Youko est une jeune fille à la vie tranquille. Étudiante modèle,Yoko voit son quotidien perturbé par d‘étranges rêves peuplés de myriades de créatures fantastiques. Élève modèle Yoko est très soucieuse du regard de ses camarades de classe. Sur le chemin du retour, un étrange individu vient à sa rencontre et lui promet de lui être fidèle et de toujours la protéger des dangers. Ce n’est que lorsqu’ils se font tous deux subitement attaquer par un monstrueux oiseau géant que le mystérieux personnage en dévoile plus à Youko : elle est l’élue et doit le suivre dans son monde pour accomplir son destin.

Nos trois amis arrivent séparément sur les terres d’un monde nouveau. Yoko se retrouve seule, et sans qu’elle le sache, les traits de son visage ont changé. L’épée que lui a donné Keiki est l’objet de toutes les convoitises des habitants d’un village dévasté tout proche, mais Yoko parvient à la conserver. Elle est cependant capturée et emmenée dans une grande ville où elle retrouve Sugimoto. Toutes deux commencent à en apprendre plus sur cet univers inconnu et constatent qu’étrangement, Yoko est la seule à comprendre le langage des gens de ce monde.

Les deux jeunes filles sont accusées de la destruction du village et sont emmenées à la capitale. En chemin, elles rencontrent également Asano, lui aussi prisonnier, qui de son côté a croisé Keiki se transformant en licorne…

Sur la route qui l’emmène vers la capitale de la région, le convoi qui retient prisonniers Yoko, Asano et Sugimoto, est attaqué par des créatures loups. C’est l’intervention de l’hinman, l’esprit que Keiki a introduit dans le corps de Yoko, qui les sauvera. Yoko, Asano et Sugimoto arrivent dans un village pour trouver de la nourriture et rencontre Takki, une jeune femme qui décide de les aider, mais dont Sugimoto se méfie. Takki leur propose de travailler à l’auberge de Kasai, dans le royaume de Kou : Yoko y découvre qu’il y a de nombreux réfugiés du royaume de Kei, car ce dernier n’a plus d’empereur et est donc en proie aux attaques de créatures malfaisantes.

Youko fait un autre rêve dans laquelle elle retrouve l’étrange garçon-singe. Il sème le doute dans l’esprit de Yoko en lui racontant que ses deux camarades ne sont pas ses amis et qu’ils lui en veulent pour tout ce qui leur arrive…Sur les conseils de Takki, nos trois héros se séparent pour ne pas se faire prendre par le gouvernement, et Yoko et Sugimoto sont les premières à partir le lendemain matin, laissant Asano seul.

Convaincue par Kourin, Sugimoto la suit, et laisse ses deux camarades derrière elle.

Le garçon-singe réapparaît alors dans les visions de Yoko, et lui fait voir d’autres images du Japon, montrant sa mère et son professeur en train de se questionner sur sa disparition : fuite ? enlèvement ?…

Tandis que l’armée de Lady Johei et les troupes impériales livrent bataille, Yoko se réveille enfin, après trois jours de convalescence. Elle se rend compte qu’un individu géant aux allures de souris a soigné ses blessures et la protège du gouvernement. Rakushun, c’est son nom, conseille à Yoko de se rendre dans le royaume de En, car les étrangers n’y sont pas mal vus, et pour cela, il lui explique la géographie de ce monde, qui est divisé en douze royaumes : huit pays (Ryuu, Kei, Kou, Sou, Sai, Han, et Kyou) et quatre îles (Ren, Hou, Tai, et Shun).

Pour la première fois, Yoko éprouve du plaisir à se battre : elle le fait pour elle-même, pour sauver sa propre vie. Le garçon-singe de ses visions la trouble une fois de plus, lui racontant qu’elle n’a jamais fait tout cela pour sauver ses amis, mais juste pour les impressionner.

Sugimoto supplie Shuujo de lui donner une nouvelle chance pour éliminer Yoko et l’empereur accepte. Sugimoto se voit alors confier de nouveaux pouvoirs et remarque alors que son visage a changé, comme cela avait été le cas pour Yoko à son arrivée aux douze royaumes.

Yoko et Rakushun font connaissance de Shoryu, l'empereur de En. Il explique à Yoko que c'est son épée qui lui sonne toutes ces visions et que cela constitue une preuve supplémentaire que la jeune fille est bien la nouvelle reine de Kei.

Shoryu raconte à Youko son histoire dans le Japon du 16e siècle, car Enki et lui en sont originaires… Abandonné par ses parents, Enki regardait Kyoto brûler lorsque son nyoukai le trouva et l’amena sur le Mt Hou, dans le monde des douze royaumes. Il était donc un Taiho, c’est-à-dire un kirin capable de désigner un empereur. Mais il refusa de faire cet acte, les empereurs étant selon lui à l’origine des guerres.

Youko demande à Rakushun quelques informations au sujet de la précédente impératrice de Kei, Yo-ou, et c’est son épée qui lui en donne quelques visions.

Enki explique à Youko ce qu’il faisait à Hourai lorsqu’ils se sont rencontrés la toute première fois : il cherchait un kirin noir, Taiki, Takasato de son nom japonais.

Sugimoto réalise qu'elle a été dupée, s'excuse auprès de Yoko et lui avoue qu'elle veut rentrer chez elle. Kourin implore le Roi de Kou de rentrer au palais de Suikou avec elle car les cieux vont le punir pour ce qu'ils ont fait à Yoko, amis l’empereur de Kou refuse.

Rakushun raconte à Yoko l'histoire des douze royaumes. Jadis, l'empereur céleste détruisit le monde et reconstruisit douze royaumes. il créa la mer jaune et la mont Ho. Au Roi de chaque royaume, il distribua une branche, où était enroulé un serpent, les serpents soutenant la voûte céleste. Sur chaque branche, se trouvaient trois fruits symbolisant le trône, le pays et sa terre. Les branches se muèrent alors en pinceau.

La terre représente le peuple, le pays représente la loi et le pinceau l'histoire. Le trône est incarné par l'animal sacré. Il y a douze royaumes, douze Rois et douze animaux sacrés. Ils sont les seuls à choisir les souverains du royaume. Si le souverain s'égare, l'animal sacré tombe malade.