1868 год. В результате нападения разбойника Дарио Брандо повозка падает с обрыва, после чего Мэри погибает. Её муж, Джордж Джостар, и новорожденный сын Джонатан выживают, и Джордж думает, что Дарио спас их. В знак благодарности Джордж принимает в семью его сына — Дио Брандо. Дио начинает различными способами издеваться над Джонатаном например крадёт первый поцелуй у возлюбленной Джонатана — Эрины Пендлетон и даже сжигает его собаку. Но Джонатан не падает духом и мирится со своей судьбой.

Проходит 7 лет, отношения между Дио и Джонатаном стали более терпимыми. Однако отец Джонатана и хозяин поместья — Джордж, медленно умирает от неизвестной болезни. Джонатан, понимая, что в этом как-то замешан Дио, отправляется в Лондон, чтобы найти магазин, где был куплен яд. На него нападают разбойники во главе с Робертом Спидвагоном, который видит добрые намерения Джонатана и решает помогать ему. Тем временем Дио изучает таинственную каменную маску и решает испытать её на проходящем мимо пьянице. Маска превращает его в вампира и он чуть не убивает Дио, но сам погибает от солнечного света.

Джонатан находит лавку, где был продан яд, и возвращается домой. Он разоблачает Дио, но тот в попытке самозащиты набрасывается с ножом на Джонатана. Его спасает Джордж, подставив своё тело под удар. Дио надевает на себя маску и превращается в вампира. Джонатан вступает в жестокую схватку с Дио, в поместье начинается пожар. Дио проигрывает схватку, и умирает, однако в дальнейшем выясняется, что ему удалось выжить.

На Пэгги напал один из подчинённых Дио в ответ на отказ присоединиться к нему. Джонатан спасает Пэгги, после чего направляется к Дио, чтобы уничтожить его. Джонатан не может просто так ввести в его тело хамон, но узнаёт, что может победить его с помощью меча, добытого у Бруфорда. В это время Томпэтти и Страйдзо сражаются против армии нежити Дио. В конце концов, Джонатану удаётся ввести хамон в тело Дио, уничтожив его.

Дио не умирает, так как успевает отделить свою голову, пока до неё не дошёл хамон. Джонатан женится на Эрине и на круизном лайнере решает отправиться в путешествие в Америку. В лайнере оказывает и Дио, который обращает всех людей в зомби. От Дио осталась только голова, но и с ней Дио остаётся достаточно сильным. Он намеревается убить Джонатана, чтобы заполучить его тело в качестве замены своего уничтоженного. Джонатан решает уничтожить лайнер, чтобы похоронить в море себя и Дио. Перед этим Эрина спасается, выплывая на гробу Дио с чужим младенцем на руках.

1938 год. Через 49 лет после смерти Джонатана постаревшие Спидвагон и Страйдзо отправляются в Мексику, где находят множество каменных масок. Страйдзо внезапно убивает всех членов экспедиции и надевает на себя маску, превратившись в вампира. Тем временем в Нью-Йорке живёт внук Джонатана — Джозеф Джостар. Он спасает мелкого карманника по имени Смоки Браун от полицейских, а позже подвергается атаке со стороны Страйдзо, который объявляет, что убил Спидвагона.

Цезарь подходит к заброшенному зданию, но подвергается нападению Вама, который для защиты от солнца искажает свет и создаёт эффект прозрачности. Цезарь демонстрирует улучшенные навыки Ваму, который сбегает внутрь здания, осознав, что слаб снаружи. Цезарь продолжает сражаться с Вамом и сильно ранит его, однако из-за просчёта получает смертельный удар. Цезарю удаётся получить кольцо-противоядие у Вама и передать Джозефу через свой последний созданный пузырь.

Джозеф сражается против Карса, но начинает проигрывать ему. Он прибегает к хитрому плану, скидывает Карса со здания и спасает Лизу Лизу. Кажется, что Карс должен умереть, но он успел добыть камень Эйши и вставить его в каменную маску, надев на себя. Штрохайм делает попытку убить его с помощью ультрафиолетовых лучей.

Карс становится совершенным существом и больше не боится солнца. Он может также преобразовывать части своего тела, чтобы, например, летать. Понимая, что у Джозефа нет шансов победить, он сбегает на самолёте и хочет заманить Карса к вулкану. Джозефу удаётся прижать Карса к носу самолёта благодаря Штрохайму, который спрятался в боковой части самолёта. Перед тем, как самолёт падает в магму, Штрохайм хватает Джозефа и успевает приземлиться у края кратера, но сила удара оказывается настолько велика, что механические ноги Штрохайма полностью ломаются.

