Akane ist noch immer für das Amt für Öffentliche Sicherheit tätig. Zusammen mit einem neuen Kollegen beschützt sie das Sybille-System vor einem Bombenattentäter.

Nach Shisuis Mord bleibt das Geheimnis weiterhin bestehen. Der Bombenattentäter wurde gefasst und verrät einen Komplizen, der durch die Scans nicht identifiziert wurde.

Als Shisui aufwacht, fehlt ihr ein Auge. Akane Tsunemori macht sich auf die Suche nach dem unsichtbaren Mann.

Nachdem sie von Inspektorin Shisui kontaktiert wurde, hat Aoyanagi bei einem Besuch in der Psychiatrie mit einem rebellischen Patienten zu tun.

Mika kann sich von dem erlebten Massaker nur schwer erholen. Akane beschließt, das vermutete Versteck Kamuis aufzusuchen.

Die Fahndung beginnt. Kamui hat die Kontrolle über die Ministeriumsdrohnen übernommen und anonyme Gamer dazu gebracht, sie zu fliegen. Doch sie halten es für ein Spiel.

Akane Tsunemori ist nun sicher, dass der unsichtbare Mann existiert, und versucht, ihn mithilfe der Hinweise aus seinem Versteck aufzuspüren.

Während Akane und ihr Team Kirito Kamuis Vergangenheit durchleuchten, macht Mika Shimotsuki im Archiv des Ministeriums eine schockierende Entdeckung.

Sakuya und Kasei enthüllen die Wahrheit hinter dem Sybille-System. Akane will derweil dessen Widersprüche auflösen. Kamui schreitet zur letzten Phase seines Plans voran.

Kamui setzt seinen Plan zur Saturierung des Sybille-Systems um. Kasei fühlt sich in Gefahr und befiehlt Inspektorin Tsunemori, so schnell wie möglich einzugreifen.

Akane Tsunemori steht Kirito Kamui in einer Konfrontation gegenüber, in der die wahren Absichten ihres Enforcers enthüllt werden.