식량이 떨어지자 로크는 먹을 것을 찾아 캠프에 왔던 멧돼지들을 잡자고 제안한다. 케이트는 사이드가 만든 안테나를 달기 위해 멧돼지 사냥팀에 합류하고, 로크, 마이클과 함께 사냥을 떠난다.

잭은 물에 빠진 분을 구하지만, 분은 여자를 구하러 가는 자신을 왜 끌고 나왔냐며 오히려 화를 낸다. 헐리와 찰리는 얼마 남지 않은 물을 텐트에 넣어두기로 하고, 잭은 아버지의 환영을 쫒아서 숲으로 들어가버린다.

찰리와 클레어가 이든에게 납치된 사실을 알게 된 잭과 로크는 수색팀을 짠다. 로크와 분, 잭과 케이트는 양쪽으로 흩어져 정글로 들어가고, 나무에 매달려있는 찰리를 발견하고 숨을 쉬지 않는 찰리를 가까스로 살려낸다. 찰리는 아무것도 기억나지 않는다며 그들이 원하는 것은 클레어 뿐이었다고 말한다.

소이어는 멧돼지가 자기만 괴롭혔다고 생각하고 정글로 멧돼지를 잡으러 들어간다. 케이트는 소이어가 갖고 있는 권총을 회수하기 위해 소이어를 따라 정글로 들어간다. 소이어와 케이트는 진실게임을 하며 서로에 대해 조금씩 알아간다.

잭은 다리를 심하게 다친 분이 잠깐 의식이 돌아온 분은 비행기가 절벽 위에서 떨어졌다고 말하고, 잭은 로크가 거짓말을 했다는 것을 알게 된다. 잭은 문제는 피가 아니라 다리라는 것을 깨닫고 분의 다리를 자르려 하지만 분은 자신을 보내달라고 한다.

잭, 로크, 케이트, 헐리 일행은 다이너마이트로 해치 입구를 폭파시킨다. 그러나 잭은 시간 내에 캠프의 사람들을 모두 대피시킬 수 없다면서 해치를 포기 하자고 한다. 그러나 로크는 해치를 조사해 봐야겠다며 캠프를 떠난다.

잭과 로크는 마이클에 의해서 무기 창고에 갇히는 신세가 된다. 마이클은 이들을 가둔 뒤 아들 월트를 찾아 정글로 떠난다. 그러나 다행히 이들은 잭의 진찰을 받기 위해 해치에 왔던 소이어와 케이트에 의해 구출된다. 잭과 로크, 소이어는 무기를 가지고 마이클을 찾아 나서는데...

헐리는 리비를 기쁘게 해주기 위해서 피크닉을 계획한다. 한편 잭과 로크는 마이클에게 정체를 알 수 없는 그들에 대해서 자세한 정보를 얻게 되는데...

그들이 살고 있는 마을 상공에서 오세아닉 항공 815편이 조각나며 폭발한다. 그들의 마을은 문명사회의 전원주택을 방불케 할 정도로 깔끔하고 아늑하다. 그들의 우두머리인 벤은 즉각 굿윈과 이든을 부르고, 생존자로 위장하여 정보를 알아내라는 특명과 함께 각각 꼬리와 동체 부분이 떨어진 곳으로 보낸다.

클레어는 섬을 탈출할 수 있는 방법을 찾았다며 바쁘게 움직이고, 선과 진은 클레어를 돕는다. 하지만, 클레어는 찰리와 데스먼드가 자꾸 자기가 하는 일을 방해하고 있다는 느낌을 지울 수가 없다. 한편 어렵게 음파 장애물을 통과하여 그들의 주거지로 잠입하는데 성공한 사이드 일행은 전혀 예상하지 못했던 광경을 마주하게 된다.

잭과 케이트는 화물선과 연락을 취한 후 희망에 부풀어있다. 해변으로 돌아온 데스몬드는 사이드, 소이어, 헐리에게 찰리가 죽었으며, 화물선을 보낸 사람이 페니가 아니라는 사실을 알려준다. 여기에 로크까지 가세하자, 생존자는 급기야 잭을 중심으로 화물선에 희망을 거는 팀과 로크를 중심으로 화물선을 위협으로 간주하는 팀, 둘로 갈라진다.

모두가 걱정하는 가운데 잭의 맹장수술은 성공적으로 끝나고, 그 와중에 케이트에 대한 잭의 변함없는 애정이 확인된다. 한편 소이어 일행은 해변으로 돌아오는 도중에 키미와 용병들을 만나지만, 라피더스의 도움으로 위기를 모면한다. 하지만 그날 밤 클레어가 뜬금없이 정글로 사라진다.

로크는 꿈에서 호레이스라는 인물로부터 계시를 받는다. 다르마 이니셔티브 직원들의 시체가 버려진 구덩이에서 오두막의 위치를 알아낸 후 제이콥을 만나러 가는데, 뜻밖에도 오두막엔 클레어가 있다. 한편 배로 돌아간 키미는 라피더스를 압박하기 위해 의사를 살해하고, 분쟁 중에 선장마저 죽인다.

잭, 케이트, 사이드, 헐리 등 소위 오세아닉 6인방이 구조되어 기자회견을 갖는데, 이들은 어떤 이유에서인지 추락 후 섬에서 일어난 모든 사건에 대해 거짓말을 한다. 때늦게 치뤄진 아버지 장례식에서 잭은 클레어의 엄마 캐롤을 만나 클레어가 이복여동생이란 사실을 전해 듣고, 선은 항공사로부터 받은 합의금으로 아버지 회사 지분의 반을 사들인다.

화물선이 폭파되면서 바다에 떨어진 진은 폭풍에 배가 난파되어 섬 인근에서 표류 중이던 다니엘 루소 일행에 의해 구조된다. 루소는 당시 임신 7개월이었다. 진은 이들이 연기 괴물에게 동료를 잃는 광경과 태아의 아버지인 로베흐가 루소가 쏜 총에 맞아 죽임을 당하는 광경을 목격한다.

케이트와 잭, 헐리는 보안팀장인 소이어의 도움으로 막 잠수함을 타고 들어온 달마 신입으로 위장한다. 비행기 추락 여부를 확인하기 위해서 플레임 기지로 달려간 진은 뜻밖에 사이드와 마주치고, 라진스키는 사이드가 첩자라면서 그 자리에서 죽여야 한다고 주장한다. 하지만 소이어는 임기응변의 기지를 발휘하여 일단 본부 철창에 가둔다.

케이트와 줄리엣 때문에 소이어는 할 수 없이 잠수함에서 내린다. 소이어 일행은 스완 해치를 찾아 헤매다가 로즈와 버나드를 만나는데, 이들 부부는 정신없이 숨가쁘게 돌아가는 섬의 현 상황에는 전혀 관심이 없어 보인다. 수소폭탄에서 핵탄두만 제거한 후 잭과 사이드는 스완 해치로 향하는데, 도중에 달마 마을에서 총격전이 벌어진다.

소이어는 수포폭탄을 터뜨리지 못하도록 설득하려다가 실패하고 잭과 주먹다짐을 하는데, 줄리엣이 생각을 바꿔먹는 사람에 머쓱해진다. 사이드는 총에 맞은 상처 때문에 출혈이 심해서 사경을 헤매게 된다. 라진스키는 드릴 작업을 멈추라는 챙 박사의 경고를 무시하고, 필은 무장한 사람들을 데리고 스완해치에 나타난다.