在“云上庭园”桐人的剑和爱丽丝的剑的“武装完全支配术”相互碰撞，造成本无法破坏的“圣托拉尔·卡赛多拉尔”的墙壁破碎，桐人和爱丽丝被抛出。紧接着，桐人将剑刺入外墙的缝隙，救起了坠落的爱丽丝。可是作为敌人的两人，即使在走投无路的情况下也相互碰撞着彼此的信念。不久，桐人对爱丽丝提议休战直至返回塔的内部。

尤吉欧终于抵达“圣托拉尔·卡赛多拉尔”的90层。那里是热气腾腾的大浴场。感到困惑的尤吉欧，同在热水中缓解长途奔波疲劳的整合骑士贝尔库利·辛赛西斯·万邂逅了。尤吉欧被既沉着又有深不可测震撼力的贝尔库利压倒，却依然独自战斗。另一边，桐人与爱丽丝继续攀登着“圣托拉尔·卡赛多拉尔”的墙壁。

桐人偶然在对话中说出了赛鲁卡这个名字。听到这个名字的爱丽丝完全变了个样子。见到这一幕的桐人，告诉了她整合骑士的真相。可是，无法接受桐人所说的话的爱丽丝激烈地动摇。与此同时，在与贝尔库利的战斗中失去意识的尤吉欧被元老长丘德尔金用手带到了最顶层。在那里等待着尤吉欧的是……

桐人和打破了右眼封印的爱丽丝一起来到了第90层的大浴场。在那里的，是被丘德尔金石化了的贝尔库利。爱丽丝因师父的悲惨而流泪，但恢复意识的贝尔库利在朦胧中仍竭尽全力向两人告知了尤吉欧的去向。听到这些的桐人背起留在那里的蓝蔷薇之剑，向丘德尔金追去。随后在他们前往的元老院，桐人目睹了令人惊愕的东西。

自同阿多米尼斯多雷特的激斗起已经过了半年。爱丽丝带着失去右臂、变成废人的桐人在故乡卢利特村村外安静生活着。望着同他一起守护的世界，爱丽丝回忆起至今为止的经历。这时，在她的面前，同为整合骑士，且是她弟子的艾尔多利耶·辛赛西斯·萨蒂万出现了。

分隔人界与黑暗领域的“东之大门”。就在其附近，暗黑帝国的军队逼近。为了人们决定战斗的爱丽丝，带着桐人和人界军会合。可是和压倒性的暗黑帝国军队的兵力相比，在人界军中能够战斗的整合骑士，只有十三人。绝对的劣势中，爱丽丝在犹豫是否将同废人一样的桐人带到前线……

“最终压力测试”开始，“东之大门”终于崩塌了。在成为了暗黑神贝库达的加百列面前，组成大规模军队的暗黑军团，向人界进军。少数精锐的人界军，分头迎击。尽管是绝望的战力差距，人界军的整合骑士们还是以一骑当千的可怕力量将敌人打倒。但暗黑军团以其压倒性的兵数慢慢将人界军击散。

整合骑士莱恩利·辛赛西斯·特文蒂赛门被命令守备补给部队。因初次战斗十分害怕而逃了出来。结果，暗黑军团的哥布林们入侵到了桐人所在的补给部队的帐篷。

由于整合骑士爱丽丝放出了强大的术式，暗黑军团受到了大损伤，起死回生的策略成功了。在人界军处于胜利的沸腾时，爱丽丝遭遇敌方败退的残兵，得知皇帝贝库达的目的是寻找“光之巫女”。另一边，察觉到“光之巫女”存在的皇帝贝库达，即加百列，展开了不顾己方军队牺牲的无情的作战。

捕捉到“光之巫女”爱丽丝身影的加百列为了抓住她，下达了全军突击的命令。负责暗黑军团一角的精锐——拳斗士先于本队出发，追赶着爱丽丝等人的游击队。爱丽丝和贝尔库利思考着迎击因心意而拥有坚固肉体的拳斗士军的作战。此时毛遂自荐的，是迄今一直保持沉默的整合骑士谢塔·辛赛西斯·忒尔夫。

Asuna已使用超级女神Stacia（超级女神）的超级用户帐户登录了黑社会。下降后，多亏罗尼（Ronie）和铁斯（Tiese），她与Kirito团聚。但是很快爱丽丝到来，导致局势不稳定！

亚丝娜通过“地形操作”制造出了无底的峡谷。为了抵达人界军所在的对岸，暗黑骑士与拳斗士将草绳当作桥梁前进。发现此良机的贝尔库利率领游击队出击。另一边，在现实世界的RATH内部，从加百列率领的工作队成员之一克里特那里，得知奇妙的新大型虚拟现实多人在线角色扮演游戏要进行限时β测试……

由于加百列的策略，现实世界的美国玩家被给予了暗黑骑士的账号。他们陆续登录“Underworld”，不分人界军和暗黑军团将“人工摇光”杀害。亚丝娜注意到杀戮集团他们是从现实世界登录的玩家，拼命想要阻止他们。另外，在对岸目睹这一切的伊斯卡恩，对漠不关心同伴之死的皇帝感到愤怒……

诗乃通过超级账号“太阳神索鲁斯”登录了。她在千钧一发之际救下了被美国玩家军包围的亚丝娜等人。使用索鲁斯账号固有的能力“无限制飞行”，追踪被贝库达掳走的爱丽丝。另一边，用超级账号“地神提拉利亚”登录的莉法也来到了“Underworld”。

“人界”军和亚丝娜面对蜂拥而至的美国玩家军团，人数少却仍在勇猛战斗。但是，无法颠覆绝望的战斗力差，“人界”军的士兵们纷纷倒下。满身疮痍的亚丝娜也处于随时倒下也不奇怪的状况。亚丝娜为了打破状况，做好了决死的觉悟的时候，见到了率领着来自《ALO》的援军登录的莉兹贝特的身影。

亚丝娜和爱丽丝一起，前往用于弹出摇光的控制台“World End Altar”——“尽头祭坛”。如果在极限加速阶段开始前不打倒加百列回到现实世界的话，桐人在之后的200年间都会在“Underworld”度过。桐人抑制着焦躁的心情，与变成奇怪姿态的加百列交锋。