Nell'anno 2001, due anni dopo gli eventi di Diamond Is Unbreakable, Koichi Hirose si reca a Napoli, in Italia, dopo essere stato incaricato da Jotaro Kujo di cercare un ragazzo di nome Haruno Shiobana.

Bucciarati affronta Giorno per capire se è lui l'assassino di Luca il lacrimoso e soddisfare gli ordini del suo capo, ma presto scoprirà che anche Giorno è un portatore di Stand. E questo lo metterà in una situazione tra le più problematiche.

Giorno rivela a Bruno il suo sogno di prendere il controllo della città per impedire l'ingresso di droghe. Dovrà entrare nella banda di Bucciarati per poi prenderne il controllo. Per fare questo Giorno dovrà superare un esame d'ammissione, che a prima vista sembra semplice ma che si rivelerà più complesso del previsto.

Deciso a superare la prova di Polpo, Giorno fatica a tenere acceso l'accendino. Purtroppo, non è riuscito, e appare uno Stand. Quest'ultimo ha già fatto una vittima innocente con una delle frecce che accompagna il famoso arco. Giorno, in pericolo di morte, dovrà combattere contro questo Stand!

La morte di Polpo in circostanze misteriose ha lasciato la gente della banda un pò intranquilla. Inoltre, circola una voce che il capo nascondeva un enorme tesoro ma nessuno sa dove possa essere.

La situazione sullo yacht è critica. Solo Bucciarati e Abbacchio restano per combattere, e se vogliono uscirne vivi e salvare i loro amici, devono risolvere il mistero dello Stand nemico.

Il gruppo di Bucciarati ha catturato il portatore dello Stand che li attacava, ma ci sono buone probabilità che non sia da solo. Se ha un complice, devono sapere dove si trova e dovranno agire rapidamente per non essere scoperti.

Mista e Giorno, ora sull'isola di Capri, si sono separati. Mista si dovrà confrontare con Sale, che usa uno Stand con il potere di "bloccare le cose". Come riuscirà a contrastarlo?

A Bucciarati e compagni arriva una missione affidata direttamente dal misterioso boss di Passione, che chiede di proteggere sua figlia.

Narancia è stato seguito mentre faceva shopping. Fortunatamente lo notò prima di tornare al nascondiglio, quindi per non rivelare dove si nasconde la figlia del capo dovrà affrontare un avversario formidabile, in grado di ridurre le proprie dimensioni.

Formaggio intrappola l'ormai in miniatura Narancia sotto i suoi piedi e tenta di interrogarlo, ma Narancia resiste. Un flashback mostra la vita di Narancia nelle strade e il suo incontro con Bucciarati.

Abbacchio, Fugo e Giorno devono recarsi a Pompei per compiere la seconda missione affidata loro dal loro capo, ma poco dopo essere arrivati scoprono di non essere soli. Viene anche rivelata la storia di come fugo ha incontrato Bucciarati.

Fugo lotta con Illuso, il cui potere lo tiene in un mondo in cui tutto è invertito, un mondo dentro gli specchi. Fuori, Abbacchio e Giorno litigano: Il primo sostiene che dovrebbero seguire gli ordini e concentrarci solo sulla missione principale, trovare la chiave. Ma il giovane Giorno si rifiuta di abbandonare Fugo. Le opinioni divergono e la squadra già fragile va in frantumi.

Con la chiave del boss in tasca, Bucciarati e la sua squadra devono ora andare alla stazione di Neapolis e seguire le istruzioni del loro capo. Ma queste non sono chiare e Bucciarati non trova dove usare la chiave, finché non nota una particolarità sulla tartaruga nella fontana che il capo ha indicato. Dovranno agire rapidamente perché sono già seguito da due uomini.

Mentre Mista usciva dal nascondiglio per eliminare i suoi nemici, fa un errore e viene attaccato da Pesci. Ma Mista è più astuto e trova un modo per capovolgere la situazione a suo vantaggio. Tuttavia, sa che Pesci non è solo e che un altro pericolo è in arrivo.

Solo Bucciarati può affrontare Prosciutto, Pesci e i loro Stand. Per riuscire a sconfiggerli dovrà mettere alla prova la sua determinazione.

Si presume che la minaccia fosse finita e che i ragazzi potessero andare avanti con il loro viaggio, ma subito dopo Melone appare con la chiara intenzione di porre fine alla vita di tutti e di prendere Trish.

Il gruppo continua il suo viaggio, questa volta verso Venezia, ma gli assassini di Passione non si arrenderanno così facilmente.

Mista e Giorno affrontano un nemico che sembra essere invulnerabile ai loro attacchi. Ci vorrà molta determinazione da entrambe le parti per vincere questa lotta.

Con il dischetto in loro possesso, Bucciarati e la sua squadra si dirigono verso il punto d'incontro tra Trish e suo padre. Le istruzioni fornite dal capo sono molto precise e lui vuole che siano seguite alla lettera, altrimenti l'incontro non può essere fatto. Tuttavia la missione non è finita fino a quando Trish non sarà con il capo.

Bucciarati capisce che il capo voleva uccidere Trish. Il giovane non può lasciargli fare una cosa del genere, uccidere una ragazza innocente. Si opporrà quindi al suo capo, da solo, e senza sapere come affrontare il suo Stand.

Ora che Giorno, Bucciarati e gli altri hanno deciso fermamente di tradire il capo, sono diventati immediatamente il bersaglio prioritario del loro nuovo nemico.

La squadra di Bucciarati viene attaccata da due uomini del boss, Squalo e Tiziano. Questi prima attaccano Narancia e poi mettono in trappola Giorno. Gli scagnozzi del Boss sembrano avere un piano ben preparato.

