カズマの「シェルブリッド」VS 劉鳳の「絶影」。この邂逅が二人の少年を数奇な運命へと導いてゆく。日本国内に誕生した初めての独立自治領＝ロストグラウンド。そこには、「アルター」と呼ばれる特殊能力を使って、なんでも屋を請け負っている少年が住んでいた。その少年の名は、カズマ。

次第に判明してゆくロストグラウンドとホーリーの実体。さらに、少女・水守の知る劉鳳の過去とは!? ロストグラウンドに組織された「ホーリー」に、桐生水守という少女が赴任してきた。彼女は幼なじみの劉鳳と再会する。しかし、そこで彼女が見たのは変わり果てた旧友の姿だった。

今、ここに明かされる絶影の誕生秘話。そして、カズマと劉鳳の2度目の対決の行方は?! ホーリー本部に連行されたカズマ。そこで尋問を受け続けた彼は、劉鳳に再戦状を叩きつける。そのころ、君島はカズマ脱出のサポートのため行動を開始。だが、水守もカズマ救出に動き出していた……。

美人アルター使い、あやせ参戦。非道なアルター使い・立浪にカズマの拳が唸る!! 新たな依頼を引き受けることとなったカズマ。それは、ホーリー強制労働所の解放であった。カズマたちはアルター使いの女性・あやせに協力。だが、彼らの前に巨大な銃を持った男・立浪が立ちふさがる!!

再会するカズマと水守。新たなホーリーの刺客・橘あすかのアルター能力とは？ 病に倒れたかなみを助けるため、ホールドの医療車を強襲するカズマと君島。その場にいた水守によってかなみは救われるが、ホーリーの橘あすかがカズマに挑戦してきた。

激化するカズマVSホーリーの全面戦争!! そのさなか、劉鳳の絶影が真の姿を表す!! ついに本格化するホーリーのネイティブアルター狩り！ アルター使いを集結して逆襲を企てるカズマと君島！ だが、彼らの眼前に“真の力”を解放した劉鳳が立ちふさがる!!

カズマVSあすかの対決の行方は……。そして、彼らを襲う謎のアルターの正体とは？ 戦いの最中、暗黒の地下洞窟へと転落してしまうカズマとあすか。共に協力して出口を探す二人であったが、今度は彼らの前に正体不明の巨大アルターが襲いかかった!!

カズマがホーリーに体験入隊!? その裏で暗躍するアルター“マッドスプリクト”とは? なんとホーリーへの入隊を申し出たカズマ!! その真意は連行された仲間たちの救出であった。だが、ホーリー本部での華やかな生活は、カズマの心境を次第に変えてゆく……、のか？

“雷を使うアルター”再び登場。ヤツとの壮絶なバトルが、カズマに新たな力をもたらす!! シェルブリッドの強化のため、能力者を生むという森に足を踏み入れたカズマ。だがそこは、アルター能力を持った野生動物が住む禁断の地であった。

新生シェルブリッドの初戦相手は、合体システムを持った巨大ロボット型アルター！ カズマの前に現れたホーリー隊員、エマージー・マクフェル。だがこの男、カズマの拳を一方的に受けるばかりで、一向に反撃をしようとしない……？

ついに本性を表したジグマール隊長。秘密を知った水守の運命はいかに？ホーリーの機密を知ったため、ジグマールに投獄された水守。その頃、囚われの姫君を救うために、一人の騎士が颯爽と行動を開始した。

相棒カズマの窮地を救うべく、男・君島が見せる一世一代の大活躍!! かなみ達の働く牧場にまで侵攻して来たホーリーの部隊。権力という名の暴力に立ち向かうカズマだが、その姿を周囲の者は無法者にしか見ようとしない。

真シェルブリットVS真・絶影!! 激突するカズマと劉鳳が、光の中で見たものとは！？哀しみに我を忘れ、次々とホーリー部隊を潰すカズマ。そして、そんなカズマの行動に、劉鳳もまた激しい怒りを覚える。二人のアルター使いが雌雄を決する時が来た！

ロストグラウンドを震撼させたカズマと劉鳳の対決。そして、月日は流れた……。大隆起から8ヶ月。カズマと離れ離れになったかなみは、山奥でアウトローたちに働かされていた。そして、そんな彼女の前にある意外な人物が姿を現す!!

賭け試合を請け負うカズマ。もう、背負うものなど何もない。そう、己の命さえも……。アルターの賭け試合を調べていた水守とあすかは、闘技場で戦うカズマの姿を発見する。一方、記憶を失った劉鳳は、人々を守るため村に留まることを決意するのだった。

己の信念を貫くため、かつての仲間に拳を向ける劉鳳。だが、一方のカズマは……。劉鳳の得た能力を調査すべく、彼の元に送り込まれた雲慶と来夏月。ジグマールの真意とは一体？ そんな中、ついに開かされる常夏三姉妹の正体とは!?

