Це день запуску однієї з найбільш довгоочікуваних відеоігор усіх часів. Приєднуйтеся до Кіріто, який починає свою подорож у віртуальному світі Сворд Арт Онлайн.

Гравця було вбито в безпечній зоні невідомим способом. Асуна та Кріто беруть на себе обов'язок з'ясувати, як і чому це відбулося.

Кіріто зрозумів, як і тепер він має зрозуміти, чому.

Кіріто погодився на дуель із головою Лицарів Альянсу Крові. Якщо Кіріто переможе, Асуна може покинути Лицарів, а якщо він програє…

Гру завершено.

Ліфа змушена залишити свою територію та групу, щоб об’єднатися з Кіріто. По дорозі до нейтральної території вона більше розповідає про правила та зони АЛО.

Рішучість Кіріто врятувати Асуну межує з божевіллям. Його безрозсудність зупиняється, коли Ліфа раптово виходить із системи.

Чоловік у плащі спостерігає, як Кіріто веде свій перший бій, і потім вимагає від нього відповіді, чи він «справжній». Кіріто помічає у нього татуювання Веселого гроба, гільдії вбивць, яка існувала в САО. Незнайомець каже Кіріто, що колись уб'є його, і зникає.

Чоловік у плащі вижив у САО, і він може бути одним із гравців, з яким Кіріто бився на смерть... Ця думка поглинає Кіріто, і його біль відчутний настільки, що він турбує Сугуху.

Турнір наближається до кінця, і єдині гравці, що вижили, це Кіріто, Сінон і Дарк Вінд, що зайняв друге місце на останньому турнірі. Оскільки Десґан може мати декількох спільників, і Дарк Вінд також може бути в небезпеці, Кіріто вирішує перемогти його першим. Він діє як приманка, в той час як Сінон повинна знищити ворога. Довіра Кіріто до неї окупається, оскільки її куля вражає ціль, і він нарешті стикається з Десґаном віч-на-віч.

Десґан вправно володіє не лише пістолетом, але й мечем, і він поступово відбирає здоров’я Кіріто. Тим часом приціл Сінон був знищений Десґаном, що не дає їй атакувати, тому вона змушена просто спостерігати за боєм. Вона зціплює зуби і думає, чи може вона ще щось зробити.

Кіріто разом зі своїм другом дитинства Юджіо отримав завдання зрубати величезне дерево під назвою Кедр Гігас. Вони махають сокирою, коли їхня подруга Аліса приходить з обідом. Під час обіду троє друзів вирішують піти до печери.

Кіріто прокидається та опиняється в таємничому світі. Його пам'ять нечітка, він намагається вийти з системи, але не може повернутися в реальний світ. Після безцільного блукання він опиняється під величезним деревом.

У реальному світі Кадзуто Кірігая лежить без свідомості. На прохання Кікуоки Кадзуто переміщують до добре обладнаної лікарні, але коли Асуна та Суґуха намагаються відвідати його, їм відмовляють. З підозрою Асуна та інші розходяться, щоб дізнатися більше про Рас.

Асуна проникає в Рас, дослідницьку лабораторію в Океанській Черепасі, де вона невпинно допитує Кікуоку про місцеперебування Кадзуто. Кікуока розповідає, що за розробкою Транслятора Душі стоїть приголомшлива мета епічного масштабу.

Кіріто опиняється на дуелі проти елітного студента Воло Левантейна, використовуючи справжні мечі. Поки зацікавлений натовп дивиться на це, Сортілієна підбрадьорює Кіріто, і починається двобій.

Юджіо роздумує про те, що йому слід додати до свого меча, щоб стати сильнішим. Коли над ним глузують елітні студенти Райос і Гумберт, Юджіо вирішує прийняти пропозицію Гумберта про дуель.

Кіріто та Юджіо втікають зі своєї камери, але шлях їм блокує Елдрі Синтезис Тридцять Один, якого попередила Аліса про можливу втечу. Кіріто та Юджіо борються проти нього, поки Юджіо не розуміє, що десь бачив Елдрі.

Кіріто та Юджіо були врятовані молодою дівчиною Кардиналом, яка усамітнилася у Великій бібліотеці Центрального собору. Кардинал пояснює Кіріто, як виникли Церква Аксіом і Індекс заборон.

Коли Кіріто та Аліса активують мистецтво Абсолютного керування зброєю, удар прориває дірку в, здавалося б, неприступній стіні Центрального собору, і вони обидва вилітають назовні.

Юджіо досягає дев'яностого поверху Центрального собору, який виявляється величезною зоною для купання. Збентежений Юджіо стикається з Беркулі Синтезис Один, який замочується у ванні. Тим часом Кіріто та Аліса все ще піднімаються на стіну Центрального собору.

Побачивши реакцію Аліси, коли вона згадала ім’я Сельки, Кіріто вирішив розповісти їй правду про Лицарів Єдності. Тим часом, втративши свідомість під час битви з Беркулі, Юджіо прокидається на верхньому поверсі собору.

Кіріто та Аліса доходять до лазні на дев'яностому поверсі. Там вони знаходять командира Лицаря Єдності Беркулі, якого Чуделкін перетворив на камінь. Аліса розплакалася, побачивши трагічне становище свого наставника.

На шляху Кіріто й Аліси стоїть Юджіо, який пройшов Ритуал Синтезу та став лицарем єдності. Кіріто приголомшений, доки Аліса не закликає його битися з Юджіо всіма силами.

Кардинал з'являється на верхньому поверсі Центрального собору для розборки зі своїм запеклим ворогом останніх двохсот років. Вона намагається досягти своєї мети — видалити Адміністратора.

Носячи в серці надії Кардинала, Юджіо й Аліси, Кіріто знову підводиться й уявляє Чорного Мечника, найкращого гравця, який переміг в САО. Заради всіх, кого він зустрів у цьому світі, Кіріто зіткнувся з Адміністратором.

Шаста, командир темних лицарів Темної території, мав намір використати смерть Адміністратора як шанс на мир з Імперією людей. Але його планам заважає повернення імператора Вектора в країну темряви.

Сповнена рішучості боротися за людство, Аліса приєднується до сил Імперії людей, взявши з собою Кіріто. Але хоча сили темряви можуть похвалитися величезною чисельністю, лише тринадцять Лицарів Єдності доступні для боротьби за Імперію людей.

Випробування остаточного навантаження почалося, і Східні ворота зруйнувалися. Підбурювана Габріелем, нині імператором Вектором, величезна армія країни темряви сунеться до Імперії людей.