L'equip de bàsquet de l'Institu Seirin es prepara per enfrontar-se a la Generació miraculosa en la Copa d'Hivern. En Kuroko i companyia aprofiten el dia lliure per participar en un torneig de bàsquet de carrer. Allà coincideixen amb en Tatsuya Himuro de qui en Kagami va aprendre a jugar a bàsquet quan vivia als Estats Units. I juntament amb en Himuro l'acompanya l'Atsushi Murasakibara, membre de la Generació miraculosa.

En Murasakibara, de la Generació miraculosa, es presenta al torneig de bàsquet de carrer. En Kagami no se'n pot esta de desafiar-lo i en Murasakibara juntament amb en Himuro s'enfronten contra en Kuroko i companyia. Mentrestant, la resta dels membres del Seirin, tot i ser el seu dia lliure, es troben per entrenar al pavelló on es presentarà la Momoi entre llàgrimes.

Finalment comença la fase eliminatòria de la Copa d'Hivern. Els primers rivals dels Seirin són els Josei amb un joc interior molt agressiu gràcies al seu pivot Narumi i al doble marcatge sobre en Kagami. Malgrat que els Seirin tenen un joc interior més aviat dèbil, la reincorporació d'en Kiyoshi desconcertarà al rival.

Ja s'han classificat els quatre equips que participen a la Lliga Final en la que es decidirà quins dos equips representaran a Tòquio en la Copa d'Hivern. En el primer partit, els Seirin guanyen contra els Senshinkan, el Rei de l'Oest; i els Shutoku guanyen per pallissa als Kirisaki Daiichi. Malgrat això, el líder dels Kirisaki, en Makoto Hanamiya, un dels Cinc Reis sense Corona, s'ha quedat a les grades observant el partit dels Seirin...

Durant el segon quart del partit entre els Seirin i els Shutoku, en Kagami continua bloquejant els llançaments d'en Midorima. Però en Midorima sorprèn amb un estil de joc totalment inusual en ell. La incorporació d'en Kiyoshi enforteix l'interior dels Shutoku i a la segona part es preparen per començar una guerra de punts.

A punt de finalitzar el tercer quart, els Seirin treuen a la pista en Kuroko que amb la seva nova habilitat, l'Entrada Dissipant, aconsegueix regatejar en Midorima i en Takao i sumar punts al marcador fins a arribar a l'empat. Durant l'últim quart, cap dels dos equips sembla disposat a cedir i arriben als últims dos segons del partit sense que hi hagi un resultat definitiu.

El trepidant partit entre els Seirin i els Shutoku finalment acaba en empat. En Kuroko i en Midorima prometen tornar-se a enfrontar a la Copa d'Hivern. En acabar el partit, en Kagami sent una conversa entre en Hyuga i en Kiyoshi, i es queda astorat en sentir dir en Kiyoshi que aquest any és la seva última oportunitat.

En Hyuga deixa enrere el seu passat i s'incorpora a l'equip de bàsquet. En comprovar la ferma determinació que mostren els membres de l'equip des de dalt del terrat de l'institut, la Riko també s'hi uneix. Malgrat que en Kiyoshi i en Hyuga no s'avenen gaire, dins la pista aconseguiran dur l'equip fins a les portes de la Lliga Final.

Els Seirin comencen marcant el primer punt, però els Kirisaki Daiichi aprofiten els angles morts de l'àrbitre per jugar brut. En Kiyoshi, que ja se les va tenir l'any passat amb en Hanamiya, decideix encarregar-se tot sol de l'interior perquè no lesionin els seus companys.

Els Seirin acaben el segon quart liderant el partit gràcies al fet que en Kiyoshi para amb el seu propi cos tots els cops del joc brut dels Kirisaki Daiichi. Al tercer quart, surt a jugar en Seto, que juntament amb en Hanamiya formen una "teranyina" que intercepta totes les passades de l'Izuki. Com més els puja la sang al cap, els Seirin queden més atrapats a la trampa.

En Hyuga, la Riko i els altres convencen en Kiyoshi perquè es retiri a la banqueta. En Hyuga se sent furiós davant el joc brut dels Kirisaki Daichi i no aconsegueix encistellar cap triple. Però de sobte recorda que la promesa que li va fer a en Kiyoshi no era derrotar en Hanamiya, sinó convertir-se en els millors del Japó.