あやせ再び……。さらに進化したアルターを擁して、カズマに戦いを挑む彼女の真意とは？ ロストグラウンドを去る決意を固めたカズマは、かつて本土に連れ去られたネィティブアルターのあやせと出会う。だが、すでに彼女は本土側の刺客となっていた……。

劉鳳との再会を果たす水守。そして時を同じくして、カズマもある男と出会っていた……。カズマを探すため村を出たかなみと劉鳳。そこで彼らは、無常の手先に襲われる水守たちを発見する。一方、無常を目指し荒野を進むカズマの前に、クーガーが立ちふさがった!?

劉鳳たちの危機に駆けつけるカズマ!!　そして、常夏3姉妹の真の姿とは？ 村人たちを人質にとられ、なす術のない劉鳳。だが、帰還したカズマの拳が彼らの窮地を打ち砕く。そして、追い詰められた来夏月が常夏三姉妹の真の力を開放する。

かなみのもとへと戻ったカズマ。そんな、安らぎも束の間、さらなる陰謀が彼女を襲う!! 来るべき無常との決戦を前に、なおもいがみ合うカズマと劉鳳。だがそこに、水守奪取の命を受けたビフが再び強襲!! そして、事件は意外な方向へと発展してゆく……。

かなみの救出に向かわんとするカズマ達。そんな彼らをホーリーの衛星が攻撃してきた!! ホーリーアイによる無常の宣戦布告。衛星を砕くべく宇宙へと駆け昇るカズマと劉鳳であったが、それこそは「向こう側」の扉を開かんとする無常の策略であった!!

ホーリーの長にして最強の男・ジグマール。その秘められし力と、真意が今……。敵陣への突入を果たすも、共闘を拒み別々の道を進むカズマと劉鳳。劉鳳の前にはジグマールが、カズマの前にはビフ達が立ち塞がる。死闘の果てに、劉鳳が知った真実とは!?

死の淵をさまよう劉鳳。だが、彼を待ち受けていたのは、死よりも過酷な現実だった……。イーリャン・ナイトに苦戦するカズマ。一方、劉鳳は謎のアルターの圧倒的な力の前についに力尽きてしまう。瀕死の劉鳳を救うべくシェリスは己が能力を解き放つ……。

ついに最終決戦に突入!? カズマと劉鳳が放つ真の輝きが、無常の野望を粉砕する!! 己の過去を清算すべく、謎のアルターに再び挑む劉鳳。背負ってきたもののため、無常との「ケンカ」に応じるカズマ。それぞれの思いを胸に、二人のアルター使いが最終決戦に臨む。

自らの要塞と共に滅びる無常。しかし、それはロストグラウンドで生きる者にとって、新たな戦いの序曲に過ぎなかった。さらなるロストグラウンドへの介入のため、新たな治安維持部隊を派遣して来た本土側。だが、部隊の上陸はカズマと劉鳳によって阻止されるのだった。そして、3ヶ月の月日が流れた……。

全身全霊を持って対決するカズマと劉鳳。それは、己の力のみで生きてきた二人にとって避けられぬ行為であった。一時の平穏を迎えたロストグラウンドで、再び対峙する事となったカズマと劉鳳。いつ果てるともなく続く激しい死闘。その中で、二人はささやかな夢を垣間見るのだった。そして……。

２１世紀初頭、突如発生した大隆起現象により生まれた外界と隔絶された地域、ロストグラウンド。そこは日本という国家にありながら、都市部と未開発地区に分断された、特殊な二層社会によって形成される事となった。そしていつしか、その特殊な環境“ロストグランド”に住む人間の中から、物質を分解し、別物（＝アルター）として再構成する特殊能力を持つ者、“アルター使い”が現れるようになった…

　未開発地区に暮らすアルター使いの少年・カズマは、対アルター能力者特殊部隊ホーリーの隊員、劉鳳とあるきっかけで出会い、戦い、そして敗れる。　自分の力を信じて突き進むカズマと、自身の信念で悪を断罪する劉鳳。根幹では通じるものを持ちながらも決して相容れない二人は、互いのアルターをぶつけ合い、荒廃した大地を舞台に戦い続けていくことになる……！！

強大な力のぶつかり合いが、ロストグラウンドに再隆起現象を引き起こしてから８ヶ月。

光に飲み込まれたカズマと劉鳳の行方は、依然として知れないままだった。

その二人の力を利用し、『向こう側の世界』へ行くことを渇望する無常矜侍は、部下の異能泰介と共に、精製したアルター使いを率いて、ロストグラウンドに降り立つ。だが、カズマは己の戦う理由を失って抜け殻と化し、荒野を放浪していた。そして一方、劉鳳は記憶をなくし、集落に身を寄せていたかなみと出会う。

また、無常よりも先んじて、向こう側の力を手に入れようとするマーティン・ジグマールは、ホーリー隊員を劉鳳の元へと差し向けるのだった。

背負うもののため、過去との決着のため、荒廃した大地を覆う野望に抗うため、カズマと劉鳳はそれぞれの戦いに臨む！