刚考上大学的笹原完士，决定要加入能将自己对於「漫画动画游戏」之热爱与大家一起分享的社团。原本只是因为好奇而来参观现视研的社团教室，最後却在斑目的算计下，彻底瓦解了他那份没有根据的自尊。即使如此，笹原仍不肯承认自己是OTAKU，因而迟迟无法与现视研的其他成员打成一片。这天，笹原随著其他成员来到了有著偶像般俊俏长相，骨子里却是个不折不扣的OTAKU的高坂家里玩……

现视研成员带著笹原来到秋叶原，顺便为他举办迎新会。笹原在店家看到他从未接触过的18禁电脑游戏，不禁兴奋了起来；至於斑目与其他人则是在店里找著自己想要的同人杂志。透过与其他人的交流，让笹原也渐渐地融入了现视研的生活。　　另一方面，小咲为了得到高坂的心，於是找高坂一起去原宿约会。小咲原本打算利用这次机会，慢慢地并且确实地展开追求攻势，没想到却还是不敌高坂的OTAKU精神……

在一场暴风雨即将来临的预感中，现视研成员前往漫画节会场。斑目在还没进场前就情绪高涨到极点，一个人离开排队的队伍四处游荡，最後却因为不小心滑倒而伤到了右手。强忍著剧烈疼痛在会场内寻找目标的斑目、第一次参加漫画节而兴奋不已的笹原、在Cosplay会场拼命拍照的田中、特地坐电车到会场找高坂，却因为车站人潮拥挤而放弃走出车站直接坐车回家的小咲；当现视研成员以各自的方式享受著这一天的漫画节时，斑目终於忍受不了手腕的疼痛而……

在秋天的校庆即将到来前夕，从外国归来的日侨子女「大野」出现在现视研的社团办公室，此时其他成员刚好正试图说服小咲在校庆穿上Cosplay服装，小咲则以这不是平常人会做的事为由而拒绝。小咲本来以为大野也会赞同她的想法，没想到一问之下才发现原来大野早已有过Cosplay的经验，甚至还对田中个人制作的服装感到兴趣。为了揭发这个女OTAKU的真面目，小咲於是以要帮忙量尺寸为理由，硬是要大野带小咲跟田中去她的住处……

社团自治委员会决定在12月底解散已经没有实际进行活动的社团，现视研也名列其中。这个消息本来就已经让现视研的成员们够沮丧的了，没想到原口却又在此时出现。小咲原本只是对自治会的强硬态度、原口讨人厌的说话语气感到厌恶，然而当她看到现视研成员只会坐以待毙的蠢样之後更是觉得气愤，为了让现视研得以继续存在，因此便与大野一起（？）展开了行动……

不打电玩也不看动画的小咲，开始察觉到自己与高坂之间的距离，即便是两人独处，高坂还是会自顾自地看起他的动画。小咲原本是佯称要帮朋友而来找现视研的成员商量，最後却连自己也开始玩起了电玩；这时候，笹原的那个一般辣妹（？）的妹妹突然打电话来找他，由於现视研的成员们对「妹妹」这个字眼向来很感兴趣，於是就偷偷跟著笹原前去赴约……

笹原加入现视研已经过了一年，由於初代会长决定要专心准备毕业论文，因此他推荐斑目担任第二任会长，而斑目也欣然接受。　　斑目就任新会长之後，派出向来积极争取每一个Cosplay机会的大野，让她穿著Cosplay服装站在第一线争取新生入社，没想到竟然真的招来了两个新同学。然而，等待著这两个新同学的却是小咲的无情洗礼……

春天是最适合制作模型的季节，因此田中决定教导身为模型初学者的笹原与大野如何玩模型；只要一提到模型的事，田中可就有说不完的话。当小咲看到田中、大野、笹原等人很开心的在一旁玩著模型时，虽然并不想加入他们，却还是感到一股莫名的疏离感。到了最後，小咲居然把大野辛苦完成的模型……

最近斑目迷上了「在社团教室的桌上摆满H GAME杂志」这件事，这一天他也买了大量的杂志并带到社团教室，没想到当他打开门时却看到教室内只有小咲一人。　　仔细想想，虽然小咲已经来了一年，但斑目却从未像这样跟小咲在教室独处…，一想到这点，更让斑目显得坐立不安。此时，斑目在小咲的脸上找到了一项重大的发现……

夏天到了，现视研的成员来到海边戏水！虽然难得来到海边，但斑目等几个人却以「晒太黑会不好意思去参加漫画节」或是「为了保留体力」之类莫名其妙的理由，一直不肯下水，而笹原的妹妹此刻也为了高坂而擅自跟来了海边…。　　海边戏水结束後，对现视研来说，夏天最大的活动「漫画节」也将接著到来。