Després d'assegurar-se una plaça per la Copa d'Hivern, els Seirin es relaxen en unes aigües termals. Allà coincideixen amb els membres de l'equip de l'Acadèmia Tôô. Aprofitant que han jugat un partit d'entrenament per la vora, l'Imayoshi i companyia fan una visita als Seirin per anunciar-los que ells seran els primers rivals de la Copa d'Hivern.

En Kagami marxa als Estats Units a entrenar-se amb qui va ensenyar-li a jugar a bàsquet quan vivia a Los Angeles. La resta de l'equip s'entrena amb el pare de la Riko, que de jove havia format part de la selecció nacional. Finalment, arriba el dia del primer partit de la Copa d'Hivern, en què els Seirin s'enfronten amb els Tôô.

La nova jugada d'en Kuroko ha deixat de tenir efecte sobre l'Aomine i en Kuroko es feu obligat a seure a la banqueta. Les ganes d'ajudar al seu company desperten el potencial d'en Kagami. L'Aomine s'adona de la transformació d'en Kagami i no pot evitar sentir-se emocionat de poder-se enfrontar a un rival que està a la seva altura.

A causa del marcatge de l'Imayoshi, en Kuroko es veu lligat de mans i peus. Gràcies a les previsions de la Momoi basades en les dades, els Tôô aconsegueixen aplacar els atacs del Seirin. La diferència de punts no para de créixer, però en Kuroko tindrà una darrera carta amagada a la màniga: la tècnica de Distracció de Desbordament!

Ja a l'últim quart del partit entre els Seirin i els Tôô, per més que s'hi esforcen els Seirin no poden escurçar la diferència del marcador. En Kuroko, en Kagami i en Kiyoshi decideixen fer un triple marcatge a l'Aomine i aconsegueixen parar-li els peus, però l'Aomine de sobte entra a la zona...!

En Kagami sap que el destí dels Seirin està a les seves mans i igual que l'Aomine també entra a la zona. Comença així el combat entre els asos dels dos equips que semblen jugar en una altra dimensió. Pocs segons abans del final del partit, tan sols els separen tres punts de diferència. Als Seirin no els queden forces per una pròrroga així que per guanyar els caldrà fer dues cistelles.

Després de superar el primer partit de la Copa d'Hivern, els Seirin es reuneixen a casa d'en Kagami per celebrar-ho. De sobte apareix l'Alex, l'exjugadora de la WNBA que va ensenyar a jugar a bàsquet a en Kagami i a en Tatsuya. Després de comprovar l'enorme talent de la Generació miraculosa, l'Alex proposa a en Kagami fer un entrenament abans del següent partit.

A la segona ronda de la Copa d'Hivern, els Seirin s'enfronten contra els Nakamiya Minami. La Riko decideix jugar sense en Kuroko i en Kagami. Els veterans no se n'acaben de sortir, però el seu fort desig de convertir-se en els millors del Japó acaba empenyent l'equip cap a la victòria. La resta d'equips de la Generació miraculosa també es classifiquen per a la següent ronda. I arriba el dia del partit entre els Seirin i els Yosen!

Davant la defensa inexpugnable de l'ègida dels Yosen, els Seirin intenten franquejar-la amb passades ràpides i la nova tècnica d'en Kiyoshi, l'Urpa de Cargol.

Després que en Kuroko hagi anotat el primer punt, els Seirin comencen a remuntar. Al tercer quart, el combat entre en Himuro i en Kagami comença de veritat. Amb el seu Tir Miratge i els seus moviments elegants, en Himuro demostra estar a l'altura de la Generació Miraculosa.

Finalment, en Murasakibara surt a atacar! Els Seirin intenten aturar-lo fent-li un triple marcatge, però el seu Martell de Thor resulta imparable. En Kiyoshi cau a terra vençut i li cedeix el lloc a en Kuroko que entra a la pista disposat a fer complir la voluntat d'en Kiyoshi de guanyar.

Els Seirin tenen seriosos problemes per penetrar a la defensa dels Yosen, però gràcies a la nova formació de defensa individual furtiva a tota la pista aconsegueixen mantenir-se a pocs punts dels Yosen. Impacient per canviar la situació en Kagami desitja poder entrar a la zona, però les paraules d'en Kise li faran obrir els ulls.

En Kagami entra a la zona i en Murasakibara queda aclaparat. Els Seirin agafen embranzida i en Murasakibara està a punt d'abandonar el partit, però en Himuro el convenç per no fer-ho. Quan falta un minut perquè s'acabi el partit i a sis punts de diferència, en Kiyoshi torna a incorporar-se.