Rider unterbricht das Duell zwischen Saber und Lancer um sie für seine Armee zu rekrutieren. Kurz darauf schließen sich auch Archer und Berserker dem Kampf an.

Rider, Saber und Archer treffen sich im Garten des Einzbern Schlosses und diskutieren über die Pflichten eines Königs. Die Zusammenkunft wird jedoch gewaltsam von Assassin unterbrochen.

Caster und Ryunosuke wollen ein großes Spektakel veranstalten und beschwören ein riesiges Monster am Fluss, um Gott zu verhöhnen. Die anderen Teilnehmer des Krieges versammeln sich ebenfalls dort, um dem Schrecken ein Ende zu bereiten.

Archer und Berserker liefern sich eine intensive Schlacht in den Wolken, während am Boden Rider und Saber sich aus dem Kampf gegen Caster zurückziehen um ihre Strategie zu überdenken...

Flashback ... Vor vielen Jahren lebte der junge Kiritsugu mit seinem Vater Noritaka auf einer Insel auf den Philippinen. Dieser erforscht das Thema anhand von Pflanzen. Eines Tages läuft ein Experiment aus dem Ruder...

Saber sucht die Auseinandersetzung mit Rider und Kiritsugu macht sich auf, um Tokiomi auszuschalten.

Der Kampf um den Gral findet seinen Höhepunkt. Wer wird triumphieren und welches Schicksal wird sich für den Sieger und die Menschheit ergeben?