L'inspecteur Akane Tsunemori se voit confier sa première affaire : le kidnapping d'une femme retenue otage.

Récupérant du tir paralysant d'Akane et des retombées de sa première affaire, Kogami s'interroge : est-il vraiment fait pour une carrière d'inspecteur ?

Ginoza, Akane et les Exécuteurs enquêtent sur une mort suspecte dans une usine de fabrication de drones.

En enquêtant sur la disparition de Kimihiko Hayama, l'unité découvre que ce dernier a été tué et que quelqu'un a usurpé son identité.

Après un nouveau meurtre reprenant le même mode opératoire que pour Kimihiko Hayama, la pression monte d'un cran pour retrouver l'assassin.

Tandis qu'Akane s'intéresse de plus près à Kogami et à son passé, les détectives enquêtent sur l'incident de drone d'Hachioji.

Après avoir établi un lien entre les récents assassinats et le Cas du Spécimen, Ginoza découvre l'existence d'une preuve : une photo floue de Makishima.

Kogami découvre que le tueur d'étudiantes n'est pas le même assassin que celui de l'affaire non résolue vieille de plusieurs années, mais bien l'un des étudiants.

Alors qu'il tente de retrouver Makishima, Kogami emmène Tsunemori chez son ancien professeur pour en apprendre davantage sur les différents profils criminels.

Makishima et Senguji tentent de piéger Kogami dans une station de métro abandonnée en se servant de Yuki comme appât, mais tout ne se passe pas comme prévu.

Partie seule à la recherche de Makishima pour retrouver son amie Yuki, Akane découvre avec stupéfaction que son arme ne peut rien contre le criminel.

Dans cet épisode se déroulant trois ans avant le début de la série, la guitariste et criminelle Yayoi est recrutée par l'Inspecteur Kogami.

Joshu Kasei, la responsable du Bureau de la Sécurité publique, ordonne à Ginoza de capturer Makishima bien que ce dernier soit "criminellement asymptomatique".

Une série de crimes a été commise par des tueurs portant des casques, usurpant les faibles coefficients de criminalité d'innocentes victimes.

Alors que les images des criminels aux casques se répandent, les citoyens répondent peu à peu par la violence, et bientôt, de véritables émeutes éclatent.

Akane, Kogami et Shusei réussissent à piéger Makishima, mais un combat éclate, mettant les émotions d'Akane à rude épreuve.

Après l'arrestation de Makishima et la fin des émeutes, Kogami s'intéresse au procès de Makishima et aux allers et venues de Shusei.

Retiré de l'affaire Makishima, Kogami remet peu à peu en question l'intégrité de Kasei.

Tandis que Ginoza refuse la thérapie, Makishima met à exécution son plan pour s'en prendre à l'importation de nourriture du Japon.

Akane contacte le Système Sibyl et lui demande de retirer l'ordre d'exécution de Kogami si elle réussit à capturer Makishima vivant.

Alors que Makishima reprogramme le virus, Kogami et Akane débarquent à l'usine et tentent par tous les moyens de l'empêcher de mettre en œuvre son plan.

Tandis que Kogami et Makishima sont prêts à tout pour en découdre, Akane tente de faire respecter la loi pour empêcher les deux hommes de s'entretuer.