La squadra di Bucciarati parte per la Sardegna alla ricerca delle origini del boss e per raggiungerla useranno un aereo privato in modo che nessuno possa seguirli, ma prima di partire un misterioso portatore di Stand appare in pista.

Trish è da sola sul retro del jet ad affrontare Notorious B.I.G. Deve fare una scelta difficile: correre il rischio di recuperare la spilla di Giorno e salvare il team di Bucciarati, o di proteggere la sua vita e nascondersi nell'armadio dove il mostruoso Stand non lo vedrà.

Doppio ha il compito importante di proteggere il segreto del capo. Sicuramente dovrà affrontare la squadra di Bucciarati, attualmente in Sardegna, ma non sono gli unici a bersagliarlo.

Doppio affronta Risotto Nero, il più misterioso assassino di Passione. Perfino il boss non sa quale sia il suo potere. Non ha davvero nessun vantaggio e dovrà usare l'astuzia se vuole uscirne vivo.

Risotto ha capito chi era il capo, ma forse troppo tardi. Bucciarati e i suoi uomini, sono appena arrivati in Sardegna e dovranno affrontare il sopravvissuto del duello tra il Boss e Risotto.

Bucciarati e Giorno cercano senza successo negli archivi della polizia un volto corrispondente a quello del boss indicatogli da Abbacchio, quando improvvisamente vengono contattati tramite computer da una voce misteriosa che propone loro di allearsi per sconfiggere Diavolo. Lo sconosciuto afferma infatti che King Crimson è uno stand invincibile, eccetto forse sfruttando una Freccia, di cui lui è in possesso, per ottenere un potere ancora superiore.

Appena tornati sulla terraferma, Bucciarati e la sua squadra sono già attaccati da un nuovo spaventoso Stand. Il quale è innocuo se sali di quota. È quindi sufficiente lasciare il villaggio e andare verso la montagna per fuggire dal suo campo di azione. Tuttavia, un secondo Stand renderà il compito molto più difficile di quanto sembri.

Bucciarati si trova subito in difficoltà per via della velocità, della forza e dei riflessi superiori di Secco. Giorno e Mista si arrampicano intanto verso l'elicottero; Mista spara al veicolo con Sex Pistols, ma i proiettili non riescono a trovare Cioccolata e vengono invece feriti, incapacitando Mista. Giorno e Pistol No. 5 si introducono nell'elicottero dove vengono attaccati a sorpresa da Cioccolata, che si è nascosto dissezionando chirurgicamente il suo corpo in più parti, e che cerca di far precipitare il ragazzo di sotto per farlo cadere vittima della muffa di Green Day. Giorno riesce infine a ferire Cioccolata alla testa tramite un proiettile di Mista e a farlo cadere esanime.

Secco riceve un ultimo messaggio da Cioccolata in cui il compagno gli rivela di aver scoperto che il gruppo di Bucciarati intende incontrare qualcuno al Colosseo che ha un piano per sconfiggere il boss. Lo sconosciuto si rivela essere Jean Pierre Polnareff, il cui corpo è ora mutilato e costretto su una sedia a rotelle. Bucciarati usa Sticky Fingers per fuggire sottoterra dal suo avversario verso il Colosseo sperando di far perdere le proprie tracce, ma Secco lo insegue sfruttando l'abilità di Oasis e il suo udito altamente sviluppato. Proprio quando Secco sembra avere la meglio tramite una pioggia di rocce appuntite che feriscono Bucciarati, il giovane fa scoppiare i pneumatici di una macchina vicina per spaccare i timpani del nemico.

Il Colosseo si trova a pochi metri da Bucciarati. Quest'ultimo incontrerà finalmente colui che può aiutarlo a sconfiggere il boss. Ma Doppio è qui e intende scoprire questo famoso segreto prima di lui.

Jean Pierre ha usato la freccia sul suo Stand prima che Diavolo lo uccidesse. Questo ha avuto uno strano effetto. Tuttavia, nelle vicinanze del Colosseo, tutti gli esseri viventi si sono addormentati. Quando si svegliano, Giorno e i suoi compagni sono completamente confusi.

Lo stand di Polnareff è fuori controllo da quando è stato colpito dalla freccia. Ma Bucciarati si getta su di lui senza esitazione. Tuttavia, anche se sembra lento, Chariot Requiem non permetterà a nessuno di toccare la freccia.

Requiem per proteggere la freccia sta attaccando chiunque si avvicini, ma Diavolo è riuscito a trovare un modo per sconfiggerlo e impossessarsi del'oggetto che protegge.

Diavolo ha perso la pazienza. D'ora in poi, non perderà più tempo. Tutti quelli che sono sulla sua strada pregheranno, perché questa volta è determinato, e la freccia è nelle sue mani.

Ferito a morte, Diavolo cade sul fiume e Trish esorta Giorno a cercarlo, ma Giorno afferma che non sarà necessario. Il potere di Golden Experience Requiem ha condannato Diavolo a morire ancora e ancora per l'eternità. In un flashback di prima che Bucciarati e gli altri incontrino Giorno, un fiorista si avvicina a Bucciarati e gli chiede di vendicare sua figlia.

Mista interroga Scolippi che spiega che il suo stand, Rolling Stones, crea pietre con immagini di persone al momento della loro morte. Una volta che una persona tocca la propria pietra, può scegliere di accettare la propria morte. Dopo aver appreso questo, Mista fa del suo meglio per impedire a Bucciarati di toccare la propria pietra.