Карсу удаётся выбраться из Магмы, и он отрубает руку Джозефу. Выясняется, что Карс может использовать хамон, который по силе в сто раз превосходит силу Джозефа. Но происходит сильное извержение, и камень, на котором находятся Джозеф и Карс, улетает в высшие слои атмосферы. Карс улетает в космос и навечно замерзает, а Джозеф падает обратно на землю и пропадает без вести. Все считали, что он умер, и даже устроили похороны. Однако Джозеф выжил, так как упал в воду, и за ним ухаживала Сьюзи; впоследствии они поженились. В конце показана дальнейшая судьба главных героев. 1989 год, постаревший Джозеф отправляется в Японию, чтобы встретится с дочерью. Показаны короткие сцены, где его внук Дзётаро сидит в тюрьме, а гроб с телом Дио Брандо вытаскивают на сушу.

Действие происходит в 1989 году. Моряки вытаскивают сундук с телом Дио Брандо со дна атлантического океана, который покоился там 100 лет, он оживает и убивает моряков. Становится ясно, что Дио сумел захватить тело Джонатана, которым заменил своё уничтоженное. По этой причине у всех потомков Джонатана пробуждаются «стенды» (яп. スタンド сутандо) — существа, являющиеся воплощением духовной сущности, воли человека и обладающие разными способностями. Их получают Джозеф Джостар, его дочь Холли Кудзё и внук Дзётаро Кудзё. Однако Дзётаро убеждён, что одержим злым духом и сам добровольно становится заключённым в тюрьме, его оттуда силой вытаскивает дед Джозеф и его спутник Авдол. Джозеф вводит Дзётаро в курс дела.

Дзётаро отправляется в школу, где на него нападает Нориаки Какёин, он овладевает телом медсестры и с помощью неё сражается с Дзётаро, однако стенд Платиновая звезда успешно освобождает медсестру от стенда Какёина и одерживает победу над самим Какёином, Дзётаро приносит его без сознания к себе домой и узнаёт, что на деле он был под контролем Дио.

Дзётаро и Джозеф находят на голове Какёина отросток волос Дио, который контролирует его мозг. Дзётаро удачно извлекает его из головы Какёина и оставляет его поправляться. Внезапно выясняется, что стенд Холли начинает медленно убивать её, так как Холли слишком нежная и слабая для своего стенда. Дзозеф, Дзётаро и Авдол делают вывод, что должны немедленно попасть в Египет, чтобы убить Дио и спасти Холли, к ним решает добровольно присоединится Какёин.

С Польнареффом решает сражаться Авдол, они выходят на улицу, битва вышла эпичной, хоть Авдол оказался серьёзно раненным, он одержал победу перед Польнареффом, однако видя его благородство решает не убивать его. Дзётаро освобождает Польнареффа от зависимости Дио, и тот решает присоединится к главным героям в надежде найти убийцу своей сестры, веря, что он как то связан с Дио.

Дио, снова использовав остановку времени с новой силой нападает на Дзётаро, ломая ему кости и при следующей атаке собирается окончательно добить его с помощью парового катка, однако сам не замечает, как Дзётаро уже своим стендом останавливает время и незаметно выбирается до того, как каток бы раздавил его и сам наносит сокрушительный удар Дио, сломав его стенд на пополам. Дио оказывается поверженным, его тело забирает фонд Спидвагон. Дзётаро настаивает на том, чтобы кровь из тела Дио перелили в тело Джозефа, что врачи и делают. Джозеф возвращается к жизни и не становится вампиром. А тело Дио сжигают под солнечными лучами. Польнарефф расстаётся с героями, а Джозеф с Дзётаро возвращаются в Японию, чтобы проведать Холли, сумевшую поправится.

April 1999. Jotaro Kujo arrives to Morioh City in search of someone named Higashikata, and ends up running into a young man surrounded by delinquents. Jotaro then finds out that his name is Josuke Higashikata, and was exactly the person he was looking for.

Josuke spots the terrible and violent villain Angelo's Stand, and tells Jotaro about that incident. Jotaro figures it's a Stand that can somehow enter people, so he warns Josuke to not eat or drink anything until he can get to him. Right when he's told that, Josuke witnesses the Stand go into his mother, and then does the unthinkable.

