在卢利特村长大的少年——桐人，和青梅竹马尤吉欧一同背负着砍倒巨大的黑树——基家斯西达的天职。今天也为了砍倒巨树而正挥动着斧头，青梅竹马的爱丽丝送来了亲手制作的馅饼。午餐时分，3人决定远行前往童话中“尽头山脉”的洞窟。面对对于是否违反作为世界的规则的禁忌目录感到不安的尤吉欧，桐人与爱丽丝异口同声说没问题，迎来了出发的日子。

自同阿多米尼斯多雷特的激斗起已经过了半年。爱丽丝带着失去右臂、变成废人的桐人在故乡卢利特村村外安静生活着。望着同他一起守护的世界，爱丽丝回忆起至今为止的经历。这时，在她的面前，同为整合骑士，且是她弟子的艾尔多利耶·辛赛西斯·萨蒂万出现了。

凛子联系和人说爱丽丝失踪了。焦急的和人想去六本木支部，刚要出门，玄关的内线电话就响了。慌慌张张打开门，门口是一个拿着大纸箱的快递员。瓦楞纸的票据上写着“海洋资源勘探研究机构”和明朝体，收件人栏上用不自然的笔迹写着和人的住址和姓名。