שלו.

האמת המטרידה נחשפת לאחר שאל מוצא את מי שמכונה "אבא", ואד שוב מפר את הטאבו הגדול ביותר של האלכימיה.

האחים אלריק פוגשים את "אבא" ונדהמים לראות כיצד הוא יוצר הומונקולוס חדש באמצעות אלכימיה שאמורה להיות בלתי אפשרית.

טעות אחת קטנה של האחים, ויקיריהם יראו את נחת זרועו של בראדלי. מלבד זאת, ייתכן שאין צורך באבן החכמים.

אדוארד שומע את הסיפור של הוקאיי על תקופה שבה חיילים נשלחו לבצע רצח עם. בד בבד, הזוועות משדה הקרב באישבל נחשפים.

מוסטאנג מצליח למצוא בעלי ברית גם אחרי שאיבד את אנשיו, אלא שגם אויביו אינם לבדם. ההומונקולים משחררים את אחד הרוצחים המסוכנים ביותר ממלחמת אישבל.

מפגש סודי מאפשר למוסטאנג להצית שאיפות חדשות במכר ותיק – בעל ברית שיש לו חיילים. אד ואל פוגשים את המעריץ הגדול ביותר שלהם.

קימבלי סוגר על סקאר. אזור הגבול הצפוני הופך לשדה קרב. תנאים קשים עומדים בדרכם של אד ואל אל מבצר בריגס.

אד חושף קנוניה בסדר גודל אדיר: מזימה שכבר גבתה קורבנות רבים מספור. נראה שצפויה שפיכות דמים גם במבצר בריגס.

רייבן מנסה לדרדר את ארמסטרונג. בינתיים, אד ואל נאלצים להמתין בתאם. לפני שנים רבות, אביהם התמודד עם שבי, וכדי להימלט מהכאב, הוא נפרד לשלום.

צמד כימרות מאיים על סקאר, והאחים אלריק נחלצים במפתיע לעזרתו. בהמשך, הניסיון של וינרי להתעמת עם סקאר מסתיים באסון.

חטיפתה של וינרי בידי סקאר נחשפת, וצריך לגבש תוכנית חילוץ. סופה קשה מתקרבת – סופה שרק אלפונס אלריק יכול לה.

האחים אלריק, שהקשר ביניהם עמוק יותר מקשר דם, חלקו זה עם זה רגעים של שמחה וגם של כאב. עכשיו, נראה שהחיבור המיסטי בין נשמותיהם עלול להיות קטלני.

מיי ומרקו משיגים התקדמות במאמציהם לפענח את המחקר של אחיו של סקאר, אבל ייתכן שכבר מאוחר מכדי למנוע אסון.

בצפון המושלג, החיילים במבצר בריגס נלחמים מול צבא פולשים, ומרקו עומד בראש מתקפה נגד אויב מפלצתי.

אזהרות שקטות נשמעות מכל עבר: היום המובטח קרב ובא.

במתקפה על הביצורים של סנטרל, מוסטאנג מוביל כוח שמורכב מכל מיני חיילים מהצפון, כולל כמה פנים אהובות מהעבר.

הצוות של אד ניצב מול עדר של בובות רעבתניות – יצורים מתועבים שמקושרים לנשמות של בני אדם.

אבן החכמים נמצאת בידיו של אלפונס, והוא מתעמת ללא חת עם פרייד ועם קימבלי.

השמועה על ההפיכה מסייעת למורדים. מיי מפתה את אנבי לתוך מלכודת שמובילה לעימות חזיתי עם מוסטאנג.

אדוארד, אלפונס, הוהנהיים, איזומי ומוסטאנג ממתינים שגורלם יוכרע במאורה של אבא, והעתיד נראה עגום.

אבא מממש את תוכניתו ובולע את כל הנשמות באמסטריס. כעת הוא יכול לעבור דרך שער גן העדן ולהגיע לעין האלוהים.

ליקוי חמה נותן מעט תקווה לנשמותיהם של אנשי אמסטריס. הוהנהיים חושף את תוכניותיו, ואדוארד נלחם בפרייד בפעם האחרונה.

אדוארד, ארמסטרונג ואיזומי מוצאים דרך לעמוד בפני המתקפות האכזריות של אבא. אלפונס מקריב מעצמו כדי לעזור לאדוארד.

בעקבות העימות הסופי עם אבא, אדוארד גומל לאלפונס הקרובן שהקריב בהקרבה משלו. הוהנהיים מוצא סוף־סוף מנוחה לנפשו.

בפרק האחרון, האחים אלריק חוזרים לריסמבול, שבה מחכה להם עתיד חדש. וינרי ואדוארד מגלים זה לזה את רגשותיהם.