O estudante Kouichi Sakakibara se muda com para viver com seus avós em Yomiyama devido ao trabalho de seu pai, porém logo ao chegar à cidade acaba hospitalizado devido a um problema de pulmão. Finalmente, ao começar a frequentar a escola, na turma 3 da Escola Yomiyama do Norte, um mês após o ocorrido, uma garota com um tapa-olho chama a sua atenção. Esta era a Mei Misaki com quem ele havia se cruzado por coincidência no hospital. O clima de mistério ao redor dela intriga-o, mas embora os seus colegas lhe deem uma recepção agradável, ninguém parece disposto a conhecê-la.

Fascinado, o Kouichi conversa com a Mei toda vez que ele a vê, porém ela jamais lhe responde apropriadamente, ficando apenas por lhe dizer palavras que soam mais como avisos... "Você deveria ser mais cuidadoso."... Enquanto isto os colegas dele ficam perplexos com o comportamento do Kouchi. Mesmo assim, na ânsia por saber mais, ele segue a Mei após a escola e acaba se deparando com algumas coisas não muito agradáveis...

Quando o Kouichi se encontra com a Mei no estúdio das bonecas antigas, ela conta a ele a história da turma 3 de 9ª série envolvendo uma estudante há 26 anos, porém os colegas dele se calam quando ele pergunta por mais informações. Sua tia, Reiko, lhe diz que a sua mãe era uma das estudantes de 26 anos trás...

A credibilidade dos rumores da "maldição da turma 3" se eleva com a morte acidental e repentina de uma estudante e o Kouchi não consegue evitar o pensamento de que a Mei está de alguma forma ligada aos acontecimentos de 26 anos atrás. Ela, por outro lado, apesar de notar o novo clima na sala, continua a abster os detalhes do que está acontecendo. Neste meio tempo a turma 3 parece aterrorizada com alguma coisa, colocando a monitora de medidas preventivas, a Akazawa, numa situação difícil...

Após o acidente trágico da Mizuno, a tensão em sala de aula acaba escalando, sendo que a Akazawa acaba sendo escolhida como a nova monitora da turma sem o conhecimento do Kouichi. Ele sabe que os seus colegas vêm discutindo algo pelas suas costas, mas todos se recusam a lhe dizer o porquê. Para a sua sorte, o Takabayashi discorda do restante da turma e acaba se oferecendo para responder as perguntas do Kouichi, porém aí...

Todas as "turmas 3" vieram fazendo uso de uma simpatia por 26 anos na tentativa de deter a "calamidade". Desde que o Kouichi entrou na turma, este era o motivo por trás de tudo que lhe parecia estranho. Finalmente, então, ele aceita as circunstâncias da simpatia, embora ele não veja lógica alguma por de trás dela, passando assim a ficar mais tempo com a Mei. Até que então ele começa a desvendar coisas interessantes da escola Yomi do Norte na sua biblioteca...

Com o sangrento desfecho na sala da turma 3, os estudantes finalmente percebem que a calamidade ainda não cessara. A tal "simpatia" é deixada de lado e os estudantes começam a imaginar quem dentre eles seria o morto. Enquanto isto, o Kouichi descobre que, há 15 anos, a calamidade começara, porém acabou parando no meio do ano. O bibliotecário Chibiki conta a ele que a turma 3 tinha visitado o Santuário de Yomiyama numa viagem da turma durante as férias daquele ano...

O Kouichi e seus colegas saem no carro da Reiko para encontrar o ex-colega dela chamado Matsunaga. Num hotel resorte onde trabalha, este homem tem em mãos uma pista de como deter a calamidade. Enquanto passam o dia na praia a sua espera, acabam encontrando a Mei que estava num lugar próximo passando as férias com a família. Lá, todos aproveitam a liberdade longe daquela ansiedade que os agourava em Yomiyama até que...

A agonia na turma 3 aumenta desde o inesperado acidente que ocorrera mesmo fora de Yomiyama. Após ouvir o murmuro do Matsunaga "...na sala de aula" momentos após o acidente, o Kouichi decide procurar na sala antiga da turma 3 por alguma pista. Ele pede a ajuda do Teshigawara e do Mochizuki, na tentativa de evitar mais envolvidos, porém a Mei acaba se juntando a eles na busca e assim começam uma investigação...

Finalmente, o Kouichi e seus amigos encontram a fita que o Matsunaga havia deixado no edifício antigo, porém a tensão continua crescendo. Então a turma 3, liderada pela Prof. Mikami e o Chibiki, sai numa viagem de turma, onde o Kouichi, a Mei e o Teshigawara se encontram no quarto do Mochizuki para escutar a fita do Matsunaga. É aí onde eles aprendem como deter a calamidade...

A fita do Matsunaga finalmente revelara as medidas necessárias para deter a calamidade após já ter começado. É aí que o Kouichi, a Mei, o Teshigawara e o Mochizuki tentam pensar numa maneira para dar fim ao drama da turma 3, porém se a fita caísse nas mãos erradas...

O pânico se espalha e os estudantes desesperados buscam a "chave" para deter a calamidade da turma 3 de uma vez por todas. Será que o Kouichi e seus amigos poderão solucionar o caso antes que o número de mortes escale ainda mais?

Mei Misaki secretamente se encontra com sua irmã gêmea, Misaki Fujioka, e elas passam o dia juntos. Mal sabem elas que ambas as suas vidas estão prestes a mudar.