Vor dem Hintergrund ständig wechselnder Loyalität, unruhiger Allianzen und alter Feindseligkeiten, verschärft sich der Konflikt zwischen der Republik und den Separatisten - dieser legt letztendlich den Grundstein für Darth Sidious' ultimativen Verrat an den Jedi. In diesen unsicheren Zeiten werden einige der tiefsten Geheimnisse der hellen und dunklen Seite der Macht aufgedeckt: Nicht nur, dass ein furchtloser Klon-Soldat eine schockierende Verschwörung aufdeckt, auch Anakin Skywalkers engste Beziehung kommt dadurch an ihre Grenzen. Und Meister Yoda macht eine Entdeckung, die das Gleichgewicht der Macht in der Galaxie für immer verändern kann...

銀河系陷入一片混亂，Ahsoka和Rex要在生存戰中競賽。

En la temporada final, titulada Las misiones perdidas, la fuerza combatirá desavenencias en su interior y se enfrentará a la amenaza creciente de los Sith y sus aprendices en la Galaxia, y la creación de la orden 66.

Οι Χαμένες Αποστολές

Az elveszett küldetések

In these eagerly anticipated episodes, some of the deepest mysteries of the conflict between the light and the dark sides of the Force are revealed. An intrepid clone trooper discovers a shocking secret carried by each and every soldier of the Republic. Anakin Skywalker's closest relationship is tested to its limits when a well-intentioned senator is manipulated by the masterminds of the war. A wicked enemy from the past uncovers an ancient weapon that could give her unrivaled power. And Master Yoda's investigation into the disappearance of a Jedi takes him deep inside the Force's mysteries, where what he discovers could forever change the balance of power in the galaxy.

La sesta stagione vede la Guerra dei Cloni giungere ormai a conclusione, mentre cominciano a nascere i sospetti di molti complotti all'interno del Senato. Nella prima puntata, il clone Tup è affetto da una misteriosa malattia mentale, provocando la morte scioccante di un Maestro Jedi. Verrà mandato su Kamino per fare ulteriori analisi, ma in seguito morirà dopo aver estratto dal suo cervello una specie di tumore. Il clone Fives scopre l'esistenza di una costruzione organica per scopi sconosciuti nascosta nel cervello di tutti i cloni, ma verrà ucciso senza riuscire a rivelare la sua scoperta. Nelle ultime puntate il saggio maestro Yoda, guidato dalla voce di Qui-Gon Jinn, cerca di comprendere come mantenere il proprio spirito dopo la morte attraverso numerose prove che metteranno alla prova il maestro Jedi.

ทหารโคลนทัปพ่ายแพ้ให้แก่อาการป่วยทางจิตปริศนา นำไปสู่การตายที่น่าตกใจของอาจารย์เจได