Angelo's Stand ability was brought forth by the mysterious bow and arrow, and apparently they're also connected to Dio. After defeating Angelo, Jotaro thought that the danger had left the city, and tries to find the whereabouts of the bow and arrow. A few days later, Koichi is walking home with Josuke, and they pass a house that should be empty...

Koichi suddenly arrives at Rohan's house. Koichi carefully goes inside and finds Rohan drawing manga at an incredible speed. Apparently he can't stop himself from drawing after reading about Koichi's experiences. Rohan attempts to tear another page from Koichi by using Heaven's Door, when someone unexpected shows up at his door...

К раненному Кире подходит медсестра и Кира делает её своим заложником и решает применить способность Killer Queen Bites the Dust, которая после применения возвращает человека на час назад. Однако Киру останавливает Дзётаро, остановивший время и нанёсший последний удар Кире, отбросив его под проезжавшую машину скорой помощи, которая переездает Киру, и он умирает, попадая на границу мира мёртвых, где встречает Рэми Сугимото, хотя сразу этого не осознаёт. Рэми заставляет его повернуться и Киру затягивает в мир мёртвых. Рэми теперь свободна и перед уходом в мир иной прощается с главными героями. Мать Хаято пока не осознала, что её «муж» мёртв. Дзётаро, Джозеф и Сидзука покидает Морио.

Koichi arrives in Italy on a mission from Jotaro to find Giorno; they meet haphazardly when Giorno steals Koichi's luggage, and the ensuing chase leads Giorno into a Stand battle with the gangster Leaky Eye Luca.

Faced with Bucciarati's Stand, Sticky Fingers, Giorno desperately uses Gold Experience to defend himself.

News of Polpo's death reach the organization, along with word that he had a huge fortune hidden somewhere. Meanwhile, Giorno meets Bucciarati's gang.

Number Six from Sex Pistols manages to warn Bucciarati about the enemies and fights back, but The Grateful Dead's powers are taking a toll on him. Bucciarati steels his resolve and throws himself out with Prosciutto out of the train that's going 150kph. Barely hanging onto life, Prosciutto uses The Grateful Dead again. Pesci decides to take Prosciutto's resolve to heart and attacks Bucciarati.

After defeating Proscuitto and Pesci, Bucciarati and the others head to Venice in a car. Melone from the Hitman Team finds some of Bucciarati's blood at the scene where the train had stopped and then activates Babyface. The powerful remote-control Stand created by assaulting a woman on the train then goes after Bucciarati.

In the aftermath of the battle between Risotto and Doppio, Abbacchio uses Moody Blues to try and uncover the boss's identity. But the boss is adamant about keeping his identity a secret and executes his next gambit against the group.

Giorno achieves his dream and destiny of becoming a Gang-star.

In the past, Bruno and his team investigated the mysterious death of a girl and how it ties into the power known as Rolling Stones. And in the present, the final fate of Giorno and the gang is revealed as Golden Wind comes to a close.

Флорида, 2011 год. Юная Джолин отбывает срок по ложному обвинению. После того, как отдалившийся отец передает ей странный предмет, она открывает в себе таинственные силы.

Джолин осваивается в Тюрьме на улице Зеленого Дельфина и знакомится со своей двуличной сокамерницей, Гвесс, которая крадет ее медальон и новый крошечный Стенд.

Джолин привыкает к жизни в тюрьме, но внезапно получает зловещее предупреждение от загадочного мальчика, после чего её навещают отец и пользователь вражеского Стенда.

Приспешник Дио по имени Джонгалли Эй жаждет мести. С риском для жизни мальчик помогает Дзётаро и Джолин, но та отказывается оставлять ребёнка в беде.

Father and daughter try to escape the visiting room's trap and the prison, but an enemy Stand extracts two discs from Jotaro. One holds Star Platinum.

Pale Snake's user, Father Pucchi, makes his entrance. A baseball game in the yard against Miraschon heats up when F.F. and Stone Ocean get involved.

Jolyne resolves to escape Green Dolphin Island and put a stop to Father Pucchi's ambitions. A prison guard brings her a message from Pale Snake.

Jolyne's group hurries to find Weather Forecast and stop his Stand. Meanwhile, Weather Forecast resolves to settle the score with Father Pucchi.

The unstoppable acceleration of time brings the universe full circle. Emporio awakes in Green Dolphin Street Prison, and humanity enters a new world.