高_的房间到处都是OTAKU的相关商品，导致小?蝔姜纁氻ㄓp心被绊倒，头狠狠地撞到地板上的游戏机，心情也变得很不好。後来小?蝳b社团办公室又再度撞到相同的地方，这下让她决定要彻底打扫社团教室。正当她将过去的珍贵（？）同人志彻底清理了一番，并舒服地抽著烟时，不料却因此引发了一场火灾……。　　为了负起责任，小?蝟Q迫在学园祭穿上COSPLAY的服装。

由于上次的那场火灾，现视研被校方处以禁止使用社团教室的惩罚。虽然大家轮流提供各自的住处作为聚会场所，但气氛却越来越凝重，某日更是由於斑目的一句话而让小咲出来。　　小咲也对这件事感到过意不去，而且到现在她看到火还是会害怕。现视研被命令参加志工活动以为惩戒，然而志工活动的日期却跟冬天的漫画节刚好撞上……。 (END)

Two new members join the society: the abrasive Manabu Kuchiki and the standoffish Chika Ogiue. Ohno hatches a plan to trick Ogiue into revealing her true inner self.

At Kasukabe's urging, Madarame sets out in search of a less otaku-ish outfit. Later, a heart-to-heart over sushi reveals that they might not be from completely different worlds after all. Unfortunately, this only confuses him more.

The school festival approaches, and Ohno is committed to another cosplay photo shoot. But tension brews as Ogiue scoffs at the idea of cosplay, and Ohno finds Tanaka's secret stash of costumes for the other Genshiken girls. Caught in the middle with the photo shoot only minutes away, Kasukabe hatches a scheme to smooth things over, and even get Ogiue to try something she's never done before.

6月，笹原收到COMIFES参展的入选通知。当笹原和斑目在社团教室讨论这件事时，凑巧看到荻上在笔记本中画的图，于是提议也让她参加同人志。由於是第一次以社团身分参加，为此感到困惑的笹原决定去找漫研的高柳商量。没想到不知道是从哪里得知消息，那个绰号“黑心原”的原口突然出现在大家面前……

收到COMIFES入选通知后已经过了1个月，眼看印刷厂的截稿期限就在三天后，但已经完成的原稿却只有荻上画的两页，因此临时在社团教室举办了“COMIFES紧急对策会议”。没想到笹原跟久我山却在会议中吵了起来，让会议迟迟无法进展。此时荻上鼓起勇气，向大家表示自己愿意接下画漫画的工作……

在现视研成员各自的努力下总算完成了同人志，顺利迎接COMIFES的到来。第一次以社团身分入场的笹原、高坂、朽木三人，看到空荡荡的会场后深受感动。当他们完成摊位布置后，黑心原出现在他们面前，并留下对笹原而言宛如诅咒般的“希望你们能卖完呢”这句话后就走了。他们是否能卖完所有的同人志呢？

笹原与斑目在社团教室里聊著大野与田中的关系，荻上认为他们两人并没有在交往。咲、高坂与朽木也陆续加入这个话题，没想到此时当事者的大野与田中居然凑巧来到社团教室。白目的朽木突然问了他们两人「你们有一腿吗？」，朽木接下来又做出一连串的白目发言，最后终于惹恼了大野而被她揍了一顿！看到田中迟迟不肯表态，大野究竟会……

当斑目跟笹原在社团教室嬉闹时，荻上也很凑巧地走了进来。此时荻上完全进入腐女模式，脑里居然开始想着“斑目学长一定是0号”，进入了她自己的妄想世界。当荻上在画册画出“强势1号”风格的笹原时，却不小心被咲看到了。但是，咲似乎完全误会了荻上，并露出满面的笑容……

现视研的成员们正在讨论著COMIFES的行程，大野也故意问了荻上“你第一天会去吗？”。虽然大野只是想捉弄一下荻上，但当事者的荻上却毅然决然地回答“我绝对不会去！”。COMIFES当天，荻上将发型与服装打扮成高中时代的自己，甚至还戴起了厚眼镜，彻底假扮成一副“从乡下来的宅女”，出现在台场……

斑目、田中、久我山三人即将参加毕业典礼。久我山已经找到医疗器材公司的工作，田中则继续念服装设计的专门学校，只有斑目一个人还不知道毕业之后要做什么。毕业典礼当天，现视研的成员们依旧兴高采烈地谈着“不签”的话题。当原被斑目问到下一任会长人选时，原表示他希望请大野接任。至于最让人担心的斑目本身的出路则是……

不知道为什么，荻上现在才开始觉得在COMIFES卖“YAOI本”是件很丢脸的事。大野告诉荻上虽然同人志跟角色扮演属于不同领域，但最深层的那种羞耻心却是一样的，她希望荻上能将自己的难为情幻想说出来跟她分享。大野接任会长后，展开了招揽新社员的活动。新生们虽然对角色扮演的服装感到兴趣，但最后却都被朽木的个性给吓跑了。此时，有个男子正以诡异的眼神看著他们的摊位……

