Après avoir été accueilli au sein d'une famille aristocratique à la mort de son père, Dio Brando jure de dépouiller Jonathan "JoJo" Joestar, l'héritier de la lignée.

JoJo rencontre un chef de gang nommé Speedwagon lorsqu'il se rend à Londres pour enquêter sur l'empoisonnement présumé de son père par Dio.

Lorsque JoJo affronte Dio après avoir administré l'antidote à son père, Dio attaque JoJo au couteau et revêt lui-même le masque de pierre ensanglanté.

JoJo retrouve son premier amour, Erina. Un homme nommé Will A. Zeppeli démontre son étrange pouvoir et explique à JoJo qu'il doit détruire le masque de pierre.

JoJo et ses compagnons tombent dans une embuscade tendue par Dio et une horde de zombies, après avoir été conduits dans un cimetière par un garçon nommé Poco.

Le légendaire chevalier ressuscité Bruford reprend possession de son âme humaine et confie son épée à JoJo. Tarkus attaque JoJo de toute sa puissance.

Malgré l'issue qu'il sait fatale, Zeppeli défie Tarkus. Dans son ultime acte, il utilise ses dernières forces pour transférer ses pouvoirs à son successeur JoJo.

JoJo sauve la sœur de Poco, mais Dire, l'ami de Zeppeli, est complètement désintégré par Dio. L'épée de Bruford à la main, JoJo se retrouve à nouveau face à Dio.

JoJo et Erina partent en croisière pour leur lune de miel. Mais à la stupeur de JoJo, l'un des sbires de Dio se trouve à bord du navire.

De nombreux masques de pierre sont découverts au Mexique en 1938. Pendant ce temps à New York, Joseph, petit-fils de JoJo, aide un jeune homme du nom de Smokey.

Joseph se bat contre Straizo, transformé en vampire après avoir trahi son ami Speedwagon. Après l'affrontement, Straizo fait une mise en garde contre l'"homme du pilier".

Joseph est pris pour cible par l'un des hommes de Stroheim après son arrivée au Mexique. Pendant ce temps, Stroheim tente de réveiller l'homme du pilier Santana.

Après avoir été absorbé dans le corps de Santana, Joseph essaie de s'échapper en se servant de l'Onde. En vain. Il tente alors d'exposer Santana à la lumière du soleil.

Joseph et Speedwagon rencontrent le petit-fils de Zeppeli, Caesar, lorsqu'ils arrivent à Rome après avoir appris l'existence des autres hommes du pilier.

L'homme du pilier Wamuu repousse sans peine l'attaque de Caesar Zeppeli et le blesse. Joseph dévoile une nouvelle technique développée en secret.

Caesar emmène Joseph à Venise et lui présente son mentor Lisa Lisa, qui entreprend immédiatement de lui apprendre à maîtriser ses pouvoirs d'Onde.

Lisa Lisa dit à Joseph que la pierre appelée "Super Aja" est nécessaire pour détruire les hommes du pilier. Joseph et Caesar se mesurent à d'autres maîtres de l'Onde.

Joseph et Caesar combinent leurs pouvoirs d'Onde pour affronter les hommes du pilier qui ont volé la pierre rouge d'Aja après avoir pris possession du corps de Suzi Q.

Stroheim affronte Kars dans son nouveau corps mécanique. Pendant ce temps, Joseph et Kars chutent d'une falaise en tentant de s'emparer de la pierre rouge.

Caesar arrive à la cachette de l'ennemi avec une nouvelle attaque secrète quand Lisa Lisa révèle son passé à Joseph.

Lisa Lisa élabore un plan ingénieux lorsqu'elle tombe avec Joseph sur Wamuu et Kars qui les attendent à l'hôtel avec une centaine de leurs sbires vampires.

Joseph et Wamuu commencent leur course mortelle dans une ancienne arène. Même s'il parvient à s'emparer de la première arme, Joseph se trouve en situation périlleuse.

Joseph contre la dernière attaque de Wamuu grâce au bandana de Caesar. Lisa Lisa défie Kars en duel dans les ruines du temple.

Joseph s'efforce d'empêcher Lisa Lisa de chuter à sa mort. Speedwagon révèle ensuite les détails du passé de Lisa Lisa

La pierre rouge rend Kars invincible. Joseph fonce vers un volcan en avion pour attirer Kars vers une issue tragique.

Kars émerge de la lave en fusion et tranche le bras de Joseph. Joseph tend instinctivement la pierre rouge pour se protéger du coup de grâce de Kars.