季节进入了初夏，笹原、小咲、高坂等人也到了必须开始决定毕业後出路的时期。小咲为了准备自己的店，这阵子忙到没时间跟高坂见面。或闭O因为疲惫，小咲开始怀疑“高坂是否只要有成人游戏能玩就行了，根本不需要自己？”，并为此感到不安…。笹原本来想到出版社工作，但面试时却都不顺利。让他陷入苦战的原因是……

为了讨论COMIFES的事，大野与笹原来到了荻上的家。大野虽然使出各种手段想看到荻上画的同人志原稿，但仍遭到荻上的顽强抵抗。某天，当斑目独自一人在现视研的社办吃午饭时，大野在美国认识的安琪拉与蘇这两个朋友突然来访。他们说这次来日本的目的是为了参加COMIFES，现视研的成员们也被这两人搞得团团转……

COMIFES当天，荻上与笹原两人负责顾摊。可能是过于意识彼此的存在，两人的互动感觉怪怪的。但是当第一本书卖出去之後，除了荻上感到很开心之外，笹原也开心得好像是自己的书卖出去了一样。荻上看到这样的笹原之后，紧张感才渐渐消解。但是，当荻上国中时代的同学偶然地经过摊位时，荻上的模样却又顿时改变。就在此时，蘇凑巧地出现……

夏天结束了，但笹原还是没有找到工作。接连不断的挫败，让他自己甚至忘了当初为什么会想到出版社当编辑。他也因此变得有点自暴自弃，甚至在社办说出“乾脆等一年后再来找好了”。咲与荻上看到笹原这个模样，毫不留情地对他说“对你真失望”。开始逃避的笹原，是否会听进去两人的这句话？还是说……

收录在《现视研》第二季的DVD当中。男主角笹原第一次玩的工口游戏《拉面天使プリティメンマ》继《不平衡抽签》之后剧中剧再次实体化。

With Ogiue as new president and several of the original members already graduated, four new members join the society: Ohno's friend Susanna, the loud Rika Yoshitake, the grumpy Mirei Yajima and the mysterious Hato Kenjirou. The new members join the club attracted by Ogiue's yaoi drawings. She welcomes the new members but fears the club will become a "rotten girl" (fujoshi) haven for yaoi fans and that is getting a bit too far removed from its original purpose.

Hato has a difficult time with Yajima and Yoshitake's obsession over his crossdressing. Keiko Sasahara, Kanji's kogal sister, appears in the club's room while Madarame is in there thinking about Saki Kasukabe. Ogiue recruits Genshiken members as employees to help in her manga artist work.

After Madarame lends a thankful Hato his place to change into girl's clothes, both start to become good friends. The group continues their work helping Ogiue finish the club's doujinshi for the Summer Comifes.

Angela returns to Japan to visit the Summer Comifes and do some cosplay with Ohno like she does every year. Two girls from Ogiue's past make an unexpected visit to the club's booth, much to Susanna's chagrin.

In the final day of the Summer Comifes, Angela's sudden and vocal interest in Madarame make him and the rest of the Genshiken have an utterly embarrassing moment. However, Hato's timely confession to the group may be even more shocking than that.

The group has to deal with the aftermath of Hato's confession and its embarrassing (but hilarious) effects on Madarame, Kuchiki and the rest of the Genshiken. A relative of Yoshitake visits the club's room to know more about the University and the otaku society.

Ogiue plans to make a romance manga story for the club's magazine that is going to be published at the Campus Festival, so she asks the members of Genshiken about their past relationships during High School for inspiration. Hato reveals the full extent of his artistic skills and the strange condition that limits them.

Hato talks with Madarame at his apartment to apologize for his actions during the last Comifes. The members of the otaku society struggle to complete their manga stories for the club's magazine.

The Genshiken members successfully participate in the Campus Festival activities, but several different persons from Hato's High School days make an unexpected appearance at the University.

二代目收录的特别短片

Hato comes to terms with his past and finally reveals the true reasons for his crossdressing. Saki Kasukabe arrives at the Campus Festival just in time to discover Madarame and Susanna in a compromising position.

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In the epilogue of Hato's revelation another situation ensues. Madarame and Saki are tricked to be reunited alone in the club's room by Sasahara and a dubious Hato.

After a long and emotional struggle Madarame finally has confessed his feelings to Saki (sort of). Both new and old members of the Genshiken support their fellow otaku friend in the only way they know. Ohno's angst about her future with Tanaka and life after graduation make her cosplay to an extreme.

The Genshiken club members travel together to a spa resort. By using her own personal experiences as an example, president Ogiue gives a troubled Hato some important lessons about love, friendship and mutual understanding.

二代目收录的特别短片

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Some time before the events of the Genshiken Second Season TV series Susanna Hopkins and Angela Burton visit Japan during New Year's Eve. Sue stays over at Ogiue Chika’s apartment while planning to study at the same University. The original members of the Genshiken organize a New Year’s shrine visit with their American guests.